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Oryza sativa
cluster # 2180 cluster # 2180       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2180#0 length = 4078 sequences # 2  

consensusID : consensus_2180#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 4078
fasta sequence
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>consensus_2180#0 TGCATCGTCTGAATGCTAAGATTAAGACGGAAGGACAGCCGGAATGGGGATATGGCTAGT GCAACAGCAGGGTGGATGAAGATATGCAGGGATGGGGACAATGCAGGAGGTGAGGGAACG GTGGCTGCTAACAGCAACACCGGCGTGGATGAAAGCTCAGAATTTGAGCTGAAGGATGGA GCGCTGCCATTCTACATATTGGATGCATACGAGGAGCCTTTTGGTGCTAATTCGGGCACA GTATATTTGTTTGGAAAGGTTGAAGTAGGCAAGCGGTTCCACAGTTGTTGTGTGGTTGTA AAGAATATGCAAAGGTGCATATATGCTATTCCAAGCAGTTCAATCTTCCCAAGGGACACC ATATCAAGGCTAGAGAAGAATTCCACTACTTCTGATTCTTCTCCATCACTTCGAGCAAGT CTACATGAGTTAGCATCAGGATTGAAGAGCGAAATAGCTGATAAGTTGTCAGACTTCAAC GTGTCAAATTTTGCAATGACTCCAGTCAAGAGGAACTATGCATTTGAGAGGACTGATCTA CCAAATGGGGAGCAGTATGTCTTGAAGATAAATTACCCATATAAGGATTCGGCGCTACCT ACAGACCTTCGAGGTCAACATTTCCATGCATTACTTGGGACGAACAATAGTGCTCTTGAA TTGCTTCTCATCAAAAGGAAGATCAAGGGGCCTTCATGGCTTTCGATCTCCAAATTTTTG GCATGTCCAGCTACTCAGCGGGTCAGCTGGTGTAAATTTGAAGTTACAGTTGATAGTCCC AAAGACATATCTGTTTTGATGACAAGTACCACGTTAGAAGTTCCTCCTGTCGTGGTTGCA GCAGTTAATCTTAAAACTATCATAAATGAGAAACACAATGTGCATGAAATTGTGTCAGCA TCAGTCATATGCTGTCACCGTGTGAAAATAGATAGTCCAATGCGTTCTGAAGATTGGCAG AAACGGGGAATGCTCAGCCATTTTACTGTTATGCGCAAGCTTGAAGGCAGTATATTTCCT ATAGGCCTCTCCAAGGAATCCTCTGATAGGAACCAGAAGGCTGGTAGCAATGTGCTGGCA CTCGAGAGCAGTGAACGTGCATTGTTAAACCGCTTGATGATCGAGCTTAGCAAACTTGAT TGCGATGTACTTGTGGGACACAATATTTCTGGATTTGACTTGGACGTCCTTTTGCACCGT GCACAGACTTGCAAAGTACCAAGCAATATGTGGTCCAAGATTGGTCGTCTTAGGCGCTCA GTAATGCCCAGACTCACCAAAGGGAACACACTTTATGGGTCTGGGGCAAGTCCAGGAATT ATGTCCTGCATTGCTGGTCGTCTCCTCTGTGATACCTACTTATGCTCTCGCGATCTCCTG AAGGAGGTGAGTTATTCTTTGACACAACTTGCAGAAACACAATTGAAAAAGGAGAGGAAA GAGGTCTCTCCACATGATATTCCCCCAATGTTCCAATCTTCAGGAGCACTTCTCAAGCTG GTTGAATATGGCGAGACTGATGCATGTCTTGCTTTGGAGCTCATGTTTCATTTGAGTGTT CTCCCGCTTACACGCCAATTGACAAATATCAGCGGTAACCTGTGGGGAAAAACTCTCCAG GGTTCTAGAGCTCAAAGGGTAGAGTATCTGCTGTTGCATGCATTCCATGCAAGAAAATTT ATTGTACCGGACAAGTTTGCACGCAGTAAAGAGTTTAACTCTACAAAACGAAAAATGAAC CCTGATACCGAGGCTGCAAGACCTGATGAAGCTGATCCTTCAATTGATGACGAGGGACAT CATGTTGATCAAGGTAAAACGAAAAAAGGTCCTTCATATGCTGGTGGCTTGGTTTTGGAG