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Oryza sativa
cluster # 4462 cluster # 4462       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4462#0 length = 2771 sequences # 3  

consensusID : consensus_4462#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2771
fasta sequence
                              [AGCAGGACGCGGGTGCTTGGCGGCGGCGCAGCAGCTGGGTGCGAGAGCAAGGGCGAATGGCAGCGTGGATGCAACGCGTGCAGGCGCGGCAGCCCAGCGTAGCGTCGGCGCACCGTGGCATCCTGGTATACTACTGCTATTCCATTCAAGTGGCGGTGCATCTTTCTCCTCCTCCCTACCAGGTGATGCTTTCCTCTTGCGGGGCTGGATTTGGTGTTGGTTCTCTATTCCAGCTGCTCCCATTGGTTGAATTTGGTGCACAAGTCTGACCCTTTAATCTGTTCTGCCCCTTCCGATGTGAATCATTGGCTATCGACAGAGAATTTGTTCGAATTTGGCTCTTCGAGTTCCCAACTATAAAGGATGATGTTTTTCTTGGCCAGATTAGTGTTTCTCTCCTCTCCTAGCCACGAGGGGGGGAGGGAGAACAGATTGTAAGCAGCAAGTTGAGCAGCAAAGACAACCGATGCAGTGGCGTGGAGTTCGAGTTTGACAGTTCGGTGCCCAATCCAGGGTTGCAGTGCTGGAACAAGGCAGAGTAGTTGCTTTGTCTTTGTTTTTCTTTGTATGTTGCAAATTCGCATCACATCAAAGTACGCATCAGTATGATCTCAGGATTCTATGGATGAGAGTACACATCAATATGCTCTCTGGGGATGAGCCACATGATCTTGGGATCAGATTCATCTGAGCAACACAAGATCTTGGCTAATTGGTGTATATTTTTGATAGCTTTTTTTTTTTTGAAGGGAGATTTTTGATAGCTTATTAATACTGAACATCTGGATATATGCCTTATAAGAGCGAGGAAACTTAAGTCTATGGCTTAGCTAATAAAGATTGTAGGTTTTTAGAGTAGGAACAAGGTTAGCATTTCTGTCATTTTATTATACACGCGTTGTTCTTTTTGGACGTGAGATTTAGTTGTCTGTTTGTCAGTCAATGGACTAAAATAATGTAAACTAGGCATATAACAACCATTTAAATTTATGGATTTATGGTTTGATGCAATTTAGCACATGCTAGGTCCTCTTCTCAAATTAGTAGGAGTTTAGGACAAAGTATAATGGTGCTACCTTACTCATATTATACTGGATTGTCAGAATCAGTTGGGCCATTCATTGGCTCCTCCTCCCCTCCTCTATGCTCACTTTGTCATGCTCTGTAGCGGTGGTGGCGTCATATCAGAGATGGAGCAAGAATTGTTGCCGCACTGAATGCTCCATAATGCAAGAAAACCAGTATAGAGAAGCCAGATACATCCGCATAAAGCAAAGACAAACATAGCTTATTTTGTCGGCTTATAACTATGTTAGTTTTGCAGTTTTTGGTTAGAGCTTTGCTTTTTGTGATAACTCTGTTCTTTTGCAGAGTAGATGAATATAAGCCTGTAGTCTGTGATCTATGTGTACACATAACCTCTTTTTTTAAAAAATTCTCATAATATGGATCCAAATTTCATAAGCTATAAGAATTATTGATAATATTCCTGAAGCTTTTGTTCTGGCTTGCTACTCATTTAATAGAAGTTGTCTTCCATTGCCTGAGTGCTCGACTATAAAGAACCTAAATATTAGTTCTTATCAACCTGTGACATTGTAGTGATTTTGTGCTAGCTGATGAATAGTGGATAGTAGCAATGTAGTTTAATTTCAGGAAGGAAAAGAGTGATGCATAGGGAAGGAAAACCTTTGTTCAAAATAAATATATATCATTAGATCTCTCAAAACCTTGCTGTTTTGTGTTCTGCTATTCATTCAGCATTTTAGCTAAAGGCCTAATTTTTATAACCAAACTATGATTACGACGTTGCAATTTTCCGTTAGTTTTATTGTTGCATGTACATTGGGTAAGCACTCGCCTTACAATGTGGGGTGCACTCTCCTGCAGTGGATTTGCCTCGCCTGTGCTTGCATGTGCTTCATTCTATGCAGGTAGAACAAGAAGATCCAGCTTCTACACAGGTAGTATATGTGTGCCTATAACTTTGCTGTAATCACCTCAGTGAGTAGTCTGCTGATCCATCTTTTTGTTCAACTGTGGCAATGGCTGCGGGTAAGCCTTTTAGATATTGATTTGTCAAAATAAACTGACACAAGCTTTCAGAGATGTGTGATTTCATATTTTCCATGATAAAAAATAATGTTATTTCCATTGCTTCAAAGATATACTATATGTTGTGTGTTAATTCCCTTTGCTTCAAAGTTTCTTCAGATAAAGCTGCATGAA-GATGAAAAGACATTTTATTCAGTACTATCGGTTACTTTACATTTATTTATGCCATGCTTTTTTTATTGGTTCAGGAAGATGTACACAGTACACTGATCTGGTGGAGAAGAACACCACAACCACCTCAGCTAACATGTTCCTTTGTTGCACCTGAAAAGGGATAATTCGCATATATTTCATCTTAAAAAGAAACTGAGCTGAAGAAACTTATGAATCAGATAACATTTTTTCTAGGCCTGAATTTGTCTGCTTAATTTTGCAGGCACGGCGAAGCAGCGTTGGAGGTGGCTGCTGGCTCCTATGATGTTGCCCATGTCTCCTGCTACAAGTGCAACCGGTGCAACTGCTAATGTTAAGAGATTATTGACTGTAGCAAGCACCAACGTGCCTATCTGGGATGAAGTGATGAATAAATAAAAGAGGCCATCCAGTGTGACGGTTCAATCTCTGTATATTTGGCTGTTGATAATTACTGGTCATCTTGCCAGTGTGCCCTGTGTAATGTTGTTCAGTGAAATATAAGATAATTTGTTTATGAGAAA]

[+] EMBL AK106708             [AGCAGGACGCGGGTGCTTGGCGGCGGCGCAGCAGCTGGGTGCGAGAGCAAGGGCGAATGGCAGCGTGGATGCAACGCGTGCAGGCGCGGCAGCCCAGCGTAGCGTCGGCGCACCGTGGCATCCTGGTATACTACTGCTATTCCATTCAAGTGGCGGTGCATCTTTCTCCTCCTCCCTACCAGGTGATGCTTTCCTCTTGCGGGGCTGGATTTGGTGTTGGTTCTCTATTCCAGCTGCTCCCATTGGTTGAATTTGGTGCACAAGTCTGACCCTTTAATCTGTTCTGCCCCTTCCGATGTGAATCATTGGCTATCGACAGAGAATTTGTTCGAATTTGGCTCTTCGAGTTCCCAACTATAAAGGATGATGTTTTTCTTGGCCAGATTAGTGTTTCTCTCCTCTCCTAGCCACGAGGGGGGGAGGGAGAACAGATTGTAAGCAGCAAGTTGAGCAGCAAAGACAACCGATGCAGTGGCGTGGAGTTCGAGTTTGACAGTTCGGTGCCCAATCCAGGGTTGCAGTGCTGGAACAAGGCAGAGTAGTTGCTTTGTCTTTGTTTTTCTTTGTATGTTGCAAATTCGCATCACATCAAAGTACGCATCAGTATGATCTCAGGATTCTATGGATGAGAGTACACATCAATATGCTCTCTGGGGATGAGCCACATGATCTTGGGATCAGATTCATCTGAGCAACACAAGATCTTGGCTAATTGGTGTATATTTTTGATAGCTTTTTTTTTTTTGAAGGGAGATTTTTGATAGCTTATTAATACTGAACATCTGGATATATGCCTTATAAGAGCGAGGAAACTTAAGTCTATGGCTTAGCTAATAAAGATTGTAGGTTTTTAGAGTAGGAACAAGGTTAGCATTTCTGTCATTTTATTATACACGCGTTGTTCTTTTTGGACGTGAGATTTAGTTGTCTGTTTGTCAGTCAATGGACTAAAATAATGTAAACTAGGCATATAACAACCATTTAAATTTATGGATTTATGGTTTGATGCAATTTAGCACATGCTAGGTCCTCTTCTCAAATTAGTAGGAGTTTAGGACAAAGTATAATGGTGCTACCTTACTCATATTATACTGGATTGTCAGAATCAGTTGGGCCATTCATTGGCTCCTCCTCCCCTCCTCTATGCTCACTTTGTCATGCTCTGTAGCGGTGGTGGCGTCATATCAGAGATGGAGCAAGAATTGTTGCCGCACTGAATGCTCCATAATGCAAGAAAACCAGTATAGAGAAGCCAGATACATCCGCATAAAGCAAAGACAAACATAGCTTATTTTGTCGGCTTATAACTATGTTAGTTTTGCAGTTTTTGGTTAGAGCTTTGCTTTTTGTGATAACTCTGTTCTTTTGCAGAGTAGATGAATATAAGCCTGTAGTCTGTGATCTATGTGTACACATAACCTCTTTTTTTAAAAAATTCTCATAATATGGATCCAAATTTCATAAGCTATAAGAATTATTGATAATATTCCTGAAGCTTTTGTTCTGGCTTGCTACTCATTTAATAGAAGTTGTCTTCCATTGCCTGAGTGCTCGACTATAAAGAACCTAAATATTAGTTCTTATCAACCTGTGACATTGTAGTGATTTTGTGCTAGCTGATGAATAGTGGATAGTAGCAATGTAGTTTAATTTCAGGAAGGAAAAGAGTGATGCATAGGGAAGGAAAACCTTTGTTCAAAATAAATATATATCATTAGATCTCTCAAAACCTTGCTGTTTTGTGTTCTGCTATTCATTCAGCATTTTAGCTAAAGGCCTAATTTTTATAACCAAACTATGATTACGACGTTGCAATTTTCCGTTAGTTTTATTGTTGCATGTACATTGGGTAAGCACTCGCCTTACAATGTGGGGTGCACTCTCCTGCAGTGGATTTGCCTCGCCTGTGCTTGCATGTGCTTCATTCTATGCAGGTAGAACAAGAAGATCCAGCTTCTACACAGGTAGTATATGTGTGCCTATAACTTTGCTGTAATCACCTCAGTGAGTAGTCTGCTGATCCATCTTTTTGTTCAACTGTGGCAATGGCTGCGGGTAAGCCTTTTAGATATTGATTTGTCAAAATAAACTGACACAAGCTTTCAGAGATGTGTGATTTCATATTTTCCATGATAAAAAATAATGTTATTTCCATTGCTTCAAAGATATACTATATGTTGTGTGTTAATTCCCTTTGCTTCAAAGTTTCTTCAGATAAAGCTGCATGAA GATGAAAAGACATTTTATTCAGTACTATCGGTTACTTTACATTTATTTATGCCATGCTTTTTTTATTGGTTCAGGAAGATGTACACAGTACACTGATCTGGTGGAGAAGAACACCACAACCACCTCAGCTAACATGTTCCTTTGTTGCACCTGAAAAGGGATAATTCGCATATATTTCATCTTAAAAAGAAACTGAGCTGAAGAAACTTATGAATCAGATAACATTTTTTCTAGGCCTGAATTTGTCTGCTTAATTTTGCAGGCACGGCGAAGCAGCGTTGGAGGTGGCTGCTGGCTCCTATGATGTTGCCCATGTCTCCTGCTACAAGTGCAACCGGTGCAACTGCTAATGTTAAGAGATTATTGACTGTAGCAAGCACCAACGTGCCTATCTGGGATGAAGTGATGAATAAATAAAAGAGGCCATCCAGTGTGACGGTTCAATCTCTGTATATTTGGCTGTTGATAATTACTGGTCATCTTGCCAGTGTGCCCTGTGTAATGTTGTTCAGTGAAATATAAGATAATTTGTTTATGAG   ]
