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Oryza sativa
cluster # 7290 cluster # 7290       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7290#0 length = 914 sequences # 4  

consensusID : consensus_7290#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 914
fasta sequence
                              [GCGGCGCCTTCGGCCGCCGGCGGTGGCTGCTGGGTCATGCACGAGTACAGCCTCGCCCTGCCGATGCACAAGAAGGTGAGAAACCACTACTAATCAATCATATGAGCATATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC-AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGCTCTCTGCTCATCAGATCGAATCGTCTCATCAAGTTGTGCAGCTCCACTACTACCAGTATCTGCTAGTACTAGTACTACTAGCCACTCTCTTGCATATATGCAAGAACCAACCAAACCAACC]

[+] EMBL CB634462             [GCGGCGCCTTCGGCCGCCGGCGGTGGCTGCTGGGTCATGCACGAGTACAGCCTCGCCCTGCCGATGCACAAGAAGGTGAGAAACCACTACTAATCAATCATATGAGCATATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTATCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAACAAAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGC                                                                                                                         ]
[+] EMBL CB672392             [                                                                                                       GAGCATCTTATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGCTCTCTGCTCATCAGATCGAATCGTCTCATCAAGTTGTGCAGCTCCACTACTACCAGTATCTGCTAGTACTAGTACTACTAGCCACTCTCTTGCATATATGCAAGAACCAACCAAACCAACC]
[+] EMBL CB671993             [                                                                                                       GAGCATATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGCTCTCTGCTCATCAGATCGAATCGTCTCATCAAGTTGTGCAGCTCCACTACTACCAGTATCTGCTAGTACTAGTACTACTAGCCACTCTCTTGCATATATGCAAGAAACAACCAAACCAACC]
[+] EMBL CF304374             [                                                                                                           ggATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAA                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_7290#0 GCGGCGCCTTCGGCCGCCGGCGGTGGCTGCTGGGTCATGCACGAGTACAGCCTCGCCCTG CCGATGCACAAGAAGGTGAGAAACCACTACTAATCAATCATATGAGCATATGATTTCCTC CTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTT CATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTG TGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATT TGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGC TAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCT ATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTT AAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCA AGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAACAAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTT CTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTAC AGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATA ACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGG CTGTACTAGATGCTCTCTGCTCATCAGATCGAATCGTCTCATCAAGTTGTGCAGCTCCAC TACTACCAGTATCTGCTAGTACTAGTACTACTAGCCACTCTCTTGCATATATGCAAGAAC CAACCAAACCAACC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)