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Oryza sativa
cluster # 6373 cluster # 6373       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6373#0 length = 1571 sequences # 4  

consensusID : consensus_6373#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1571
fasta sequence
                              [GACCGTGCCACGGCGTCANAGNCAAACTAATACTAACTACACAAGCCTCCTCCGTTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCATTCTCCTCCTCCTCTCGAGGCCGGCCGAGATATCAATGGAAGTCGAATACCACGAGGAGTACGTGCGGAACTCGAGAGGGGTGCAGCTCTTCACCTGCGGCTGGCTGCCCGCCAAAACGTCGCCCAAGGCCCTCGTCTTCCTCTGCCACGGCTATGCCATGGAGTGCAG-GGCTACATGAGAGAGTGTGGGATGCGGCTGGCGGCGGCGGGGTACGGGGTGTTCGGCATGGACTACGAGGGGCACGGCAANTCGATGGGCGCCCGCTGCTANATTCGCAGCTTCCGCCGTTTCGTCGAAGAATTGCCAACGCTTTNTCAAGTCCATCTGCGGTAAACAACAAAATCTCTACCCTTTCTTCATTACTTCCCTCTTCAACCTCTCTGCTTACTTTACATTCAGCTACACAATTTCAGTACACTATCAAGCCAGGCTCTGTCTGTGTGTAGCTATGCAATGTTTCAACTTAGCTGCCGTTTACTGTACGTCCGTTTTAGCATTAGTGATGACATGATAATTCAGGCACCAACTAGCTTTTAATCCTTGTCGTTGCCCGCTTAGGCTAAATACCTGAATCCAACATATGGTAGCTAGCCAGCTACTTGTCATTTGTCCCCCACCTAATGATGAAGGGGGACGTACGTACGGAGTTTGGCACGCATTGAATCGATCTTGGTTCATCATCGGCAATGGAGGGCTCGATCGGTAGGCCATTGAGCATTAATCATATATATATGATCGTCATCGGTGATGGTACTATAGTAGGGTACCCACTGTTCAGCGATCACCACTACCCGGCAATCACCAGTGCTTGGTCGGTCCTGTGGCAACATTAATTATTATCGGTTTGTTTGGATTGAAGCCAATTTTACTCTACTAAAATCTTAGTAATTTCAATAGCGTCATTTGCATGTTTGGTTTGGTATCAATTTTTTTCACGCTAGTTCAGATTTTATACTACTAAAATTGGTAGTATTAAAATTTGGCCCATGTGGCTGGTTACTCGAGAGGCGTCCGTTCCTGGTTGCTGTTGTATACTGAAGCCTGATATATCGCAGTAAGCTACATTCTCCGTTTTATATTATAGGCCGTTTTGATTATTTTAAAATCGAACTTCTTAAAAATTTGATCAAGTTAATAACAACGTTTATAGCACCAAATTAGTTTTATATTAAATCTAACATTGAATATATTTTGATAGTTTCTTTGTTTTATGTTAAAAATATTGCTATATCTTTTTCATAAATTTAGTTAAAAATAAAGAAATTTGATTTAGAAAAATATCAAAACGACTTATAATATAAATTATAAAACTAAGGTAGTGATTTCACAGTATAACATATTAGTGCTACAGTTACATGCCTATGCATTCTTTCGTGCTGAATAGCTGAATGATTTGTGATATTTATTGGATGGTAAACGAATGAATTAGCTGTTATAAAGTTTCAAAATACGCTTAAAACAGCGTTCTGAAAAATTCATATGTACAAAGTTTTT]

