These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4462#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 2771 fasta sequence [AGCAGGACGCGGGTGCTTGGCGGCGGCGCAGCAGCTGGGTGCGAGAGCAAGGGCGAATGGCAGCGTGGATGCAACGCGTGCAGGCGCGGCAGCCCAGCGTAGCGTCGGCGCACCGTGGCATCCTGGTATACTACTGCTATTCCATTCAAGTGGCGGTGCATCTTTCTCCTCCTCCCTACCAGGTGATGCTTTCCTCTTGCGGGGCTGGATTTGGTGTTGGTTCTCTATTCCAGCTGCTCCCATTGGTTGAATTTGGTGCACAAGTCTGACCCTTTAATCTGTTCTGCCCCTTCCGATGTGAATCATTGGCTATCGACAGAGAATTTGTTCGAATTTGGCTCTTCGAGTTCCCAACTATAAAGGATGATGTTTTTCTTGGCCAGATTAGTGTTTCTCTCCTCTCCTAGCCACGAGGGGGGGAGGGAGAACAGATTGTAAGCAGCAAGTTGAGCAGCAAAGACAACCGATGCAGTGGCGTGGAGTTCGAGTTTGACAGTTCGGTGCCCAATCCAGGGTTGCAGTGCTGGAACAAGGCAGAGTAGTTGCTTTGTCTTTGTTTTTCTTTGTATGTTGCAAATTCGCATCACATCAAAGTACGCATCAGTATGATCTCAGGATTCTATGGATGAGAGTACACATCAATATGCTCTCTGGGGATGAGCCACATGATCTTGGGATCAGATTCATCTGAGCAACACAAGATCTTGGCTAATTGGTGTATATTTTTGATAGCTTTTTTTTTTTTGAAGGGAGATTTTTGATAGCTTATTAATACTGAACATCTGGATATATGCCTTATAAGAGCGAGGAAACTTAAGTCTATGGCTTAGCTAATAAAGATTGTAGGTTTTTAGAGTAGGAACAAGGTTAGCATTTCTGTCATTTTATTATACACGCGTTGTTCTTTTTGGACGTGAGATTTAGTTGTCTGTTTGTCAGTCAATGGACTAAAATAATGTAAACTAGGCATATAACAACCATTTAAATTTATGGATTTATGGTTTGATGCAATTTAGCACATGCTAGGTCCTCTTCTCAAATTAGTAGGAGTTTAGGACAAAGTATAATGGTGCTACCTTACTCATATTATACTGGATTGTCAGAATCAGTTGGGCCATTCATTGGCTCCTCCTCCCCTCCTCTATGCTCACTTTGTCATGCTCTGTAGCGGTGGTGGCGTCATATCAGAGATGGAGCAAGAATTGTTGCCGCACTGAATGCTCCATAATGCAAGAAAACCAGTATAGAGAAGCCAGATACATCCGCATAAAGCAAAGACAAACATAGCTTATTTTGTCGGCTTATAACTATGTTAGTTTTGCAGTTTTTGGTTAGAGCTTTGCTTTTTGTGATAACTCTGTTCTTTTGCAGAGTAGATGAATATAAGCCTGTAGTCTGTGATCTATGTGTACACATAACCTCTTTTTTTAAAAAATTCTCATAATATGGATCCAAATTTCATAAGCTATAAGAATTATTGATAATATTCCTGAAGCTTTTGTTCTGGCTTGCTACTCATTTAATAGAAGTTGTCTTCCATTGCCTGAGTGCTCGACTATAAAGAACCTAAATATTAGTTCTTATCAACCTGTGACATTGTAGTGATTTTGTGCTAGCTGATGAATAGTGGATAGTAGCAATGTAGTTTAATTTCAGGAAGGAAAAGAGTGATGCATAGGGAAGGAAAACCTTTGTTCAAAATAAATATATATCATTAGATCTCTCAAAACCTTGCTGTTTTGTGTTCTGCTATTCATTCAGCATTTTAGCTAAAGGCCTAATTTTTATAACCAAACTATGATTACGACGTTGCAATTTTCCGTTAGTTTTATTGTTGCATGTACATTGGGTAAGCACTCGCCTTACAATGTGGGGTGCACTCTCCTGCAGTGGATTTGCCTCGCCTGTGCTTGCATGTGCTTCATTCTATGCAGGTAGAACAAGAAGATCCAGCTTCTACACAGGTAGTATATGTGTGCCTATAACTTTGCTGTAATCACCTCAGTGAGTAGTCTGCTGATCCATCTTTTTGTTCAACTGTGGCAATGGCTGCGGGTAAGCCTTTTAGATATTGATTTGTCAAAATAAACTGACACAAGCTTTCAGAGATGTGTGATTTCATATTTTCCATGATAAAAAATAATGTTATTTCCATTGCTTCAAAGATATACTATATGTTGTGTGTTAATTCCCTTTGCTTCAAAGTTTCTTCAGATAAAGCTGCATGAA-GATGAAAAGACATTTTATTCAGTACTATCGGTTACTTTACATTTATTTATGCCATGCTTTTTTTATTGGTTCAGGAAGATGTACACAGTACACTGATCTGGTGGAGAAGAACACCACAACCACCTCAGCTAACATGTTCCTTTGTTGCACCTGAAAAGGGATAATTCGCATATATTTCATCTTAAAAAGAAACTGAGCTGAAGAAACTTATGAATCAGATAACATTTTTTCTAGGCCTGAATTTGTCTGCTTAATTTTGCAGGCACGGCGAAGCAGCGTTGGAGGTGGCTGCTGGCTCCTATGATGTTGCCCATGTCTCCTGCTACAAGTGCAACCGGTGCAACTGCTAATGTTAAGAGATTATTGACTGTAGCAAGCACCAACGTGCCTATCTGGGATGAAGTGATGAATAAATAAAAGAGGCCATCCAGTGTGACGGTTCAATCTCTGTATATTTGGCTGTTGATAATTACTGGTCATCTTGCCAGTGTGCCCTGTGTAATGTTGTTCAGTGAAATATAAGATAATTTGTTTATGAGAAA] 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GATGAAAAGACATTTTATTCAGTACTATCGGTTACTTTACATTTATTTATGCCATGCTTTTTTTATTGGTTCAGGAAGATGTACACAGTACACTGATCTGGTGGAGAAGAACACCACAACCACCTCAGCTAACATGTTCCTTTGTTGCACCTGAAAAGGGATAATTCGCATATATTTCATCTTAAAAAGAAACTGAGCTGAAGAAACTTATGAATCAGATAACATTTTTTCTAGGCCTGAATTTGTCTGCTTAATTTTGCAGGCACGGCGAAGCAGCGTTGGAGGTGGCTGCTGGCTCCTATGATGTTGCCCATGTCTCCTGCTACAAGTGCAACCGGTGCAACTGCTAATGTTAAGAGATTATTGACTGTAGCAAGCACCAACGTGCCTATCTGGGATGAAGTGATGAATAAATAAAAGAGGCCATCCAGTGTGACGGTTCAATCTCTGTATATTTGGCTGTTGATAATTACTGGTCATCTTGCCAGTGTGCCCTGTGTAATGTTGTTCAGTGAAATATAAGATAATTTGTTTATGAG ] [+] EMBL CF324562 [ AAAGATTGTAGGTTTTTAGAGTAGGAACAAGGTTAGCATTTCTGTCATTTTATTATACACGCGTTGTTCTTTTTGGACGTGAGATTTAGTTGTCTGTTTGTCAGTCAATGGACTAAAATAATGTAAACTAGGCATATAACAACCATTTAAATTTATGGATTTATGGTTTGATGCAATTTAGCACATGCTAGGTCCTCTTCTCAAATTAGTAGGAGTTTAGGACAAAGTATAATGGTGCTACCTTACTCATATTATACTGGATTGTCAGAATCAGTTGGGCCATTCATTGGCTCCTCCTCCCCTCCTCTATGCTCACTTTGTCATGCTCTGTAGCGGTGGTGGCGTCATATCACAGATGGAGCAAGAATTGTTGCCGCACTGAATGCTCCATAATG ] [+] EMBL BI811964 [ aCTGCATGAAGGATGAAAAAACA TTTA CCAGTACTATCG TACTACACATTTATTTAT CCATGCTTTTTTTATTGGTTCAGGAAGATGTAC CAGTACACTGATCTGGTGGAGAAGAACACCACAACCACCTCAGCTAACACGTTCCTTTGTTGCACCTGAAAAGGGATAATTCGCATATATTTCATCTTAAAAAGAAACTGAGCTGAAGAAACTTATGAATCAGATAACATTTTTTCTAGGCCTGAATTTGTCTGCTTTCTTTT CAGGCACGGCGAA CAGCGTTCGAGGTGGCTGCTGGCTCCTATGATGTTGCCCATGTCTCCTGCTAC AGT C ACCGGTGCAACTGCTAATGTTAAGAGATTATTGACTGTAGC AGCACCAACGTGCCTATCTGGGATGAAGTGATGAATAAATAAAAGAGGCCATCCAGTGTGACGGTTC ATCTCTGTATATTTGGCTGTTGATAATTACTGGTCATCTTGCCAGTGTGCCCTGTGTAATGTTGTTCAGTGAAATATAAGATAATTTGTTTAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||