cluster # 3177

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 3177 cluster # 3177 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3177#0 length = 807 sequences # 2

consensusID : consensus_3177#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 807
fasta sequence

                              [AGTATTTATACCTGAAGTCAGATTCAGAGATTTTTCTGGAGACTAGATTCAGAGTTCAGAGGTTGGTAGGTAGTTTAGGTAGTAGGTTTGTTAGTTATGCAGCAGCTGAACTGGGTCAGCCTGTTGCTCTTGCTGTTCTTCATGGTTGCTGCACTCAGCTCCTTCGTTGCCACTGCACACAGAGAGCTGCCAATGGCAAGAAAAGTCGATGAAATTGGAGACCATCTTCAGGCCAAGCTGGATAATCAAGCTAGCTCTGTCAGTGTAACCAGAGCAACGGCGAAGGCTGAACATGATCATCAGGAGGCTGTCATGAGGAAATGCAAGAACGGGAGGAAGAACTGCAAGANTTTCAGACCAAGAAAGCTTCCTGCANATGCAGATGGCAAGATCCATTTCGATGGCCACATGCCATTCACTGCAGATTACCNCTCAGTTCGTCGGCATCCTCCCAGTCACAACTAGGAGTTAATCTTAACACTACTAGTACCAGCTAGTTGCTTTGCTTAGAAATATATATCCAGTAATTAAGTAGCCTAATTTAATCAGTAGTGACAGTCCATATAGCTAAGCTGTAGTATCAATTCTTCTTTCCTTTNGTCCTNGGATGGTCATCNCTGTCAGGCTCTCAGCTTCCAGTTAGCATTGCATGGCTTTGCTCTTTGCTTTGCTGACATTTTTGTTAGTTAGCAANAGTAGCTCNCAGTGATGGCATGTCNCCACCCTTGATGTTCCCTAATTTAAGCTGTTAATCCATCAAAGTTAAAAAAGATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL OSC24301             [AGTATTTATACCTGAAGTCAGATTCAGAGATTTTTCTGGAGACTAGATTCAGAGTTCAGAGGTTGGTAGGTAGTTTAGGTAGTAGGTTTGTTAGTTATGCAGCAGCTGAACTGGGTCAGCCTGTTGCTCTTGCTGTTCTTCATGGTTGCTGCACTCAGCTCCTTCGTTGCCACTGCACACAGAGAGCTGCCAATGGCAAGAAAAGTCGATGAAATTGGAGACCATCTTCAGGCCAAGCTGGATAATCAAGCTAGCTCTGTCAGTGTAACCAGAGCAACGGCGAAGGCTGAACATGATCATCAGGAGGCTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AU085840             [                                                                                                                                                                                                                                           AGCTGGATAATCAAGCTAGCTCTGTCAGTGTAACCAGAGCAACGGCGAAGGCTGAACATGATCATCAGGAGGCTGTCATGAGGAAATGCAAGAACGGGAGGAAGAACTGCAAGANTTTCAGACCAAGAAAGCTTCCTGCANATGCAGATGGCAAGATCCATTTCGATGGCCACATGCCATTCACTGCAGATTACCNCTCAGTTCGTCGGCATCCTCCCAGTCACAACTAGGAGTTAATCTTAACACTACTAGTACCAGCTAGTTGCTTTGCTTAGAAATATATATCCAGTAATTAAGTAGCCTAATTTAATCAGTAGTGACAGTCCATATAGCTAAGCTGTAGTATCAATTCTTCTTTCCTTTNGTCCTNGGATGGTCATCNCTGTCAGGCTCTCAGCTTCCAGTTAGCATTGCATGGCTTTGCTCTTTGCTTTGCTGACATTTTTGTTAGTTAGCAANAGTAGCTCNCAGTGATGGCATGTCNCCACCCTTGATGTTCCCTAATTTAAGCTGTTAATCCATCAAAGTTAAAAAAGATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_3177#0
AGTATTTATACCTGAAGTCAGATTCAGAGATTTTTCTGGAGACTAGATTCAGAGTTCAGA
GGTTGGTAGGTAGTTTAGGTAGTAGGTTTGTTAGTTATGCAGCAGCTGAACTGGGTCAGC
CTGTTGCTCTTGCTGTTCTTCATGGTTGCTGCACTCAGCTCCTTCGTTGCCACTGCACAC
AGAGAGCTGCCAATGGCAAGAAAAGTCGATGAAATTGGAGACCATCTTCAGGCCAAGCTG
GATAATCAAGCTAGCTCTGTCAGTGTAACCAGAGCAACGGCGAAGGCTGAACATGATCAT
CAGGAGGCTGTCATGAGGAAATGCAAGAACGGGAGGAAGAACTGCAAGANTTTCAGACCA
AGAAAGCTTCCTGCANATGCAGATGGCAAGATCCATTTCGATGGCCACATGCCATTCACT
GCAGATTACCNCTCAGTTCGTCGGCATCCTCCCAGTCACAACTAGGAGTTAATCTTAACA
CTACTAGTACCAGCTAGTTGCTTTGCTTAGAAATATATATCCAGTAATTAAGTAGCCTAA
TTTAATCAGTAGTGACAGTCCATATAGCTAAGCTGTAGTATCAATTCTTCTTTCCTTTNG
TCCTNGGATGGTCATCNCTGTCAGGCTCTCAGCTTCCAGTTAGCATTGCATGGCTTTGCT
CTTTGCTTTGCTGACATTTTTGTTAGTTAGCAANAGTAGCTCNCAGTGATGGCATGTCNC
CACCCTTGATGTTCCCTAATTTAAGCTGTTAATCCATCAAAGTTAAAAAAGATGTAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case