cluster # 4837

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Oryza sativa
cluster # 4837 cluster # 4837 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4837#0 length = 600 sequences # 3

consensusID : consensus_4837#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 600
fasta sequence

                              [CGCACGGCGAGAACTGCCCGCCACGCNGACCAGGACNCCGGCCGGAGCCACCAGGGCACCGGGAACCCGCCGTTCCAGATCAGATAACCCTACCTAAGCATGCTCCCTCTCTTCTGTCATNCAGCCATGCTAGTGTGAGTGTGTGTGTTCGTGCCACTAACTACTAACTACATGTCTACATCGATCTATCTACCTATATATATCCACCACCTACGTCCCTTCTTCCTCAAATCAATCAAATCTATCTATCTATCTATTTATCTATCCCTGAATCTATCTCTATCCGGTGTGCTTTGCTGCTGCTGATTAACTGGCAGTGTGATCATCTCCCTCTACTGCTGCTACATATATGCAGTGCTATGCTGGAGAGGCATAAATGTGCTATATATATGTTCTCTGCCACAACCCTAAGCTAATTGTAACCTGTTGATTAAGCAGGTGTTCTAGGGATTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGAGGGTGTGTTTGATGTGTAATTGTACTATTGCCTTTGCCCAACAGAAACTTGTAGGCTGCAGTGTGCCTATGTATGCTGTTGTGCCGGGATGGCAGTGGTAATATATGCTGTTTGAGTCAAAAAAAA]

[+] EMBL AU083476             [CGCACGGCGAGAACTGCCCGCCACGCNGACCAGGACNCCGGCCGGAGCCACCAGGGCACCGGGAACCCGCCGTTCCAGATCAGATAACCCTACCTAAGCATGCTCCCTCTCTTCTGTCATNCAGCCATGCTAGTGTGAGTGTGTGTGTTCGTGCCACTAACTACTAACTACATGTCTACATCGATCTATCTACCTATATATATCCACCACNTACGTCCCTTCTTCCTCAAATCAATCAAATCTATCTATCTATCTATTTATCTATCCCTGAATCTATCTCTATCCGGTGTGCTTTGCTGCTGCTGATTAACTGGCAGTGTGATCATCTCCCTCTACTGCTGCTACATATATGCAGTGCTATGCTGGAGAGGCATAAATGTGCTATATATATGTTCTCTGCCACAACCCTAAGCTAATTGTAACCTGTTGATTAAGCAGGTGTTCTAGGGATTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGAGGGTGTGTTTGATGTGTAATTGTACTATTGCCTTTGCCCAACAGAAACTTGTAGGCTGCAGTGTGCCTATGTATGCTGTTGTGCCGGGATGGCAGTGGTAATATATGCTGTTTGAGTCAAAAAAAA]
[+] EMBL AU172758             [                                                                                                                                                                                                 CTATATATATCCACCACCTACGTCCCTTCTTCCTCAAATCAATCAAATCTATCTATCTATCTATTTATCTATCCCTGAATCTATCTCTATCCGGTGTGCTTTGCTGCTGCTGATTAACTGGCAGTGTGATCATCTCCCTCTACTGCTGCTACATATATGCAGTGCTATGCTGGAGAGGCATAAATGTGCTATATATATGTTCTCTGCCACAACCCTAAGCTAATTGTAACCTGTTGATTAAGCAGGTGTTCTAGGGATTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGAGGGTGTGTTTGATGTGTAATTGTACTATTGCCTTTGCCCAACAGAAACTTGTAGGCTGCAGTGTGCCTATGTATGCTGTTGTGCCGGGATGGCAGTGGTAATATATGCTGTTTGAGTCAAAAAAAA]
[+] EMBL AU182804             [                                                                                                                                                                                                 CTATATATATCCACCACCTACGTCCCTTCTTCCTCAAATCAATCAAATCTATCTATCTATCTATTTATCTATCCCTGAATCTATCTCTATCCGGTGTGCTTTGCTGCTGCTGATTAACTGGCAGTGTGATCATCTCCCTCTACTGCTGCTACATATATGCAGTGCTATGCTGGAGAGGCATAAATGTGCTATATATATGTTCTCTGCCACAACCCTAAGCTAATTGTAACCTGTTGATTAAGCAGGTGTTCTAGGGATTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGAGGGTGTGTTTGATGTGTAATTGTACTATTGCCTTTGCCCAACAGAAACTTGTAGGCTGCAGTGTGCCTATGTATGCTGTTGTGCCGGGATGGCAGTGGTAATATATGCTGTTTGAGTCAAAAAAAA]




>consensus_4837#0
CGCACGGCGAGAACTGCCCGCCACGCNGACCAGGACNCCGGCCGGAGCCACCAGGGCACC
GGGAACCCGCCGTTCCAGATCAGATAACCCTACCTAAGCATGCTCCCTCTCTTCTGTCAT
NCAGCCATGCTAGTGTGAGTGTGTGTGTTCGTGCCACTAACTACTAACTACATGTCTACA
TCGATCTATCTACCTATATATATCCACCACCTACGTCCCTTCTTCCTCAAATCAATCAAA
TCTATCTATCTATCTATTTATCTATCCCTGAATCTATCTCTATCCGGTGTGCTTTGCTGC
TGCTGATTAACTGGCAGTGTGATCATCTCCCTCTACTGCTGCTACATATATGCAGTGCTA
TGCTGGAGAGGCATAAATGTGCTATATATATGTTCTCTGCCACAACCCTAAGCTAATTGT
AACCTGTTGATTAAGCAGGTGTTCTAGGGATTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGAGGGTGT
GTTTGATGTGTAATTGTACTATTGCCTTTGCCCAACAGAAACTTGTAGGCTGCAGTGTGC
CTATGTATGCTGTTGTGCCGGGATGGCAGTGGTAATATATGCTGTTTGAGTCAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case