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Oryza sativa
cluster # 9841 cluster # 9841       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9841#0 length = 1887 sequences # 7  

consensusID : consensus_9841#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1887
fasta sequence
                              [GGCCTCTCAAATGTTTGCCAAGAAGTAGTAAAGATTAATTTACTATCAGAATACTCTTACAATATTAGAGTACACGGCCATAGAAAACGGCCACATCAACCAATGTACCCATGCCATCGCTGCCGCTATCAGCTCTACATATAGGATTCTCCCCCTCTTTCTGGTGGAGAAATGATCTTTGCTAGGTCGATCCAAAACCATAATAGTCTCGATTCCAAAAAAAACCGGGATTAAAAATGATCTTTAGTCCCGGTTAAAGATCCTACTAAAAATGTCAGATGTATGTCGGGGGCCGAGGATCTTTAGTCCTGGTTGGTGTCACGCCAACTGGGACTAAAGATCACCACTTTAGTCTTGGTTGGTAATACCAACCGGGACTAAAGATCATCTAGACTCTCGGTTGGTATTACCAACCAGAACTAAAATTAAACGCGTAATATATAATCCCTATCACTTATCCTCTCCTCTACAATCGCAACTCACACAGATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA-CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGCAAGACCGGACTTCGCTTCCCTAACCTTTGATTAATAAATTAATTAATTAGTGTCATTAGCATTTAATTAATTAATAGTAATATTTTTTAATAAACATCATTAGTAATTAATTAATCGGTAATTGTCTGTTAATTATCCACTAATCATGATGCCAGTTGCCAGGCCATCTCGCGAGCGGATGAAGCGAGACCGTGACTGGACCTACGGTATCGCGGCAGGATTTGGCGAGACCGCGGCACGGCGTCACGCCATTGTAATTTTCGCTGAATGGATATCGTTTTGATTTCGTACTCCGACAACGGTATATTTGTTATAAAAAATTTAGGGTAATTGTGTTCTTGTTCTTGCTTTACAGTTGAATTGTGATTTTACCC-CTACTTTTTAGGGTTTATGATTTTGTCCTATCTTTTTGAAAGGAAGGAGTGGAGTGCCCC]

[+] EMBL AK061057             [GGCCTCTCAAATGTTTGCCAAGAAGTAGTAAAGATTAATTTACTATCAGAATACTCTTACAATATTAGAGTACACGGCCATAGAAAACGGCCACATCAACCAATGTACCCATGCCATCGCTGCCGCTATCAGCTCTACATATAGGATTCTCCCCCTCTTTCTGGTGGAGAAATGATCTTTGCTAGGTCGATCCAAAACCATAATAGTCTCGATTCCAAAAAAAACCGGGATTAAAAATGATCTTTAGTCCCGGTTAAAGATCCTACTAAAAATGTCAGATGTATGTCGGGGGCCGAGGATCTTTAGTCCTGGTTGGTGTCACGCCAACTGGGACTAAAGATCACCACTTTAGTCTTGGTTGGTAATACCAACCGGGACTAAAGATCATCTAGACTCTCGGTTGGTATTACCAACCAGAACTAAAATTAAACGCGTAATATATAATCCCTATCACTTATCCTCTCCTCTACAATCGCAACTCACACAGATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
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[+] EMBL CB660620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB651330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTATCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCTCCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCTTTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTACGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CB649175             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCTGAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTATTTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGATTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCATGCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACTGCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCTTTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTAAAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCA CCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CB660621             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCACCCTATATATAAAGTAAAATATATGACTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGCACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGCAAGACCGGACTTCGCTTCCCTAACCTTTGATTAATAAATTAATTAATTAGTGTCATTAGCATTTAATTAATTAATAGTAATATTTTTTAATAAACATCATTAGTAATTAATTAATCGGTAATTGTCTGTTAATTATCCACTAATCATGATGCCAGTTGCCAGGCCATCTCGCGAGCGGATGAAGCGAGACCGTGACTGGACCTACGGTATCGCGGCAGGATTTGGCGAGACCGCGGCACGGCGTCACGCCATTGTAATTTTCGCTGAATGGATATCGTTTTGATTTCGTACTCCGACAACGGTATATTTGTTATAAAAAATTTAGGGTAATTGTGTTCTTGTTCTTGCTTTACAGTTGAATTGTGATTTTACCC CTACTTTTTAGGGTTTATGATTTTGTCCTATCTTTTTGAAAGGAAGGAGTGGAGTGCCCC]
[-] EMBL CB660623             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCCTTCAAGTCAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTCATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAAAGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGCGTCTCCTGTGTGCAAGACCGGACTTCGCTTCCCTAACCTTTGATTAATAAATTAATTAATTAGTGTCATTAGCATTTAATTAATTAATAGTAATATTTTTTAATAAACATCATTAGTAATTAATTAATCGGTAATTGTCTGTTAATTATCCACTAATCATGATGCCAGTTGCCAGGCCATCTCGCGAGCGGATGAAGCGAGACCGTGACTGGACCTACGGTATCGCGGCAGGATTTGGCGAGACCGCGGCACGGCGTCACGCCATTGTAATTTTCGCTGAATGGATATCGTTTTGATTTCGTACTCCGACAACGGTATATTTGTTATAAAAAATTTAGGGTAATTGTGTTCTTGTTCTTGCTTTACAGTTGAATTGTGATTTTACCCAAGGGTTTTTAGGGTTTATGATTTTGTCCTATCTTTctc                      ]


