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Oryza sativa
cluster # 6252 cluster # 6252       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6252#0 length = 2263 sequences # 4  

consensusID : consensus_6252#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2263
fasta sequence
                              [GTTCTCCACTGAACCGCCGCCACCCCCCTTTCATATTGTGTAGCGGCAACGCCTCCGCCATCTCTCCTGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGG-CTACGTGCTGCATCCACCACAACAGCAACGAAGAGGATGTGACGGGGCTCGGGAGTTCCCGTTGATGGCGGCAACATGCTGGAGAATTTCCTGGCATAAAATGCACTTTTTCTTGTTTCTGAATTTCCTGGCCTCCATGTGCACCTTCAACCGAATTTTATTTAGTTGCTATATGCAGGTCACGCAGCAATCCTGCAAATACTTAATGGTTGGTTGGCGAAATGTGCAGCCCACATTAGGAGTGCAACAATGAAGTGCTTCCATAAGTAAGCTTCAATTATCCTTCAATCTTGATAAGCTTGAATGATCTGAAGCGATATGCACATGTTCTGGGACTTTGTAAGTGGAAAAGATGGATTTTTTTTACTTTGGTCAGGCTGCTCAGGATGGAGCTGAAGAAATACATGACAAGAACTAAGAGATAAAACAGAAAATGCAGATGCAGGAAGAGCAACAGGTAGATGATGCGTTAATTATTGCCTTTATATTCATTTTAGACGATATAGGCAATTGTCAAAGTTGCATCTGCCTGCAGTTACTAAAGTAATCCCTATCACTATATTTTGTGGTTCTCCCTTTTATTTGTATTAAAAACTTCAGAGTCATTGAGAAGTGCCATCAGGCTTAGTTCTACTCGATGTCAATAAAATTCAGAGTCATCTTCCTGTTCCTCTTTTTTGTAGAGTATAAGGATATTGTGATCGGAAAGAGTTTAAACTGTGATTTGGCTTCTAAAGAGACCTCATGGTTTTGAGGCATCAAAACAAAAGGCTCATTCATTCTGTTGTGCATGAAACAAATTGGTCTAATTCCTGTGTCTCTGTAGATTCTTTAGATTCAAACTGCAGCAAAGAACGGTTTACAGTTATAGAAATGTTGGCTTCCCAGTTCCTAATTAAGATGTGAGCATCCCAGTGAACTGTACTCTCAGTGTCTTTGTAGTTTAATCTACATTGGTGGCACTGTCTACCTTATAATCTTACAAACTTCAGTAAGAAAATAATCTTACTACCTGATTTTAGGTTCAAACATTGTGTTTTTCAGAACATCCATGAATAGGAGTGAAGCATCTGTGCTGGTAATGATTGCTATACAAACTTCTTTGCAATCTCAAGACTAAAGTATTTACTTTTCCTTTTTCATTTATGCTCTTTTCAGTGTCATTGTGCCTTTTTTATTGACATTCTAAAAAGTTGCTAAAGTTACATTGTTGACTGCTCTTGACCATATTGAGATAATGAGAAATCAGAGATATAGTAATGTGTGGCTTAATTTGGCTTATATTAGAGCATTGCTACTGGTAAAAGTACCTAGCGAAAAAAATTGCTCATGGTAAACTACCTGCATAATTTCACTAGTACCTTTTGTGATGCAGTAGTTGTTTATGCACTAAATGGTGGCCTCTGTTCCTGAAGATCCAGTCCTATATTTTTGCTAGGTTGATCCAAATATGCTCATGTTCTTATTTCGATCTATATAATTGAGCATTTGGTCTTCTTTCCCATTAATTGTACTATGTTTTGGTTTAGCATGTAATATAGTCCAATCTTGATATTAATTCAGTTTCTAGCTATATTGATCTTCCAGTTTCTTACAAGCTTATCACAATTGCAGGTTTAATTATACATTCAAGCATCAACTTCAGGATCTGTACCATCTATTAATATCATCTTTCTGTTATTGATTGATCAACCAAATAATATGTTCCTAGCTATTGTAACTTTGGTTATTGCTTTAACTGTCATGAACCATGAATTGCTTGTATGCTAATTATTAATTGTAACCTCTTTACTGAAATATATATTTATGTTGGAATGTGTTGTGCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CF322677             [GTTCTCCACTGAACCGCCGCCACCCCCCTTTCATATTGTGTAGCGGCAACGCCTCCGCCATCTCTCCTGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGGCCTACGTGCTGta                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AK100445             [               GCCGCCACCCCCCTTTCATATTGTGTAGCGGCAACGCCTCCGCCATCTCTCCTGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGG