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Oryza sativa
cluster # 3508 cluster # 3508       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3508#0 length = 3082 sequences # 2  

consensusID : consensus_3508#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3082
fasta sequence
                              [GAGCACAGAGGATGGTGATTTTGTTCATCCTTCACGGCGAATTCTCCCAATTTCTTCCATTTAAGTTCTTCTTGGTTGTCTGATTATTAGGTTTCTGCTTCGAAAATGCTGGTTTGCTCTGCTGCTGGCTGCTTGGGTTCAACCTGATCTGGTGCTTCCTAGTCGAATTCAAGGAGAGCCGAGGAAAATATTTGGGAGGGGCAATGGCAGAAACCGCGGTGAGTGCATCTAAGGGTGTGATAGGTGCCCTTTTTGAGAAGCTCACTAAGCTGGTGGAGGACAAGTGCACCAATCTCGTAGGCATGTCAAAAAATATTGTGTTCCTTAAAGATGAGCTCCCAACCATGAGCGCGCTACTCGAGAAGCTAGAGGATGCAGATGAACTTGATCCAGTGGTGAAGGCTTGGAGGAACCAGGTCAGGGAGATGGCATATGATATTGAAGATTGCATCGATGACTTTGTGCACCACGTGGGAGGTGGTGATGTGGAAGCTGGCTTCATCGATAAGGTTTCTCACTTTCTCAGAACTTTGAGGGCCCGTCTTGAGACTGCCGAGCATATCAA-GGATCTCAAGATTCAGCTAATAGAGATAAATGAACGGCACAAGAGGTACAAA-TTTGATCTAGATGACACTCCTAGTTCTAGCTTTGTGGCCATTGATCCTCGGTTGCCAGCACTGTACAGTGAAGCCGCTAATCTTGTGGGTATTGAAGGCCCAAGGGAACAGGTTATAAAGTGGTTGACAGATGCGGATCAACAAATAATGGTCCTACCAATTGTTGGCTTTGGAGGTCTGGGTAAAACTACGCTCG-CCAAGGAGGTTTATCAAAAAATTGGACAGCAATTCAACACCACGGAATTTGTTTCAGTTTCCCAAAGGCCTGATGTAACAAGATTTCTCAAAGGAATACAATCAAAACTTCCGATAAGGCTGTCTTCTGAATATTGTGAAGTTAAAGACATCATTGACAACATCAGAGCATATCTACAACATAGAAGGTACCTTTTTGTTGTTGATGACTTGTGGGATGCACCTACATGGAATATTATTCGGTCTGTTTTTCCAGAAAATGGCATGGGCTGTAGAATAATTGTGACCACACGATCGGAAGATGTTGCTAGATGGGTATGCTGCAATCATCGACGATTCATTTACAGAATGGAGCCCCTCAGTGATGAAAACTCAAGATGGCTATTCTTTAACAGGATATTTGGCTCGGAAGATGGTTGCCCTTCCCAATTTAGAGAAATTTCCGCTCAGATTCTGAAAAAATGTAGCGGTTTACCACTTGCAATCATTACCATTGCTAGCCTATTGGCTAATCAGCCTGCACCACACAAGAAAGAATATTGGGAGAGTATTCGTAATTCTATTGGCACCTGGGGGTCTGGCACAAATCCCACGTTGGAAGGGATGAGGCAAATTTTACACCTTAGCTACAAGGATCTTCCTCGTCATCTTAGGACATGCTTCCTATACCTTGGTATTTATCCTGAGGACTTCACCATCAAGAAGGATGATTTGATTAGACAATGGCTGGCTGAAGGCTTTGTCCATCATTTCCATGGGGGGAGTTCAGAGGAAGTTGCTAAGAGTTATTTCAATGAACTGATCAATAGAAGCTTAATTCAACCAGAAGAAACCAAATATGGGGAGGTAGTTTCTTGTAGAGTACATGATATGATGCTTGATTTGATCTTAAGTAGGTGTGCAGAGGATAATTTTATCTGCGTGGCATACAATCTAGAAGAATTGTCTGGAAAACATGAATTCAAAGTCCGTCGATTATTGGTCGACTCTAGAGTTGGTGATTCAGGAGATACCAAAATATCAGGAACACCTGCTCCTAGATTGTTGCAACTCAGATCACTTCAGCTGTTTGGAGTATCTGTATCCCTGTCTTTGTTGCCACTGTCTAAGTATATCCGAGTGTTGATATTACACTTGGGAAAAACCGGGACAGGAGGCAATGAAAGAGTTGATGTGACCGCAATTGGGCAATTATTCCAGTTGAGGTATTTGAAGATTGTAAGCCTCCATCATGCGCTCGTACTAGAGCTTCCTACTGAAATTCGAGGACTTCAATATTTGTCAACATTGGAAATAGATTGCACAAATGAGAACAGTTTGCCATCAGATATTGTTCATTTGTCCCGCTTGTCCCACCTGATTGTTCCAAGTGGTATAGGGTTACCTGATGGGAAGATAGGCAGCATGAAGTCCCTATGCACTCTCCAAAAAATTGAGATTTTAGATATCAAGAGCGCCATTGGCCTTGGTGAGCTGACCAATCTAAAGGACCTTGAGCTGTACAGTAAACAGGCTCTGTCAGAGAGAGAGATTGATGCGCTGGTAACTTCCCTTGGAAAACTTCATAAGCTCATATCTCTGCGCATGTCTAAGTTTGCAGAATGTATCTGGTATGATGAGGATAACCGGCTCGGTTCATTGTCCAATCCTCCTCTCAATATTGAGAGACTCCACCTGGGAGGATGGAGGTTGCGTCGAGTTCCTAGATGGATCAATGGTCACCTCCAAAACCTCTGCTTCCTCGTTCTTGATGTTACAGAGATGTCAACTGATGAGGTTCGGCTCCTTGGAGAGCTACCTTCACTCAGTGAACTCTGCCTGAGCGTGAAGCGTTTGGCTCCATGCAGCGCATCCCTCGTATTCGGTGCAGGGTTCCCAGCATTGGAGTGTCTTGAATTCTTTTGCGGTGGAGATATATCACACCTGTGCTTTGAGGCAGGGGTTATGCCCAATCTCAGAAAGATCATTCTGTTTTACATAGATATTGAATGGAGCGGCACCGCACCAGTTGGCATTGAGCACCTACTGGACAAACAACTCCGATACATCCAATTACATCCGGTTACTGACACAGCAGTGGATGCCGAGCGTATCAGCCTCGCATTCACAGAAGCTATAAGAGCACATACAAGCCGTGGTGGTGCTGGACCTTACCTGCGCTTCGCCCGGATCCGAAGTGGTAGCCTCATAGGTGCAAACTCTTTAATCCGGCACAGTTTTACTTGTCATAGAGTTTCTGCTTTGTTTCTCCTGAATCACATTCTTGCCAT]

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>consensus_3508#0 GAGCACAGAGGATGGTGATTTTGTTCATCCTTCACGGCGAATTCTCCCAATTTCTTCCAT TTAAGTTCTTCTTGGTTGTCTGATTATTAGGTTTCTGCTTCGAAAATGCTGGTTTGCTCT GCTGCTGGCTGCTTGGGTTCAACCTGATCTGGTGCTTCCTAGTCGAATTCAAGGAGAGCC GAGGAAAATATTTGGGAGGGGCAATGGCAGAAACCGCGGTGAGTGCATCTAAGGGTGTGA TAGGTGCCCTTTTTGAGAAGCTCACTAAGCTGGTGGAGGACAAGTGCACCAATCTCGTAG GCATGTCAAAAAATATTGTGTTCCTTAAAGATGAGCTCCCAACCATGAGCGCGCTACTCG AGAAGCTAGAGGATGCAGATGAACTTGATCCAGTGGTGAAGGCTTGGAGGAACCAGGTCA GGGAGATGGCATATGATATTGAAGATTGCATCGATGACTTTGTGCACCACGTGGGAGGTG GTGATGTGGAAGCTGGCTTCATCGATAAGGTTTCTCACTTTCTCAGAACTTTGAGGGCCC GTCTTGAGACTGCCGAGCATATCAAGGATCTCAAGATTCAGCTAATAGAGATAAATGAAC GGCACAAGAGGTACAAATTTGATCTAGATGACACTCCTAGTTCTAGCTTTGTGGCCATTG ATCCTCGGTTGCCAGCACTGTACAGTGAAGCCGCTAATCTTGTGGGTATTGAAGGCCCAA GGGAACAGGTTATAAAGTGGTTGACAGATGCGGATCAACAAATAATGGTCCTACCAATTG TTGGCTTTGGAGGTCTGGGTAAAACTACGCTCGCCAAGGAGGTTTATCAAAAAATTGGAC AGCAATTCAACACCACGGAATTTGTTTCAGTTTCCCAAAGGCCTGATGTAACAAGATTTC TCAAAGGAATACAATCAAAACTTCCGATAAGGCTGTCTTCTGAATATTGTGAAGTTAAAG