>consensus_9841#0 GGCCTCTCAAATGTTTGCCAAGAAGTAGTAAAGATTAATTTACTATCAGAATACTCTTAC AATATTAGAGTACACGGCCATAGAAAACGGCCACATCAACCAATGTACCCATGCCATCGC TGCCGCTATCAGCTCTACATATAGGATTCTCCCCCTCTTTCTGGTGGAGAAATGATCTTT GCTAGGTCGATCCAAAACCATAATAGTCTCGATTCCAAAAAAAACCGGGATTAAAAATGA TCTTTAGTCCCGGTTAAAGATCCTACTAAAAATGTCAGATGTATGTCGGGGGCCGAGGAT CTTTAGTCCTGGTTGGTGTCACGCCAACTGGGACTAAAGATCACCACTTTAGTCTTGGTT GGTAATACCAACCGGGACTAAAGATCATCTAGACTCTCGGTTGGTATTACCAACCAGAAC TAAAATTAAACGCGTAATATATAATCCCTATCACTTATCCTCTCCTCTACAATCGCAACT CACACAGATCAAATCTCTCCCCCTCTTCCCTTTCCTCCTCCTCTCCTCTCCTACAGTCTA TCCTCTCTTCCTCATCCCCTCTCCTCCACCTCCTGCCCTTCCTCCTCTCCTCCCCCTCCT CCCCTTCCCATCCGGCGGGCCGGCGGCCGTGGCGAGCAGTGGCAGCGGCTTTGTTTGTCT TTTTTTATATAATCTGTGATTCACTAAGATGTTTAAATTTGTGATTCAATGCATGGATCT GAGATGTATAATCTGTAATGTATTTGATTTGTGTGTAATTTTTTAGGATTTGTGATGTAT TTGATTTTTGTGTATAAGTAACTTTAAGATTTATGATGTAGATTTGGGATGTTACATTGA TTTGGGGATTTAGGGTTTGATTTGATTTGGGGATTTGGGGTATGATTTAGGGATATGCAT GCCACTTGATTCGGGAGAAAATAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGGGGATCATCTGGTACT GCCGCTATTCTTTCTTTACTCTCGGTTGATAACATCAACCGGGACTAAAGATCCCTCTCT TTAGTCCGGTTGGTCCATCTTTAGTCTTGGATTCCTATTCCGGTTGGAAAACCGAGACTA AAAGGGTTACTAACCGGGAGTAAAAATAGTTTCCACCTATATATAAAGTAAAATATATGA CTGATTCAATATGTCATCTGAGGTCCAACGTGTAACGATCGATCGAATCGCCATCGTAGC ACCCACTGTGGCGAGAAATTTGTATTTAGACCCCTCGTGCTATATAATATGCCTTCAAGT CAACTTCCAAACACTCCCAGACCTTTTGAGAAAAAAAATTCAAAAATATACTTTTTTTTC ATTGGTTTTATATAAATATACAGGTTTAGAAAGAAATTATAGAAATCTAATCGTCACGAA AGAAAGTTCAAAATCGCGTGTTGCCGCACGACTTGCGCGAGACCGCTCAGTCTCGCGCGC GTCTCCTGTGTGCAAGACCGGACTTCGCTTCCCTAACCTTTGATTAATAAATTAATTAAT TAGTGTCATTAGCATTTAATTAATTAATAGTAATATTTTTTAATAAACATCATTAGTAAT TAATTAATCGGTAATTGTCTGTTAATTATCCACTAATCATGATGCCAGTTGCCAGGCCAT CTCGCGAGCGGATGAAGCGAGACCGTGACTGGACCTACGGTATCGCGGCAGGATTTGGCG AGACCGCGGCACGGCGTCACGCCATTGTAATTTTCGCTGAATGGATATCGTTTTGATTTC GTACTCCGACAACGGTATATTTGTTATAAAAAATTTAGGGTAATTGTGTTCTTGTTCTTG CTTTACAGTTGAATTGTGATTTTACCCCTACTTTTTAGGGTTTATGATTTTGTCCTATCT TTTTGAAAGGAAGGAGTGGAGTGCCCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)