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Oryza sativa
cluster # 5833 cluster # 5833       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5833#0 length = 356 sequences # 3  

consensusID : consensus_5833#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 356
fasta sequence
                              [AATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTTGGAGTGGTTAGCAATGGCTGGCACAAATGGAGGAAGATGGAAAAGACTGGTTGCGTCGACGGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGA-CACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTT-GATACTCTTTTAGAAGTGAAGTTCTCTTCATCACTGAATCAGAGTTGTGATTTA--TTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI813841             [AATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTTGGAGTGGTTAGCAATGGCTGGCACAAATGGAGGAAGATGGAAAAGACTGGTTGCGTCGACGGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGA CACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGGATACTCTTTTAGAAGTGAAGTTCTCTTCATCACTGAAaaa                                                                                               ]
[+] EMBL CF301474             [                                                                                                                                           TTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTT GATACTCTTTTAGAAGTGAAGTTCTCTTCATCACTGAATCAGAGTTGTGATTTA  TTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                                               ]
[+] EMBL CF299190             [                                                                                                                                                                   ACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTT GATACTCTTTTAGAAGTGAAGTTCTCTTCATCACTGAATCAGAGTTGTGATTTATGTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA]


>consensus_5833#0 AATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTTGGAGTGGTTAGCAATGGCTGGCACAAATGGAGGAAGA TGGAAAAGACTGGTTGCGTCGACGGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCT GGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGACACTGCATGCCTTGTTGAT TGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAGTG AAGTTCTCTTCATCACTGAATCAGAGTTGTGATTTATTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)