cluster # 16503

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Oryza sativa
cluster # 16503 cluster # 16503 Sequences # 35 consensus # 2

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consensus_16503#0 length = 1619 sequences # 34

consensus_16503#1 length = 221 sequences # 1

consensusID : consensus_16503#0
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Sequences nbr = 34
consensus length = 1619
fasta sequence

                              [ACCACTGACATGG-CTGAAGGAGTAGAAAACACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT-GGT-GGT-GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT-GGATCGGGCTATGGTTCTG-GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG-GCGGCGGCGGTGGTGGTG-AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGTCTGGGCAAGGCTCTGGCTATGGTGCAGGTGTTGGTGGTGCTGGCGGGTATGGTAGTGGTGGCGGAGGTGGTGGTGGCCAAGGTGGTGGTGCTGGCGGCTACGGGCAAGGGTCTGGCTATGGTTCCGGCTATGGGTCGGGTGCTGGTGGTGCTCATGGTGGTGGTTATGGAAGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGAGGCCATGGCCGACTCCGGCGACTCGTCCCCGCACTCCGCCGCGGCCACCGACGACGCGCACCACGAGGGCTCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGCGGCGCCCCCGCCACCGGCGCCGCCGGCGAAGGTGCGGTTGATGGTGAGCTACGGGGGGCGCATCCAGCCGCGGCCGCACGACCACCAGCTCTCGTACGTCAACGGCGAGACGAAGATCCTGTCGCTCGAGAGGCCCCTCCGCTTCGCCGACTTCGCCGCGCGGTTGGCCGGCCTCGCGGGTTCTCCGGGGGACTTCTGCGTCAAGTACCAGCTCCCCGGCGAGGACCTCGACGCGCTCGTCTCCGTCACCAACGACGAGGATCTGGAGCACCTCGTCCTCGAGTACGACCGCCTCCACCTGCTCCGCCCCGCGCCGGGATCTGGCGGCGGCTCGTCCCGCGGCGGTTCCACGCCCAGGCTCAGGGTTTTCCTCTCCCCCGTCTTCTTCATCCCCGCGCCGCCGCATGGCTACTTCACCACCGCCGCTGGCCCCGGCGCCACCTCCTTCCCCGCCGTCTACGCCGTCGTGCAGCACAATGGCAATGCCAATGCGAGCGGCAATGGCCCTTCCCCCGCCGCCGCGTCGAATGCTCAGGCCTACGCGCCGCAGGTGGCGTATGACAGCAATGGCCACGCCATCTACTACACCAGCGTCCTCCCCCAGTATGCTTCGGCTGTCAGCGGCGTGCCGGCGGCGGCCACCGTGCTCGGCACTGACCCAGCCAAGCCGGTGGCGGTGAAACCAACAGTTTCCTGAGCAGCATGCCAGTATCTTAACCTCGCCGCCGATGGGTTAAAAAACTAAAAAAGAGTTTGGCAATTTTCTCTGTCTAGTCCGTCAATATGCGTTAATATGTCAGTTGGATTCGTTATTGTCTCTAGTATTTACCTATAATATTCTTTTTCTCTCTCTCTCTTTTGTTTAGAGTTTTGGTTTTGGCCTTCATGATATGCGACTAGAGTTCTTGGTGTGCTTAGATGTACATAGTCTTTCTGGACATAATGGATATTATATTAGCCTATTGGATGAG]

