These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6829#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1133 fasta sequence [CTCCACTTCCTCCTCTCATCGAAGCTAGCTGATCTGCCATGGACGCTCTCTCCTGCCTGGCGCCGCACGCCGCGCTGCTGCCGTGCGCGGCCTTCACCGACGCCGACATCACGCGCGCGCTCCACTTCTCCTCCTCCATGCCCGACACCTCCTCCTCACCCTCCTCATCCTCCTCCGCGGCCTTCCTCGCCGACTTCTGCGGTGGTGGCGCCGGAGGAGGGTTCGTGGTGTCGGCGCCGCCACCGACGATGCCGGCGATCACCTGCGAGTCCGTTCTCGTGGCCGACAGCGCGCGCCCGTCGCCGGCCGGGCCTGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGCTGGGGCTGGGCCCCGCGGGTGGGCGCGCCGGGAAGCGGCGGTCGCGGGCGTCGAAGCGCGCGCCGACCACCTACATCAGCACCGACCCGGCCAACTTCCGCCTCATGGTGCAGCACGTCACCGGCGTCCAGGCCGACCCCGCCTCCCTCGCCGACGGCGCCGCCGGCATCCTTCCCACCACCACCACCACTGCGCCGTTCGACGCCTCCTCCGGCCTCCACATGCTCGACACCTTCGCCGCCGCCAACCCGCTGCTGCAAGCCGAGCAAGCGGCGGCGCTTCAGCAGCAGCCGTGCTTCCCCACGCTGGACTCGTCGTGGAGCGCCGTCATGTACGATGGCAGCGACCTCCTCTGAGCATTCCTTCATTCCCAGCTGCTGCTGCTGCACTGCAGTGCCAACACTAGTTAATTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTGTG-GCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTTGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGTCAGCAGTAAAACATCAGAAAA] [+] EMBL AK108527 [CTCCACTTCCTCCTCTCATCGAAGCTAGCTGATCTGCCATGGACGCTCTCTCCTGCCTGGCGCCGCACGCCGCGCTGCTGCCGTGCGCGGCCTTCACCGACGCCGACATCACGCGCGCGCTCCACTTCTCCTCCTCCATGCCCGACACCTCCTCCTCACCCTCCTCATCCTCCTCCGCGGCCTTCCTCGCCGACTTCTGCGGTGGTGGCGCCGGAGGAGGGTTCGTGGTGTCGGCGCCGCCACCGACGATGCCGGCGATCACCTGCGAGTCCGTTCTCGTGGCCGACAGCGCGCGCCCGTCGCCGGCCGGGCCTGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGCTGGGGCTGGGCCCCGCGGGTGGGCGCGCCGGGAAGCGGCGGTCGCGGGCGTCGAAGCGCGCGCCGACCACCTACATCAGCACCGACCCGGCCAACTTCCGCCTCATGGTGCAGCACGTCACCGGCGTCCAGGCCGACCCCGCCTCCCTCGCCGACGGCGCCGCCGGCATCCTTCCCACCACCACCACCACTGCGCCGTTCGACGCCTCCTCCGGCCTCCACATGCTCGACACCTTCGCCGCCGCCAACCCGCTGCTGCAAGCCGAGCAAGCGGCGGCGCTTCAGCAGCAGCCGTGCTTCCCCACGCTGGACTCGTCGTGGAGCGCCGTCATGTACGATGGCAGCGACCTCCTCTGAGCATTCCTTCATTCCCAGCTGCTGCTGCTGCACTGCAGTGCCAACACTAGTTAATTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTGTG GCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTTGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGTCAGCAGTAAAACATCAG ] [+] EMBL AU183230 [ CCTCTCATCGAAGCTAGCTGATCTGCCATGGACGCTCTCTCCTGCCTGGCGCCGCACGCCGCGCTGCTGCCGTGCGCGGCCTTCACCGACGCCGACATCACGCGCGCGCTCCACTTCTCCTCCTCCATGCCCGACACCTCCTCCTCACCCTCCTCATCCTCCTCCGCGGCCTTCCTCGCCGACTTCTGCGGTGGTGGCGCCGGAGGAGGGTTCGTGGTGTCGGCGCCGCCACCGACGATGCCGGCGATCACCTGCGAGTCCGTTCTCGTGGCCGACAGCGCGCGCCCGTCGCCGGCCGGGCCTGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGCTGGGGCTGGGCCCCGCGGGTGGGCGCGCCGGGAAGCGGCGGTCGCGGGCGTCGAAGCGCGCGCCGACCACCTACATCAGCACCGACCCGGCCAACTTCCGCCTCA ] [+] EMBL AU174364 [ ccgCTAGTTAATTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTGTG GCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTTGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGTCAGCAGTAAAACATCAAAAAA] [+] EMBL OS1321688 [ TTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTTTGNGCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTNGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||