CTACGTGCTGCATCCACCACAACAGCAACGAAGAGGATGTGACGGGGCTCGGGAGTTCCCGTTGATGGCGGCAACATGCTGGAGAATTTCCTGGCATAAAATGCACTTTTTCTTGTTTCTGAATTTCCTGGCCTCCATGTGCACCTTCAACCGAATTTTATTTAGTTGCTATATGCAGGTCACGCAGCAATCCTGCAAATACTTAATGGTTGGTTGGCGAAATGTGCAGCCCACATTAGGAGTGCAACAATGAAGTGCTTCCATAAGTAAGCTTCAATTATCCTTCAATCTTGATAAGCTTGAATGATCTGAAGCGATATGCACATGTTCTGGGACTTTGTAAGTGGAAAAGATGGATTTTTTTTACTTTGGTCAGGCTGCTCAGGATGGAGCTGAAGAAATACATGACAAGAACTAAGAGATAAAACAGAAAATGCAGATGCAGGAAGAGCAACAGGTAGATGATGCGTTAATTATTGCCTTTATATTCATTTTAGACGATATAGGCAATTGTCAAAGTTGCATCTGCCTGCAGTTACTAAAGTAATCCCTATCACTATATTTTGTGGTTCTCCCTTTTATTTGTATTAAAAACTTCAGAGTCATTGAGAAGTGCCATCAGGCTTAGTTCTACTCGATGTCAATAAAATTCAGAGTCATCTTCCTGTTCCTCTTTTTTGTAGAGTATAAGGATATTGTGATCGGAAAGAGTTTAAACTGTGATTTGGCTTCTAAAGAGACCTCATGGTTTTGAGGCATCAAAACAAAAGGCTCATTCATTCTGTTGTGCATGAAACAAATTGGTCTAATTCCTGTGTCTCTGTAGATTCTTTAGATTCAAACTGCAGCAAAGAACGGTTTACAGTTATAGAAATGTTGGCTTCCCAGTTCCTAATTAAGATGTGAGCATCCCAGTGAACTGTACTCTCAGTGTCTTTGTAGTTTAATCTACATTGGTGGCACTGTCTACCTTATAATCTTACAAACTTCAGTAAGAAAATAATCTTACTACCTGATTTTAGGTTCAAACATTGTGTTTTTCAGAACATCCATGAATAGGAGTGAAGCATCTGTGCTGGTAATGATTGCTATACAAACTTCTTTGCAATCTCAAGACTAAAGTATTTACTTTTCCTTTTTCATTTATGCTCTTTTCAGTGTCATTGTGCCTTTTTTATTGACATTCTAAAAAGTTGCTAAAGTTACATTGTTGACTGCTCTTGACCATATTGAGATAATGAGAAATCAGAGATATAGTAATGTGTGGCTTAATTTGGCTTATATTAGAGCATTGCTACTGGTAAAAGTACCTAGCGAAAAAAATTGCTCATGGTAAACTACCTGCATAATTTCACTAGTACCTTTTGTGATGCAGTAGTTGTTTATGCACTAAATGGTGGCCTCTGTTCCTGAAGATCCAGTCCTATATTTTTGCTAGGTTGATCCAAATATGCTCATGTTCTTATTTCGATCTATATAATTGAGCATTTGGTCTTCTTTCCCATTAATTGTACTATGTTTTGGTTTAGCATGTAATATAGTCCAATCTTGATATTAATTCAGTTTCTAGCTATATTGATCTTCCAGTTTCTTACAAGCTTATCACAATTGCAGGTTTAATTATACATTCAAGCATCAACTTCAGGATCTGTACCATCTATTAATATCATCTTTCTGTTATTGATTGATCAACCAAATAATATGTTCCTAGCTATTGTAACTTTGGTTATTGCTTTAACTGTCATGAACCATGAATTGCTTGTATGCTAATTATTAATTGTAACCTCTTTACTGAAATATATATTTATGTTGGAATGT                                 ]
[+] EMBL CF330578             [                                                                   TGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCACCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCCCTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGCATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTATCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAGATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGG CTACGTGCTGCATCCACCACAAAAGCAACGAAGAGGATGTGACGGGGCTCGGGAGTTCCCGTTGATGGCGGCAACATGCTGGAGAATTTCCTGGCATAAAATGCACTTTTTCTTGTTTCTGAATTTCCTGGCCTCCATGTGCACCTTCAACCGAATTTTATTTAGTTGCTATATGCAGGTCACGCAGCAATCCTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CA756048             