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Oryza sativa
cluster # 6386 cluster # 6386       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6386#0 length = 1234 sequences # 4  

consensusID : consensus_6386#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1234
fasta sequence
                              [TGGACTGAAGGAGTAGAAAAAACTTCTTGTTGTTGTGCTGCTACTATCTCTTCTCATCTATGCGGCCACAGCATGGGATGCCGAGAGCTTCTTCAACTTCAAGAGTTGTCCACCAAATCAGTGCGGCAAACATGGACCAAAAGTCCGGTTCCCACTCCGCCTTGCATCACAATCTCCGTCGTGCGGCACACCTCTCATGGAGTTATCATGTTCTGGACAGGACACCATCCTGTATCACCCAGTTCTAGGCTCCTGCAAGGTGACTGCAATATCTTACAAGCATGCTGCCATGTCCATCATCCTGCTTGTAGATTCCACACCTCACTGCCCACTTCAGAAGCTCATCTCGACAAATTTATCAACTGATGTGTACAAACCTCANAAATTGGAAGCTGCAAGCTTAGTAAGTTGTTCAAGAGATTTACCAAGAGATCAGCACGGTGTA-GTTGGCCCAATAACTTGCCTCAGTAACAACGCAAGCCAGTGGTATTTGATACATCCTTATGCATATTGTCCTGTTCTTCAGCCAGACTGCAAAGTTGTTAGTAATGGCATCCAGGCACCCTCAACTTTTAAGGAAACAGAAAATGGAGTAATCGGTGTTGATGAAGTTGGTATTCACTTGGTACTCCAGTGACATAACCAGAGATTGTCAAAAATGTGAAAATGAAGGCAAACACTGTGGTTTCAGCTCACAAAGGGGCCGAGCATTCTGCAATTATGGTATTTTCTCTTTCTGAAGCAGAAATCTTACATCAATATTATGACTTGCTTTGCCTTGGTAGGAAACTCTATGGTCTTTACCTTTTCATTCTCTTAGTTTAAAGTTTGCCGATTAAATTGTTCAAAAGATTTCCACAGTTGAATTAGTTGTAAACACTGCAGATCAGAGCAGCTGCTAGCCAATGGAAGCATACCAAAGCTTTAGGTTCACATGCATGGTTATTTTAATTTAAAAAAAAAAAAAACAAGAGAAGGTTATAACCGATTAAGAGTAACGGAATTTTTTTGAAATTTTTAAAATTAAAAAAAAAACCATTCATTTACAAGGTAACCTAGATCAAAATGAATTTTTCTTTAGGATTGGAGCATAGGCATCCCTTGGTAACTAGAGAGGGTGCTATGAATGAACACACTCTCCAAAATACCATTGTTAGTATCAACGTATAGTTTATTTGATTGTAACCATTTGGACTGGACCGCCTATACATGTTAAAAGTTAAAGAAAAAAAAA]

