cluster # 2846

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Oryza sativa
cluster # 2846 cluster # 2846 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2846#0 length = 509 sequences # 2

consensusID : consensus_2846#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 509
fasta sequence

                              [CCGCCGCGGAGCTCGCCGAGCGCCGGCGATTCGCAGAGAAGTACCATTACGACATTGCCCTCGACCGCCCGTTGCAAGGCCGCTACGAGTGGGAGCCACGTGTAGCACGTGAAAGGGAGGGGTAGAAGTGTCAACTCAACTCACACCCATGTCTGC-ACTCACACAGTGATGCCAAGCTAGCTTAATCATCAGCAGCTAATTATCTGGGAGAGGCTGGGGATCGAGTTAGTGACCTTGTTTCTCCTGCTAATTCTCA-ATT-AGGGAATTAATTAATTACTCCTC-ATCCTCATCTCCACCCTGTTGTCAGTTGGATCTCACTACCATATATATCTCAGCTCTGTCAATTAATCTTTTGTATAGTTGGTAGGAAATAATCAAGGATAATCCACGGTGATTTGGAGGATGCTTCTGATGAGCTCCCCTCTTGCTAATTACTAATATGTATCTTCCACATAATTTC--CCTAATTTACTGTTTATTACTACTTATTAACCCCCTTCCAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI804168             [CCGCCGCGGAGCTCGCCGAGCGCCGGCGATTCGCAGAGAAGTACCATTACGACATTGCCCTCGACCGCCCGTTGCAAGGCCGCTACGAGTGGGAGCCACGTGTAGCACGTGAAAGGGAGGGGTAGAAGTGTCAACTCAACTCACACCCATGTCTGC ACTCACACAGTGATGCCAAGCTAGCTTAATCATCAGCAGCTAATTATCTGGGAGAGGCTGGGGATCGAGTTAGTGACCTTGTTTCTCCTGCTAATTCTCA ATT AGGGAATTAATTAATTACTCCTC ATCCTCATCTCCACCCTGTTGTCAGTTGGATCTCACTACCATATATATCTCAGCTCTGTCAATTAATCTTTTGTATAGTTGGTAGGAAATAATCAAGGATAATCCACGGTGATTTGGAGGATGCTTCTGATGAGCTCCCCTCTTGCTAATTACTAATATGTATCTTCCACATAATTTC  CCTAATTTACTGTTTATTACTACTTATTAACCCCCTTCCAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI803862             [                                                              cACCGCCCGTTGCAA GCCGCTACGAGTGGGAGCCA GTG AGCACGTGAAAGGGAGGGGTAGAAGTGTCAACTCAACTCACACCCATGTCTGCAACTCACAGAGTGATGCCAAGCTAGCTTAATCATCAGCAGCTAATTATCTGGGAGAGGCTGGGGATCGAGTTAGTGACCTTGTTTCTCCTGCTAATTCTCACATTGAGGGAATTAATTAATTACTCCTCAATCCTCATCTCCACCCTGTTGTCAGTTGGATCTCACTACCATATATATCTCAGCTCTGTCAATTAATCTTTTGTATAGTTGGTAGGAAATAATCAAGGATAATCCACGGTGATTTGGAGGATGCTTCTGATGAGCTCCCCTCTTGCTAATTACTAATATGTATCTTCCACATAATTTCCGCCTAATTTACTGTTTATTACTACTTATTAACCCCCTTCCAAAAAAAAAA]




>consensus_2846#0
CCGCCGCGGAGCTCGCCGAGCGCCGGCGATTCGCAGAGAAGTACCATTACGACATTGCCC
TCGACCGCCCGTTGCAAGGCCGCTACGAGTGGGAGCCACGTGTAGCACGTGAAAGGGAGG
GGTAGAAGTGTCAACTCAACTCACACCCATGTCTGCACTCACACAGTGATGCCAAGCTAG
CTTAATCATCAGCAGCTAATTATCTGGGAGAGGCTGGGGATCGAGTTAGTGACCTTGTTT
CTCCTGCTAATTCTCAATTAGGGAATTAATTAATTACTCCTCATCCTCATCTCCACCCTG
TTGTCAGTTGGATCTCACTACCATATATATCTCAGCTCTGTCAATTAATCTTTTGTATAG
TTGGTAGGAAATAATCAAGGATAATCCACGGTGATTTGGAGGATGCTTCTGATGAGCTCC
CCTCTTGCTAATTACTAATATGTATCTTCCACATAATTTCCCTAATTTACTGTTTATTAC
TACTTATTAACCCCCTTCCAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case