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Oryza sativa
cluster # 2221 cluster # 2221       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2221#0 length = 353 sequences # 2  

consensusID : consensus_2221#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 353
fasta sequence
                              [TGGTGCTGCTTAATATGGAGAATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACATACTGAGCGCTATTATTTCTCCTTTGAGAACCAAGCCAGTATTCTGATTCTCCAAATATTATGCAGGCATTTCCTTCTATTTTGAGCAAGCAGTGGTTGTTTCCTAGAGTATGATGGATGTATTGATATGTTCAATTGTTTAGCTTGCGTATGATAACACAGATAATTGTCTATTATTATCTTTGCAAATTTGTTGCTCCATGTTGAAACCTTTAGCGTTGAAAACTGGTTACCAGTGGGATTTAGTACCCGATTGTGTATGAGTCATAATAATTCTCCATACAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU032098             [TGGTGCTGCTTAATATGGAGAATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACATACTGAGCGCTATTATTTCTCCTTTGAGAACCAAGCCAGTATTCTGATTCTCCAAATATTATGCAGGCATTTCCTTCTATTTTGAGCAAGCAGTGGTTGTTTCCTAGAGTATGATGGATGTATTGATATGTTCAATTGTTTAGCTTGCGTATGATAACACAGATAATTGTCTATTATTATCTTTGCAAATTTGTTGCTCCATGTTGAAACCTTTAGCGTTGAAAACTGGTTACCAGTGGGATTTAGTACCCGATTGTGTATGAGTCATAATAATT                   ]
[+] EMBL AU081360             [ GGTGCTGCTTAATATGGAGAATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACATACTGAGCGCTATTATTTCTCCTTTGAGAACCAAGCCAGTATTCTGATTCTCCAAATATTATGCAGGCATTTCCTTCTATTTTGAGCAAGCAGTGGTTGTTTCCTAGAGTATGATGGATGTATTGATATGTTCAATTGTTTAGCTTGCGTATGATAACACAGATAATTGTCTATTATTATCTTTGCAAATTTGTTGCTCCATGTTGAAACCTTTAGCGTTGAAAACTGGTTACCAGT GGATTTAGTA CCGATTGTGTATGAGTCATAATAATTCTCCATACAAAAAAAAAAA]


>consensus_2221#0 TGGTGCTGCTTAATATGGAGAATATGATGATCCTTTCCCCAGATGATCGACAATGAACAT ACTGAGCGCTATTATTTCTCCTTTGAGAACCAAGCCAGTATTCTGATTCTCCAAATATTA TGCAGGCATTTCCTTCTATTTTGAGCAAGCAGTGGTTGTTTCCTAGAGTATGATGGATGT ATTGATATGTTCAATTGTTTAGCTTGCGTATGATAACACAGATAATTGTCTATTATTATC TTTGCAAATTTGTTGCTCCATGTTGAAACCTTTAGCGTTGAAAACTGGTTACCAGTGGGA TTTAGTACCCGATTGTGTATGAGTCATAATAATTCTCCATACAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)