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTGTTCCTGAAGATCCAGTCCTATATTTTTGCTAGGTTGATCCAAATATGCTCATGTTCTTATTTCGATCTATATAATTGAGCATTTGGTCTTCTTTCCCATTAATTGTACTATGTTTTGGTTTAGCATGTAATATAGTCCAATCTTGATATTAATTCAGTTTCTAGCTATATTGATCTTCCAGTTTCTTACAAGCTTATCACAATTGCAGGTTTAATTATACATTCAAGCATCAACTTCAGGATCTGTACCATCTATTAATATCATCTTTCTGTTATTGATTGATCAACCAAATAATATGTTCCTAGCTATTGTAACTTTGGTTATTGCTTTAACTGTCATGAACCATGAATTGCTTGTATGCTAATTATTAATTGTAACCTCTTTACTGAAATATATATTTATGTTGGAATGTGTTGTGCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_6252#0 GTTCTCCACTGAACCGCCGCCACCCCCCTTTCATATTGTGTAGCGGCAACGCCTCCGCCA TCTCTCCTGCGCCATCGCCCCCCATCCTCGAGCTCGACGCGGTGGAGAGGCGCGCCTCCA CCTTCCTTGGCTGGCGTCTTCTCTTCATCCTCTCCCTCTCCAAAGCTCCATCGCTGTCCC CTCTCCCACCCCTTTCTCTGCATTCGGCCAGATCCAGCCAATAGAAGCTATGGCCATGGC ATCTGGCTCCCCTGAGCTTGGTGGAGTGGAGAGGCCAAGGAGGGGAGGCCTCCCCCAGTA TCTTCCTCTCCCAAATCACCATTGCTGCCAGCTCTTCCTCCCCCTTCCGGATCCGGCCAG ATCTAGGCTTCATCGAGTTGGGGACTTCCAGATCTGGAGCTCCAGTTCATGGCTACGTGC TGCATCCACCACAACAGCAACGAAGAGGATGTGACGGGGCTCGGGAGTTCCCGTTGATGG CGGCAACATGCTGGAGAATTTCCTGGCATAAAATGCACTTTTTCTTGTTTCTGAATTTCC TGGCCTCCATGTGCACCTTCAACCGAATTTTATTTAGTTGCTATATGCAGGTCACGCAGC AATCCTGCAAATACTTAATGGTTGGTTGGCGAAATGTGCAGCCCACATTAGGAGTGCAAC AATGAAGTGCTTCCATAAGTAAGCTTCAATTATCCTTCAATCTTGATAAGCTTGAATGAT CTGAAGCGATATGCACATGTTCTGGGACTTTGTAAGTGGAAAAGATGGATTTTTTTTACT TTGGTCAGGCTGCTCAGGATGGAGCTGAAGAAATACATGACAAGAACTAAGAGATAAAAC AGAAAATGCAGATGCAGGAAGAGCAACAGGTAGATGATGCGTTAATTATTGCCTTTATAT TCATTTTAGACGATATAGGCAATTGTCAAAGTTGCATCTGCCTGCAGTTACTAAAGTAAT CCCTATCACTATATTTTGTGGTTCTCCCTTTTATTTGTATTAAAAACTTCAGAGTCATTG AGAAGTGCCATCAGGCTTAGTTCTACTCGATGTCAATAAAATTCAGAGTCATCTTCCTGT TCCTCTTTTTTGTAGAGTATAAGGATATTGTGATCGGAAAGAGTTTAAACTGTGATTTGG CTTCTAAAGAGACCTCATGGTTTTGAGGCATCAAAACAAAAGGCTCATTCATTCTGTTGT GCATGAAACAAATTGGTCTAATTCCTGTGTCTCTGTAGATTCTTTAGATTCAAACTGCAG CAAAGAACGGTTTACAGTTATAGAAATGTTGGCTTCCCAGTTCCTAATTAAGATGTGAGC ATCCCAGTGAACTGTACTCTCAGTGTCTTTGTAGTTTAATCTACATTGGTGGCACTGTCT ACCTTATAATCTTACAAACTTCAGTAAGAAAATAATCTTACTACCTGATTTTAGGTTCAA ACATTGTGTTTTTCAGAACATCCATGAATAGGAGTGAAGCATCTGTGCTGGTAATGATTG CTATACAAACTTCTTTGCAATCTCAAGACTAAAGTATTTACTTTTCCTTTTTCATTTATG CTCTTTTCAGTGTCATTGTGCCTTTTTTATTGACATTCTAAAAAGTTGCTAAAGTTACAT TGTTGACTGCTCTTGACCATATTGAGATAATGAGAAATCAGAGATATAGTAATGTGTGGC TTAATTTGGCTTATATTAGAGCATTGCTACTGGTAAAAGTACCTAGCGAAAAAAATTGCT CATGGTAAACTACCTGCATAATTTCACTAGTACCTTTTGTGATGCAGTAGTTGTTTATGC ACTAAATGGTGGCCTCTGTTCCTGAAGATCCAGTCCTATATTTTTGCTAGGTTGATCCAA ATATGCTCATGTTCTTATTTCGATCTATATAATTGAGCATTTGGTCTTCTTTCCCATTAA TTGTACTATGTTTTGGTTTAGCATGTAATATAGTCCAATCTTGATATTAATTCAGTTTCT AGCTATATTGATCTTCCAGTTTCTTACAAGCTTATCACAATTGCAGGTTTAATTATACAT TCAAGCATCAACTTCAGGATCTGTACCATCTATTAATATCATCTTTCTGTTATTGATTGA TCAACCAAATAATATGTTCCTAGCTATTGTAACTTTGGTTATTGCTTTAACTGTCATGAA CCATGAATTGCTTGTATGCTAATTATTAATTGTAACCTCTTTACTGAAATATATATTTAT GTTGGAATGTGTTGTGCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)