cluster # 360

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 360 cluster # 360 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_360#0 length = 2204 sequences # 2
consensusID : consensus_360#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2204
fasta sequence
                              [GGATCCACAGCGGAAAAAGGACATGTGGTAAATGCCGGGCACAAATACCAGCAAAAATGGCAGAGCAGCCAAGAGTCAACTCAGCATTAGTTTCTGTTATCCGTATGGCTAAGGTTTCAAAGAATGCCAACTCAGCTGTCTCTGCAGCTGCGTATCATTACATACGAAATGATGATAGACCTGACAAGGCTTTTACAACTGAAAGGGCTAAGAGGGCTGGAAAAGCTAATGCTTCAAGTGGCCAGATCTTTGTTACTATCCCACCCGACCATTTTGGCCCCATTCTTGCAGAGAATGACCCCAAGAGAAGCATTGGTGTTCTAGTTGGGGATACATGGGAAGACAGACTTGAGTGCAGGCAATGGGGTGCCCATTTTCCTCACGTGGCTGGTATTGCTGGCCAATCCACACATGGTGCTCAGTCGGTAGCCCTCTCGGGTGGGTATGTCGATGATGAGGACCATGGGGAATGGTTTCTATATACTGGAAGTGGTGGAAGAGATCTAAGTGGGAACAAGCGTACAAACAAGGAGCAGTCCTCAGACCAGAAATTTGAGAAGCTGAATGCTGCTCTTCGTATTAGTTGCCTCAAGGGTTACCCTGTCAGGGTTGTGCGGTCCCACAAAGAGAAGCGTTCTTCATATGCTCCTGAAGCTGGTGTGAGGTATGATGGAGTTTACAGGATTGAAAAATGTTGGAGGAAGATTAGTGTTCAGGGTAAATTCAAGGTTTGCAGGTATCTCTTTGTACGTTGTGACAATGAACCAGCTCCTTGGACTAGTGATATTTATGGTGACCGTCCGAGGCCACTCCCCAAAGTTGATGAGCTGAAAGGTGCAACAGACATATCAGAGAGGAAAGGAACTCCTTCATGGGACTTTGATGAGAAAGAAGGCTGGAAGTGGGTGAAGCCTCCACCAATCAGCAGAAAGCCTAACCTATCAGGGGATCCTGCAACTGACAAGGAAATCCGGAGGGTTGCAAGGCGTGCCCAGATGTCTGTGACTGAAAGGCTGCTGAAAGAGTTTGGATGTTCCATTTGCAAGCAAGTGATGAAGGAACCACTCACTACTCCATGTGCTCATAACTTCTGCAAGTTGTGTTTGGTTGGGACATATGGTAGTCAATCGTCTATGAGGGAGAGAAGCCGGGGTGGGCGGACTCTAAGGGCACAGAAGATTGTGAAGAAGTGCCCTTCATGTCCAACTGATATTTGTGACTTCCTAGAGAATCCACAGATCAATCGAGAGATGATGGATTTGATTGAGTCCTTGCAAAGAAAGGCTGTTGAAGAAGGAGATACCAAGACAAGCTCAGATGTTAGCAATGGTGCTGAGTCATCTGGAGATGATGGAAACAACGAAGCTTTAGAGAAGGGAGAGGATGATAGCAGCTTGAAGGATGATGGCAGCTTGAAGGATGATGGCAAAGTGGTCAAGGCCGTGGTTGTAATCAAGGAAGAGGACCTGCAGCCTAAGAAGAGCAAAGGAGAAGATGAGAAAGAACAAGGTGACAAGAAGATGGACAGTGCTGATGTGGTGGACATTGCAGTTGAAAAGAAACAGGCGACGAAGCGGGCTTCTGAG-AAGGCTGAGAAGAAGCAGGCAAGGAAGCGCAAGGGGGATGCTGTTGCCACAAATG-ATGGTAAAAGGATGAAAACAGGTGGTGATGCTATGGAGACAGCAGCGGA--AGAGGATGCTCCCCTGAGCGGCGGAACTCCTGTGAAGCGCAACAGCAGGAAGAGTAGTGAGGTTGATGCCAAAGGCGGTGGCGGTAGTCCTGTTGTGAGCAGCCCTCGCAGGGTGACGAGGAGCAATGCCAAGGCTAGCGGTGAAGCTGATGGTAGCCCTGCGACAAGGACCAGGAGGGCTACCCGCGCTGAAGCCTGAATGAAGATGGATGAATGGCTGGTTGGCTGGCTGTAGAGGGGAAGAAGACGGAGACTGGAGCCATTTTGGGGTCGTATTCGTATATTCTATCTATTTAGTAATTTAGGCCGTTTGCCTTGTGCTGTTGCTCTAGCTCTTTTGATCCACAAGGGGTGAACTGGAACTGCCGCGGTGTGCTTTTGGGATGGCTTGGGTTGGGTTGTTAGTTGAAGGAATATATACTTATATACAGTGGTTGCTTTACCTTTACCTGTATGGATGTATGATGGATGTTCCTCATACAACTTTCCAATTCCAATTACTGGCATGGTTTGC]

[+] EMBL AK101136             [GGATCCACAGCGGAAAAAGGACATGTGGTAAATGCCGGGCACAAATACCAGCAAAAATGGCAGAGCAGCCAAGAGTCAACTCAGCATTAGTTTCTGTTATCCGTATGGCTAAGGTTTCAAAGAATGCCAACTCAGCTGTCTCTGCAGCTGCGTATCATTACATACGAAATGATGATAGACCTGACAAGGCTTTTACAACTGAAAGGGCTAAGAGGGCTGGAAAAGCTAATGCTTCAAGTGGCCAGATCTTTGTTACTATCCCACCCGACCATTTTGGCCCCATTCTTGCAGAGAATGACCCCAAGAGAAGCATTGGTGTTCTAGTTGGGGATACATGGGAAGACAGACTTGAGTGCAGGCAATGGGGTGCCCATTTTCCTCACGTGGCTGGTATTGCTGGCCAATCCACACATGGTGCTCAGTCGGTAGCCCTCTCGGGTGGGTATGTCGATGATGAGGACCATGGGGAATGGTTTCTATATACTGGAAGTGGTGGAAGAGATCTAAGTGGGAACAAGCGTACAAACAAGGAGCAGTCCTCAGACCAGAAATTTGAGAAGCTGAATGCTGCTCTTCGTATTAGTTGCCTCAAGGGTTACCCTGTCAGGGTTGTGCGGTCCCACAAAGAGAAGCGTTCTTCATATGCTCCTGAAGCTGGTGTGAGGTATGATGGAGTTTACAGGATTGAAAAATGTTGGAGGAAGATTAGTGTTCAGGGTAAATTCAAGGTTTGCAGGTATCTCTTTGTACGTTGTGACAATGAACCAGCTCCTTGGACTAGTGATATTTATGGTGACCGTCCGAGGCCACTCCCCAAAGTTGATGAGCTGAAAGGTGCAACAGACATATCAGAGAGGAAAGGAACTCCTTCATGGGACTTTGATGAGAAAGAAGGCTGGAAGTGGGTGAAGCCTCCACCAATCAGCAGAAAGCCTAACCTATCAGGGGATCCTGCAACTGACAAGGAAATCCGGAGGGTTGCAAGGCGTGCCCAGATGTCTGTGACTGAAAGGCTGCTGAAAGAGTTTGGATGTTCCATTTGCAAGCAAGTGATGAAGGAACCACTCACTACTCCATGTGCTCATAACTTCTGCAAGTTGTGTTTGGTTGGGACATATGGTAGTCAATCGTCTATGAGGGAGAGAAGCCGGGGTGGGCGGACTCTAAGGGCACAGAAGATTGTGAAGAAGTGCCCTTCATGTCCAACTGATATTTGTGACTTCCTAGAGAATCCACAGATCAATCGAGAGATGATGGATTTGATTGAGTCCTTGCAAAGAAAGGCTGTTGAAGAAGGAGATACCAAGACAAGCTCAGATGTTAGCAATGGTGCTGAGTCATCTGGAGATGATGGAAACAACGAAGCTTTAGAGAAGGGAGAGGATGATAGCAGCTTGAAGGATGATGGCAGCTTGAAGGATGATGGCAAAGTGGTCAAGGCCGTGGTTGTAATCAAGGAAGAGGACCTGCAGCCTAAGAAGAGCAAAGGAGAAGATGAGAAAGAACAAGGTGACAAGAAGATGGACAGTGCTGATGTGGTGGACATTGCAGTTGAAAAGAAACAGGCGACGAAGCGGGCTTCTGAG AAGGCTGAGAAGAAGCAGGCAAGGAAGCGCAAGGGGGATGCTGTTGCCACAAATG ATGGTAAAAGGATGAAAACAGGTGGTGATGCTATGGAGACAGCAGCGGA  AGAGGATGCTCCCCTGAGCGGCGGAACTCCTGTGAAGCGCAACAGCAGGAAGAGTAGTGAGGTTGATGCCAAAGGCGGTGGCGGTAGTCCTGTTGTGAGCAGCCCTCGCAGGGTGACGAGGAGCAATGCCAAGGCTAGCGGTGAAGCTGATGGTAGCCCTGCGACAAGGACCAGGAGGGCTACCCGCGCTGAAGCCTGAATGAAGATGGATGAATGGCTGGTTGGCTGGCTGTAGAGGGGAAGAAGACGGAGACTGGAGCCATTTTGGGGTCGTATTCGTATATTCTATCTATTTAGTAATTTAGGCCGTTTGCCTTGTGCTGTTGCTCTAGCTCTTTTGATCCACAAGGGGTGAACTGGAACTGCCGCGGTGTGCTTTTGGGATGGCTTGGGTTGGGTTGTTAGTTGAAGGAATATATACTTATATACAGTGGTTGCTTTACCTTTACCTGTATGGATGTATGATGGATGTTCCTCATACAACTTTCCAATTCCAATTACTGGCATGGTTTGC]
[+] EMBL AA750762             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCAGTTGAAAAGAAACAGGCGACGAAGCGGGCTTCTAAGAAAGGCTGAGAAGAAGCAGGCAAGGAAGCGCAAGGGGGATGCTGTTGCCACAAATGAATGGT AAAGGATGAAAACAGGTGGTGATGCTATGGAGACAGCAGCGGAAGAGAGGATGCT CCCTGAGCGGCGGAACTCCTGT AAGCGCAACAGCAGGAAGAGTAGTGAGGTTGATGC  AA GCGGTGGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]




>consensus_360#0
GGATCCACAGCGGAAAAAGGACATGTGGTAAATGCCGGGCACAAATACCAGCAAAAATGG
CAGAGCAGCCAAGAGTCAACTCAGCATTAGTTTCTGTTATCCGTATGGCTAAGGTTTCAA
AGAATGCCAACTCAGCTGTCTCTGCAGCTGCGTATCATTACATACGAAATGATGATAGAC
CTGACAAGGCTTTTACAACTGAAAGGGCTAAGAGGGCTGGAAAAGCTAATGCTTCAAGTG
GCCAGATCTTTGTTACTATCCCACCCGACCATTTTGGCCCCATTCTTGCAGAGAATGACC
CCAAGAGAAGCATTGGTGTTCTAGTTGGGGATACATGGGAAGACAGACTTGAGTGCAGGC
AATGGGGTGCCCATTTTCCTCACGTGGCTGGTATTGCTGGCCAATCCACACATGGTGCTC