[+] EMBL CF320950             [ACCACTGACATGG CTGAAGGAGTAGAAAACACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGTCTGGGCAAGGCTCTGGCTATGGTGCAGGTGTCGGTGGTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CF321513             [ aCACTGACATGGACTG AGGAGTAG  AACACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGAAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGACTGGGCAAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CF318424             [        CATGGACTG AGGAGTAGAAA  ACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CF320197             [        CATGG ACGAAGGAGTAGAAAACACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGTGGGTGGGTGGGGGAAGGAGCGGGGGGTGGGTACGGTGGGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGNCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CF319426             [           ga CTG AGGAGTAGAAA  ACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CF318106             [                GAAGGAGTAGAAAACACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CF321846             [                   GGAGTAGAAAACTAT CCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGN GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGGTCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTtt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CF317210             [                                CTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CF316857             [                                     CAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CF317176             [                                     CAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CF321153             [                                     CAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTTGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGTCTGGGCAAGGCTCTGGCTATGGTGCAGGTGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CF318696             [                                     CAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CF315686             [                                     CAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CF316374             [                                     CAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CF337097             [                                     CAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AK063947             [                                      AGCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGTCTGGGCAAGGCTCTGGCTATGGTGCAGGTGTTGGTGGTGCTGGCGGGTATGGTAGTGGTGGCGGAGGTGGTGGTGGCCAAGGTGGTGGTGCTGGCGGCTACGGGCAAGGGTCTGGCTATGGTTCCGGCTATGGGTCGGGTGCTGGTGGTGCTCATGGTGGTGGTTATGGAAGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGAGGCCATGGCCGACTCCGGCGACTCGTCCCCGCACTCCGCCGCGGCCACCGACGACGCGCACCACGAGGGCTCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGCGGCGCCCCCGCCACCGGCGCCGCCGGCGAAGGTGCGGTTGATGGTGAGCTACGGGGGGCGCATCCAGCCGCGGCCGCACGACCACCAGCTCTCGTACGTCAACGGCGAGACGAAGATCCTGTCGCTCGAGAGGCCCCTCCGCTTCGCCGACTTCGCCGCGCGGTTGGCCGGCCTCGCGGGTTCTCCGGGGGACTTCTGCGTCAAGTACCAGCTCCCCGGCGAGGACCTCGACGCGCTCGTCTCCGTCACCAACGACGAGGATCTGGAGCACCTCGTCCTCGAGTACGACCGCCTCCACCTGCTCCGCCCCGCGCCGGGATCTGGCGGCGGCTCGTCCCGCGGCGGTTCCACGCCCAGGCTCAGGGTTTTCCTCTCCCCCGTCTTCTTCATCCCCGCGCCGCCGCATGGCTACTTCACCACCGCCGCTGGCCCCGGCGCCACCTCCTTCCCCGCCGTCTACGCCGTCGTGCAGCACAATGGCAATGCCAATGCGAGCGGCAATGGCCCTTCCCCCGCCGCCGCGTCGAATGCTCAGGCCTACGCGCCGCAGGTGGCGTATGACAGCAATGGCCACGCCATCTACTACACCAGCGTCCTCCCCCAGTATGCTTCGGCTGTCAGCGGCGTGCCGGCGGCGGCCACCGTGCTCGGCACTGACCCAGCCAAGCCGGTGGCGGTGAAACCAACAGTTTCCTGAGCAGCATGCCAGTATCTTAACCTCGCCGCCGATGGGTTAAAAAACTAAAAAAGAGTTTGGCAATTTTCTCTGTCTAGTCCGTCAATATGCGTTAATATGTCAGTTGGATTCGTTATTGTCTCTAGTATTTACCTATAATATTCTTTTTCTCTCTCTCTCTTTTGTTTAGAGTTTTGGTTTTGGCCTTCATGATATGCGACTAGAGTTCTTGGTGTGCTTAGATGTACATAGTCTTTCTGGACATAATGGATATTATATTAGCCTATTGGATGAG]
[+] EMBL CF317090             [                                       GCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CF315076             [                                       GCTCACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAGGAACCCTCCTAGGTTATGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CF319963             [                                          CACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGTGGGTGGGTGGGTGAAGGGAGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CF308417             [                                          CACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CF321267             [                                          CACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGNCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CF320820             [                                          CACTGAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CF337173             [                                              GAAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL OSC13711             [                                               AAGTAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGNAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL OS0051A              [                                                  TAGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTCGCTCTTCCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGTCCACCAGTGCAAGACCCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTGCGTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTCCTGCCCGTGGCGGGTATGGGCGTCGTGGAGGCGCGCGGCGGCGGTGGTGGTG ATGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL OSC18181             [                                                   AGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTGAAGGGTTGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGTCTTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AU197532             [                                                   AGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTng                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CF314472             [                                                   AGCAACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CF337114             [                                                      AACGCAGCTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL OSC01351             [                                                         atgnCTCATCAGTGTCAAGATNGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATNGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCNNCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CF321649             [                                                              TCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGTCTGGGCAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL C26922               [                                                                   AGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCNATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTNCAAGAACCCTCCTAGGTNATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGNGGNGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL OSC00011             [                                                                                                GGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGT GGT GGT GGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTAC GT GGATCGGGCTATGGTTCTG GTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGTGGTGGAGGCG GCGGCGGCGGTGGTGGTG AGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
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>consensus_16503#0
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GGCTGTCAGCGGCGTGCCGGCGGCGGCCACCGTGCTCGGCACTGACCCAGCCAAGCCGGT
GGCGGTGAAACCAACAGTTTCCTGAGCAGCATGCCAGTATCTTAACCTCGCCGCCGATGG
GTTAAAAAACTAAAAAAGAGTTTGGCAATTTTCTCTGTCTAGTCCGTCAATATGCGTTAA
TATGTCAGTTGGATTCGTTATTGTCTCTAGTATTTACCTATAATATTCTTTTTCTCTCTC
TCTCTTTTGTTTAGAGTTTTGGTTTTGGCCTTCATGATATGCGACTAGAGTTCTTGGTGT
GCTTAGATGTACATAGTCTTTCTGGACATAATGGATATTATATTAGCCTATTGGATGAG

consensusID : consensus_16503#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 221
fasta sequence

                              [CGNACGTGTGGGGNTGAAGTAGCAACGCAGNTCATCAGTNTCAAGATGGCTACTACTAANCATTTGGNTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGTGGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGTGGATCGGGCTATGGTTCTGGTTCTGGGTA]

[+] EMBL OSC13092             [CGNACGTGTGGGGNTGAAGTAGCAACGCAGNTCATCAGTNTCAAGATGGCTACTACTAANCATTTGGNTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGTGGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGTGGATCGGGCTATGGTTCTGGTTCTGGGTA]




