cluster # 6121

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Oryza sativa
cluster # 6121 cluster # 6121 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6121#0 length = 1592 sequences # 4
consensusID : consensus_6121#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1592
fasta sequence
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[+] EMBL AK120866             [TCTGCAGTGCAGTGCCCACGCGAGCCGAGACGAGACGATGGCATCATCTCCCGCTCCAAGCCCCGCCGCGCCGCCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCGCGGCGCTCGCCGTGGTCGCGTCCGCCTCCGCCGCCGCGTGCTCCGCGGGCGACCGGGACGCGCTGCTGGCGATCCGGGCGGCGCTGTCGGAGGCGCACCTCGGGGTGTTCTCGTCGTGGACGGGCACCGACTGCTGCACCAGCTGGTACGGCGTGAGCTGCGATCCCACCACCGGCCGCGTCGCCGACCTCACCCTCCGCGGCGAGGCCGACGACCCCGTCATGGCGCCCGCCGGCCGCCCGGCCTCCGGCGTCATGTCCGGCTACATCTCCGACGCGGTGTGCCGCCTCGGCCGCCTCTCCTCCCTCATCCTCGCCGACTGGAAGCAGATCTCCGGGCCCATCCCGCCGTGCGTCGCCACGGCCCTCCCTTACCTCCGCATCCTCGAGCTCCCCGGCAACCGCCTCACCGGCGAGATCCCGCGCTCCATCGGCAGCCTCTCCCGCCTCACCGTGCTCAACCTCGCCGACAACCTCATCGCCGGCGAAATCCCAAGCTCCATCACCTCGCTCGCGTCGCTGAAGCACCTCGACCTCACCAACAACCAGCTCACCGGCGGGATCCCGGACGACGTGGGCGACCTCACCATGCTCAGCCGCGCGCTGCTCGGCCGGAACAAGCTCACCGGCGCCATCCCAACGTCGGTCGGCTCCCTGACCCGGCTCGCCGACCTCGACCTCGCCGAGAACGGCCTCACCGGCGGGATCCCGGACAGCCTGGGCGGCGCCCACGTGCTCACCTCCCTGTACCTCGGCGGCAACCGGGTCTCCGGCCGGATCCCGGCGAGCCTGCTGCAGAACAAGGGGCTGGGCATCCTGAACCTGAGCCGGAACGCCGTCGAGGGCGCCATCCCCGACGTGTTCACCGCCGAGTCCTACTTCATGGTGCTCGACCTGTCCCGGAACAGGCTCACCGGCGCCGTGCCGAGGTCGCTGTCGGCGGCAGCGTACGTCGGCCACCTCGACCTCAGCCACAACCGGCTGTGCGGCTCCATCCCCGCCGGCCCGCCGTTCGACCACCTCGACGCCGCCTCCTTCGCCAGCAACAGCTGCCTCTGCGGCGGCCCGCTCGGCAAGTGCACGTGACGTGCCCCAACCAGAGCCGTCCGATCGATCGGGAGAGCCTGATCGAACGTGTGGTGTGCGATGTACCGTGTACGATGCAACGAACTTACGTGTTCGTATATATGGTTAATTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAAGAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAGAA                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AK060670             [ CTGCAGTGCAGTGCCCACGCGAGCCGAGACGAGACGATGGCATCATCTCCCGCTCCAAGCCCCGCCGCGCCGCCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCGCGGCGCTCGCCGTGGTCGCGTCCGCCTCCGCCGCCGCGTGCTCCGCGGGCGACCGGGACGCGCTGCTGGCGATCCGGGCGGCGCTGTCGGAGGCGCACCTCGGGGTGTTCTCGTCGTGGACGGGCACCGACTGCTGCACCAGCTGGTACGGCGTGAGCTGCGATCCCACCACCGGCCGCGTCGCCGACCTCACCCTCCGCGGCGAGGCCGACGACCCCGTCATGGCGCCCGCCGGCCGCCCGGCCTCCGGCGTCATGTCCGGCTACATCTCCGACGCGGTGTGCCGCCTCGGCCGCCTCTCCTCCCTCATCCTCGCCGACTGGAAGCAGATCTCCGGGCCCATCCCGCCGTGCGTCGCCACCGCCCTCCCTTACCTCCGCATCCTCGAGCTCCCCGGCAACCGCCTCACCGGCGAGATCCCGCGCTCCATCGGCAGCCTCTCCCGCCTCACCGTGCTCAACCTCGCCGACAACCTCATCGCCGGCGAAATCCCAAGCTCCATCACCTCGCTCGCGTCGCTGAAGCACCTCGACCTCACCAACAACCAGCTCACCGGCGGGATCCCGGACGACGTGGGCGACCTCACCATGCTCAGCCGCGCGCTGCTCGGCCGGAACAAGCTCACCGGCGCCATCCCAACGTCGGTCGGCTCCCTGACCCGGCTCGCCGACCTCGACCTCGCCGAGAACGGCCTCACCGGCGGGATCCCGGACAGCCTGGGCGGCGCCCACGTGCTCACCTCCCTGTACCTCGGCGGCAACCGGGTCTCCGGCCGGATCCCGGCGAGCCTGCTGCAGAACAAGGGGCTGGGCATCCTGAACCTGAGCCGGAACGCCGTCGAGGGCGCCATCCCCGACGTGTTCACCGCCGAGTCCTACTTCATGGTGCTCGACCTGTCCCGGAACAGGCTCACCGGCGCCGTGCCGAGGTCGCTGTCGGCGGCAGCGTACGTCGGCCACCTCGACCTCAGCCACAACCGGCTGTGCGGCTCCATCCCCGCCGGCCCGCCGTTCGACCACCTCGACGCCGCCTCCTTCGCCAGCAACAGCTGCCTCTGCGGCGGCCCGCTCGGCAAGTGCACGTGACGTGCCCCAACCAGAGCCGTCCGATCGATCGGGAGAGCCTGATCGAACGTGTGGTGTGCGATGTACCGTGTACGATGCAACGAACTTACGTGTTCGTATATATGGTTAATTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAAGAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAGAATGTTTTCTCTTTCCTGCCTTTCTCTTCTTTATACTTTTAACCTTTTTTGCTAGTGATTTACTTGATAGTTCTACTTTAAAGTTTGTATTGTACAAGTGACAAAAGCATAAGAAATGCTAAAGAT                                                ]
[+] EMBL AK120908             [      GTGCAGTGCCCACGCGAGCCGAGACGAGACGATGGCATCATCTCCCGCTCCAAGCCCCGCCGCGCCGCCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCGCGGCGCTCGCCGTGGTCGCGTCCGCCTCCGCCGCCGCGTGCTCCGCGGGCGACCGGGACGCGCTGCTGGCGATCCGGGCGGCGCTGTCGGAGGCGCACCTCGGGGTGTTCTCGTCGTGGACGGGCACCGACTGCTGCACCAGCTGGTACGGCGTGAGCTGCGATCCCACCACCGGCCGCGTCGCCGACCTCACCCTCCGCGGCGAGGCCGACGACCCCGTCATGGCGCCCGCCGGCCGCCCGGCCTCCGGCGTCATGTCCGGCTACATCTCCGACGCGGTGTGCCGCCTCGGCCGCCTCTCCTCCCTCATCCTCGCCGACTGGAAGCAGATCTCCGGGCCCATCCCGCCGTGCGTCGCCACCGCCCTCCCTTACCTCCGCATCCTCGAGCTCCCCGGCAACCGCCTCACCGGCGAGATCCCGCGCTCCATCGGCAGCCTCTCCCGCCTCACCGTGCTCAACCTCGCCGACAACCTCATCGCCGGCGAAATCCCAAGCTCCATCACCTCGCTCGCGTCGCTGAAGCACCTCGACCTCACCAACAACCAGCTCACCGGCGGGATCCCGGACGACGTGGGCGACCTCACCATGCTCAGCCGCGCGCTGCTCGGCCGGAACAAGCTCACCGGCGCCATCCCAACGTCGGTCGGCTCCCTGACCCGGCTCGCCGACCTCGACCTCGCCGAGAACGGCCTCACCGGCGGGATCCCGGACAGCCTGGGCGGCGCCCACGTGCTCACCTCCCTGTACCTCGGCGGCAACCGGGTCTCCGGCCGGATCCCGGCGAGCCTGCTGCAGAACAAGGGGCTGGGCATCCTGAACCTGAGCCGGAACGCCGTCGAGGGCGCCATCCCCGACGTGTTCACCGCCGAGTCCTACTTCATGGTGCTCGACCTGTCCCGGAACAGGCTCACCGGCGCCGTGCCGAGGTCGCTGTCGGCGGCAGCGTACGTCGGCCACCTCGACCTCAGCCACAACCGGCTGTGCGGCTCCATCCCCGCCGGCCCGCCGTTCGACCACCTCGACGCCGCCTCCTTCGCCAGCAACAGCTGCCTCTGCGGCGGCCCGCTCGGCAAGTGCACGTGACGTGCCCCAACCAGAGCCGTCCGATCGATCGGGAGAGCCTGATCGAACGTGTGGTGTGCGATGTACCGTGTACGATGCAACGAACTTACGTGTTCGTATATATGGTTAATTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAAGAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAGAATGTTTTCTCTTTCCTGCCTTTCTCTTCTTTATACTTTTAACCTTTTTTGCTAGTGATTTACTTGATAGTTCTACTTTAAAGTTTGTATTGTACAAGTGACAAAAGCATAAGAAATGCTAAAG                                                  ]
