These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4206#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1588 fasta sequence [GCGGAGGGGGTAGCTGGGCGAGGTCTTGGGGGGTGATTTTTGCGGAGAAATTCTGTTGTTGTTGGATGCAAGGAGGGGCCATGTCGGCGGCGGCGACGGCGACGGCGAGCGAGGCGGCGGCGTACGGCGGCGTGGGCATGAGCAAGAGCGGGGCCCTGCAGCCTCAGCCGCCGCACGGCGCCGCCGCCGCGGTGCGCCTCGCCTACACCCACGACGGCATCGCGGTGTACAAGCACACGCCGCCGCCGCCGGTGTACCAGACGCCGGCCGCCGTCGCCGCCCCGTCGCCGCCCGTCCGCGGCAATGGCGGTGCGCCCGCGTCCGCCGAGCAGCACAAGCGCAAGCGCGGCCGACCGCGCAAGTACGCCGTCACGGACGTGCCGCTCGCCGTCGTGCCACCCTCGCCGCGAAAGGCTGCGGCCGCCGCCGGCGCCAGCGCCGCCCAGTCTCCGGCGACGCCCACGCTGCCGCCGGGCTTCTCGTCGGGCCTGGCCGCGTACGGAGGCGCCGCGGCGAGCCAGCCGGCGCCACGTCAGGCTCCGCCGGCATCCGGGCGCGTGCTACCTCACAAGAAGAGGGGCCGGCCGCCGGGCTCCGGCAACAAACAGCAGCAGCGGCCTCAGCACAAGAAGGCAGCAGCTCCAGGATCTAGTGTGATTGGATTGAAGCCTAGCGTCATCACAGTGCAAGTTGGAGAGGGTGTAGTGTCCAGGGTGATGTCCTTTACTAAGAATGGATGGGCTGTTTGTGTTCTCCCAGCTAATGGTGCTGTATCCAACATGACACTGCGTCAAGCAGGTTCTTCTGGTGCAACAACAGTAAATTATGAGGGCCATTTTGAGATTCTTTCTTTGTCTGGCTCATATCTGCTGTCAGAAAGTGTTGGCCTGAGCAGTCGAGCTGGGGGACTTAGTGTTTCACTTGCTGGTCCTGACGGACGTGTTTTAGGTGGCGGAGTAGCAGGACCTCTGAATGCAGCTACACCTGTTCAGGTGGTCATTGGAAGCTTTCTGGCTGATGTGAAGAAGGGGCACAAACAGGCCATGCCGAGTGGGGCTCCGTATCCAGGTGTGAGCACTCCAACATCCAGAGGGACTCCCAGTGGATCCTCAGGTGGGCCTGGTAGCCCCCTAAACCAAAGTGCAAGTGGCTCATTTAACACCAGCAACCAACAAGCCTTGGCTGACTTCCCATGGAGATGAGCTTGGTGGTTCTGATGATCTTTCAGCCTTCAGCTAAAGTCATTGGTGGTTCTGATGAGGGGATTGGGGTTTGTAGCTATTGGACCTCAAGAGGTAAACATAATTTGGTGGTTTCGGCTGTCGCTTCGTTTATTAGACAGGTTGTTATCTCTCAAGT-TTA-GGTGCTGAAAATGTCAGCTCTTAGTTTAGGTGCTCCTAGACACCTA-G-TGTTCA-GA-GAAA-TCAGCTTGAAAGGAAAAGCTGAGAAAAAAATTTGTTGGCTTCAATGCA-CCCCTGGATGTCATGTGGTTAAGTGACCATGTCGAAATGTGT-GGTGCTGTTTTAAGGTACACCTGTTCTTATTACTCTTTGTTTAGTGAGGGAATGCTGCATGGTTGCTTATGCAAAAA] [+] EMBL AK121658 [GCGGAGGGGGTAGCTGGGCGAGGTCTTGGGGGGTGATTTTTGCGGAGAAATTCTGTTGTTGTTGGATGCAAGGAGGGGCCATGTCGGCGGCGGCGACGGCGACGGCGAGCGAGGCGGCGGCGTACGGCGGCGTGGGCATGAGCAAGAGCGGGGCCCTGCAGCCTCAGCCGCCGCACGGCGCCGCCGCCGCGGTGCGCCTCGCCTACACCCACGACGGCATCGCGGTGTACAAGCACACGCCGCCGCCGCCGGTGTACCAGACGCCGGCCGCCGTCGCCGCCCCGTCGCCGCCCGTCCGCGGCAATGGCGGTGCGCCCGCGTCCGCCGAGCAGCACAAGCGCAAGCGCGGCCGACCGCGCAAGTACGCCGTCACGGACGTGCCGCTCGCCGTCGTGCCACCCTCGCCGCGAAAGGCTGCGGCCGCCGCCGGCGCCAGCGCCGCCCAGTCTCCGGCGACGCCCACGCTGCCGCCGGGCTTCTCGTCGGGCCTGGCCGCGTACGGAGGCGCCGCGGCGAGCCAGCCGGCGCCACGTCAGGCTCCGCCGGCATCCGGGCGCGTGCTACCTCACAAGAAGAGGGGCCGGCCGCCGGGCTCCGGCAACAAACAGCAGCAGCGGCCTCAGCACAAGAAGGCAGCAGCTCCAGGATCTAGTGTGATTGGATTGAAGCCTAGCGTCATCACAGTGCAAGTTGGAGAGGGTGTAGTGTCCAGGGTGATGTCCTTTACTAAGAATGGATGGGCTGTTTGTGTTCTCCCAGCTAATGGTGCTGTATCCAACATGACACTGCGTCAAGCAGGTTCTTCTGGTGCAACAACAGTAAATTATGAGGGCCATTTTGAGATTCTTTCTTTGTCTGGCTCATATCTGCTGTCAGAAAGTGTTGGCCTGAGCAGTCGAGCTGGGGGACTTAGTGTTTCACTTGCTGGTCCTGACGGACGTGTTTTAGGTGGCGGAGTAGCAGGACCTCTGAATGCAGCTACACCTGTTCAGGTGGTCATTGGAAGCTTTCTGGCTGATGTGAAGAAGGGGCACAAACAGGCCATGCCGAGTGGGGCTCCGTATCCAGGTGTGAGCACTCCAACATCCAGAGGGACTCCCAGTGGATCCTCAGGTGGGCCTGGTAGCCCCCTAAACCAAAGTGCAAGTGGCTCATTTAACACCAGCAACCAACAAGCCTTGGCTGACTTCCCATGGAGATGAGCTTGGTGGTTCTGATGATCTTTCAGCCTTCAGCTAAAGTCATTGGTGGTTCTGATGAGGGGATTGGGGTTTGTAGCTATTGGGCCTCAAGAGGTAAACATAATTTGGTGGTTTCGGCTGTCGCTTCGTTTATTAGACAGGTTGTTATCTCTCAAGT TTA GGTGCTGAAAATGTCAGCTCTTAGTTTAGGTGCTCCTAGACACCTA G TGTTCA GA GAAA TCAGCTTGAAAGGAAAAGCTGAGAAAAAAATTTGTTGGCTTCAATGCA CCCCTGGATGTCATGTGGTTAAGTTACCATGTCGAAATGTGT GGTGCTGTTTTAAGGTACACCTGTTCTTATTACTCTTTGTTTAGTGAGGGAATGCTGCATGGTTGCT ] [+] EMBL CA765571 [ TTTACTTGCTGGTCCTGACGGACGTGTTTTAGGTGGCGGAGTAGCAGGACCTCTGAATGCAGCTACACCTGTTCAGGTGGTCATTGGAAGCTTTCTGGCTGATGTGAAGAAGGGGCACAAACAGGCCATGCCGAGTGGGGCTCCGTATCCAGGTGTGAGCACTCCAACATCCAGAGGGACTCCCAGTGGATCCTCAGGTGGGCCTGGTAGCCCCCTAGACCAAAGTGCAAGTGGCTCATTTAACACCAGCAACCAACAAGCCTTGGCTGACTTCCCATGGAGATGAGCTTGGTGGTTCTGATGATCTTTCAGCCTTCAGCTAAAGTCATTGGTGGTTCTGATGAGGGGATTGGGGTTTGTAGCTATTGGACCTCAAGAGGTAAACATAATTTGGTGGTTTCGGCTGTCGCTTCGTTTATTAGACAGGTTGTTATCTCTCAAGT TTA GGTGCTGAAAATGTCAGCTCTTAGTTTAGGTGCTCCTAGACACCTA G TGTTCA GA GAAA TCAGCTTGAAAGGAAAAGCTGAGAAAAAGATTTGTTGGCTTCAATGCA CCCCTGGATGTCATGTGGTTAAGTGACCATGTCGAAATGTGTGGGTGCTGTTTTAAGGTACACCTGT ] [+] EMBL BI802889 [ ATGAGGGGATTGGGGTTTGTAGCTATTGGACCTCAAGAGGTAAACATAATTTGGTGGTTTCGGCTGTCGCTTCGTTTATTAGACAGGTTGTTATCTCTCAAGTCTTACGGTGCTGAAAATGTCAGCTCTTAGTTTAGGTGCTCCTAGACACCTACGCTGTTCACGACGAAACTCAGCTTGAAAGGAAAAGCTGAGAAAAAAATTTGTTGGCTTCAATGCACCCCCTGGATGTCATGTGGTTAAGTGACCATGTCGAAATGTGT GGTGCTGTTTTAAGGTACACCTGTTCTTATTACTCTTTGTTTAGTGAGGGAATGCTACATGGTTGCTTATGCAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||