AGTCGGTAGCCCTCTCGGGTGGGTATGTCGATGATGAGGACCATGGGGAATGGTTTCTAT
ATACTGGAAGTGGTGGAAGAGATCTAAGTGGGAACAAGCGTACAAACAAGGAGCAGTCCT
CAGACCAGAAATTTGAGAAGCTGAATGCTGCTCTTCGTATTAGTTGCCTCAAGGGTTACC
CTGTCAGGGTTGTGCGGTCCCACAAAGAGAAGCGTTCTTCATATGCTCCTGAAGCTGGTG
TGAGGTATGATGGAGTTTACAGGATTGAAAAATGTTGGAGGAAGATTAGTGTTCAGGGTA
AATTCAAGGTTTGCAGGTATCTCTTTGTACGTTGTGACAATGAACCAGCTCCTTGGACTA
GTGATATTTATGGTGACCGTCCGAGGCCACTCCCCAAAGTTGATGAGCTGAAAGGTGCAA
CAGACATATCAGAGAGGAAAGGAACTCCTTCATGGGACTTTGATGAGAAAGAAGGCTGGA
AGTGGGTGAAGCCTCCACCAATCAGCAGAAAGCCTAACCTATCAGGGGATCCTGCAACTG
ACAAGGAAATCCGGAGGGTTGCAAGGCGTGCCCAGATGTCTGTGACTGAAAGGCTGCTGA
AAGAGTTTGGATGTTCCATTTGCAAGCAAGTGATGAAGGAACCACTCACTACTCCATGTG
CTCATAACTTCTGCAAGTTGTGTTTGGTTGGGACATATGGTAGTCAATCGTCTATGAGGG
AGAGAAGCCGGGGTGGGCGGACTCTAAGGGCACAGAAGATTGTGAAGAAGTGCCCTTCAT
GTCCAACTGATATTTGTGACTTCCTAGAGAATCCACAGATCAATCGAGAGATGATGGATT
TGATTGAGTCCTTGCAAAGAAAGGCTGTTGAAGAAGGAGATACCAAGACAAGCTCAGATG
TTAGCAATGGTGCTGAGTCATCTGGAGATGATGGAAACAACGAAGCTTTAGAGAAGGGAG
AGGATGATAGCAGCTTGAAGGATGATGGCAGCTTGAAGGATGATGGCAAAGTGGTCAAGG
CCGTGGTTGTAATCAAGGAAGAGGACCTGCAGCCTAAGAAGAGCAAAGGAGAAGATGAGA
AAGAACAAGGTGACAAGAAGATGGACAGTGCTGATGTGGTGGACATTGCAGTTGAAAAGA
AACAGGCGACGAAGCGGGCTTCTGAGAAGGCTGAGAAGAAGCAGGCAAGGAAGCGCAAGG
GGGATGCTGTTGCCACAAATGATGGTAAAAGGATGAAAACAGGTGGTGATGCTATGGAGA
CAGCAGCGGAAGAGGATGCTCCCCTGAGCGGCGGAACTCCTGTGAAGCGCAACAGCAGGA
AGAGTAGTGAGGTTGATGCCAAAGGCGGTGGCGGTAGTCCTGTTGTGAGCAGCCCTCGCA
GGGTGACGAGGAGCAATGCCAAGGCTAGCGGTGAAGCTGATGGTAGCCCTGCGACAAGGA
CCAGGAGGGCTACCCGCGCTGAAGCCTGAATGAAGATGGATGAATGGCTGGTTGGCTGGC
TGTAGAGGGGAAGAAGACGGAGACTGGAGCCATTTTGGGGTCGTATTCGTATATTCTATC
TATTTAGTAATTTAGGCCGTTTGCCTTGTGCTGTTGCTCTAGCTCTTTTGATCCACAAGG
GGTGAACTGGAACTGCCGCGGTGTGCTTTTGGGATGGCTTGGGTTGGGTTGTTAGTTGAA
GGAATATATACTTATATACAGTGGTTGCTTTACCTTTACCTGTATGGATGTATGATGGAT
GTTCCTCATACAACTTTCCAATTCCAATTACTGGCATGGTTTGC
clustalw multiple alignements is not computed in this case