[-] EMBL CB000556             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGCGCCTGTGTGCGTGAGAGAAAAAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAAAATGTTTTCTCTTTCCTGCCTTTCTCTTCTTTATACTTTTAACCTTTTTTGCTAGTGATTTACTTGATAGTTCTAGTTTAAAGTTGGTATTGTACAAGTGACAAAAGCATAAGAAATGCTAAAGATCTTGTATGAGAGGTTGTGGTTTCATATTTGTGCGCTTGGGCCCTTGGC]




>consensus_6121#0
TCTGCAGTGCAGTGCCCACGCGAGCCGAGACGAGACGATGGCATCATCTCCCGCTCCAAG
CCCCGCCGCGCCGCCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCGCGGCGCTCGCCGTGGTCGCGTCCGC
CTCCGCCGCCGCGTGCTCCGCGGGCGACCGGGACGCGCTGCTGGCGATCCGGGCGGCGCT
GTCGGAGGCGCACCTCGGGGTGTTCTCGTCGTGGACGGGCACCGACTGCTGCACCAGCTG
GTACGGCGTGAGCTGCGATCCCACCACCGGCCGCGTCGCCGACCTCACCCTCCGCGGCGA
GGCCGACGACCCCGTCATGGCGCCCGCCGGCCGCCCGGCCTCCGGCGTCATGTCCGGCTA
CATCTCCGACGCGGTGTGCCGCCTCGGCCGCCTCTCCTCCCTCATCCTCGCCGACTGGAA
GCAGATCTCCGGGCCCATCCCGCCGTGCGTCGCCACCGCCCTCCCTTACCTCCGCATCCT
CGAGCTCCCCGGCAACCGCCTCACCGGCGAGATCCCGCGCTCCATCGGCAGCCTCTCCCG
CCTCACCGTGCTCAACCTCGCCGACAACCTCATCGCCGGCGAAATCCCAAGCTCCATCAC
CTCGCTCGCGTCGCTGAAGCACCTCGACCTCACCAACAACCAGCTCACCGGCGGGATCCC
GGACGACGTGGGCGACCTCACCATGCTCAGCCGCGCGCTGCTCGGCCGGAACAAGCTCAC
CGGCGCCATCCCAACGTCGGTCGGCTCCCTGACCCGGCTCGCCGACCTCGACCTCGCCGA
GAACGGCCTCACCGGCGGGATCCCGGACAGCCTGGGCGGCGCCCACGTGCTCACCTCCCT
GTACCTCGGCGGCAACCGGGTCTCCGGCCGGATCCCGGCGAGCCTGCTGCAGAACAAGGG
GCTGGGCATCCTGAACCTGAGCCGGAACGCCGTCGAGGGCGCCATCCCCGACGTGTTCAC
CGCCGAGTCCTACTTCATGGTGCTCGACCTGTCCCGGAACAGGCTCACCGGCGCCGTGCC
GAGGTCGCTGTCGGCGGCAGCGTACGTCGGCCACCTCGACCTCAGCCACAACCGGCTGTG
CGGCTCCATCCCCGCCGGCCCGCCGTTCGACCACCTCGACGCCGCCTCCTTCGCCAGCAA
CAGCTGCCTCTGCGGCGGCCCGCTCGGCAAGTGCACGTGACGTGCCCCAACCAGAGCCGT
CCGATCGATCGGGAGAGCCTGATCGAACGTGTGGTGTGCGATGTACCGTGTACGATGCAA
CGAACTTACGTGTTCGTATATATGGTTAATTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGG
GCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGTGTGTGT
GTGTGTGAGAGAAAGAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAGAATGTTTTCTCTTTCCTGCCTT
TCTCTTCTTTATACTTTTAACCTTTTTTGCTAGTGATTTACTTGATAGTTCTACTTTAAA
GTTTGTATTGTACAAGTGACAAAAGCATAAGAAATGCTAAAGATCTTGTATGAGAGGTTG
TGGTTTCATATTTGTGCGCTTGGGCCCTTGGC
clustalw multiple alignements is not computed in this case