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Oryza sativa
cluster # 5995 cluster # 5995       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5995#0 length = 1240 sequences # 3  
consensusID : consensus_5995#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1240
fasta sequence 
                              [CTGATCAGTCTTCAATTTTGGGCAAGCTTTCTATGTACTGATTGTTCATGTAGTTAGCTTCCAACCAAAGTGAAATTTGTTCTGTACTTGACAATGTGACATGTCTTAGTTTAATTTGGTTTTGGCTAATTTAATCTTGACAACAAAATGCACTGTAGTAGGAATCACTTGAGAAATTCATTTATTTCATAAGTACACATGATGAAATTATTTTTTACAGTTCTGTATAAGATGTTTTTTTTATATCTCTGAATTTATCAAAGCCACATTTTTAGAACTTTCTCAAACCCATGTAATTTCTGAATGTGAAGGTGCACTTATTGAAATGGATGGATTAGTCAACTACCCTCCCATTCCTATAAAACTATACTGAAAAATAGATTAAACAATCATGACTGCCCTGTCCCAAACAAATGTTTTTTTTCCCTAAAATACAGACTTAAAAGGATTGTATCACAGTACTATTTGGAGCACTTTTACATTTAGAGGACTTAGATGCTGAGTGCCAAGTACTGGATGTGAGTAAGCTTGATCATTTAGATTATTTAGATAATCAACATCCTTACTCCTATAGGAACTGAATTGCCTAATGTAAATTTCTAGGATGTTCGTGTAGTTAGCTCCCAACCAAAGTGGAATTTGGTTTTTGTTCGTGTACTTCAACAATGTGAATTTTTTTCCTGCAGTAACCTTGGTTTTTGTTCCTGCAGTAATTGAATTTCCAGGATGTGAATTTTCAGGATGTTCATGTAGTTAGCTCCCAACCAAAGTGAAATTTGCTTTTTGTTCTGTACTTCAACAATGTCACATGTCTTAGTTTAATTTGGTTTTGGCTAATTTAATCTTGAAAACAAAATGCACTGTAGTATGAATCACTTGAGAAATTCATTTATTTCATAAATACACATGATGCAATTTTTTTTTAAGTTCTGTTATTGCTTGCCCTGTCGATTATTGAGTTCACAAGGATCTTCGCTTGGTGAGTATAAATTTTGAATTCTATCCTCTTCGTATGTCTCTTCTCTTGCTCGATTTGCTTTGCTGTTGGTGCCTCTTTGTGACTGTACTGTACCTGCTACTTTTTTTTCGTTAATCTTGTCTTTGATCTCGGAAAGGTTACCTGATTTCGCATAGATTTTGTGGCTTAAGAAGTAATAATCATTGTTAAAATAAGTGAGATTTGAAATAATTATTTCCTAACAAGTGAGATATTAGATAATATGCTGGTAAATTATTTCAT]

[+] EMBL CB633765             [CTGATCAGTCTTCAATTTTGGGCAAGCTTTCTATGTACTGATTGTTCATGTAGTTAGCTTCCAACCAAAGTGAAATTTGTTCTGTACTTGACAATGTGACATGTCTTAGTTTAATTTGGTTTTGGCTAATTTAATCTTGACAACAAAATGCACTGTAGTAGGAATCACTTGAGAAATTCATTTATTTCATAAGTACACATGATGAAATTATTTTTTACAGTTCTGTATAAGATGTTTTTTTTATATCTCTGAATTTATCAAAGCCACATTTTTAGAACTTTCTCAAACCCATGTAATTTCTGAATGTGAAGGTGCACTTATTGAAATGGATGGATTAGTCAACTACCCTCCCATTCCTATAAAACTATACTGAAAAATAGATTAAACAATCATGACTGCCCTGTCCCAAACAAATGTTTTTTTTTCCTAAAATACAGACTTAAAAGGATTGTATCACAGTACTATCTGGAGCACTTTTACATTTAGAGGACTTAGGTGCTGAGTGCCAAGTACTGGATGTGAGTAAGCTTGATCATTTAGATTATTTAGAGAATCAACATCCTTACTCCTATAGGAACTGAATTGCCTAATGTAAATTTCTAGGATGTTCGTGTAGTTAGCTCCCAACCAAAGTGGAATTTGGTTTTTGTTCGTGTACTTCAACAATGTGAATTTTTTTCCTGCAGTAACCTTGGTTTTTGTTCCTGCAGTAATTGAATTTCCAGGATGTGAATTTTCAGGATGTTCATGTAGTTAGCTCCCAACCAAAGTGAAATTTGCTTTTTGTTCTGTACTTCAACAATGTCACATGTCTTAGTTTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CF307031             