cluster # 3816

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Oryza sativa
cluster # 3816 cluster # 3816 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_3816#0 length = 2380 sequences # 2
consensusID : consensus_3816#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2380
fasta sequence
                              [AGCAAACCTGATGAAATGTCAAGTTGATGCAAAGCTTTGCGCGTTGAGGTCATTCATAACATTTCTGTCAGTATGCACTGGAACAAGTTCATATAAGAAGTTTGGCTTACCTGGTGGAGGGATTTCAATAACAACTACACAATCAGCGGTTAGATGTGCATGCAAGTCTCTGCAGTCAGCTGTTGACTCCCTCCCTCCTGAGGTTGATAACAGTGGGGTTTTGTTTCCTCCCTTGTCTGGACAAGTGGAATTGTTGCTTACTATCACCAGGATCTTACTTGACCATGCTAAACAAAGCAAAAGTTCAAGGCATCTTTATCCAGTTATTGTACTACTCATGAAAACTTCAGGTGCCAGCACTTCCTTTTTGTTTAATCTCATGCCATCCAGTCCTGCTCTTAAGCAACCAGTGAAGTCCCTCCTTGTTCTGCTTTTGTCATTATTTGAATTCGTTTACAAGAAGGTTGACATGAAAGATGGATCTGAAGATGTCAATATATTTGGGGAGTTATCCCTTTTAAGTATGAGCTTGTTACCTGTATTATGCAAATTGGCAGAGAGCAGAGAATATTTTGATCTTGCTATTGCATCAATGGACATAATATTGAAAGGCTTTTTGCCTTCTAATGTATGGGTGCCTATTCTACAAAAGCATTTTCGTCTCCAGGTTATACTGCAAAAGTGCCAAAGTGGGGCTTTATTGTGTACTCAAGTCATATTGAATTTCCTCTTGACTATGGGGCGGACAAAGGACGGTGCTAAAATTCTTCAGTCTGCCAATATTTTTGCTTTCATAAAGGTCCTTCTGAGTCAGATGTCTTTGGATGACTCCTGTTTGAGAAATTCCTTGAGCACCCAAACAAAGGATGTGAAAATTTGGGGTTTGGGTCTTGCTATTGTCTCCTCTTTGAACCATTGCATGGATGATGATATTTCCCGCAACAGTGTTGCAAACAGTACTATCAGCTTCCTTTCAGGGCAAGTGCCTTTGATGTCGTCTTATCTATCTGCACAAAGTGTTAACACTCATCAGAGCAAGAAAAGGACACTGTTACAAAAGTCACAGACATCACTTTCAGCTCTCAGTCTTACTGAGAATATTCTCACACTTCTCTGTATTTTGGCCAAGTACCATTTCCCACGGGACACAGGTATGAAGGAAGTAGATTCAGAATTAAGGGAGATTATTATCCACCTGCTTGCATTTATAAGCAGAGGTAGTGAAAGAACCGGTGATTCCCCAAACTGGAACTTATCCTTTGGTTGTCCTCCTATTATTAAAGAGGAAATGAAGCTTAATGAAGAGCCACCACTTATTAGGAGCAAATATGGATGGTTCCGATTTGCTGCAAGTTGTACTTTGTCAACTCCATCTGTCTCTGGTCCTCCCAATGCAGGATTGTCACTTGTGATTAGAGACAAAAATCCAGCGGATTCTGATTCTATGAAGCAGACTCGTTTTACAGAGATGTTAGCAGTACAAATCTATAGGATTGCTTTTCTTATTATGAAGTTCCTATGCAGTCAAGCAAAAGAGGCAGTAAGAAGGGCAGAAGAACTGGAGTTCCTTGACCTTGCTCATTTCCCAGAACTTCCGATGCCAGATATTCTTCACGGCCTGCAGGATCAAGTGGTTTCTATTGTCACTAAAGTATTAGAGGCAAATGTATCTACTGCACTCAATACCGAGACAGAGAGGGTGTGCCAACTTCTGTTGGTGATACTTGAAACATCACTTTACATGGAATTGTGTGTATCCCAATCATGTGGCATCAGACCAGTGATGGGTCGTTTTGAAGATTTCTCCAAGGAAATTAAGGCTATGGTTCATGCTTCTGAGAAGCATTCCAGTTTTAAACCATTGGTCAGGTCACTTGCCCAAATTACCACTCTTCTTTATCCCGGGATTGTACAAAATAACAATCTCATGTAATTTTTGTAAATTGTGTAGCTATGATAATGAAATTTGTTGGTTAACTATCATAGATGGAATGGCAGCTCACATATCATTGTCAATGTAGCTCCTGACTGGGTAGTGTGTAGCCGCCAAAAAGAAACTGGGTAGCATGTGACTGTTCATGCATCTTAAACATCTGACGTGATAGCACATAGCAGAGGCTCTCGGCAAGGCAGCAACACCAAGAACTCCACTGTTCGTCAACTTCTGTGCTAACCTATTCGCCAAGAGCGTAGTGCCAGGAATGGGCATTAGGAAGACTGGAAGTTCATCTTAGCTTTTTTTTTTTTTGTAGGTTTGATCTGTTTAGTTGCATCTTGCAGTTTACATCGAGTTGCATCAATGGCCGATGTGGCTACCATGTTTATTGAATACTCTACATGGTAGGTGCAAATGAGGACTGGAATTAGTTCCACAGCTATT]

[+] EMBL AK064417             [AGCAAACCTGATGAAATGTCAAGTTGATGCAAAGCTTTGCGCGTTGAGGTCATTCATAACATTTCTGTCAGTATGCACTGGAACAAGTTCATATAAGAAGTTTGGCTTACCTGGTGGAGGGATTTCAATAACAACTACACAATCAGCGGTTAGATGTGCATGCAAGTCTCTGCAGTCAGCTGTTGACTCCCTCCCTCCTGAGGTTGATAACAGTGGGGTTTTGTTTCCTCCCTTGTCTGGACAAGTGGAATTGTTGCTTACTATCACCAGGATCTTACTTGACCATGCTAAACAAAGCAAAAGTTCAAGGCATCTTTATCCAGTTATTGTACTACTCATGAAAACTTCAGGTGCCAGCACTTCCTTTTTGTTTAATCTCATGCCATCCAGTCCTGCTCTTAAGCAACCAGTGAAGTCCCTCCTTGTTCTGCTTTTGTCATTATTTGAATTCGTTTACAAGAAGGTTGACATGAAAGATGGATCTGAAGATGTCAATATATTTGGGGAGTTATCCCTTTTAAGTATGAGCTTGTTACCTGTATTATGCAAATTGGCAGAGAGCAGAGAATATTTTGATCTTGCTATTGCATCAATGGACATAATATTGAAAGGCTTTTTGCCTTCTAATGTATGGGTGCCTATTCTACAAAAGCATTTTCGTCTCCAGGTTATACTGCAAAAGTGCCAAAGTGGGGCTTTATTGTGTACTCAAGTCATATTGAATTTCCTCTTGACTATGGGGCGGACAAAGGACGGTGCTAAAATTCTTCAGTCTGCCAATATTTTTGCTTTCATAAAGGTCCTTCTGAGTCAGATGTCTTTGGATGACTCCTGTTTGAGAAATTCCTTGAGCACCCAAACAAAGGATGTGAAAATTTGGGGTTTGGGTCTTGCTATTGTCTCCTCTTTGAACCATTGCATGGATGATGATATTTCCCGCAACAGTGTTGCAAACAGTACTATCAGCTTCCTTTCAGGGCAAGTGCCTTTGATGTCGTCTTATCTATCTGCACAAAGTGTTAACACTCATCAGAGCAAGAAAAGGACACTGTTACAAAAGTCACAGACATCACTTTCAGCTCTCAGTCTTACTGAGAATATTCTCACACTTCTCTGTATTTTGGCCAAGTACCATTTCCCACGGGACACAGGTATGAAGGAAGTAGATTCAGAATTAAGGGAGATTATTATCCACCTGCTTGCATTTATAAGCAGAGGTAGTGAAAGAACCGGTGATTCCCCAAACTGGAACTTATCCTTTGGTTGTCCTCCTATTATTAAAGAGGAAATGAAGCTTAATGAAGAGCCACCACTTATTAGGAGCAAATATGGATGGTTCCGATTTGCTGCAAGTTGTACTTTGTCAACTCCATCTGTCTCTGGTCCTCCCAATGCAGGATTGTCACTTGTGATTAGAGACAAAAATCCAGCGGATTCTGATTCTATGAAGCAGACTCGTTTTACAGAGATGTTAGCAGTACAAATCTATAGGATTGCTTTTCTTATTATGAAGTTCCTATGCAGTCAAGCAAAAGAGGCAGTAAGAAGGGCAGAAGAACTGGAGTTCCTTGACCTTGCTCATTTCCCAGAACTTCCGATGCCAGATATTCTTCACGGCCTGCAGGATCAAGTGGTTTCTATTGTCACTAAAGTATTAGAGGCAAATGTATCTACTGCACTCAATACCGAGACAGAGAGGGTGTGCCAACTTCTGTTGGTGATACTTGAAACATCACTTTACATGGAATTGTGTGTATCCCAATCATGTGGCATCAGACCAGTGATGGGTCGTTTTGAAGATTTCTCCAAGGAAATTAAGGCTATGGTTCATGCTTCTGAGAAGCATTCCAGTTTTAAACCATTGGTCAGGTCACTTGCCCAAATTACCACTCTTCTTTATCCCGGGATTGTACAAAATAACAATCTCATGTAATTTTTGTAAATTGTGTAGCTATGATAATGAAATTTGTTGGTTAACTATCATAGATGGAATGGCAGCTCACATATCATTGTCAATGTAGCTCCTGACTGGGTAGTGTGTAGCCGCCAAAAAGAAACTGGGTAGCATGTGACTGTTCATGCATCTTAAACATCTGACGTGATAGCACATAGCAGAGGCTCTCGGCAAGGCAGCAACACCAAGAACTCCACTGTTCGTCAACTTCTGTGCTAACCTATTCGCCAAGAGCGTAGTGCCAGGAATGGGCATTAGGAAGACTGGAAGTTCATCTTAGCTTTTTTTTTTTTTGTAGGTTTGATCTGTTTAGTTGCATCTTGCAGTTTACATCGAGTTGCATCAATGGCCGATGTGGCTACCATGTTTATTGAATACTCTACATGGTAGGTGCAAATGAGGACTGGAATTAGTTCCACAGCTATT]
[+] EMBL CF304581             [                                                                                                                                                                                                           TTGATAACAGTGGGGTTTTGTTTCCTCCCTTGTCTGGACAAGTGGAATTGTTGCTTACTATCACCAGGATCTTACTTGACCATGCTAAACAAAGCAAAAGTTCAAGGCATCTTTATCCAGTTATTGTACTACTCATGAAAACTTCAGGTGCCAGCACTTCCTTTTTGTTTAATCTCATGCCATCCAGTCCTGCTCTTAAGCAACCAGTGAAGTCCCTCCTTGTTCTGCTTTTGTCATTATTTGAATTCATTTACAACAAGGTTGACATGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]




>consensus_3816#0
AGCAAACCTGATGAAATGTCAAGTTGATGCAAAGCTTTGCGCGTTGAGGTCATTCATAAC
ATTTCTGTCAGTATGCACTGGAACAAGTTCATATAAGAAGTTTGGCTTACCTGGTGGAGG
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TGTTGACTCCCTCCCTCCTGAGGTTGATAACAGTGGGGTTTTGTTTCCTCCCTTGTCTGG
ACAAGTGGAATTGTTGCTTACTATCACCAGGATCTTACTTGACCATGCTAAACAAAGCAA
AAGTTCAAGGCATCTTTATCCAGTTATTGTACTACTCATGAAAACTTCAGGTGCCAGCAC
TTCCTTTTTGTTTAATCTCATGCCATCCAGTCCTGCTCTTAAGCAACCAGTGAAGTCCCT
