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Oryza sativa
cluster # 3218 cluster # 3218       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3218#0 length = 1574 sequences # 2  

consensusID : consensus_3218#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1574
fasta sequence
                              [AGTACATAGTAAATTCCCCAAATTTATCTATCACTGTAAGATGGTATCAGAGCTCATGGGCTGAACCCTAGCCCTCGATCCCCGTCGTCCGCCGGCGCTCCGGCTTGCCGGCGGTGGCTCCCTATCGGGCAAATCTTCTTCACGTCCTCCTCGTCCGGATCAGCAGCGGGATTCACAGCAAGTCAGTGTGATTCGTCCGTCACGCGTGAGTGCATCGCTCATTGCAGCCGCTCGTCACGCGGTTGCTCCGCTCAGCCGTTGTTGCTGCTCTTCCACTACTGCTGCCGCTGTGTGCTGCTGGTGCTAATTCAAGAGACAATACATCAAGTCCTGTAAGCAAGTCTCTGTCCAGTCAATTTGTCAAATTTTCTTCTGCTGGTCTTGATGGCAACATCCAACCCCTTTCTTGGAGGTGGAGCTCTGCTCTCCACGGACATTAAGCTAAATGGTCAAAATTATCAAGAATGGGAACTTTCAGCTCGTATGCTTTTGAGGTCGATTGGTCAAGCATCTCACCTCACAGATGATCCTCCTGATGAGAAAACGGATGCAACTAAAATTAAGGCGTGGAAAACAGCAGATGATCGTGTTATGGGATTCATATTCATGAGTGTAGAGGTGCCTATTCGGATGAGTTTCAGGGATCACTCTACTGCTAAAGAGATGTGGGACTACCTCAAACAGAGGTACACTCAAGAAAGCGGAGCTTTGCGTTTTTCCTTGCTGCAGAATTTGCACAACTTACAACAACAAGATCAGTCCATTGAAGAATTTTATAATGCCTTTACTCGGTTGTCTGGACAGCTTGAGGCACAGACTCCAAAAGGTGCTTCAGGTTGTGCACAATGCAAGGCGAGAGAGAAGCATGATCAAGAAAATCTAGTGTATCAATTTGTCATGAGACTTTCCTCTCAATTTGAGTCCATTCGAGTTCAGTTGCTTGGACGTCCTACACGTCCTACTATGGCGGAGGCTCTTGCAGATCTAATCGCTGAGGAGACACGTCTTTGTTCCTTGGACACTACTCCTACTCCTGTGGTTACTCACAATGTCATGGCAGCACCTCAGCGTGTTGGAGCTCCTATGGGCGGGATCCCTGAATTCAGTTCCATCGCCAAAAGTGATCGTATTTGCTCTCATTGCAAGAAGGTTGGACATATTTCCGATGATTGCTTCTATCTTCATCCAGAGAAGTTGGCTGATTATCAAGCTAGGCGTGCAGCGGTCCCCCGTCCTCGTGCGACGGCTAGTGCTCCTGTTTTCTTGGATATCACTGCTGCTGGTCCTTCTAGTACTAGTGCTGGTGGCAGTGCCTCTAGCGCCGTCTCATGTGCTCCTCAGTCATTGGTTGCAAGACCGTCTTATCAAGCCAGTGATTGGTCATGGCCATCACCATAGTTGGTCCCCAAGGCCTCTAAGTGTGAGGTCATCTTCGCCTACCACTTTTGTTGCCATCTCCTACTTGTTGCTTTTGCTTGCTGTTTGGAGAAAAAGGTTGTTGCTGCTATAGTATATATCTGTCCTTCAGTTCAGTTCAAGTCTTCTGTTATCCATTAAATCTATCTAAGTCAATT]

