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Oryza sativa
cluster # 17755 cluster # 17755       Sequences # 406       consensus # 54


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_17755#0 length = 5760 sequences # 3  
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consensusID : consensus_17755#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 5760
fasta sequence
                              [CATCTCTCCCTCCCCCTCTCCCGCCTCCACCCCCTCGCGCCGCCGCCTCCACCCCCTCGTGCCGCCATGCCCGCGTCCACCTCCGCCGCCGTCGCGTCGCCATCTCCGAGCTCCTCCGTCTCGCGCCGCCGCTGCCTCCGCCTCCCCCTCCGTCTCGCACCGCCGCCGCCTCCGCCGTTGCCGAGCGCCTTCCCCTTGCGGCACGCCAAACCCTAGCCGCCGCCCGCTCCCTCTCTCTCCCGCGCCGCCGCCCACTCCCTCTGCGTCTCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCATCCCCACCGCCTTCAAACCCTAGCCGCCGTCCGCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCGCGCCGCCTCCCACTCCCTCCGCCGTCGCCGCCGCCGCAGCCGCTGCCGCATCCATCCCCGCCGCCGTCAAACCCTAGCCGCCGCCGCCCACGTCCCCGCCCTCCCGGACGCCGCCGCGGGGACGGCGGGGGGCGTGGAGGTGGGGATCTCCTGCGAGCTGTTCCACTCCGCGGTCGTCGTCGACGGCGGCGCCTGGGTGTGGGCCAAGGGTGACGGGGGCCGCCTCGGCCTCGGGGACGAGTCCTCTGCCTTCGTCCCGCGCCACAACCCCAACCTCAGCGAGCTCCGCGTCCTCGCGCTCGGCGGCACCCACTCCGCCGCCCTGACCGCCTCCGGGGAAGTCTTCACATGGTGAGGAAACCACCACCACATTGCTCATTTGAAATGCCTGAGGGCTATGGTGGATTTGGAGCTTTGGGACATTATGTTTACCATAGGGAATTGTTGCCAAGGAAAGTGAATGGTCCTTGGGAAGGGAAGATATCACACATTGCTACCCGTGGAGCACATACTGCGGCAATCACTGACTCAGGTGAGCTCTACAATTGGGGTTGTGATGAAGGCGATCGTAGGTTGGGGCTTGGAAGTAGAGGTGGTCCTGGTGCAGCTGGTTCTCTGAGTGTTCCTTCCAAGCCACCATGGGACTTGGAAATTGGTGATGCATTTATCATACATTATACTTATAGGTGTGACTATGATATGAAGGGTAAACTCACTCATGGCAAAGTTGCAGAATCGAGATTTGACAAAAGATCCTATGATAGTAAACCTCCCCCTAAAAATTTGCCATTGCCTCAAAATGGTTTACCTCAAAGCGTGAGGGAAAGGGAAGCTTACTTTGTTTTCTGAAAGCGAAAGGTTGGGCAAGCTCATTGAGTGTCGGTGGTTGCACTTATGGGACACAACGCTCCTCATATGCCTATATCTTTGAAATGTCTATCCGCCTTACTGATTCAGGACTGAAAAATGAAAACCAGCTGCCATTCAATATGGCAATGGTTCAGTTGCTGGGTTTTTCAACGAGGATAGTGTTACAATAGGTGATCTGGTTGTGAAAGATCAGGTATGCACTATATATCTCAGTTACTGATTATCTCTGATCATATACTCCAAAATATTTGAACACCGTTGCTTCACCGCTTTAGAAATTCATTGGAGTTACAAAGGAGCCAAGCCATATACTTTCATGGTTGCAAAATTTGGTGACAATCTTGGTCTCGGATTTCAGGAAATAGCTGTTTGGAGATGCAGTGCCTGTGTGGTAAGACAGCATGATCTATAGTGGTATGATATACTGGTAGTTCGGTCCATTCATTACAAGCTGCTCTTTTTCTTAAATTATTTGTGTTCTTTGGGCATTTTGCTCAATAAGGGTTAATCCTCGCAAAATATAATCTAATTCACCTCACTCCTTTTTAACCCGTTAAATTATCGCTATCACCTTCTATAGAGTTCCTTGCACGGAAACCTCTGTTCTGAAAAGCTGCAAATTATTTGTAGTTATGGTGTTTTTTTATGCATTCCATATTGGCCAAAGCATCGTCGGCTATGACCAAGTAGTCTGCACATGTGCAAGATTTGTGGGGTTTGGATATGTATTATTTCTCCCCACTATTGTTTCCTGATGTGCCTTGGTGTTGTTTCCTCATTTTATTTGTTCCATCTGACCGGCCATGTTGGTTGGTATCCAGTTTTCCCTTTAGTTGGATTCCAAAAATATTTGATATCCCCACTCACCTTCTCTTTGTAGTACCTGAGTCTTTTATGCAGCTTGTGTATTTCACAATTGACCCTTTGCAGGTGAATATTTGGCTTTGGCTGGTGAAAAATCAATGCAGCGGATACAATCGAACTCGAACTTGATACGCATTGTTCCATCTGTGGTGTAAGATCCTTTTGATTGCACTATAGATTTTTTATTTTTGGTGGTCTAACGCAGTAGGCTGACACTCCTTTTAACCAATCTATTGATTATCTATTCTTGGCTTGGACAATATGGAGATAGCGTGTCCGGACAAGAGTAGCATTATTTGTAGGTAGGACATACAAGAAGTAGATATATTTCTAATTTCTAAATTGTGAATGTATTATTAAGTGCTTTAGCATGTCATAAGTAGAAATTTGCTGGAATGGTAGATAATCATGCCCCCTTTTAAACATAGCATGGGAATTAGAGTAGGATCAGGATGCTTTCCTTTCCTTGGTAAAAATGTTCTTGACTGCATTTCAAAACTTAGACCATCATCTATTTCAGTGTAATACCATTATTCTGCAGAAACACACAAAACTATCATTGAATAGATAGTCCTATATTTATAAGGCATGTAATTCTTGATTCTTTTAATCAATCCAAGTGCTATTTTGCTGTGGTTCATGAATCTTTGCGTTACCTGTAAAGCTGTGGTTTATATATTTCTTTGGGAGCTGGATTCTCTTGGTAATTAACTCAATCACCTCTGTCATTGGTGGATTAACTGTCTTCATGCACCTTTACGCCATACATGCTTTATGTAGTGTGTAGGCCTCAGGGATAAAAATGTATTTAACAATATGGTGTATATACAAGCTTAGGCAAAATTTCCAGATACAAACTTACTCCTTTAGCCTTCTCCTAAAAATTGCTTACTATTATTTCCCTGGAGCTGTCCTCAATTTTCTCAACAACGCTCATATTCTAGATGTATTAGTTATAGCAAATAATGTGATTGCTCAGCAGGAAGTTCAAGGATATCTGAATATTTGTTGGCAAATGATGTGTTCAGTCCTAAGAATACTCTTGCACTGTTTCAGGCTTTGGTTCGCATAATAAACTGAGAAAATATTATGGGAGTCTTCTCTTCATTGCTGACCTAGGCAGCAAGGCATATGGATATGCCTTCAACCAACTCGAGAATTGCACTGTAAAATATCAAAAAAAAAAAAGGAAAGTGTTTGTGTTCTTATCAAGGTCTTTCTGTTGAGTTTTAAGGTTCAGAGTGAAGATCCCTTGATGGTCCATTTGTGTTGGTTTGGATCAACAACATGCCATGGGCTGCTGATACTAGCATGGCGGCTCTTGGGGCCAAGGTAATTGAATTCTTCGCTCTAACAATTGTTTCTCCAGTATTTTTTTTGTCCATATAGTATACTTTGTATTTCAAACCTATCTTCTTGGTGGGGGAAGAAGATCCATATTTCCACCTAGGGAATATAGTAGGCATGTTCATTTTCTGTTGACAAACCTGTGATTAGGACTAGCCATTAGCCTTATGTATTTACTGACCAAAATGTGGACATAAATCCTTTTCTATGGTTCTTGAATTTACACAGATCAAGAATAAGGATATTTCTACTTGGACATGTATACAACTTTAGTTGTAAAAACTTAGATGATGTTTAGCCATTTAGCCCATCATAGTACTTTCCGGTCTTTTATTATTCTGTTTCGTGTTGTAGCAAGGCAAACTTTATGATTTGTTCGTTGTAACCACTCTGAGGTAAGCATGATTTCTTTGACCGATGGAGGTAGACCGTCTTGTGATTTGAAGAAAACAATTGGTATGTTGATAATGCTAAAAGAACGCTTAATTGTGCATGTAATTTGTTATAGGGAACTAGATTGAACTAGGTTTATTTTTTGTTGTCTGGTTTGTTCATCATTTTTTTACAGCCAAAGTAATAACCAAGGTTCTTGCTTCAAAATTTTGTTGTTACTCTAATACCAGTCAATATTTCAGTGATATCTATTAAATTACTTCTCCGAAGCTACATTCGAACTCAGCAAGTCACCCTATCCTATTTAACTGGTTTCTTTTTTACAGCATTAAATATATGCTATTTTGCCCATGTAACGAAGAGCAGTTAATTTGGGGATCACTGATCAGTGATCACATAAGCATCCATTTTTTCTGCTGAAAAAACAAAACAAACACTTTTTGCAAAAGCATTTGCTGGATAATCTATCTATTTGGTTTATTTGAAAAAAAAACTTCCACTCATGGTATATTTCTATTTAGGAAAATGAGCTTATGTTTCCTTGCTCATTTTTTCATTAAAAGGCTTTCCATCAAGTATACATTTTGAACGGCACCATGGTTTGCTACTGCCTAACTGCCTTTCTAGCTGATGTTTGATCATGTATATTTTAGAATTACTTTACAAAAGGCATTGGCATTGTCCTTATAGGGACTTGGGAGATGATCATCGTTTTAATCTTCTACTTGAAATTCTTTTACAAGTATCTCTTTAAATTGAAAGATTTTGATAAAGGGTGCAAAAAGGGTACAAACCAGAAAGCACTGTTGACTTGTCTTGTATTGAAAATGCTTTGCAAGGATAGATCTACTAGCTATTGAACTGAGTGTAAATAAAGGTCCTGTATATTGTATAAATTCAGTGGAAAGTTACACGTAATGTCTAGCTGTGCTTGCGACCATATGGCATTGACTAATATTTGATGCATTTTGTCTATGTAGGTCTTACAAAAGGTTTGATCTGCTGGTCTACTGAAGAAAACATTATTTAGTGTTGCCTACAAATTAATAGTTTCAGTGAGGTAGCTGTCGATGTCAGAGCACCAAGTGCTTATGGATCTTACCTAAATGTTTGCCGGAGGTTGTTCATCGGTCACAACAAT-CCTCATCATGTTTTCATGTCAACTATT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[-] EMBL CB629901             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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CCTCATCATGTTTTCATGTCAACTATTTTAGCCCTTGTTCCCATCAATTAGTTAACTTTTGGAGCTAAAAGCTTCCGATAAAAAAACTGCAGGGGTATGACTAGAGATCACATAAATATGACTGATCAATGCTCTACAATACATGCTACTCCTACTTCATCTAGCCACATTGTGTCGTCGGAATATACATGCAGCCAGGTTAAATAGATTTATTTGGAAAGCTTATTGTCTTTCAGCAACAAATATACATGTTTGTTTGGCATCGTTTTGAGCCTCTTTACAGGTACTGATTTACCTTTAATTCTATAAAAAATGTTATATTCATTATAGAATTATCTTGAGCTTTGTCAATGTCACCTTAGTTATTCCAAAGGTATAACTGATTTATTTCATGAAACTATGCTGTTATCTATCTTGATAATTAGTTCCATGTCCTTTGCTTCAATAGCAGCAATGCAGTTTCAGCTTCTCCCAAGGAGAAAGCTGTAGTAAAAAAAAGAGGACAAAGTAATGTGATGCCTGCTAATGCACCTCATCAATTTGTTGGCACTCTGCCGCCTGGAACCTGAAGATTATATAGTTGTTGTTCATGTCATAGTGGCAATGTTTACTCTCCCTATATTATTCCAGTGTTTGCAAACACATCTATATCGTAAGCCATGTATACTCTTTGCACTTGTCTAATTACATTGCCAGTGTGCCTCATAAACACAGTTGCATGTACACACGCATATATATTAGAAACACGCGTCTACCGTTCAAAGTAATTGGATCTGGTCCGGTTATATG]
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fasta sequence
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[+] EMBL AK120633             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[+] EMBL CF314215             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTACAAGTATCTCTTTAAATTGAAAGATTTTGATAAAGGGTGCAAAAAGGGTACAAACCAGAAAGCACTGTTGACTTGTCTTGTATTGAAAATGCTTTGCAAGGATAGATCTACTAGCTATTGAACTGAGTGTAAATAAAGGTCCTGTATATTGTATAAATTCAGTGGAAAGTTACACGTAATGTCTAGCTGTGCTTGCGACCATATGGCATTGACTAATATTTGATGCATTTTGTCTATGTAGGTCTTACAAAAGGTTTGATCTGCTGGTCTACTGAAGAAAACATTATTTAGTGTTGCCTACAAATT     TTTTCAGTGAGGTAGCTGTCGATGTCAGAGCACCAAGTGCTTATGGATCTTACCTAAATGTTTGNNCGGAGGTTGTTCATCGGTCACAACAATCCTCATCATGTTTTCATGTCAACTATTTTAGCCCTTGTTCCCATCAATTAGTTAACTTTTGGAGCTAAAAGCTTCCGATAAAAAAACTGCAGGGGTATGACTAGAGATCACATAAATATGACTGATCAATGCTCTACAATACATGCTACTCCTACTTCATC                                                                                                                                                                                                                               ]


