These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6313#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1820 fasta sequence [GCAGAGGAGCGCGATCCCCCACCCCAAACCGGCACGGGATGCCTCAGCGGCGGCCGCGCCTGGCGCCCCTCACCCGCCGCCTCTCCACCTGCCGGGACGGCGACCTCGCCGCCCTCCTCTCGGTCCTCCGCTCGCCGCCAGCATCCTCCACGTCGCTCCCGCGCGCACTCTCCAGTGCCTTCCCGTCCCCATCCGACTCCTTCCCCCTCGGCAAGCTCCCCTCCCTCCTCCCGCTCCTCCCCTCCCCACTCCTCTCCCTCCGGTTCCTCCTGTGGCGCCTTCCCCCCTCCTCGCCGCTCCCGTCCTCGTACGCCCTCTCCTCGCTCGCCGCCTCGCTCCCCGATCTCCCGTCCGCCGTGCCCCTCCTCCTCTCCTCGTCGCCGCAACCTCTCCCGCTCAGGCACTACGCCCTCCTCCTGGGCATCTCCGCACACGCTGGACTATTCCCCGCCTCCCTCGCTCTCCTGCGGCACATGCGCTCCTTCGGCCTCGCCCCCGATGCTGCTTGCTTCCGCTCCGCCCTCCGCTCGGCCGGCTCTCCCGGCGATGTCTGTGCCGTTCTCGGTATCATGTCGGCGTGCGGTGTCTCGCCGAGCGTCCCACTGGTTGTGACCTCGGTGCATAAGCTGGCAACCGCGGGGGACTTCGTCGGTGCCCGCCAGCTGATCGAGAAAATGCCGGAGTTTGGGTGCGTGACCAATGTGGCCGTGTACACCGCGTTGCTCGACGGGATGTGCAGTTTCGGGGATGTGGATGCAGCGCTGAGGCTGGTGGAAGAGATGGAGGGTTGGAGCTTGGGTGCAGGGTGCGTGCCCAACGTGGTGTCGTATACGTGTTTGGTGAAATGCCTGTGTGGGAAAAAGAGGATGGGGGAGGCGCTGAGCTTGCTGGATAGGATGACAGGAAGAGGGGTGATGCCCAACCGGGTGTTCGTGCGAACGCTCGTCGGCGGATTCTGTTCAGAGGAGATGGTCGCAGACGCTTATGCTGTAGTGGAGCGTGTGGTCAGCGATGGGAGTGTGTCGAGCGACCAATGCTACAATGTGCTGCTTATTTGCCTGTGGAGGGTTGGGATGGATGGTGAAGCTGAAGGGCTTGTGCAGAGGATGATGAAGAAAGGGGTGCGGCTGAGCCCTCTTGCGGCCAGTGTTATGGTCAGAGAGC-TTTGCAAT-AGGAATAGGCTATTG-GATGCTTGCTACTGGATAGGAGTCATGGAAGAGAACGGGGTGCTCTGTGACAC-TGATGTCTACAA-TGG-TTTG-TTGCTTAGGCTGTGTGTGGAAGGGCATGTTGGTGAGGCCTTGGCGTTGGCTAAGAAGGTTGCTGAGAGGGGGATTCTCATAGAGGCTTCTTGTGCTGATCGTTTGATGGATTTGCTAAAGCAATATGGTGATGAGGAGCTAGCACCAAAAATATCAGAACTGAGGAGGTGCTCTGAAGTGCTGTCACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGAAAAATGCTTCCGTGCTGCATGATTACAGCAA-G-AAAAGGCTTTGA-GGGTTTGTTA-CGCTGAAATAGATTGGTGGGGATAGGGTGCAGCACAGAGTGATTTGTGTGAGCAAAATGTGGATGAGTTACTTCATTTACTTGCCCATTTCCTGTAGTTTTTCTGAACTCTGTTCAGATCCTCCAGTCCAAGGGATGCTTCAGGACATGTGAACTATGATTGCGATGGAATTCTCAGGTTCCTCATTAGTATGCTCCCAAACAGATATGTTTGTTTAAGTGGTGATCAATCAAATGTTTTACATTTTTAAAGAAAAA] [+] EMBL AK067384 [GCAGAGGAGCGCGATCCCCCACCCCAAACCGGCACGGGATGCCTCAGCGGCGGCCGCGCCTGGCGCCCCTCACCCGCCGCCTCTCCACCTGCCGGGACGGCGACCTCGCCGCCCTCCTCTCGGTCCTCCGCTCGCCGCCAGCATCCTCCACGTCGCTCCCGCGCGCACTCTCCAGTGCCTTCCCGTCCCCATCCGACTCCTTCCCCCTCGGCAAGCTCCCCTCCCTCCTCCCGCTCCTCCCCTCCCCACTCCTCTCCCTCCGGTTCCTCCTGTGGCGCCTTCCCCCCTCCTCGCCGCTCCCGTCCTCGTACGCCCTCTCCTCGCTCGCCGCCTCGCTCCCCGATCTCCCGTCCGCCGTGCCCCTCCTCCTCTCCTCGTCGCCGCAACCTCTCCCGCTCAGGCACTACGCCCTCCTCCTGGGCATCTCCGCACACGCTGGACTATTCCCCGCCTCCCTCGCTCTCCTGCGGCACATGCGCTCCTTCGGCCTCGCCCCCGATGCTGCTTGCTTCCGCTCCGCCCTCCGCTCGGCCGGCTCTCCCGGCGATGTCTGTGCCGTTCTCGGTATCATGTCGGCGTGCGGTGTCTCGCCGAGCGTCCCACTGGTTGTGACCTCGGTGCATAAGCTGGCAACCGCGGGGGACTTCGTCGGTGCCCGCCAGCTGATCGAGAAAATGCCGGAGTTTGGGTGCGTGACCAATGTGGCCGTGTACACCGCGTTGCTCGACGGGATGTGCAGTTTCGGGGATGTGGATGCAGCGCTGAGGCTGGTGGAAGAGATGGAGGGTTGGAGCTTGGGTGCAGGGTGCGTGCCCAACGTGGTGTCGTATACGTGTTTGGTGAAATGCCTGTGTGGGAAAAAGAGGATGGGGGAGGCGCTGAGCTTGCTGGATAGGATGACAGGAAGAGGGGTGATGCCCAACCGGGTGTTCGTGCGAACGCTCGTCGGCGGATTCTGTTCAGAGGAGATGGTCGCAGACGCTTATGCTGTAGTGGAGCGTGTGGTCAGCGATGGGAGTGTGTCGAGCGACCAATGCTACAATGTGCTGCTTATTTGCCTGTGGAGGGTTGGGATGGATGGTGAAGCTGAAGGGCTTGTGCAGAGGATGATGAAGAAAGGGGTGCGGCTGAGCCCTCTTGCGGCCAGTGTTATGGTCAGAGAGC TTTGCAAT AGGAATAGGCTATTG GATGCTTGCTACTGGATAGGAGTCATGGAAGAGAACGGGGTGCTCTGTGACAC TGATGTCTACAA TGG TTTG TTGCTTAGGCTGTGTGTGGAAGGGCATGTTGGTGAGGCCTTGGCGTTGGCTAAGAAGGTTGCTGAGAGGGGGATTCTCATAGAGGCTTCTTGTGCTGATCGTTTGATGGATTTGCTAAAGCAATATGGTGATGAGGAGCTAGCACCAAAAATATCAGAACTGAGGAGGTGCTCTGAAGTGCTGTCACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGAAAAATGCTTCCGTGCTGCATGATTACAGCAA G AAAAGGCTTTGA GGGTTTGTTA CGCTGAAATAGATTGGTGGGGATAGGGTGCAGCACAGAGTGATTTGTGTGAGCAAAATGTGGATGAGTTACTTCATTTACTTGCCCATTTCCTGTAGTTTTTCTGAACTCTGTTCAGATCCTCCAGTCCAAGGGATGCTTCAGGACATGTGAACTATGATTGCGATGGAATTCTCAGGTTCCTCATTAGTATGCTCCCAAACAGATATGTTTGTTTAAGTGGTGATCAATCAAATGTTTTACATTTTT ] [+] EMBL C27277 [ AACCGGGTGTNCGTNCGAACNCTCGTCGGCGGATTCTGTTCAGAGGAGATGGTCGCAG CGCTTATNCTGTAGTGGAGCGTGTGGTCAGCGATGGGAGTGTGTCGAGCGACCAATGCTACAATGTGCTGCTTATTTNCCTGTGGAGGGTTGGGATGGATGGTGAAGCTGAAGGGCTTGTNCAGAGGATGATGAAGAAAGGGGTGCGGCTGAGCCCTCTTGCGGCCAGTGTTATGGTCAGAGAGCTTTTGCAATAAGGAATAGGCTATTGTGATGCTTGCTACTGGATAGGAGTCATGG AGAGAACGGGGTACTCTGTGACACTTNATGTCAACAANTGGTTTTGTTTGCTTAGG ] [+] EMBL C28068 [ GGTGCTCTGTGACAC TGATGTCTACAA TGG TTTG TTGCTTAGGCTGTGTGTGGAAGGGCATGTTGGTGAGGCCTTGGCGTTGGCTAAGAAGGTTGCTGAGAGGGGGATTCTCATAGAGGCTTCTTGTGCTGATCGTTTGATGGATTTGCTAAAGCAATATGGTGATGAGGAGCTAGCACCAAAAATATCAGAACTGAGGAGGTGCTCTGAAGTGCTGTCACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGANAAATTCTTCCGAGCTGCATGATTACAGCAANGAAAAAGGCTTTGAGGGGTTTGTTACCGTTGNAAT ] [-] EMBL CF324732 [ CACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGAAAAATGCTTCCGTGCTGCATGATTACAGCAA G AAAAGGCTTTGA GGGTTTGTTA CGCTGAAATAGATTGGTGGGGATAGGGTGCAGCACAGAGTGATTTGTGTGAGCAAAATGTGGATGAGTTACTTCATTTACTTGCCCATTTCCTGTAGTTTTTCTGAACTCTGTTCAGATCCTCCAGTCCAAGGGATGCTTCAGGACATGTGAACTATGATTGCGATGGAATTCTCAGGTTCCTCATTAGTATGCTCCCAAACAGATATGTTTGTTTAAGTGGTGATCAATCAAATGTTTTACATTTTTAAAGAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||