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Oryza sativa
cluster # 8651 cluster # 8651       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8651#0 length = 1341 sequences # 5  

consensusID : consensus_8651#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1341
fasta sequence
                              [TCTGGAACACTAGATGTAAGAGAATTCAGAGAACTGGTGAACCTCTATATCCGAAGGAGTTTAATCATTTTAAGTTGACAGATCTGGAAGTGATGAACTGTGAAAGCCCTGATGAATCACGTGCCAAGAAACGAACAAATGAGGTTTTACAGGGAAATGGTCAAAGTTACAAAGAGGTTTTTTTCGATAATTTAGACTATAGTAGACCAGAAAATTATATTCGGCCAAATTGTGTGACTCCAAATTCTCTTCCAGTTGATGCCACAAGTCCATTTGGTAGTGCCATTGCCACACAAGATCAGTCAGTACCTTTTGGTAGTGCCATTGTCAGTGGACATCCAATTCTTGATGGCAACTTCTCTACTTCTGGGACCATACAGAGGCCCATGAATGTAGAGCTCCCTTCACTCCAATATCCCAACTATGACTTTAACAATAATAATGCATGGTCATATCACGACCCCTTAGGACATCCTATTGACCAGGTTGACTTTGGCTCCCTGAGATCAGAATATCTCTCTCCAAACAACAATGGTCTGCTGGATGCATTGGTTCATGGAGGACATGGACAAGGGGAACTTGCAAATTCCCAAGGATCTTTTGATGCTTGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTCTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTG-ATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCAACAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAACCTCCACCCTTGGTGGACCCTACTTTCTGGAGGCACGATGTATCACTAGAACCGAATTTGCCAGTTTATTGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGGGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGGACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC-TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGGCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAGAATATGCTGAAATTGTATATTCGATTCATTGGTTTTGATTAATCAAAGACTATTGTCGTCAAAAAA]

[+] EMBL AK106613             [TCTGGAACACTAGATGTAAGAGAATTCAGAGAACTGGTGAACCTCTATATCCGAAGGAGTTTAATCATTTTAAGTTGACAGATCTGGAAGTGATGAACTGTGAAAGCCCTGATGAATCACGTGCCAAGAAACGAACAAATGAGGTTTTACAGGGAAATGGTCAAAGTTACAAAGAGGTTTTTTTCGATAATTTAGACTATAGTAGACCAGAAAATTATATTCGGCCAAATTGTGTGACTCCAAATTCTCTTCCAGTTGATGCCACAAGTCCATTTGGTAGTGCCATTGCCACACAAGATCAGTCAGTACCTTTTGGTAGTGCCATTGTCAGTGGACATCCAATTCTTGATGGCAACTTCTCTACTTCTGGGACCATACAGAGGCCCATGAATGTAGAGCTCCCTTCACTCCAATATCCCAACTATGACTTTAACAATAATAATGCATGGTCATATCACGACCCCTTAGGACATCCTATTGACCAGGTTGACTTTGGCTCCCTGAGATCAGAATATCTCTCTCCAAACAACAATGGTCTGCTGGATGCATTGGTTCATGGAGGACATGGACAAGGGGAACTTGCAAATTCCCAAGGATCTTTTGATGCTTGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTCTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTG ATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCAACAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAACCTCCACCCTTGGTGGACCCTACTTTCTGGAGGCACGATGTATCACTAGAACCGAATTTGCCAGTTTATTGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGGGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGGACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGGCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAGAATATGCTGAAATTGTATATTCGATTCATTGGTT                                ]
[+] EMBL BP184344             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTGCCATTGTCAGTGGACATCCAATTCTTGATGGCAACTTCTCTACTTCTGGGACCATACAGAGGCCCATGAATGTAGAGCTCCCTTCACTCCAATATCCCAACTATGACTTTAACAATAATAATGCATGGTCATATCACGACCCCTTAGGACATCCTATTGACCAGGTTGACTTTGGCTCCCTGAGATCAGAATATCTCTCTCCAAACAACAATGGTCTGCTGGATGCATTGGTTCATGGAGGACATGGACAAGGGGAACTTGCAAATTCCCAAGGATCTTTTGATGCTTGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTCTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTGAATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCAACAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CA761254             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATCCCCAAGGATCTTTTGATGC TGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTNTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTG ATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCACCAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAACCTCCACCCTTGGTGGACCCTACTTTCTGGAGGCACGATGTATCACTAGAACCAAATTTGCCAGTTTATCGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGTGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGAACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGTCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAAAAaaaa                                                            ]
[+] EMBL BP184345             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CACGATGTATCAC AGAACCGAATTTGCCAGTTTATTGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGGGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGGACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGGCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAGAATATGCTGAAATTGTATATTCGATTCATTGGTTTTGATTAATCAAAGACTATTGTCGTCAAAAAA]
[+] EMBL AA750200             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATCTTCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATCGTATTACTATCTTA                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_8651#0 TCTGGAACACTAGATGTAAGAGAATTCAGAGAACTGGTGAACCTCTATATCCGAAGGAGT TTAATCATTTTAAGTTGACAGATCTGGAAGTGATGAACTGTGAAAGCCCTGATGAATCAC GTGCCAAGAAACGAACAAATGAGGTTTTACAGGGAAATGGTCAAAGTTACAAAGAGGTTT TTTTCGATAATTTAGACTATAGTAGACCAGAAAATTATATTCGGCCAAATTGTGTGACTC CAAATTCTCTTCCAGTTGATGCCACAAGTCCATTTGGTAGTGCCATTGCCACACAAGATC AGTCAGTACCTTTTGGTAGTGCCATTGTCAGTGGACATCCAATTCTTGATGGCAACTTCT CTACTTCTGGGACCATACAGAGGCCCATGAATGTAGAGCTCCCTTCACTCCAATATCCCA ACTATGACTTTAACAATAATAATGCATGGTCATATCACGACCCCTTAGGACATCCTATTG ACCAGGTTGACTTTGGCTCCCTGAGATCAGAATATCTCTCTCCAAACAACAATGGTCTGC TGGATGCATTGGTTCATGGAGGACATGGACAAGGGGAACTTGCAAATTCCCAAGGATCTT TTGATGCTTGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTC TGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTGATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTG TTGGCATCAACAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAACCTCCACCCTTGGTGG ACCCTACTTTCTGGAGGCACGATGTATCACTAGAACCGAATTTGCCAGTTTATTGCCAGT TTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCG GTCATGGGGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATG ACCTTGAGGACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTG AATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATCTCAACCAGTGAGAGAACCA AGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCG TATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATG TGGCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGT TACATTGTTTGCTAGAATATGCTGAAATTGTATATTCGATTCATTGGTTTTGATTAATCA AAGACTATTGTCGTCAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)