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[+] EMBL CB669616             [                               GCCGCCGCCTTGGACACCCCTCGCGCCGCCGTCCCCGCCTCCGCCTCACACCGCGGCCCCTCGCCACCGTCCCTGCGTCGCGCTCCCACCTCCGTCTCCGCCCCTCGCCGCCGCCCCGCCTCTTCCTCGCGCCGCCACCGCCGCCGCCTCCGCCTCGCACAGCCGCCATCCCCGCCTCCGCCTCCTGCCGCCGGCGTAAGAATCCagcct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB647471             [                                                                                                                                                                                                                                              CCACATGGAAGGGGCGGCCTCGGGTGGAGCTGGTGTCGTTGCCGCGACCTCATTGGCTAAAGGCCGGTTGTCCGTCGATCTAGAGGAGGGAGAGGTGACAGCAGCAGTAAAGAGTGGGAAGGGGCTGTCAACGGCAGTATGGGGGAGAAGCGTTGGAGCCCGCTTCCCCTACTCTCACAGGGGCCGCCGCTGTCGAACCTGTGTTACCTGGGGGCGGAGTTCAGGTTCCAGCGGGTGGAGCTCGGGGCGGAGATGATGACCGACGGTGAGGCAGTTCGATGAGCGCCATATCTGCTCTTCTACAAGGGCCCCAAGGTCTGTTCGTCCCAGGTCGATGCTAAGGAATCTGACCACCTATGTTGCTTTCTTGCCGCTGCCATCAAGACACCAAGTCGAGCTTCAAGAAGGGCACGTACTGGATGGATGCAGATGTGGTAACAGCCTTCGAGCTAAGCCGGGCCATCGACGATGGAGTGCTGCAGCCTTTGCCCTTTGGTTCGCTGACATGCTGTTCCTTCTATGTGAGGTTGCCAGTACCACGGACTCGCCGTCAGCACTGTGCAACGTCATCCTTCTGCGCTAGACTGACTCCACCCTCTGCTGAGTGAGATCGCGTGCTTTTTCCACTCGCTACAAGTCCGAGCAGCCAAGCACTTATCGCAAGAATGGAAAACCAGCTGCCATTCAATATGGCACTGGTTCAGTTGATGGGTTTTTCAACGAGGATAGTGTTACAGTANGTGATCTGGTTGTGAAAGATCAGGTGAATATTTGGCTTTGATTGGTG AAAATTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CF305159             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAAATTTTGTCTCAATAGGCAATGTGAGTTCAGGCTTCAGTAGTACCAGAGTGATTATTGATAACTACCGAGATGTCCACGTCAGAGTGGTACGAGCTCCAGATTAAGAAGAACAAGCTTTGTGACATGTTTGATGAGGGACCTAAGCAAGAATAACTTCATGAGCTCACCAGCACCGGGTGATGGGTTTCCAATAGTAACATCCCTAACCACCTTATTTATGAATAGAGATCAACTTACTGGAACAAACCATATTGAGTTCTCCGCAAATGGACCATTTAAATATCAAGTTGCTTATCAAAATCTAGGCCTCCTTGGTGATGATCGTGAGTGGTATTTTGCAATTGCTGATGTTGCATCGTGTGCACTTCCTTACCAACTTTGTCTTCCAGTTAAGATCTGAGAATGCATCTCTGGAAAAGTGCCTGGCTGAGATGACTCANAAATATAAGCAGTCTACGATAGAAAATGGCAATCTTTGAGATGACGT