[+] EMBL C74456               [GACCGTGCCACGGCGTCANAGNCAAACTAATACTAACTACACAAGCCTCCTCCGTTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCATTCTCCTCCTCCTCTCGAGGCCGGCCGAGATATCAATGGAAGTCGAATACCACGAGGAGTACGTGCGGNACTCGAGAGGGGTGCAGCTCTTCACCTGCGGCTGGCTGCCCGCCAAAACGTCGCCCAANGGCCTCGTCTTCCTCTGCCANGGCTATGCAATGGAGTTCAG GGCTACATGAGAAAGT TTGGAAGCGGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL OSS14740A            [                                                          TCCTCTTCTTCTTCCTCATTCTCCTCCTCCTCTCGAGGCCGGCCGAGATATCAATGGAAGTCGAATACCACGAGGAGTACGTGCGGAACTCGAGAGGGGTGCAG TCTTCACCTGCGGCTGGCTGCCCGCCAAAACGTCGCCCAAGG CCTCGTCTTCCTCTGCCACGGCTATG CATGGAGTGCAG GGCTACATGAGAGNGTGTGGG TGC GNTGGCGGCGGC GGGNACGGGGT TTCGG ATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL C74534               [                                                                                CCTCCTCCTCTCGAGGCCGGCCGAGATATCAATGGAAGTCGAATACCACGAGGAGTACGTGCGGAACTCGAGAGGGGTGCAGCTCTTCACCTGCGGCTGGCTGCCCGCCAAAACGTCGCCCAAGGCCCTCGTCTTCCTCTGCCACGGCTATGCCATGGAGTNCAGCGGCTACATGAGAGAGTGTGGGATGCGGCTGGCGGCGGCGGGGTACGGGGTGTTCGGCATGGACTACGAGGGGCACGGCAANTCGATGGGCGCCCGCTGCTANATTCGCAGCTTCCGCCGTTTCGTCGAAGAATTGCCAACGCTTTN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AK110785             [                                                                                    CTCCTCTCGAGGCCGGCCGAGATATCAATGGAAGTCGAATACCACGAGGAGTACGTGCGGAACTCGAGAGGGGTGCAGCTCTTCACCTGCGGCTGGCTGCCCGCCAAAACGTCGCCCAAGGCCCTCGTCTTCCTCTGCCACGGCTATGCCATGGAGTGCAGCGGCTACATGAGAGAGTGTGGGATGCGGCTGGCGGCGGCGGGGTACGGGGTGTTCGGCATGGACTACGAGGGGCACGGCAAGTCGATGGGCGCCCGCTGCTACATCCGCAGCTTCCGCCGTCTCGTCGACG ACTGCCACCGCTTCTTCAAGTCCATCTGCGGTAAACAACAAAATCTCTACCCTTTCTTCATTACTTCCCTCTTCAACCTCTCTGCTTACTTTACATTCAGCTACACAATTTCAGTACACTATCAAGCCAGGCTCTGTCTGTGTGTAGCTATGCAATGTTTCAACTTAGCTGCCGTTTACTGTACGTCCGTTTTAGCATTAGTGATGACATGATAATTCAGGCACCAACTAGCTTTTAATCCTTGTCGTTGCCCGCTTAGGCTAAATACCTGAATCCAACATATGGTAGCTAGCCAGCTACTTGTCATTTGTCCCCCACCTAATGATGAAGGGGGACGTACGTACGGAGTTTGGCACGCATTGAATCGATCTTGGTTCATCATCGGCAATGGAGGGCTCGATCGGTAGGCCATTGAGCATTAATCATATATATATGATCGTCATCGGTGATGGTACTATAGTAGGGTACCCACTGTTCAGCGATCACCACTACCCGGCAATCACCAGTGCTTGGTCGGTCCTGTGGCAACATTAATTATTATCGGTTTGTTTGGATTGAAGCCAATTTTACTCTACTAAAATCTTAGTAATTTCAATAGCGTCATTTGCATGTTTGGTTTGGTATCAATTTTTTTCACGCTAGTTCAGATTTTATACTACTAAAATTGGTAGTATTAAAATTTGGCCCATGTGGCTGGTTACTCGAGAGGCGTCCGTTCCTGGTTGCTGTTGTATACTGAAGCCTGATATATCGCAGTAAGCTACATTCTCCGTTTTATATTATAGGCCGTTTTGATTATTTTAAAATCGAACTTCTTAAAAATTTGATCAAGTTAATAACAACGTTTATAGCACCAAATTAGTTTTATATTAAATCTAACATTGAATATATTTTGATAGTTTCTTTGTTTTATGTTAAAAATATTGCTATATCTTTTTCATAAATTTAGTTAAAAATAAAGAAATTTGATTTAGAAAAATATCAAAACGACTTATAATATAAATTATAAAACTAAGGTAGTGATTTCACAGTATAACATATTAGTGCTACAGTTACATGCCTATGCATTCTTTCGTGCTGAATAGCTGAATGATTTGTGATATTTATTGGATGGTAAACGAATGAATTAGCTGTTATAAAGTTTCAAAATACGCTTAAAACAGCGTTCTGAAAAATTCATATGTACAAAGTTTTT]


>consensus_6373#0 GACCGTGCCACGGCGTCANAGNCAAACTAATACTAACTACACAAGCCTCCTCCGTTCCTC CTCTTCTTCTTCCTCATTCTCCTCCTCCTCTCGAGGCCGGCCGAGATATCAATGGAAGTC GAATACCACGAGGAGTACGTGCGGAACTCGAGAGGGGTGCAGCTCTTCACCTGCGGCTGG CTGCCCGCCAAAACGTCGCCCAAGGCCCTCGTCTTCCTCTGCCACGGCTATGCCATGGAG TGCAGGGCTACATGAGAGAGTGTGGGATGCGGCTGGCGGCGGCGGGGTACGGGGTGTTCG GCATGGACTACGAGGGGCACGGCAANTCGATGGGCGCCCGCTGCTANATTCGCAGCTTCC GCCGTTTCGTCGAAGAATTGCCAACGCTTTNTCAAGTCCATCTGCGGTAAACAACAAAAT CTCTACCCTTTCTTCATTACTTCCCTCTTCAACCTCTCTGCTTACTTTACATTCAGCTAC ACAATTTCAGTACACTATCAAGCCAGGCTCTGTCTGTGTGTAGCTATGCAATGTTTCAAC TTAGCTGCCGTTTACTGTACGTCCGTTTTAGCATTAGTGATGACATGATAATTCAGGCAC CAACTAGCTTTTAATCCTTGTCGTTGCCCGCTTAGGCTAAATACCTGAATCCAACATATG GTAGCTAGCCAGCTACTTGTCATTTGTCCCCCACCTAATGATGAAGGGGGACGTACGTAC GGAGTTTGGCACGCATTGAATCGATCTTGGTTCATCATCGGCAATGGAGGGCTCGATCGG TAGGCCATTGAGCATTAATCATATATATATGATCGTCATCGGTGATGGTACTATAGTAGG GTACCCACTGTTCAGCGATCACCACTACCCGGCAATCACCAGTGCTTGGTCGGTCCTGTG GCAACATTAATTATTATCGGTTTGTTTGGATTGAAGCCAATTTTACTCTACTAAAATCTT AGTAATTTCAATAGCGTCATTTGCATGTTTGGTTTGGTATCAATTTTTTTCACGCTAGTT CAGATTTTATACTACTAAAATTGGTAGTATTAAAATTTGGCCCATGTGGCTGGTTACTCG AGAGGCGTCCGTTCCTGGTTGCTGTTGTATACTGAAGCCTGATATATCGCAGTAAGCTAC ATTCTCCGTTTTATATTATAGGCCGTTTTGATTATTTTAAAATCGAACTTCTTAAAAATT TGATCAAGTTAATAACAACGTTTATAGCACCAAATTAGTTTTATATTAAATCTAACATTG AATATATTTTGATAGTTTCTTTGTTTTATGTTAAAAATATTGCTATATCTTTTTCATAAA TTTAGTTAAAAATAAAGAAATTTGATTTAGAAAAATATCAAAACGACTTATAATATAAAT TATAAAACTAAGGTAGTGATTTCACAGTATAACATATTAGTGCTACAGTTACATGCCTAT GCATTCTTTCGTGCTGAATAGCTGAATGATTTGTGATATTTATTGGATGGTAAACGAATG AATTAGCTGTTATAAAGTTTCAAAATACGCTTAAAACAGCGTTCTGAAAAATTCATATGT ACAAAGTTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)