These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9167#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 967 fasta sequence [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGGCATTGCGATTTGCGAATCTATCGACGCCACCGATCGACCTACGCCTGCAAATTAAATTCCGCAGCTAGCTAGCAACAACAACTCCCGACCGGCCGCGGCCACGACGCGCGCACGGACGGACGGACGACGACATGCCTCGCGCACTGATCGCCCTCGCGTCGGCTGTCCTGCTGCTGGTGGCCGCGGTGGCGCCGCCGCTCGCCGCCGCGGACGACGGCGGCGCCGGAGTCCCGGGGGAAGGGAAGCTGGAGAGCGCGGGGTCCGCGATTAAGTCGGCGGCCGCCAACGCGTTCGGGGTCGGCTCCGACATCGGCGGCGTCCCGGTCAACCCGTCGCCGGGTGGCGCCAACGCTTAATATATTTACAGTATTACAGTGGCTGTTTCCTTGTGACTTTAATTTGTCAGAGTTTTTGGAGGCCATTTCATTCCATATATACCTAATTAATTACTACCTAAATACTAGTATATGTAATTAATCACGCTTGCTTGTGT] [+] EMBL AU173269 [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAA ] [+] EMBL AU184182 [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAA ] [+] EMBL AU184195 [TTGATCTGGAGCACTTTGGGTGGCTTCTTGTCCTAAGTTATGTTAGGTTATAAACGCCTGTTTGTGCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAA ] [+] EMBL AU033244 [ nCTGGTGTCACTTCACAGCAGACTCAGGGGTGGCCTTTGTTGCTTGAATTGTGGTTTTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCaaa ] [-] EMBL CF325323 [ TTGCTCGGTTGTGATGCGTTGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGA ] [+] EMBL AK109565 [ TGAGAAATGTCAAATTCGTTGGTTGCGTCTGAAGATGTGGGCGGTTCTTGAAGAGAGCTTGGAATAATGATCTGCGTTGGTTGATAAAAGTTTGGGTTTTTTAGTACATCTTTTTAGCGACTGTACTTTGTGTCGATCTGATATACCTATCCTCTTATAGTGGTATTTGTTAGCACAAGTGGCTTTATAGCTGCAGTTTGTATCTCTTGAACAATGTGTAAACCTGGGTGCGATTTGTGACAAGTTTACAGCTTGAATGAGTCAGTCCGGTTCCATCTTGGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGGCATTGCGATTTGCGAATCTATCGACGCCACCGATCGACCTACGCCTGCAAATTAAATTCCGCAGCTAGCTAGCAACAACAACTCCCGACCGGCCGCGGCCACGACGCGCGCACGGACGGACGGACGACGACATGCCTCGCGCACTGATCGCCCTCGCGTCGGCTGTCCTGCTGCTGGTGGCCGCGGTGGCGCCGCCGCTCGCCGCCGCGGACGACGGCGGCGCCGGAGTCCCGGGGGAAGGGAAGCTGGAGAGCGCGGGGTCCGCGATTAAGTCGGCGGCCGCCAACGCGTTCGGGGTCGGCTCCGACATCGGCGGCGTCCCGGTCAACCCGTCGCCGGGTGGCGCCAACGCTTAATATATTTACAGTATTACAGTGGCTGTTTCCTTGTGACTTTAATTTGTCAGAGTTTTTGGAGGCCATTTCATTCCATATATACCTAATTAATTACTACCTAAATACTAGTATATGTAATTAATCACGCTTGCTTGTGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||