cluster # 4261

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Oryza sativa
cluster # 4261 cluster # 4261 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_4261#0 length = 1555 sequences # 3
consensusID : consensus_4261#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1555
fasta sequence
                              [CTTCCATTCTTCTCCTGCTAAGCTCCAGAGAAAGCTTCTCCTCCTCTTTCGCAAACCGTATAAAATCTCGCCTCTGAAATCGAGCCCGATCCGAGGCTTCCGCGGATGGTGCTCACGATCATGGAGGCCAAGGGGAAGGATGCATGGGGGCTACTGCTCGTGCTCCTCCTTGGCCAGCTCGTCGCCTTCTCCATGGCCGTCTCCAGCTTCACCTCCTCCCTCATTGCCACACTTGGGGTTGATGCGCCGCTCACGCAGTCTTTCTTCGCGTACTTGTTGTTGACCTTGGTTTATGTGCCAATCCTCTTGAAACGACGGCAAAAGCTGCAGATACCTTGGTATTGGTACCTAGCCTTGGCCTTCATTGATGTCCAAGGAAATTATCTTGTCGTCAAGGCGTACCAGTACTCGTACATCACCAGCGTAACACTGTTGGATTGCTGGACTGTTGTTTGGGTCGTCATACTCACCTGGTATGCATTGGGCACAAGATATTCTTTCTGGCAAATTGTTGGGGCAGGGACCTGTGTGGCAGGGCTTGCTCTTGTGCTCCTTTCAGATTCAAAATCAGCAGATGCACAAGATCCGAGTAAAATACCACTTCTAGGAGATGCCCTTGTCATTGCCGGGACAATATTTTTTGCATTTAGCAATGTTGGTGAGGAATACTGTGTCAAGAAAAAAGATCGAGTTGAATTTGTTGCCATGTTTGCACTCTTTGGGTTGCTTGTCAGTATAATTCAGATATTAATATTTGAAAAGAAGAACTTAGTTGCAATTGCCTGGTCTCCAACAATGTTATGTCTGTTCGCAGGATTTGCAGTGGCACTATTTATGTTCTACAGCATCACTCCTTTTGTCCTTAAGATGAGTGGATCAACATTGTTCAACCTTTCACTCCTAACATCCGACATGTGGGCAGTCGCCATTCGAGTTTTATTCTATCACCAACAGATAAACTGGCTGTACTATATAGCGTTCGCAGTTGTGGCCATTGGATTGATCATCTATTCGCTGAATGACCATTCTTCGGACAGTGGAACAAGAACAACTGCAAATACAGAAGCAGCAGCCCAATACCAGCAACTTCCAGGAGAGAATAATTCAACAGGAATTGGTTCGAACGACAGCCAAGAAAGGAAACAAGAGGAGGAAGTTCATATCTGTTAGTGGGGGTCAATGTACAAAGTCACCTCCCGGTGTTGAATTTGGGCATAATTACATATGGTTACAAAGGGCAAAAAAAAAAAAGAATATGCTAGGGGGAAAGCACCGGAGTTTTGTTTGCCCTCTATAACTACAACCAGTTGATGATCCATTGTCATCTGCCTGCCACCAAGGTCCAGCTCTCTTAAGTGTTTTGTGAGAGATCTTTTAGAATCCTTGTATATATATGTTTTCCTTTGTTTTTTGAAACCCCTGCTTTATCAATAGGGTGTATTAGGCAATTTATTTTCCCTATATATCCTTCAAAAACAAATGTAAGCAACAACAAATTGAACATATTGGAGGCATGGATACATATACAAGTTATTTTAAATGAAAGTATAACTTT]

[+] EMBL AK066046             [CTTCCATTCTTCTCCTGCTAAGCTCCAGAGAAAGCTTCTCCTCCTCTTTCGCAAACCGTATAAAATCTCGCCTCTGAAATCGAGCCCGATCCGAGGCTTCCGCGGATGGTGCTCACGATCATGGAGGCCAAGGGGAAGGATGCATGGGGGCTACTGCTCGTGCTCCTCCTTGGCCAGCTCGTCGCCTTCTCCATGGCCGTCTCCAGCTTCACCTCCTCCCTCATTGCCACACTTGGGGTTGATGCGCCGCTCACGCAGTCTTTCTTCGCGTACTTGTTGTTGACCTTGGTTTATGTGCCAATCCTCTTGAAACGACGGCAAAAGCTGCAGATACCTTGGTATTGGTACCTAGCCTTGGCCTTCATTGATGTCCAAGGAAATTATCTTGTCGTCAAGGCGTACCAGTACTCGTACATCACCAGCGTAACACTGTTGGATTGCTGGACTGTTGTTTGGGTCGTCATACTCACCTGGTATGCATTGGGCACAAGATATTCTTTCTGGCAAATTGTTGGGGCAGGGACCTGTGTGGCAGGGCTTGCTCTTGTGCTCCTTTCAGATTCAAAATCAGCAGATGCACAAGATCCGAGTAAAATACCACTTCTAGGAGATGCCCTTGTCATTGCCGGGACAATATTTTTTGCATTTAGCAATGTTGGTGAGGAATACTGTGTCAAGAAAAAAGATCGAGTTGAATTTGTTGCCATGTTTGCACTCTTTGGGTTGCTTGTCAGTATAATTCAGATATTAATATTTGAAAAGAAGAACTTAGTTGCAATTGCCTGGTCTCCAACAATGTTATGTCTGTTCGCAGGATTTGCAGTGGCACTATTTATGTTCTACAGCATCACTCCTTTTGTCCTTAAGATGAGTGGATCAACATTGTTCAACCTTTCACTCCTAACATCCGACATGTGGGCAGTCGCCATTCGAGTTTTATTCTATCACCAACAGATAAACTGGCTGTACTATATAGCGTTCGCAGTTGTGGCCATTGGATTGATCATCTATTCGCTGAATGACCATTCTTCGGACAGTGGAACAAGAACAACTGCAAATACAGAAGCAGCAGCCCAATACCAGCAACTTCCAGGAGAGAATAATTCAACAGGAATTGGTTCGAACGACAGCCAAGAAAGGAAACAAGAGGAGGAAGTTCATATCTGTTAGTGGGGGTCAATGTACAAAGTCACCTCCCGGTGTTGAATTTGGGCATAATTACATATGGTTACAAAGGGCAAAAAAAAAAAAGAATATGCTAGGGGGAAAGCACCGGAGTTTTGTTTGCCCTCTATAACTACAACCAGTTGATGATCCATTGTCATCTGCCTGCCACCAAGGTCCAGCTCTCTTAAGTGTTTTGTGAGAGATCTTTTAGAATCCTTGTATATATATGTTTTCCTTTGTTTTTTGAAACCCCTGCTTTATCAATAGGGTGTATTAGGCAATTTATTTTCCCTATATATCCTTCAAAAACAAATGTAAGCAACAACAAATTGAACATATTGGAGGCATGGATACATATACAAGTTATTTTAAATGAAAGTATAACTTT]
[+] EMBL CB682966             [               TGCTAAGCTCCAGAGAAAGCTTCTCCTCCTCTTTCGCAAACCGTATAAAATCTCGCCTCTGAAATCGAGCCCGATCCGAGGCTTCCGCGGATGGTGCTCACGATCATGGAGGCCAAGGGGAAGGATGCATGGGGGCTACTGCTCGTGCTCCTCCTTGGCCAGCTCGTCGCCTTCTCCATGGCCGTCTCCAGCTTCACCTCCTCCCTCATTGCCACACTTGGGGTTGATGCGCCGCTCACGCAGTCTTTCTTCGCGTACTTGTTGTTGACCTTGGTTTATGTGCCAATCCTCTTGAAACGACGGCAAAAGCTGCAGATACCTTGGTATTGGTACCTAGCCTTGGCCTTCATTGATGTCCAAGGAAATTATCTTGTCGTCAAGGCGTACCAGTACTCGTACATCACCAGCGTAACACTGTTGGATTGCTGGACTGTTGTTTGGGTCGTCATACTCACCTGGTATGCATTGGGCACAAGATATTCTTTCTGGCAAATTGTTGGGGCAGGGACCTGTGTGGCAGGGCTTGCTCTTGTGCTCCTTTCAGATTCAAAATCAGCAGATGCACAAGATCCGAGTAAAATACCACTTCTAGGAGATGCCCTTGTCATTGCCGGGACAATATTTTTTGCATTTAGCAATGTTGGTGAGGAATACTGTGTCAAGAAAAAAGATCGAGTTGAATTTGTTGCCATGTTTGCACTCTTTGGGTTGCTTGTCAGTATAATTCAGATATTAATATTTGAAAAGAAGAACTTAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CB682967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAGATATTAATATTTGAAAAGAAGAACTTAGTTGCAATTGCCTGGTCTCCAACAATGTTATGTCTGTTCGCAGGATTTGCAGTGGCACTATTTATGTTCTACAGCATCACTCCTTTTGTCCTTAAGATGAGTGGATCAACATTGTTCAACCTTTCACTCCTAACATCCGACATGTGGGCAGTCGCCATTCGAGTTTTATTCTATCACCAACAGATAAACTGGCTGTACTATATAGCGTTCGCAGTTGTGGCCATTGGATTGATCATCTATTCGCTGAATGACCATTCTTCGGACAGTGGAACAAGAACAACTGCAAATACAGAAGCAGCAGCCCAATACCAGCAACTTCCAGGAGAGAATAATTCAACAGGAATTGGTTCGAACGACAGCCAAGAAAGGAAACAAGAGGAGGAAGTTCATATCTGTTAGTGGGGGTCAATGTACAAAGTCACCTCCCGGTGTTGAATTTGGGCATAATTACATATGGTTACAAAGGGCAAAAAAAAAAAAGAATATGCTAGGGGGAAAGCACCGGAGTTTTGTTTGCCCTCTATAACTACAACCAGTTGATGATCCATTGTCATCTGCCTGCCACCAAGGTCCAGCTCTCTTAAGTGTTTTGTGAGAGATCTTTTAGAATCCTTGTATATATATGTTTTCCTTTGTTTTTTGAAACCCCTGCTTTATCAATAGGGTGTATTAGGCAATTTATTTTCCCTATATATCCTTCAAAAACAAATGTAAGCAACAACAAATTGAACATATTGGAGGCATGGATACATATACAAGTTATTTTAAATGAAAaaaaaga   ]




>consensus_4261#0
CTTCCATTCTTCTCCTGCTAAGCTCCAGAGAAAGCTTCTCCTCCTCTTTCGCAAACCGTA
TAAAATCTCGCCTCTGAAATCGAGCCCGATCCGAGGCTTCCGCGGATGGTGCTCACGATC
ATGGAGGCCAAGGGGAAGGATGCATGGGGGCTACTGCTCGTGCTCCTCCTTGGCCAGCTC
GTCGCCTTCTCCATGGCCGTCTCCAGCTTCACCTCCTCCCTCATTGCCACACTTGGGGTT
GATGCGCCGCTCACGCAGTCTTTCTTCGCGTACTTGTTGTTGACCTTGGTTTATGTGCCA
ATCCTCTTGAAACGACGGCAAAAGCTGCAGATACCTTGGTATTGGTACCTAGCCTTGGCC
TTCATTGATGTCCAAGGAAATTATCTTGTCGTCAAGGCGTACCAGTACTCGTACATCACC
AGCGTAACACTGTTGGATTGCTGGACTGTTGTTTGGGTCGTCATACTCACCTGGTATGCA
TTGGGCACAAGATATTCTTTCTGGCAAATTGTTGGGGCAGGGACCTGTGTGGCAGGGCTT
GCTCTTGTGCTCCTTTCAGATTCAAAATCAGCAGATGCACAAGATCCGAGTAAAATACCA
CTTCTAGGAGATGCCCTTGTCATTGCCGGGACAATATTTTTTGCATTTAGCAATGTTGGT
GAGGAATACTGTGTCAAGAAAAAAGATCGAGTTGAATTTGTTGCCATGTTTGCACTCTTT
GGGTTGCTTGTCAGTATAATTCAGATATTAATATTTGAAAAGAAGAACTTAGTTGCAATT
GCCTGGTCTCCAACAATGTTATGTCTGTTCGCAGGATTTGCAGTGGCACTATTTATGTTC
TACAGCATCACTCCTTTTGTCCTTAAGATGAGTGGATCAACATTGTTCAACCTTTCACTC
CTAACATCCGACATGTGGGCAGTCGCCATTCGAGTTTTATTCTATCACCAACAGATAAAC
TGGCTGTACTATATAGCGTTCGCAGTTGTGGCCATTGGATTGATCATCTATTCGCTGAAT
GACCATTCTTCGGACAGTGGAACAAGAACAACTGCAAATACAGAAGCAGCAGCCCAATAC
CAGCAACTTCCAGGAGAGAATAATTCAACAGGAATTGGTTCGAACGACAGCCAAGAAAGG
AAACAAGAGGAGGAAGTTCATATCTGTTAGTGGGGGTCAATGTACAAAGTCACCTCCCGG
TGTTGAATTTGGGCATAATTACATATGGTTACAAAGGGCAAAAAAAAAAAAGAATATGCT
AGGGGGAAAGCACCGGAGTTTTGTTTGCCCTCTATAACTACAACCAGTTGATGATCCATT
GTCATCTGCCTGCCACCAAGGTCCAGCTCTCTTAAGTGTTTTGTGAGAGATCTTTTAGAA
TCCTTGTATATATATGTTTTCCTTTGTTTTTTGAAACCCCTGCTTTATCAATAGGGTGTA
TTAGGCAATTTATTTTCCCTATATATCCTTCAAAAACAAATGTAAGCAACAACAAATTGA
ACATATTGGAGGCATGGATACATATACAAGTTATTTTAAATGAAAGTATAACTTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case