[+] EMBL CF293045             [TGGACTGAAGGAGTAGAAAAAACTTCTTGTTGTTGTGCTGCTACTATCTCTTCTCATCTATGCGGCCACAGCATGGGATGCCGAGAGCTTCTTCAACTTCAAGAGTTGTCCACCAAATCAGTGCGGCAAACATGGACCAAAAGTCCGGTTCCCACTCCGCCTTGCATCACAATCTCCGTCGTGCGGCACACCTCTCATGGAGTTATCATGTTCTGGACAGGACACCATCCTGTATCACCCAGTTCTAGGCTCCTGCAAGGTGACTGCAATATCTTACAAGCATGCTGCCATGTCCATCATCCTGCTTGTAGATTCCACACCTCACTGCCCACTTCAGAAGCTCATCTCGACAAATTTATCAACTGATGTGTACAAACCTCANAAATTGGAAGCTGCAAGCTTAGTAAGTTGTTCAAGAGATTTACCAAGAGATCAGCACGGTGTA GTTGGCCCAATAACTTGCCTCAGTAACAACGCAAGCCAGTGGTATTTGATACATCCTTATGCATATTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CF294663             [                                   TGCTGCTACTATCTCTTCTCATCTATGCGGCCACAGCATGGGATGCCGAGAGCTTCTTCAACTTCAAGAGTTGTCCACCAAATCAGTGCAGCAAACATGGACCAAAAGTCCGGTTCCCACTCCGCCTTGCATCACAATCTCCGTCGTGCGGCACACCTCTCATGGAGTTATCATGTTCTGGACAGGACACCATCCTGTATCACCCAGTTCTAGGCTCCTGCAAGGTGACTGCAATATCTTACAAGCATGCTGCCATGTCCATCATGCTGCTTGTAGATTCCACACCTCACTGCCCACTTCAGAAGCTCATCTCGACAAATTTATCAACTGATGTGTACAAACCTCAAAAATTGGAAGCTGCAAGCTTAGTAAGTTGTTCAAGAGATTTACCAAGAGATCAGCACGGTGTANNGTGGCCCAATAACTTGCCTCAGTAACAACGCAAGCCAGTGGTATTTGATACATCCTTATGCATATTGGTCTGTTCTTCAGCCAGACTGCAAAGTTGTTAGTAATGGCATCCAGGCACCCTCAACTTTTAAGGAAACAGAAAATGGAGTAATCGGTGTTGATGAAGTTGGTATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CF293046             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAAGTTGTTAGTAATGGCATCCAGGCACCCTCAACTTTTAAGGAAACAGAAAATGGAGTAATCGGTGTTGATG AGTTGGTATTCACTTGGTACTCCAGTGACATAACCAGAGATTGTCAAAAATGTGAAAATGAAGGCAAACACTGTGGTTTCAGCTCACAAAGGGGCCGAGCATTCTGCAATTATGGTATTTTCTCTTTCTGAAGCAGAAATCTTACATCAATATTATGACTTGCTTTGCCTTGGTAGGAAACTCTATGGTCTTTACCTTTTCATTCTCTTAGTTTAAAGTTTGCCGATTAAATTGTTCAAAAGATTTCCACAGTTGAATTAGTTGTAAACACTGCAGATCAGAGCAGCTGCTAGCCAATGGAAGCATACCAAAGCTTTAGGTTCACATGCATGGTTATTTTAATTTAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CF294664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTATGACTTGCTTTGCCTTGGTAGGAAACTCTATGGTCTTTACCTTTTCATTCTCTTAGTTTAAAGTTTGCCAATTAAATTGTTCAAAAGATTTCCATAGTTGAATTAGTTGTAAACACTGCAGATCAGAGCAGCTGCTAGCCAATGGAAGCATACCAAAGCTTTAGGTTCACATGCATGGTTATTTTAATTTAAAACGCGCGCACACAAGAGAAGGTTATAACCGATTAAGAGTAACGGAATTTTTTTGAAATTTTTAAAATTAAAAAAAAAACCATTCATTTACAAGGTAACCTAGATCAAAATGAATTTTTCTTTAGGATTGGAGCATAGGCATCCCTTGGTAACTAGAGAGGGTGCTATGAATGAACACACTCTCCAAAATACCATTGTTAGTATCAACGTATAGTTTATTTGATTGTAACCATTTGGACTGGACCGCCTATACATGTTAAAAGTTAAAGAAAAAAAAA]


>consensus_6386#0 TGGACTGAAGGAGTAGAAAAAACTTCTTGTTGTTGTGCTGCTACTATCTCTTCTCATCTA TGCGGCCACAGCATGGGATGCCGAGAGCTTCTTCAACTTCAAGAGTTGTCCACCAAATCA GTGCGGCAAACATGGACCAAAAGTCCGGTTCCCACTCCGCCTTGCATCACAATCTCCGTC GTGCGGCACACCTCTCATGGAGTTATCATGTTCTGGACAGGACACCATCCTGTATCACCC AGTTCTAGGCTCCTGCAAGGTGACTGCAATATCTTACAAGCATGCTGCCATGTCCATCAT CCTGCTTGTAGATTCCACACCTCACTGCCCACTTCAGAAGCTCATCTCGACAAATTTATC AACTGATGTGTACAAACCTCANAAATTGGAAGCTGCAAGCTTAGTAAGTTGTTCAAGAGA TTTACCAAGAGATCAGCACGGTGTAGTTGGCCCAATAACTTGCCTCAGTAACAACGCAAG CCAGTGGTATTTGATACATCCTTATGCATATTGTCCTGTTCTTCAGCCAGACTGCAAAGT TGTTAGTAATGGCATCCAGGCACCCTCAACTTTTAAGGAAACAGAAAATGGAGTAATCGG TGTTGATGAAGTTGGTATTCACTTGGTACTCCAGTGACATAACCAGAGATTGTCAAAAAT GTGAAAATGAAGGCAAACACTGTGGTTTCAGCTCACAAAGGGGCCGAGCATTCTGCAATT ATGGTATTTTCTCTTTCTGAAGCAGAAATCTTACATCAATATTATGACTTGCTTTGCCTT GGTAGGAAACTCTATGGTCTTTACCTTTTCATTCTCTTAGTTTAAAGTTTGCCGATTAAA TTGTTCAAAAGATTTCCACAGTTGAATTAGTTGTAAACACTGCAGATCAGAGCAGCTGCT AGCCAATGGAAGCATACCAAAGCTTTAGGTTCACATGCATGGTTATTTTAATTTAAAAAA AAAAAAAACAAGAGAAGGTTATAACCGATTAAGAGTAACGGAATTTTTTTGAAATTTTTA AAATTAAAAAAAAAACCATTCATTTACAAGGTAACCTAGATCAAAATGAATTTTTCTTTA GGATTGGAGCATAGGCATCCCTTGGTAACTAGAGAGGGTGCTATGAATGAACACACTCTC CAAAATACCATTGTTAGTATCAACGTATAGTTTATTTGATTGTAACCATTTGGACTGGAC CGCCTATACATGTTAAAAGTTAAAGAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)