ACATCATTGACAACATCAGAGCATATCTACAACATAGAAGGTACCTTTTTGTTGTTGATG ACTTGTGGGATGCACCTACATGGAATATTATTCGGTCTGTTTTTCCAGAAAATGGCATGG GCTGTAGAATAATTGTGACCACACGATCGGAAGATGTTGCTAGATGGGTATGCTGCAATC ATCGACGATTCATTTACAGAATGGAGCCCCTCAGTGATGAAAACTCAAGATGGCTATTCT TTAACAGGATATTTGGCTCGGAAGATGGTTGCCCTTCCCAATTTAGAGAAATTTCCGCTC AGATTCTGAAAAAATGTAGCGGTTTACCACTTGCAATCATTACCATTGCTAGCCTATTGG CTAATCAGCCTGCACCACACAAGAAAGAATATTGGGAGAGTATTCGTAATTCTATTGGCA CCTGGGGGTCTGGCACAAATCCCACGTTGGAAGGGATGAGGCAAATTTTACACCTTAGCT ACAAGGATCTTCCTCGTCATCTTAGGACATGCTTCCTATACCTTGGTATTTATCCTGAGG ACTTCACCATCAAGAAGGATGATTTGATTAGACAATGGCTGGCTGAAGGCTTTGTCCATC ATTTCCATGGGGGGAGTTCAGAGGAAGTTGCTAAGAGTTATTTCAATGAACTGATCAATA GAAGCTTAATTCAACCAGAAGAAACCAAATATGGGGAGGTAGTTTCTTGTAGAGTACATG ATATGATGCTTGATTTGATCTTAAGTAGGTGTGCAGAGGATAATTTTATCTGCGTGGCAT ACAATCTAGAAGAATTGTCTGGAAAACATGAATTCAAAGTCCGTCGATTATTGGTCGACT CTAGAGTTGGTGATTCAGGAGATACCAAAATATCAGGAACACCTGCTCCTAGATTGTTGC AACTCAGATCACTTCAGCTGTTTGGAGTATCTGTATCCCTGTCTTTGTTGCCACTGTCTA AGTATATCCGAGTGTTGATATTACACTTGGGAAAAACCGGGACAGGAGGCAATGAAAGAG TTGATGTGACCGCAATTGGGCAATTATTCCAGTTGAGGTATTTGAAGATTGTAAGCCTCC ATCATGCGCTCGTACTAGAGCTTCCTACTGAAATTCGAGGACTTCAATATTTGTCAACAT TGGAAATAGATTGCACAAATGAGAACAGTTTGCCATCAGATATTGTTCATTTGTCCCGCT TGTCCCACCTGATTGTTCCAAGTGGTATAGGGTTACCTGATGGGAAGATAGGCAGCATGA AGTCCCTATGCACTCTCCAAAAAATTGAGATTTTAGATATCAAGAGCGCCATTGGCCTTG GTGAGCTGACCAATCTAAAGGACCTTGAGCTGTACAGTAAACAGGCTCTGTCAGAGAGAG AGATTGATGCGCTGGTAACTTCCCTTGGAAAACTTCATAAGCTCATATCTCTGCGCATGT CTAAGTTTGCAGAATGTATCTGGTATGATGAGGATAACCGGCTCGGTTCATTGTCCAATC CTCCTCTCAATATTGAGAGACTCCACCTGGGAGGATGGAGGTTGCGTCGAGTTCCTAGAT GGATCAATGGTCACCTCCAAAACCTCTGCTTCCTCGTTCTTGATGTTACAGAGATGTCAA CTGATGAGGTTCGGCTCCTTGGAGAGCTACCTTCACTCAGTGAACTCTGCCTGAGCGTGA AGCGTTTGGCTCCATGCAGCGCATCCCTCGTATTCGGTGCAGGGTTCCCAGCATTGGAGT GTCTTGAATTCTTTTGCGGTGGAGATATATCACACCTGTGCTTTGAGGCAGGGGTTATGC CCAATCTCAGAAAGATCATTCTGTTTTACATAGATATTGAATGGAGCGGCACCGCACCAG TTGGCATTGAGCACCTACTGGACAAACAACTCCGATACATCCAATTACATCCGGTTACTG ACACAGCAGTGGATGCCGAGCGTATCAGCCTCGCATTCACAGAAGCTATAAGAGCACATA CAAGCCGTGGTGGTGCTGGACCTTACCTGCGCTTCGCCCGGATCCGAAGTGGTAGCCTCA TAGGTGCAAACTCTTTAATCCGGCACAGTTTTACTTGTCATAGAGTTTCTGCTTTGTTTC TCCTGAATCACATTCTTGCCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)