These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5082#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1436 fasta sequence [AGTTGCAACCGACGATCCATCCATGCACCGCCGTTGCAATTTGCGTTTCACCCTCCTCACCAAAATCGATTTGCTCCCCCCCTCCCCCTCAGATCCCAAATCACTAGTACTACTACCTCACTACCACCACTCCGGCGACTCCGCCGCCGCCATGCACCCCTCCTCCTCCTCCTCCCACCCGCCCGATCACCCCAACCCCAAGTCCCCGCCACCACCCGCGCCCGCCATGGGCTACCCAGCCAACCACCCACCCCCACCCCCCTCCTCCAACGCCGCCTACTTCGCCTCCGCCGCCCCACCCCCCGCCGCCACCAACGGCACCGCCGCCTTCGCCGTCGCCTACCCTTACCCTGCGCCGCCGCCCCACTCCCACTCCCACCCGCCCCCTCCTCCTCCGCACGCCTACCACCACCACCACTACCCACCACCTCCTCCTCCTCACCACCACCCCTACCCGCCTCACCCGCCTCCGCCCACCTGCCTCCGCCGCCTCCTCGGCCTCGTCGTCGCCGCCTTCCTCCTCCTCGGCGCCGCCACCTTCATCGTCTGGCTCCTCCTCCGCCCCCGCGTCCCGGCCTTCTCCCTCGCCTCCCTCACCCTCTCCCGCGTCGCCTACTCCGCCGCCAACTCCTCCCTCTCCGCCTCCTTCGACGCCTCCCTCCTCGCCGACAACCCAAACTCCAAGCTCACCGTCACCTACTTCTCCCCGCTCGCCTCCGTCTCCCTCGCCCCGTCCTCCCCCATCGCCGTCGCCACGCTCCCGCCCTTCGCGCAGCCGCCGCGGAACACCACCACGCTCGCCTTCCGCCTCGAGGTGGATGGCGCATACGTGGGTCCCGACGACGCCGCGCCGCTCAAGGGCGGGGGTGTTGGTACCATGGAGGTCCAGGTCAGGCTCGCCGCCGTCGCCGTCTTCGATCGCGGTGGCTGGCGCACGCGCCGGAGGGTCATGAGGGTCATGTGCGACGGCGTGCCCGTCGCCTTCCGCGGGAAGAACGGGATGGAGGCGGCGTTCACTGGCCCCGCTCGCCGGTGCGATGTAGTGTTGTGAAGGATCACTGCATTGTGGTCATTGACTACCTCAGATGCTGATCTATGGGAGCATCTTCCGAAGGTACGGCAAGTTAACTGGCGCTATAAGAAGTTGATCTGCCGCTGATTGATGAGTGATAGCTGCTGGGTTACTATAGTTTACCCGGCCACCATAGAATCCTTAACATGGAAAAGTCTGGATTGATTTATCCTTAATGGGTGGGTATATGA-CTTA-TGTTG-GAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCA-CAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGCAAGATATGTTCTCTAGTTCTATATGTGTGCCTGATTTCAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK071072 [AGTTGCAACCGACGATCCATCCATGCACCGCCGTTGCAATTTGCGTTTCACCCTCCTCACCAAAATCGATTTGCTCCCCCCCTCCCCCTCAGATCCCAAATCACTAGTACTACTACCTCACTACCACCACTCCGGCGACTCCGCCGCCGCCATGCACCCCTCCTCCTCCTCCTCCCACCCGCCCGATCACCCCAACCCCAAGTCCCCGCCACCACCCGCGCCCGCCATGGGCTACCCAGCCAACCACCCACCCCCACCCCCCTCCTCCAACGCCGCCTACTTCGCCTCCGCCGCCCCACCCCCCGCCGCCACCAACGGCACCGCCGCCTTCGCCGTCGCCTACCCTTACCCTGCGCCGCCGCCCCACTCCCACTCCCACCCGCCCCCTCCTCCTCCGCACGCCTACCACCACCACCACTACCCACCACCTCCTCCTCCTCACCACCACCCCTACCCGCCTCACCCGCCTCCGCCCACCTGCCTCCGCCGCCTCCTCGGCCTCGTCGTCGCCGCCTTCCTCCTCCTCGGCGCCGCCACCTTCATCGTCTGGCTCCTCCTCCGCCCCCGCGTCCCGGCCTTCTCCCTCGCCTCCCTCACCCTCTCCCGCGTCGCCTACTCCGCCGCCAACTCCTCCCTCTCCGCCTCCTTCGACGCCTCCCTCCTCGCCGACAACCCAAACTCCAAGCTCACCGTCACCTACTTCTCCCCGCTCGCCTCCGTCTCCCTCGCCCCGTCCTCCCCCATCGCCGTCGCCACGCTCCCGCCCTTCGCGCAGCCGCCGCGGAACACCACCACGCTCGCCTTCCGCCTCGAGGTGGATGGCGCATACGTGGGTCCCGACGACGCCGCGCCGCTCAAGGGCGGGGGTGTTGGTACCATGGAGGTCCAGGTCAGGCTCGCCGCCGTCGCCGTCTTCGATCGCGGTGGCTGGCGCACGCGCCGGAGGGTCATGAGGGTCATGTGCGACGGCGTGCCCGTCGCCTTCCGCGGGAAGAACGGGATGGAGGCGGCGTTCACTGGCCCCGCTCGCCGGTGCGATGTAGTGTTGTGAAGGATCACTGCATTGTGGTCATTGACTACCTCAGATGCTGATCTATGGGAGCATCTTCCGAAGGTACGGCAAGTTAACTGGCGCTATAAGAAGTTGATCTGCCGCTGATTGATGAGTGATAGCTGCTGGGTTACTATAGTTTACCCGGCCACCATAGAATCCTTAACATGGAAAAGTCTGGATTGATTTATCCTTAATGGGTGGGTATATGA CTTA TGTTG GAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCA CAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGCAAGATATGT ] [+] EMBL BI802920 [ CGCACGCGCCGGAGGGTCATGAGGGTCATGTGCGACGGCGTGCCCGTCGCCTTCCGCGGGAAGAACGGGATGGA GCGGCGTTCACTGGCCCCGCTCGCCGGTGCGATGTAGTGTTGTGAAGGATCACTGCATTGTGGTCGTTGACTACCTCAGATGCTGATCTATGGGAGCATCTTCCGAAGGTACGGGAAGTTGACTGGCGCTATAAGAAGTTGATCTGCCGCTGATTGATGAGTGATAGCTGCTGGGTTACTATAGTTTACCCGGTCACCATAGAATCCTTAACATGGAAAAGTCTGGATTGATTTATCCTTAATGGGTGGGTATATGA CTTACCCTTG GAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCACCAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGCAAGATATGTTCTCTAGTTCTATATGTGTGCCTGATTTCAAAAAAAAAA] [+] EMBL BI798007 [ TATCCTTAATGGGTGGGTATATGACCTTA TGTTGCGAGATAATTGGCTAGAGTGATTATACCCTGGTGGTTGTTTTGCACACTGAGAGGAATTTAAACATGTATGGAACCA CAGGGAACATTCATACTTTAAGCTACTATTGCTTGAAAGC AGATATGTTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||