CCTTGTTCTGCTTTTGTCATTATTTGAATTCGTTTACAAGAAGGTTGACATGAAAGATGG
ATCTGAAGATGTCAATATATTTGGGGAGTTATCCCTTTTAAGTATGAGCTTGTTACCTGT
ATTATGCAAATTGGCAGAGAGCAGAGAATATTTTGATCTTGCTATTGCATCAATGGACAT
AATATTGAAAGGCTTTTTGCCTTCTAATGTATGGGTGCCTATTCTACAAAAGCATTTTCG
TCTCCAGGTTATACTGCAAAAGTGCCAAAGTGGGGCTTTATTGTGTACTCAAGTCATATT
GAATTTCCTCTTGACTATGGGGCGGACAAAGGACGGTGCTAAAATTCTTCAGTCTGCCAA
TATTTTTGCTTTCATAAAGGTCCTTCTGAGTCAGATGTCTTTGGATGACTCCTGTTTGAG
AAATTCCTTGAGCACCCAAACAAAGGATGTGAAAATTTGGGGTTTGGGTCTTGCTATTGT
CTCCTCTTTGAACCATTGCATGGATGATGATATTTCCCGCAACAGTGTTGCAAACAGTAC
TATCAGCTTCCTTTCAGGGCAAGTGCCTTTGATGTCGTCTTATCTATCTGCACAAAGTGT
TAACACTCATCAGAGCAAGAAAAGGACACTGTTACAAAAGTCACAGACATCACTTTCAGC
TCTCAGTCTTACTGAGAATATTCTCACACTTCTCTGTATTTTGGCCAAGTACCATTTCCC
ACGGGACACAGGTATGAAGGAAGTAGATTCAGAATTAAGGGAGATTATTATCCACCTGCT
TGCATTTATAAGCAGAGGTAGTGAAAGAACCGGTGATTCCCCAAACTGGAACTTATCCTT
TGGTTGTCCTCCTATTATTAAAGAGGAAATGAAGCTTAATGAAGAGCCACCACTTATTAG
GAGCAAATATGGATGGTTCCGATTTGCTGCAAGTTGTACTTTGTCAACTCCATCTGTCTC
TGGTCCTCCCAATGCAGGATTGTCACTTGTGATTAGAGACAAAAATCCAGCGGATTCTGA
TTCTATGAAGCAGACTCGTTTTACAGAGATGTTAGCAGTACAAATCTATAGGATTGCTTT
TCTTATTATGAAGTTCCTATGCAGTCAAGCAAAAGAGGCAGTAAGAAGGGCAGAAGAACT
GGAGTTCCTTGACCTTGCTCATTTCCCAGAACTTCCGATGCCAGATATTCTTCACGGCCT
GCAGGATCAAGTGGTTTCTATTGTCACTAAAGTATTAGAGGCAAATGTATCTACTGCACT
CAATACCGAGACAGAGAGGGTGTGCCAACTTCTGTTGGTGATACTTGAAACATCACTTTA
CATGGAATTGTGTGTATCCCAATCATGTGGCATCAGACCAGTGATGGGTCGTTTTGAAGA
TTTCTCCAAGGAAATTAAGGCTATGGTTCATGCTTCTGAGAAGCATTCCAGTTTTAAACC
ATTGGTCAGGTCACTTGCCCAAATTACCACTCTTCTTTATCCCGGGATTGTACAAAATAA
CAATCTCATGTAATTTTTGTAAATTGTGTAGCTATGATAATGAAATTTGTTGGTTAACTA
TCATAGATGGAATGGCAGCTCACATATCATTGTCAATGTAGCTCCTGACTGGGTAGTGTG
TAGCCGCCAAAAAGAAACTGGGTAGCATGTGACTGTTCATGCATCTTAAACATCTGACGT
GATAGCACATAGCAGAGGCTCTCGGCAAGGCAGCAACACCAAGAACTCCACTGTTCGTCA
ACTTCTGTGCTAACCTATTCGCCAAGAGCGTAGTGCCAGGAATGGGCATTAGGAAGACTG
GAAGTTCATCTTAGCTTTTTTTTTTTTTGTAGGTTTGATCTGTTTAGTTGCATCTTGCAG
TTTACATCGAGTTGCATCAATGGCCGATGTGGCTACCATGTTTATTGAATACTCTACATG
GTAGGTGCAAATGAGGACTGGAATTAGTTCCACAGCTATT
clustalw multiple alignements is not computed in this case