>consensus_16503#1
CGNACGTGTGGGGNTGAAGTAGCAACGCAGNTCATCAGTNTCAAGATGGCTACTACTAAN
CATTTGGNTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTTAGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACC
CTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGTGGTGGTGGTGAAGGAGGCGGT
GGTGGTTACGGTGGATCGGGCTATGGTTCTGGTTCTGGGTA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_16503#0      ACCACTGACATGGCTGAAGGAGTAGAAAACACTACCCAGCTCACTGAAGTAGCAACGCAG 60
consensus_16503#1      ------------------------------CGNACGTGTGGGGNTGAAGTAGCAACGCAG 30
                                                        **         ****************

consensus_16503#0      CTCATCAGTGTCAAGATGGCTACTACTAAGCATTTGGCTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTT 120
consensus_16503#1      NTCATCAGTNTCAAGATGGCTACTACTAANCATTTGGNTCTTGCCATCCTTGTCCTCCTT 90
                        ******** ******************* ******* **********************

consensus_16503#0      AGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGT 180
consensus_16503#1      AGCATTGGTATGACCACCAGTGCAAGAACCCTCCTAGGTTATGGCCCCGGAGGAGGAGGT 150
                       ************************************************************

consensus_16503#0      GGAGGTGGTGGTGGTGGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGTGGATCGGGCTATGGTTCT 240
consensus_16503#1      GGAGGTGGTGGTGGTGGTGAAGGAGGCGGTGGTGGTTACGGTGGATCGGGCTATGGTTCT 210
                       ************************************************************

consensus_16503#0      GGTTCTGGGTATGGTGAGGGAGGTGGTAGTGGAGGTGCTGCCGGTGGCGGGTATGGGCGT 300
consensus_16503#1      GGTTCTGGGTA------------------------------------------------- 221
                       ***********                                                 

consensus_16503#0      GGTGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTGAGGGTGGTGGCTCCGGCTCTGGCTATGGGTCT 360
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GGGCAAGGCTCTGGCTATGGTGCAGGTGTTGGTGGTGCTGGCGGGTATGGTAGTGGTGGC 420
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GGAGGTGGTGGTGGCCAAGGTGGTGGTGCTGGCGGCTACGGGCAAGGGTCTGGCTATGGT 480
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      TCCGGCTATGGGTCGGGTGCTGGTGGTGCTCATGGTGGTGGTTATGGAAGTGGTGGCGGT 540
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GGCGGTGGCGGTGGAGGCCATGGCCGACTCCGGCGACTCGTCCCCGCACTCCGCCGCGGC 600
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      CACCGACGACGCGCACCACGAGGGCTCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGCGGCGCCCCCGCC 660
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      ACCGGCGCCGCCGGCGAAGGTGCGGTTGATGGTGAGCTACGGGGGGCGCATCCAGCCGCG 720
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GCCGCACGACCACCAGCTCTCGTACGTCAACGGCGAGACGAAGATCCTGTCGCTCGAGAG 780
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GCCCCTCCGCTTCGCCGACTTCGCCGCGCGGTTGGCCGGCCTCGCGGGTTCTCCGGGGGA 840
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      CTTCTGCGTCAAGTACCAGCTCCCCGGCGAGGACCTCGACGCGCTCGTCTCCGTCACCAA 900
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      CGACGAGGATCTGGAGCACCTCGTCCTCGAGTACGACCGCCTCCACCTGCTCCGCCCCGC 960
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GCCGGGATCTGGCGGCGGCTCGTCCCGCGGCGGTTCCACGCCCAGGCTCAGGGTTTTCCT 1020
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      CTCCCCCGTCTTCTTCATCCCCGCGCCGCCGCATGGCTACTTCACCACCGCCGCTGGCCC 1080
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      CGGCGCCACCTCCTTCCCCGCCGTCTACGCCGTCGTGCAGCACAATGGCAATGCCAATGC 1140
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GAGCGGCAATGGCCCTTCCCCCGCCGCCGCGTCGAATGCTCAGGCCTACGCGCCGCAGGT 1200
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GGCGTATGACAGCAATGGCCACGCCATCTACTACACCAGCGTCCTCCCCCAGTATGCTTC 1260
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GGCTGTCAGCGGCGTGCCGGCGGCGGCCACCGTGCTCGGCACTGACCCAGCCAAGCCGGT 1320
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GGCGGTGAAACCAACAGTTTCCTGAGCAGCATGCCAGTATCTTAACCTCGCCGCCGATGG 1380
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GTTAAAAAACTAAAAAAGAGTTTGGCAATTTTCTCTGTCTAGTCCGTCAATATGCGTTAA 1440
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      TATGTCAGTTGGATTCGTTATTGTCTCTAGTATTTACCTATAATATTCTTTTTCTCTCTC 1500
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      TCTCTTTTGTTTAGAGTTTTGGTTTTGGCCTTCATGATATGCGACTAGAGTTCTTGGTGT 1560
consensus_16503#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16503#0      GCTTAGATGTACATAGTCTTTCTGGACATAATGGATATTATATTAGCCTATTGGATGAG 1619
consensus_16503#1      -----------------------------------------------------------