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGAATGTGAAGGTGCACTTATTGAAATGGATGGATTAGTCAACTACCCTCCCATTCCTATAAAGCTATACTGAAAAATAGATCACACAATCATGACTACCCTGTCCCAAACAAATG  TTTGTTCCCTAAAATACAGACTTAAAAGGATTGTATCACAGTACTATTTGGAGCACTTTTACATTTAGAGGACTTAGATGCTGAGTGCCAAGTACTGGATGTGAGTAAGCTTGATCATTTAGATTATTTAGATAATCAACATCCTTACTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB675367             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCCCTAAAATACAGACTTAAAAGGATTGTATCACAGTACTATTTGGAGCACTTTTACATTTAGAGGACTTAGATGCTGAGTGCCAAGTACTGGATGTGAGTAAGCTTGATCATTTAGATTATTTAGATAATCAACATCCTTACTCCTACAGTAACTGCATTGCCTAATGTAAATTTCCAGGATGTTCGTGTAGTTAGCTCCCAACCAAAGTGGAATTTGGTTTTTGTTCGTATACTTCAACAATGTGAATTTTTTTCATGCAGTAACCTTGGTTTTTGTTCCTGCAGTAATTGAATTTCCAGGATGTGAATTTTCAGGATGTTCATGTAGCTAGCTCCCAACCAAAGTGGAATTTGCTTTTT TTCTGTACTTCAACAATGTCACATGTCTTAGTTTAATTTGGTTTTGGCTAATTTAATCTTGAAAACAAAATGCACTGTAGTATGAATCACTTGAGAAATTCATTTATTTCATAAATACACATGATGCAATTTTTTTTTAAGTTCTGTTATTGCTTGCCCTGTCGATTATTGAGTTCACAAGGATCTTCGCTTGGTGAGTATAAATTTTGAATTCTATCCTCTTCGTATGTCTCTTCTCTTGCTCGATTTGCTTTGCTGTTGGTGCCTCTTTGTGACTGTACTGTACCTGCTACTTTTTTTTCGTTAATCTTGTCTTTGATCTCGGAAAGGTTACCTGATTTCGCATAGATTTTGTGGCTTAAGAAGTAATAATCATTGTTAAAATAAGTGAGATTTGAAATAATTATTTCCTAACAAGTGAGATATTAGATAATATGCTGGTAAATTATTTCAT]




>consensus_5995#0
CTGATCAGTCTTCAATTTTGGGCAAGCTTTCTATGTACTGATTGTTCATGTAGTTAGCTT
CCAACCAAAGTGAAATTTGTTCTGTACTTGACAATGTGACATGTCTTAGTTTAATTTGGT
TTTGGCTAATTTAATCTTGACAACAAAATGCACTGTAGTAGGAATCACTTGAGAAATTCA
TTTATTTCATAAGTACACATGATGAAATTATTTTTTACAGTTCTGTATAAGATGTTTTTT
TTATATCTCTGAATTTATCAAAGCCACATTTTTAGAACTTTCTCAAACCCATGTAATTTC
TGAATGTGAAGGTGCACTTATTGAAATGGATGGATTAGTCAACTACCCTCCCATTCCTAT
AAAACTATACTGAAAAATAGATTAAACAATCATGACTGCCCTGTCCCAAACAAATGTTTT
TTTTCCCTAAAATACAGACTTAAAAGGATTGTATCACAGTACTATTTGGAGCACTTTTAC
ATTTAGAGGACTTAGATGCTGAGTGCCAAGTACTGGATGTGAGTAAGCTTGATCATTTAG
ATTATTTAGATAATCAACATCCTTACTCCTATAGGAACTGAATTGCCTAATGTAAATTTC
TAGGATGTTCGTGTAGTTAGCTCCCAACCAAAGTGGAATTTGGTTTTTGTTCGTGTACTT
CAACAATGTGAATTTTTTTCCTGCAGTAACCTTGGTTTTTGTTCCTGCAGTAATTGAATT
TCCAGGATGTGAATTTTCAGGATGTTCATGTAGTTAGCTCCCAACCAAAGTGAAATTTGC
TTTTTGTTCTGTACTTCAACAATGTCACATGTCTTAGTTTAATTTGGTTTTGGCTAATTT
AATCTTGAAAACAAAATGCACTGTAGTATGAATCACTTGAGAAATTCATTTATTTCATAA
ATACACATGATGCAATTTTTTTTTAAGTTCTGTTATTGCTTGCCCTGTCGATTATTGAGT
TCACAAGGATCTTCGCTTGGTGAGTATAAATTTTGAATTCTATCCTCTTCGTATGTCTCT
TCTCTTGCTCGATTTGCTTTGCTGTTGGTGCCTCTTTGTGACTGTACTGTACCTGCTACT
TTTTTTTCGTTAATCTTGTCTTTGATCTCGGAAAGGTTACCTGATTTCGCATAGATTTTG
TGGCTTAAGAAGTAATAATCATTGTTAAAATAAGTGAGATTTGAAATAATTATTTCCTAA
CAAGTGAGATATTAGATAATATGCTGGTAAATTATTTCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)