CCTAAAAAGGGTCTATATGACAAGTATGTGCTACTTCTGGACTTTAACAGCCTTTACCCT TCGATAATTCAGGAATACAATATCTGCTTTACTACTGTTGACCGTTCTGCTGATGGCAAT GTCCCTAATTTGCCCGCTTCAAAGACCACTGGTGTTTTGCCTGAGTTGCTAAAGAGTTTG GTGGAGAGGAGAAGAATGGTTAAATCATGGCTTAAGACTGCTTCTGGTCTCAAAAGGCAG CAGTTTGACATCCAACAGCAAGCTTTGAAGCTTACCGCAAATAGCATGTATGGCTGCTTG GGCTTTTCCAATTCCAGGTTTTATGCAAAGCCACTTGCTGAGCTTATTACACTGCAAGGA AGAGAGATATTGCAAAACACTGTTGATCTGGTTCAGAATAACTTAAATTTGGAGGTTATC TACGGTGACACAGACTCTATAATGATACATACTGGTCTGGATGACATCTCCAGGGCAAAA GGAATTGCAGGAAAAGTCATTCAGGAGGTGAATAAAAAATACCGCTGTCTGGAGATTGAT CTTGATGGGATATACAAAAGAATGCTGCTTCTCAAAAAGAAGAAATATGCTGCCATTAAA GTTGCATTAGATGGTAGCTTACGAGAGAACATTGAGCGCAAGGGACTTGATATGGTCAGA CGTGACTGGAGTTTGCTGTCAAAAGAAATTGGAGATTTTTGCCTGAATCAAATTTTGTCT GGAGGGTCATGTGATGACGTTATCGAGTCAATCCATAGTTCTCTCGTGCAGGTGCAAGAG CAGATGAGAGGTGGCCAAACAGAATTAGAAAAATATATCATTACAAAGAGCTTAACAAAA GCACCAGAAGATTATCCAGATGCTAAAAACCAACCTCATGTTCAGGTTGCTTTAAGACTG AAGCAAAATGGTTATTCTGGGTGCTCTGCAGGTGATACAGTTCCCTATATAATTTGCTCT CAACAGGATTCAGAGAGTACACATTCAGAGAGAATAGACTCTCAAAGAGCTCAGAGAGAA CCAGAGGGCTGGAAGAACCTGTACACAATGGTGTGTTTGAGAATATTAGCATCATATTAT CTGCAGCAGAGAATCAATCCTGTAGTTTCCCGTGTGTGTGCCGCAGTATCCAGGGGCACA GAGCCAGCTCGCCTGGCTGAATGCCTTGGGCTTGATTCATCCAAGTTCCAATCAAGATTG ACTGAGTCTGATAATCAAGATACGTCTAGCATGCTCTTGTCTGTAATTGATGATGAAGAT GAGAGATATCGTGGTTGTGAGCCCCTGCGATTATCATGCCCAAGCTGTTCTACTACCTTT GACTGCCCCCCTGTGTCTAGTCTGATTATTGGTTCTAGCTCTGGAAATGTATCAAATCCA AATGAAGGAAATGATGCTTCCATTAATTTTTGGCGTCGGATGCGGTGCCCAAGATGTCCA GATGACACTGATGAGTCCAGAGTTTCTCCTGCAGTACTTGCAAACCAGATGAAAAGGCAG GCTGATAGTTTCATCAATCTATATTATAAAGGTTTACTGATGTGTGATGATGAGGGTTGC AAATACTCAACGCACAGTGTGAACCTTAGAGTGATGGGGGACTCTGAGAGAGGAACCATC TGCCCCAACTACCCACGCTGCAATGGCCACCTAGTGAGACAGTATACGGAGGCAGATCTA TACAGGCAATTGTCATACTTTTGCTATGTAGTTGATGCAACTCGATGTCTTGAGAAGTTG GACCAGAAGGCGCGGCTTCCTTTTGAGAAAGAATTTGCGGCATTAAGCCAAACTATTAAC TTGGCATTAATGGAGGTTCAGAAAATCCGAGACAGATGTGCATTTGGCTGGGTTCAGTTG AAGGATCTTGCAATATCAATCTGATGAATTCCTTGTCCTTTGTAAACGTCAACCCTCAAA TATCGGTGAATGAGCTAAGAATTCCTCATAGGACGTGCAACGTTGTGTTCTTGTGTTGTA GAAGCTACATCACATGCTGAGTTGCAGACATCCAAATTACAAGATAGTAGGCTGTTCCGT GAGGGTGTTTCTCAACCTGTAAAGTACAGAATTTTCGTAGTATATTTCATTTGAATTCAA ATGTTATAGCTGTTGCTTGGGAGCAGACCCAGATGAGTACCTTTCGTAGTGTTATTTAGT GAGTGAATGTACCATGCTAAACTTGTAAATATGGTGTAGCAATATAAGATCCCAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)