cluster # 4969

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Oryza sativa
cluster # 4969 cluster # 4969 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4969#0 length = 746 sequences # 3

consensusID : consensus_4969#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 746
fasta sequence

                              [CAATTCTTATAAAAAAATCCTTTAGTTAATTGTCTTGCGCACTGCACATACTACCAACATTTGGCAATTTATATTGGTATTTCCTTTGTATTCACACCACAATAATTCGTGTAGTTGCTACTGTCTAATTTGTTATACTCCGATGCAGAGTTATATTTTATCTAATGTTATATTTTATTTTCCTATTACTATTTACTAGAATATGCAAGGGAAAGAGGAATCAATAATTAAAATATTGATATGGCAACTTGCTTCTTGCTGGTGAATAAACACTTGAACAATTCTAGCAGCTAACTTAGGTGCGGTCAATCACAGAATATTTGTTATTGATCATATAGTTTCTTGCAAATATTCCTAATTGATTGTGTTGTAAGCCTAAAGATTGTATTTACTTTTTATTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGCGCAAATTGTGTTGTAAGCCTAAAATTCTATTCACTTTTTTTTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGTGCACCACTAAAAAGCACGTCATAG-TTTAGATTTTAATAGTACCGTGACGAGCAGAACTGTTGCACGTTGCATTCGTTTTGCATAGCAACAAAACAAGCATGTGGTTTCTGTTAGTCTATTGATTTATTTTTTTTGTCTTTTGTCTCTGCTAATGTTTTATTTGTTGCTCCCATGTCTCAAAATAGATGTCCTCTTATAGTAGGTTCAATCAAGTGATGCTCACGCAACTAATATTCTTATTTCC]

[+] EMBL CB637782             [CAATTCTTATAAAAAAATCCTTTAGTTAATTGTCTTGCGCACTGCACATACTACCAACATTTGGCAATTTATATTGGTATTTCCTTTGTATTCACACCACAATAATTCGTGTAGTTGCTACTGTCTAATTTGTTATACTCCGATGCAGAGTTATATTTTATCTAATGTTATATTTTATTTTCCTATTACTATTTACTAGAATATGCAAGGGAAAGAGGAATCAATAATTAAAATATTGATATGGCAACTTGCTTCTTGCTGGTGAATAAACACTTGAACAATTCTAGCAGCTAACTTAGGTGCGGTCAATCACAGAATATTTGTTATTGATCATATAGTTTCTTGCAAATATTCCTAATTGATTGTGTTGTAAGCCTAAAGATTGTATTTACTTTTTATTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGCGCAAATTGTGTTGTAAGCCTAAAATTCTATTCACTTTTTTTTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGTGCACCACTAAAAAGCACGTCATAG TTTAGATTTTAATAGTACCGTGACGAGCAGAACTGTTGCACGTTGCATTCGTTTTGCATAGCAACAAAACAAGCATGTGGTTTCTGTT                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CB637781             [          AAAAAAATCCTTTAGTTAATTGTCTTGCGCACTGCACATACTACCAACATTTGGCAATTTATATTGGTATTTCCTTTGTATTCACACCACAATAATTCGTGTAGTTGCTACTGTCTAATTTGTTATACTCCGATGCAGAGTTATATTTGATCTAATGTTATATTTTATTTTCCTATTACTATTTACTAGAATATGCAAGGGAAAGAGGAATCAATAATTAAAATATTGATATGGCAACTTGCTTCTTGCTGGTGAATAAACACTTGAACAATTCTAGCAGCTAACTTAGGTGCGGTCAATCACAGAATATTTGTTATTGATCATATAGTTTCTTGCAAATATTCCTAATTGATTGTGTTGTAAGCCTAAAGATTGTATTTACTTTTTATTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGCGCAAATTGTGTTGTAAGCCTAAAATTCTATTCACTTTTTTTTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGTGCACCACTAAAAAGCACGTCATAGTTTTAGATTTTAATAGTACCGTGACGAGCAAAACTGTT                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CA765969             [                                                                                                                                                                                                                            TCAATAATTAAAATATTGATA  G AACTTGCTTCTTGCTGGTGAATAAACACTTGAACAATTCTAGCAGCTAACTTAGGTGCGGTCAATCACAGAATCTTTGTTATTGATCCTATAGTTTCTTGCAAATATTCCTAATTGATTGTGTTGTAAGCCTAAAGATTGTATTTACTTTTTATTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGCGCAAATTGTGTTGTAAGCCTAAAATTCTATTCAC TTTTTTTTAATTCAGTATGCCTTTCATGCTATACTGTGCACCACTAAAAAGCACGTCATAG TTTAGATTTTAATAGTACCGTGACGAGCAGAACTGTTGCACGTTGCATTCGTTTTGCATAGCAACAAAACAAGCATGTGGTTTCTGTTAGTCTATTGATTTATTTTTTTTGTCTTTTGTCTCTGCTAATGTTTTATTTGTTGCTCCCATGTCTCAAAATAGATGTCCTCTTATAGTAGGTTCAATCAAGTGATGCTCACGCAACTAATATTCTTATTTCC]




>consensus_4969#0
CAATTCTTATAAAAAAATCCTTTAGTTAATTGTCTTGCGCACTGCACATACTACCAACAT
TTGGCAATTTATATTGGTATTTCCTTTGTATTCACACCACAATAATTCGTGTAGTTGCTA
CTGTCTAATTTGTTATACTCCGATGCAGAGTTATATTTTATCTAATGTTATATTTTATTT
TCCTATTACTATTTACTAGAATATGCAAGGGAAAGAGGAATCAATAATTAAAATATTGAT
ATGGCAACTTGCTTCTTGCTGGTGAATAAACACTTGAACAATTCTAGCAGCTAACTTAGG
TGCGGTCAATCACAGAATATTTGTTATTGATCATATAGTTTCTTGCAAATATTCCTAATT
GATTGTGTTGTAAGCCTAAAGATTGTATTTACTTTTTATTTAATTCAGTATGCCTTTCAT
GCTATACTGCGCAAATTGTGTTGTAAGCCTAAAATTCTATTCACTTTTTTTTTAATTCAG
TATGCCTTTCATGCTATACTGTGCACCACTAAAAAGCACGTCATAGTTTAGATTTTAATA
GTACCGTGACGAGCAGAACTGTTGCACGTTGCATTCGTTTTGCATAGCAACAAAACAAGC
ATGTGGTTTCTGTTAGTCTATTGATTTATTTTTTTTGTCTTTTGTCTCTGCTAATGTTTT
ATTTGTTGCTCCCATGTCTCAAAATAGATGTCCTCTTATAGTAGGTTCAATCAAGTGATG
CTCACGCAACTAATATTCTTATTTCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case