[+] EMBL CF324562             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAAGATTGTAGGTTTTTAGAGTAGGAACAAGGTTAGCATTTCTGTCATTTTATTATACACGCGTTGTTCTTTTTGGACGTGAGATTTAGTTGTCTGTTTGTCAGTCAATGGACTAAAATAATGTAAACTAGGCATATAACAACCATTTAAATTTATGGATTTATGGTTTGATGCAATTTAGCACATGCTAGGTCCTCTTCTCAAATTAGTAGGAGTTTAGGACAAAGTATAATGGTGCTACCTTACTCATATTATACTGGATTGTCAGAATCAGTTGGGCCATTCATTGGCTCCTCCTCCCCTCCTCTATGCTCACTTTGTCATGCTCTGTAGCGGTGGTGGCGTCATATCACAGATGGAGCAAGAATTGTTGCCGCACTGAATGCTCCATAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI811964             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aCTGCATGAAGGATGAAAAAACA TTTA CCAGTACTATCG  TACTACACATTTATTTAT CCATGCTTTTTTTATTGGTTCAGGAAGATGTAC CAGTACACTGATCTGGTGGAGAAGAACACCACAACCACCTCAGCTAACACGTTCCTTTGTTGCACCTGAAAAGGGATAATTCGCATATATTTCATCTTAAAAAGAAACTGAGCTGAAGAAACTTATGAATCAGATAACATTTTTTCTAGGCCTGAATTTGTCTGCTTTCTTTT CAGGCACGGCGAA CAGCGTTCGAGGTGGCTGCTGGCTCCTATGATGTTGCCCATGTCTCCTGCTAC AGT C ACCGGTGCAACTGCTAATGTTAAGAGATTATTGACTGTAGC AGCACCAACGTGCCTATCTGGGATGAAGTGATGAATAAATAAAAGAGGCCATCCAGTGTGACGGTTC ATCTCTGTATATTTGGCTGTTGATAATTACTGGTCATCTTGCCAGTGTGCCCTGTGTAATGTTGTTCAGTGAAATATAAGATAATTTGTTTAAAAAAAA]


>consensus_4462#0 AGCAGGACGCGGGTGCTTGGCGGCGGCGCAGCAGCTGGGTGCGAGAGCAAGGGCGAATGG CAGCGTGGATGCAACGCGTGCAGGCGCGGCAGCCCAGCGTAGCGTCGGCGCACCGTGGCA TCCTGGTATACTACTGCTATTCCATTCAAGTGGCGGTGCATCTTTCTCCTCCTCCCTACC AGGTGATGCTTTCCTCTTGCGGGGCTGGATTTGGTGTTGGTTCTCTATTCCAGCTGCTCC CATTGGTTGAATTTGGTGCACAAGTCTGACCCTTTAATCTGTTCTGCCCCTTCCGATGTG AATCATTGGCTATCGACAGAGAATTTGTTCGAATTTGGCTCTTCGAGTTCCCAACTATAA AGGATGATGTTTTTCTTGGCCAGATTAGTGTTTCTCTCCTCTCCTAGCCACGAGGGGGGG AGGGAGAACAGATTGTAAGCAGCAAGTTGAGCAGCAAAGACAACCGATGCAGTGGCGTGG AGTTCGAGTTTGACAGTTCGGTGCCCAATCCAGGGTTGCAGTGCTGGAACAAGGCAGAGT AGTTGCTTTGTCTTTGTTTTTCTTTGTATGTTGCAAATTCGCATCACATCAAAGTACGCA TCAGTATGATCTCAGGATTCTATGGATGAGAGTACACATCAATATGCTCTCTGGGGATGA GCCACATGATCTTGGGATCAGATTCATCTGAGCAACACAAGATCTTGGCTAATTGGTGTA TATTTTTGATAGCTTTTTTTTTTTTGAAGGGAGATTTTTGATAGCTTATTAATACTGAAC ATCTGGATATATGCCTTATAAGAGCGAGGAAACTTAAGTCTATGGCTTAGCTAATAAAGA