These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7090#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1210 fasta sequence [TTCTTTTTTTTTTAGAAATCCTAATTATTCTTGATTTTGGATTGAAAAGGATGTTATGGATTGAATGTGTAAAAGAA-CAGTATATTGATAAAGAGACTGTATCCCAAAGTCAAAAGAGC-ATTGGCCTGC-AAAATAAAGGATTTGTTCTCTTTTGTAATTAGAAC-AACATAAACAAATTGGATAGAAAAGGAGCGGAAAAAGATCCGTGGATTAGACTCCTTTTCTTCCCCAGGGGTTTGTATTAAAAAATGCAACACCCTGTTCTGACCATATTGTACTATGTATCACCATTTGATAAACCGAGAAATATTTCTCTCTCTCTGATTCAAGTAGAAATACAAATGGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAACAAGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCATCCTAACCAAGATCGATTATTGGATTACAACAATTTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAAAAAAAAAACTACCAAAGTTTCAGAATTTACGATCTATTCATTCAATATTTCCTTTTTCAGAAGACAAATTTTTGCACTTACATTATCTAGCACATATAGAAATACCCTATCCTATCCATTTGGATATCTTGCTTCAACTCCTTCAATACCGGATCCAAGATGTTCCATCCTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTCAACTACTACTCGAATTGGAATAGTTTTATTACTTCAATGAAATCCATTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATAAAAGACTATTTCGGNTCCTATATAACTCTTATGTATCAGAATATGAATTTTTCTTGGTGGTTCTTCGGAAACAATCTTCTTGCTTGCGATNACTTCTTCCGGAACCTTTCTGGAACGAATCATCNTTTCTAGGAAGATGGACATTTTGGGTTAAGNACCCCTGCTTTTTCGGANACATATGGGTCGTTTGGGTNCCCTTATGCNTATGGTCGATATCAAGGAAGGCANTCTGCTCAAAGGGACT] [+] EMBL BI801974 [TTCTTTTTTTTTTAGAAATCCTAATTATTCTTGATTTTGGATTGAAAAGGATGTTATGGATTGAATGTGTAAAAGAA CAGTATATTGATAAAGAGACTGTATCCCAAAGTCAAAAGAGC ATTGGCCTGC AAAATAAAGGATTTGTTCTCTTTTGTAATTAGAAC AACATAAACAAAa ] [-] EMBL CA763499 [ TGTTATGGATTGAATGTGTAAAAGAAGCAGTATATTGATAAAGAGACTGTATCCCAAAGTCAAAAGAGCAATTGGCCTGCAAAAATAAAGGATTTGTTCTCTTTTGTAATTAGAACAAACATAAACAAATTGGATAGAAAAGGAGCGGAAAAAGATCCGTGGATTAGACTCCTTTTCTTCCCCAGGGGTTTGTATTAAAAAATGCAACACCCTGTTCTGACCATATTGTACTATGTATCACCATTTGATAAACCGAGAAATATTTCTCTCTCTCTGATTCAAGTAGAAATACAAATGGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAACAAGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCATCCTAACCAAGATCGATTATTGGATTACAACAA TTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAAAAAAAAAAC ] [+] EMBL BI799271 [ AACAAATTGGATAGAAAAGGAGCGGAAAAAGATCCGTGGATTAGACTCCTTTTCTTCCCCAGGGGTTTGTATTAAAAAATGCAACACCCTGTTCTGACCATATTGTACTATGTATCACCATTTGATAAACCGAGAAATATTTCTCTCTCTCTGATTCAAGTAGAAATACAAATGGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAAC AGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCATCCTAACC AGATCGATTATTGGATTAC ACCATTTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAAAA ] [+] EMBL CA766330 [ GGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAACAAGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCGTCCTAACCAAGATCGATTATTGGATTACAACAATTTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAGAAAAAGAAATACCAAAGTTTCAGAATTTACGATCTATTCATTCAATATTTCCTTTTTCAGAAGACAAATTTTTGCACTTACATTATCTAGCACATATAGAAATACCCTATCCTATCCATTTGGATATCTTGCTTCAACTCCTTCAATACCGGATCCAAGATGTTCCATCCTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTCAACTACTACTCGAATTGGAATAGTTTTATTACTTCAATGAAATCCATTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATAAAAGACTATTTCGGNTCCTATATAACTCTTATGTATCAGAATATGAATTTTTCTTGGTGGTTCTTCGGAAACAATCTTCTTGCTTGCGATNACTTCTTCCGGAACCTTTCTGGAACGAATCATCNTTTCTAGGAAGATGGACATTTTGGGTTAAGNACCCCTGCTTTTTCGGANACATATGGGTCGTTTGGGTNCCCTTATGCNTATGGTCGATATCAAGGAAGGCANTCTGCTCAAAGGGACT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||