[+] EMBL CA766104             [AGTACATAGTAAATTCCCCAAATTTATCTATCACTGTAAGATGGTATCAGAGCTCATGGGCTGAACCCTAGCCCTCGATCCCCGTCGTCCGCCGGCGCTCCGGCTTGCCGGCGGTGGCTCCCTATCGGGCAAATCTTCTTCACGTCCTCCTCGTCCGGATCAGCAGCGGGATTCACAGCAAGTCAGTGTGATTCGTCCGTCACGCGTGAGTGCATCGCTCATTGCAGCCGCTCGTCACGCGGTTGCTCCGCTCAGCCGTTGTTGCTGCTCTTCCACTACTGCTGCCGCTGTGTGCTGCTGGTGCTAATTCAAGAGACAATACATCAAGTCCTGTAAGCAAGTCTCTGTCCAGTCAATTTGTCAAATTTTCTTCTGCTGGTCTTGATGGCAACATCCAACCCCTTTCTTGGAGGTGGAGCTCTGCTCTCCACGGACATTAAGCTAAATGGTCAAAATTATCAAGAATGGGAACTTTCAGCTCGTATGCTTTTGAGGTCGATTGGTCAAGCATCTCACCTCACAGATGATCCTCCTGATGAGAAAACGGATGCAACTAAAATTAAGGCGTGGAAAACAGCAGATGATCGTGTTATGGGATTCATATTCATGAGTGTAGAGGTGCCTATTCGGATGAGTTTCAGGGATCACTCTACTGCTAAAGAGATGTGGGACTACCTCAAACAGAGGTACACTCAAGAAAGCGGAGCTTTGCGTTTTTCCTTGCTGCAGAATTTGCACAACTTACAACAACAAGATCAGTCCATTGAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AK068488             [                                 CTGTAAGATGGTATCAGAGCTCATGGGCTGAACCCTAGCCCTCGATCCCCGTTGTCCGCCGGCGCTCCGGCTTGCCGGCGGCGGCTCCCTATCGGGCAAATCTTCTTCACGTCCTCCTCGTCCGGATCAGCAGCGGGATTCACAGCAAGTCAGTGTGATTCGTCCGTCAAGCGTGAGTGCATCGCTCATTGCAGCCGCTCGTCACGCGGTTGCTCCGCTCAGCCGTTGTTGCTGCTCTTCCACTACTGCTGCCGCTGTGTGCTGCTGGTGCTAATTCAGGAGACAATACATCAAGTCCTGTAAGCAAGTCTCTGTCCAGTCAATTTGTCAAATTTTCTTCTGCTGGTCTTGATGGCAACATCCGACCCCTTTCTTGGAGGTGGAGCTCTGCTCTCCACGGACATTAAGCTAAATGGTCAAAATTATCAAGAATGAGAACTTTCAGCTCGTATGCTTTTGAGGTCGATTGGTCAAGCATCTCACCTCACAGATGATCCTCCTGATGAGAAAACGGATGCAACTAAAATTAAGGCGTGGAAAACAGCAGATGATCGTGTTATGGGATTCATATTCATGAGTGTAGAGGTGCCTATTCGGATGAGTTTCAGGGATCACACTACCGCTAAAGAGATGTGGGACTACCTCAAACAGAGGTACACTCAAGAAAGCGGAGCTTTGCGTTTTTCCTTGCTGCAGAATTTGCACAACTTACAACAACAAGATCAGTCCATTGAAGAATTTTATAATGCCTTTACTCGGTTGTCTGGACAGCTTGAGGCACAGACTCCAAAAGGTGCTTCAGGTTGTGCACAATGCAAGGCGAGAGAGAAGCATGATCAAGAAAATCTAGTGTATCAATTTGTCATGAGACTTTCCTCTCAATTTGAGTCCATTCGAGTTCAGTTGCTTGGACGTCCTACACGTCCTACTATGGCGGAGGCTCTTGCAGATCTAATCGCTGAGGAGACACGTCTTTGTTCCTTGGACACTACTCCTACTCCTGTGGTTACTCACAATGTCATGGCAGCACCTCAGCGTGTTGGAGCTCCTATGGGCGGGATCCCTGAATTCAGTTCCATCGCCAAAAGTGATCGTATTTGCTCTCATTGCAAGAAGGTTGGACATATTTCCGATGATTGCTTCTATCTTCATCCAGAGAAGTTGGCTGATTATCAAGCTAGGCGTGCAGCGGTCCCCCGTCCTCGTGCGACGGCTAGTGCTCCTGTTTTCTTGGATATCACTGCTGCTGGTCCTTCTAGTACTAGTGCTGGTGGCAGTGCCTCTAGCGCCGTCTCATGTGCTCCTCAGTCATTGGTTGCAAGACCGTCTTATCAAGCCAGTGATTGGTCATGGCCATCACCATAGTTGGTCCCCAAGGCCTCTAAGTGTGAGGTCATCTTCGCCTACCACTTTTGTTGCCATCTCCTACTTGTTGCTTTTGCTTGCTGTTTGGAGAAAAAGGTTGTTGCTGCTATAGTATATATCTGTCCTTCAGTTCAGTTCAAGTCTTCTGTTATCCATTAAATCTATCTAAGTCAATT]


>consensus_3218#0 AGTACATAGTAAATTCCCCAAATTTATCTATCACTGTAAGATGGTATCAGAGCTCATGGG CTGAACCCTAGCCCTCGATCCCCGTCGTCCGCCGGCGCTCCGGCTTGCCGGCGGTGGCTC CCTATCGGGCAAATCTTCTTCACGTCCTCCTCGTCCGGATCAGCAGCGGGATTCACAGCA AGTCAGTGTGATTCGTCCGTCACGCGTGAGTGCATCGCTCATTGCAGCCGCTCGTCACGC GGTTGCTCCGCTCAGCCGTTGTTGCTGCTCTTCCACTACTGCTGCCGCTGTGTGCTGCTG GTGCTAATTCAAGAGACAATACATCAAGTCCTGTAAGCAAGTCTCTGTCCAGTCAATTTG TCAAATTTTCTTCTGCTGGTCTTGATGGCAACATCCAACCCCTTTCTTGGAGGTGGAGCT CTGCTCTCCACGGACATTAAGCTAAATGGTCAAAATTATCAAGAATGGGAACTTTCAGCT CGTATGCTTTTGAGGTCGATTGGTCAAGCATCTCACCTCACAGATGATCCTCCTGATGAG AAAACGGATGCAACTAAAATTAAGGCGTGGAAAACAGCAGATGATCGTGTTATGGGATTC ATATTCATGAGTGTAGAGGTGCCTATTCGGATGAGTTTCAGGGATCACTCTACTGCTAAA GAGATGTGGGACTACCTCAAACAGAGGTACACTCAAGAAAGCGGAGCTTTGCGTTTTTCC TTGCTGCAGAATTTGCACAACTTACAACAACAAGATCAGTCCATTGAAGAATTTTATAAT GCCTTTACTCGGTTGTCTGGACAGCTTGAGGCACAGACTCCAAAAGGTGCTTCAGGTTGT GCACAATGCAAGGCGAGAGAGAAGCATGATCAAGAAAATCTAGTGTATCAATTTGTCATG AGACTTTCCTCTCAATTTGAGTCCATTCGAGTTCAGTTGCTTGGACGTCCTACACGTCCT ACTATGGCGGAGGCTCTTGCAGATCTAATCGCTGAGGAGACACGTCTTTGTTCCTTGGAC ACTACTCCTACTCCTGTGGTTACTCACAATGTCATGGCAGCACCTCAGCGTGTTGGAGCT CCTATGGGCGGGATCCCTGAATTCAGTTCCATCGCCAAAAGTGATCGTATTTGCTCTCAT TGCAAGAAGGTTGGACATATTTCCGATGATTGCTTCTATCTTCATCCAGAGAAGTTGGCT GATTATCAAGCTAGGCGTGCAGCGGTCCCCCGTCCTCGTGCGACGGCTAGTGCTCCTGTT TTCTTGGATATCACTGCTGCTGGTCCTTCTAGTACTAGTGCTGGTGGCAGTGCCTCTAGC GCCGTCTCATGTGCTCCTCAGTCATTGGTTGCAAGACCGTCTTATCAAGCCAGTGATTGG TCATGGCCATCACCATAGTTGGTCCCCAAGGCCTCTAAGTGTGAGGTCATCTTCGCCTAC CACTTTTGTTGCCATCTCCTACTTGTTGCTTTTGCTTGCTGTTTGGAGAAAAAGGTTGTT GCTGCTATAGTATATATCTGTCCTTCAGTTCAGTTCAAGTCTTCTGTTATCCATTAAATC TATCTAAGTCAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)