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Oryza sativa
cluster # 7615 cluster # 7615       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7615#0 length = 840 sequences # 5  

consensusID : consensus_7615#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 840
fasta sequence
                              [TAGCCTATACGGCTCCTCTATGATCAGAAAAAAGGAAAGTACTGTTTCATTTCGTTATTATCTTCTTGGGCGTACTTAGAATTATCTAAGATAAAATCGATTTCAACGTCCTAAATTAGACCAAAGGAATTCTGTCTGCTAGAATAATAAAAAACGCTTCGGAATTCATCTCATCCTTTATAATATAATGGTACTTTTTCTTTGTTCAGCAATAACTTAATCTTGGAATAAAACACTCGTTATAAC-AATTAATAAACGAAAAGAGTTGGGTATTAGTTCATGAAGAATTCTGTATGAATATGGATAAACGACGGAAAGAATAAATAAAGATCTTTTTTTTTGTATTGCATTCCATATCTTTTGTCCTA-TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA-TTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAAC-TTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTATTGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATAGGAAATGAGATTTTTTTCTTTTACTACAAATT-ATAAGCAGTTTTGTTTCACTCATATAGCTATCTAGTTTAACT]

[+] EMBL CB630693             [TAGCCTATACGGCTCCTCTATGATCAGAAAAAAGGAAAGTACTGTTTCATTTCGTTATTATCTTCTTGGGCGTACTTAGAATTATCTAAGATAAAATCGATTTCAACGTCCTAAATTAGACCAAAGGAATTCTGTCTGCTAGAATAATAAAAAACGCTTCGGAATTCATCTCATCCTTTATAATATAATGGTACTTTTTCTTTGTTCAGCAATAACTTAATCTTGGAATAAAACACTCGTTATAAC AATTAATAAACGAAAAGAGTTGGGTATTAGTTCATGAAGAATTCTGTATGAATATGGATAAACGACGGAAAGAATAAATAAAGATCTTTTTTTTTGTATTGCATTCCATATCTTTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA TTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAACTTTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTATTGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATAGGAAATGAGATTTTTTTCTTTTACTACAAATT ATAAGCAGTTTTGTTTCACTCATATAGCTATCTAGTTTAACT]
[+] EMBL BI801659             [                                                                                                                                                                                                                               TGGAATAAAACACTCGTTATAACAAATTAATAAACGAAAAGAGTTGGGTATTAGTTCATGAAGAATTCTGTATGAATATGGATAAACGACGGAAAGAATAAATAAAGATCTTTTTTTTTGTATTGCATTCCATATCTTTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL BI800833             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTTGTA TGCATTCCATATC TTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA TTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAAC TTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTA TGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATAGGAAATGAGATTTTTTCTTTTTACTACAAATTAATAAGCAG TTTGTTTCACTC                     ]
[-] EMBL BI803588             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTTTTA TGCATTCCATATC TTTGTCCTAGTTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAAGTTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAAC TTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTATTGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATA                                                                           ]
[-] EMBL AU078639             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATNGCATNCCATATCTTTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGNCTAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGNNGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_7615#0 TAGCCTATACGGCTCCTCTATGATCAGAAAAAAGGAAAGTACTGTTTCATTTCGTTATTA TCTTCTTGGGCGTACTTAGAATTATCTAAGATAAAATCGATTTCAACGTCCTAAATTAGA CCAAAGGAATTCTGTCTGCTAGAATAATAAAAAACGCTTCGGAATTCATCTCATCCTTTA TAATATAATGGTACTTTTTCTTTGTTCAGCAATAACTTAATCTTGGAATAAAACACTCGT TATAACAATTAATAAACGAAAAGAGTTGGGTATTAGTTCATGAAGAATTCTGTATGAATA TGGATAAACGACGGAAAGAATAAATAAAGATCTTTTTTTTTGTATTGCATTCCATATCTT TTGTCCTATTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAAT TCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCG AAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAATTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATG AGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTT TCTAATCCCTCACTAACTTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAAT CCCTTATTATTGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTA AAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATAGGAAATGAGATTTT TTTCTTTTACTACAAATTATAAGCAGTTTTGTTTCACTCATATAGCTATCTAGTTTAACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)