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Oryza sativa
cluster # 2892 cluster # 2892       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2892#0 length = 819 sequences # 2  

consensusID : consensus_2892#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 819
fasta sequence
                              [CCACCCACCATGCCCTCCTCCTCCTCGCCGCCCCCGCCGCCGCCGCCGGCGACCACCGCAACTCCACGCCGGCGCCGCCGCCGGCGGCTCCTCCCGTCGTCGGCAGGCGGCGGAGGCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCACCAATTCGTCGTCGTCGTCGCCATTCGTCTCCTTCCTCCCGCCGCCCACGTCGCCGTCGCCGTTCCACCGCTTCCTCCCCTCCCCGCTCCGCGCCTCCTCCGTCCCATTCTCGTGGGAGCACCGCCCCGGCATCCCCAAGACGCCGGCGAGGTCATCCCGCTCCTCCTCCAAGCAGCCGCCGCCCGGCGTCGTCGGCGGCGGGAAGCACTACCCCTCCGCGCCGCCGCTCCCGCTCCCGCCCTCGCTCCTCTCCAGGGCGGCCTCCGACCCCTACGCCTCCGCCGTCGTCCCCGCCGAGTACGCCGCCTCCGGCGCAATGCCGCCGCATCCGCCGCCGGGCTACTACTACCCCGCCGGGGCGAAGGCCGCCCGCCGTCTCCGGCTCCGGCGCCGCCGGCCGCGGCTCGCCGACGCCCTCGCCGAGTGGCTCTCCGTGCTCAGCCTCTACCGCTCCTGCAAGCGCGTCGCCGCCTG-CTTCGCCGCCAAGGCCAAGCCGCCGCCGCCGGCGCCGGCGCCATGAGAGCTCGCGCGCGTGCCATCTCTCTCTACTACTCGTGTACGTTTTACTATTATTAGTTTATATGATTATTATTGTGGGTTTGGATTTGTGTTTTGGTGTAATTAATCAATTCGTGTGATTAACTAAGATGGGAGTATCATACATGAACAACAAGATTCT]

[+] EMBL AK063102             [CCACCCACCATGCCCTCCTCCTCCTCGCCGCCCCCGCCGCCGCCGCCGGCGACCACCGCAACTCCACGCCGGCGCCGCCGCCGGCGGCTCCTCCCGTCGTCGGCAGGCGGCGGAGGCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCACCAATTCGTCGTCGTCGTCGCCATTCGTCTCCTTCCTCCCGCCGCCCACGTCGCCGTCGCCGTTCCACCGCTTCCTCCCCTCCCCGCTCCGCGCCTCCTCCGTCCCATTCTCGTGGGAGCACCGCCCCGGCATCCCCAAGACGCCGGCGAGGTCATCCCGCTCCTCCTCCAAGCAGCCGCCGCCCGGCGTCGTCGGCGGCGGGAAGCACTACCCCTCCGCGCCGCCGCTCCCGCTCCCGCCCTCGCTCCTCTCCAGGGCGGCCTCCGACCCCTACGCCTCCGCCGTCGTCCCCGCCGAGTACGCCGCCTCCGGCGCAATGCCGCCGCATCCGCCGCCGGGCTACTACTACCCCGCCGGGGCGAAGGCCGCCCGCCGTCTCCGGCTCCGGCGCCGCCGGCCGCGGCTCGCCGACGCCCTCGCCGAGTGGCTCTCCGTGCTCAGCCTCTACCGCTCCTGCAAGCGCGTCGCCGCCTG CTTCGCCGCCAAGGCCAAGCCGCCGCCGCCGGCGCCGGCGCCATGAGAGCTCGCGCGCGTGCCATCTCTCTCTACTACTCGTGTACGTTTTACTATTATTAGTTTATATGATTATTATTGTGGGTTTGGATTTGTGTTTTGGTGTAATTAATCAATTCGTGTGATTAACTAAGATGGGAGTATCATACATGAACAACAAGATTCT]
[+] EMBL AU161362             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCCGAGTGGCTCTCCGTGCTCAGCCTCTACCGCTCCTGCAAGCGCGTCGCCGCCTGTTTTCGCCGCCAAGGCCAAGCCGCCGCCGCCGGC CCGGCGCCATGAGAGCTCGCGCGCGTGCCATCTCTCTCTACTACTCGTGTACGTTTTACTATTATAAGTTTATATNATTATAATTGTGGGTTaaaa                                                                           ]


>consensus_2892#0 CCACCCACCATGCCCTCCTCCTCCTCGCCGCCCCCGCCGCCGCCGCCGGCGACCACCGCA ACTCCACGCCGGCGCCGCCGCCGGCGGCTCCTCCCGTCGTCGGCAGGCGGCGGAGGCTCC TCCTCCTCCTTCTCCTCCACCAATTCGTCGTCGTCGTCGCCATTCGTCTCCTTCCTCCCG CCGCCCACGTCGCCGTCGCCGTTCCACCGCTTCCTCCCCTCCCCGCTCCGCGCCTCCTCC GTCCCATTCTCGTGGGAGCACCGCCCCGGCATCCCCAAGACGCCGGCGAGGTCATCCCGC TCCTCCTCCAAGCAGCCGCCGCCCGGCGTCGTCGGCGGCGGGAAGCACTACCCCTCCGCG CCGCCGCTCCCGCTCCCGCCCTCGCTCCTCTCCAGGGCGGCCTCCGACCCCTACGCCTCC GCCGTCGTCCCCGCCGAGTACGCCGCCTCCGGCGCAATGCCGCCGCATCCGCCGCCGGGC TACTACTACCCCGCCGGGGCGAAGGCCGCCCGCCGTCTCCGGCTCCGGCGCCGCCGGCCG CGGCTCGCCGACGCCCTCGCCGAGTGGCTCTCCGTGCTCAGCCTCTACCGCTCCTGCAAG CGCGTCGCCGCCTGCTTCGCCGCCAAGGCCAAGCCGCCGCCGCCGGCGCCGGCGCCATGA GAGCTCGCGCGCGTGCCATCTCTCTCTACTACTCGTGTACGTTTTACTATTATTAGTTTA TATGATTATTATTGTGGGTTTGGATTTGTGTTTTGGTGTAATTAATCAATTCGTGTGATT AACTAAGATGGGAGTATCATACATGAACAACAAGATTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)