These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8179#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 823 fasta sequence [AAAGGTCTCCTGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG-AG-GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT-TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG-AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGCCAAGTTAATAAGAAACACGACGATTCTCA] [+] EMBL CB623129 [AAAGGTCTCCGGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAATATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGCCAAGTTAATAAGAAACACGACGATTCTCA] [+] EMBL CB623167 [AAAGGTCTCATGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGCCAAGTTAATAAGAAACAGGA ] [+] EMBL CB623242 [AAAGGTCTAAGGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGC ] [+] EMBL CB623202 [AAAGGTCTCCTGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCACGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAG ] [+] EMBL CB623204 [AAAGGTCT CTGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATACCAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAGCAGTGGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTACTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACACTATGCAAATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCCAACAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTCTGAAAAGTCTGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAGCAGCGAATTGTTTTGTTTTGGTCACGCAAACGAATATTATGATGAGAATTCTAACATCTTTGGTAGGAAGTTTGGCTCTCTCCCACTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAACCAACAATTGACAAAAAAAAACTTAGTAACTGGAAACGAAAACGTTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTAATTAACTCTGAACTATCAAATGTAACTATGTCTATGATATCTTTATTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||