Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7302 cluster # 7302       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7302#0 length = 632 sequences # 4  

consensusID : consensus_7302#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 632
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTCTATCACACATTGTATACTACCCAACTAGCTGAAGTTCACGTTAAACCTAGCTTATAAGACAACTAATTTAGTGTTAATTAAACATGAGTTTATATTTTTCATTTTATTAGCTAACTTGAAACTTGTCGTCAACCATGTTAAGTTTACTTAAGCTAGAACGCAAAAGCTGAAGCAAGATTTATGGTATAATTAACTAACTAGGGTTTACAGGATATATAGGATCAATATATGTCCAAGTTTAACTATAACACTTATAACTACTGATTTTATAATTAACTAAGGCCCTGTTTAAATCCCACCCCAAATTTTTTTACCCTATCACATCGAACGTTTGAACACATATGTATGAAGTATTAAATATAGACTAAAAACAAAACTAATTCCACATATTGTGACTAAGTTGTGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTAACAATGTGTTGCTACAGTAAACATTTGCTAATAACGGATTATTTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGATTCTGTAATTTGTTTTGATATTAGACTATGTTTAATACTTCAGATGTGACACGCCAAAACTTTACACCCCTGAATCTATACACCCCCTTGTCTCGTC]

[+] EMBL CA761206             [TTTTTTTTTTTTTCTATCACACATTGTATACTACCCAACTAGCTAAAGTTCAGGTTAAACCTAGCTTATAAAACAACTAATTTAGGGTTAATTAAACATGAGTTTATATTTTTCATTTTATTAGCTAACTTGAAACTTGTCGTCAACCATGTTAAGTTTACTTAAGCTAGAACGCAAAAGCTGAAGCAAGATTTATGGTATAATTAACTAACTAGGGTTTACAGGATATATAGGATCAATATGTGTCCAAGTTTAACTATAACACTTATAACTACTGATTTTATAATTAACTAAGGCCCTGTTTAAATCCCACCCCAAATTTTTTTACCCTATCACATCGAACGTTTGAACACATATGTATGAAGTATTAAATATAGACTAAAAACAAAACTAATTCCACATATTGGGACTAAGTTGTGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTAACAATGTGTTGCTACAGTAAACATTTGCTAATAACGGATTATTTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGATTCTGTAATTTGTTTTGATATTAGACTATGTTTAATACTTCAGATGTGACACGCCAAAACTTTACACCCCTGAATCTATACACCCCCTTGTCTCGTC]
[-] EMBL CB096906             [                  ACACATTGTATACTACCCAACTAGCTGAAGTTCACGTTAAACCTAGCTTATAAGACAACTAATTTAGTGTTAATTAAACATGAGTTTATATTTTTCATTTTATTAGCTAACTTGAAACTTGTCGTCAACCATGTTAAGTTTACTTAAGCTAGAACGCAAAAGCTGAAGCAAGATTTATGGTATAATTAACTAACTAGGGTTTACAGGATATATAGGATCAATATATGTCCAAGTTTAACTATAACACTTATAACTACTGATTTTATAATTAACTAAGGCCCTGTTTAAATCCCACCCCAAATTTTTTTACCCTATCACATCGAACGTTTGAACACATATGTATGAAGTATTAAATATAGACTAAAAACAAAACTAATTCCACATATTGTGACTAAGTTGTGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTAACAATGTGTTGCTACAGTAAACATTTGCTAATAACGGATTATTTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGATTCTGTAATTTGTTTTNATATTAGACTATGTTTAATACTTCAGATGTGACACGCCAAA                                       ]
[-] EMBL CB096771             [                    gCATTGTATACTACCCAACTANCTGAAGTTCNCGTTAANCCTAGCTTATAAGACAACTAATTTAGTGTTAATTAAACATGAGTTNATATTTTTCATTTTATTAGNTAACTTGAAACTTGTCGTCANCCATGTTAAGTTTACTTAAGCTAGAACGCAAAAGCTGAAGCAAGATTTATGGTATAATTAACTAACTAGGGTTTGCAGGATATATAGGATCAATATATGTCCAAGTTTANCTATAACACTTATAGCNNCTGATTTTATAATTAACTAAGGCCCTGTTTAAATCCCACCCCNAATTTTTTTACCCTATCNCATCGAACGTTTGAACACATATGTATGAAGTATTAAATATAGACTAAAAACAAAACTAATTCCNCATATTGTGANTAAGTTGTGAGACGAATCTTTTAAGCCTAANTGCTCCATGATTTAACAATGTGTTGCNACAGTAGNCATTTGCTAANANCGGATTANTTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACNGNTGGANTCTGTAATTTGTTTTGATANTAGACNATGTTTAATACTTCAGATGNGACACGCCAAAGCTTTACACCCCTGAAT                      ]
[-] EMBL CA764843             [                        TGTATACTACCCAACTAGCTGAAGTTCACGTTAAACCTAGCTTATAAGACAACTAATTTAGTGTTAATTAAACATGAGTTTATATTTTTCATTTTATTAGCTAACTTGAAACTTGTCGTCAACCATGTTAAGTTTACTTAAGCTAGAACGCAAAAGCTGAAGCAAGATTTATGGTATAATTAACTAACTAGGGTTTACAGGATATATAGGATCAATATATGTCCAAGTTTAACTATAACACTTATAACTACTGATTTTATAATTAACTAAGGCCCTGTTTAAATCCCACCCCAAATTTTTTTACCCTATCACATCGAACGTTTGAACACATATGTATGAAGTATTAAATATAGACTAAAAACAAAACTAATTCCACATATTGTGACTAAGTTGTGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTAACAATGTGTTGCTACAGTAAACATTTGCTAATAACGGATTATTTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGATTCTGTAGTTTGTTTTGATATTAGACTATGTTTAATACTTCAGATGTGACACGCCAAAACTTTACACCCCTGAATCTAAACACCCCCTTGTCTC   ]


>consensus_7302#0 TTTTTTTTTTTTTCTATCACACATTGTATACTACCCAACTAGCTGAAGTTCACGTTAAAC CTAGCTTATAAGACAACTAATTTAGTGTTAATTAAACATGAGTTTATATTTTTCATTTTA TTAGCTAACTTGAAACTTGTCGTCAACCATGTTAAGTTTACTTAAGCTAGAACGCAAAAG CTGAAGCAAGATTTATGGTATAATTAACTAACTAGGGTTTACAGGATATATAGGATCAAT ATATGTCCAAGTTTAACTATAACACTTATAACTACTGATTTTATAATTAACTAAGGCCCT GTTTAAATCCCACCCCAAATTTTTTTACCCTATCACATCGAACGTTTGAACACATATGTA TGAAGTATTAAATATAGACTAAAAACAAAACTAATTCCACATATTGTGACTAAGTTGTGA GACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTAACAATGTGTTGCTACAGTAAACATT TGCTAATAACGGATTATTTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGATTCTG TAATTTGTTTTGATATTAGACTATGTTTAATACTTCAGATGTGACACGCCAAAACTTTAC ACCCCTGAATCTATACACCCCCTTGTCTCGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)