TTGTAGGTTTTTAGAGTAGGAACAAGGTTAGCATTTCTGTCATTTTATTATACACGCGTT GTTCTTTTTGGACGTGAGATTTAGTTGTCTGTTTGTCAGTCAATGGACTAAAATAATGTA AACTAGGCATATAACAACCATTTAAATTTATGGATTTATGGTTTGATGCAATTTAGCACA TGCTAGGTCCTCTTCTCAAATTAGTAGGAGTTTAGGACAAAGTATAATGGTGCTACCTTA CTCATATTATACTGGATTGTCAGAATCAGTTGGGCCATTCATTGGCTCCTCCTCCCCTCC TCTATGCTCACTTTGTCATGCTCTGTAGCGGTGGTGGCGTCATATCAGAGATGGAGCAAG AATTGTTGCCGCACTGAATGCTCCATAATGCAAGAAAACCAGTATAGAGAAGCCAGATAC ATCCGCATAAAGCAAAGACAAACATAGCTTATTTTGTCGGCTTATAACTATGTTAGTTTT GCAGTTTTTGGTTAGAGCTTTGCTTTTTGTGATAACTCTGTTCTTTTGCAGAGTAGATGA ATATAAGCCTGTAGTCTGTGATCTATGTGTACACATAACCTCTTTTTTTAAAAAATTCTC ATAATATGGATCCAAATTTCATAAGCTATAAGAATTATTGATAATATTCCTGAAGCTTTT GTTCTGGCTTGCTACTCATTTAATAGAAGTTGTCTTCCATTGCCTGAGTGCTCGACTATA AAGAACCTAAATATTAGTTCTTATCAACCTGTGACATTGTAGTGATTTTGTGCTAGCTGA TGAATAGTGGATAGTAGCAATGTAGTTTAATTTCAGGAAGGAAAAGAGTGATGCATAGGG AAGGAAAACCTTTGTTCAAAATAAATATATATCATTAGATCTCTCAAAACCTTGCTGTTT TGTGTTCTGCTATTCATTCAGCATTTTAGCTAAAGGCCTAATTTTTATAACCAAACTATG ATTACGACGTTGCAATTTTCCGTTAGTTTTATTGTTGCATGTACATTGGGTAAGCACTCG CCTTACAATGTGGGGTGCACTCTCCTGCAGTGGATTTGCCTCGCCTGTGCTTGCATGTGC TTCATTCTATGCAGGTAGAACAAGAAGATCCAGCTTCTACACAGGTAGTATATGTGTGCC TATAACTTTGCTGTAATCACCTCAGTGAGTAGTCTGCTGATCCATCTTTTTGTTCAACTG TGGCAATGGCTGCGGGTAAGCCTTTTAGATATTGATTTGTCAAAATAAACTGACACAAGC TTTCAGAGATGTGTGATTTCATATTTTCCATGATAAAAAATAATGTTATTTCCATTGCTT CAAAGATATACTATATGTTGTGTGTTAATTCCCTTTGCTTCAAAGTTTCTTCAGATAAAG CTGCATGAAGATGAAAAGACATTTTATTCAGTACTATCGGTTACTTTACATTTATTTATG CCATGCTTTTTTTATTGGTTCAGGAAGATGTACACAGTACACTGATCTGGTGGAGAAGAA CACCACAACCACCTCAGCTAACATGTTCCTTTGTTGCACCTGAAAAGGGATAATTCGCAT ATATTTCATCTTAAAAAGAAACTGAGCTGAAGAAACTTATGAATCAGATAACATTTTTTC TAGGCCTGAATTTGTCTGCTTAATTTTGCAGGCACGGCGAAGCAGCGTTGGAGGTGGCTG CTGGCTCCTATGATGTTGCCCATGTCTCCTGCTACAAGTGCAACCGGTGCAACTGCTAAT GTTAAGAGATTATTGACTGTAGCAAGCACCAACGTGCCTATCTGGGATGAAGTGATGAAT AAATAAAAGAGGCCATCCAGTGTGACGGTTCAATCTCTGTATATTTGGCTGTTGATAATT ACTGGTCATCTTGCCAGTGTGCCCTGTGTAATGTTGTTCAGTGAAATATAAGATAATTTG TTTATGAGAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)