cluster # 100

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Schistosoma mansoni
cluster # 100 cluster # 100 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_100#0 length = 849 sequences # 2

consensusID : consensus_100#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 849
fasta sequence

                              [TTACACTGCTTTAACGATACATGCTGTTTATAACCACACAATTTGAAAGTTTTATATGATTTTAATTTGATGTCGATCTATTAAGCTCATTATTTACTTGATTTTTACATTCACACAATGCTATTTGACGTTAAAACAACTAAAGTGAACTGTTATGAGCGTAATAAATATTCATCATAATGCATTCTGATTATAATCTTAAACTATCCAGCGTTGAATGGAAATTATCAATGCGATCTTACACAATTGGGGCCCTGTATTTATAATCGACTTTTTTAAAACAAAGTATGAAAAAAGTGGCTGGTAAACTTGATCGATAGTATTTGATCTGCACTAAGAAGGACCTGACACACATGACATTGATCACCACCCGGTGACCAATCAATTTTGAAACTCACCTGTATTTGGTTTTTGAAACAACTTTTATTAGTATTAATAATTTAATTCACATGAAGACTTATATTACCTGTTTTCAGTTAGATATCTCAACTTTCTCTAGAAGCATATTCAATCTTGAGTATTTGTTATCGACACTGTACATTCTTGGACGATTAATTCGAAACAGTATAGTATATATCCCCTATATTTGTATTTGATCTTTTAAGTAAGAAGGGTGTTATCTGATTGTCCGCCTGTTACGTGATTTTGCGAGCTTATTGACTGTTAGAATAGTAAAGTCATGACTGTGATTGATTGTTCACTGACTTTTAAAAGATTAGTTTAGAAAGTCAAGAATGATCATTAATCGTCGTAAACGAAATATATAGTTTAAATTATTGAACAGGATGTTTTTATTTCGAATGGTACTTAACCTATGAGTACGGTGTGTAACTTTATAGTAATCTGTAA]

[+] EMBL CD123353             [TTACACTGCTTTAACGATACATGCTGTTTATAACCACACAATTTGAAAGTTTTATATGATTTTAATTTGATGTCGATCTATTAAGCTCATTATTTACTTGATTTTTACATTCACACAATGCTATTTGACGTTAAAACAACTAAAGTGAACTGTTATGAGCGTAATAAATATTCATCATAATGCATTCTGATTATAATCTTAAACTATCCAGCGTTGAATGGAAATTATCAATGCGATCTTACACAATTGGGGCCCTGTATTTATAATCGACTTTTTTAAAACAAAGTATGAAAAAAGTGGCTGGTAAACTTGATCGATAGTATTTGATCTGCACTAAGAAGGACCTGACACACATGACATTGATCACCACCCGGTGACCAATCAATTTTGAAACTCACCTGTATTTGGTTTTTGAAACAACTTTTATTAGTATTAATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD133911             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGAAAAAAGTGGCTGGTAAACTTGATCGATAGTATTCGATCTGCACTAAGAAGGACCTGACACACATGACATTGATCACCACCCGGTGACCAATCAATTTTGAAACTCAGCTGTATTTGGTTTTTGAAACAACTTTTATTAGTATTAATAATTTAATTCACATGAAGACTTATATTACCTGTTTTCAGTTAGATATCTCAACTTTCTCTAGAAGCATATTCAATCTTGAGTATTTGTTATCGACACTGTACATTCTTGGACGATTAATTCGAAACAGTATAGTATATATCCCCTATATTTGTATTTGATCTTTTAAGTAAGAAGGGTGTTATCTGATTGTCCGCCTGTTACGTGATTTTGCGAGCTTATTGACTGTTAGAATAGTAAAGTCATGACTGTGATTGATTGTTCACTGACTTTTAAAAGATTAGTTTAGAAAGTCAAGAATGATCATTAATCGTCGTAAACGAAATATATAGTTTAAATTATTGAACAGGATGTTTTTATTTCGAATGGTACTTAACCTATGAGTACGGTGTGTAACTTTATAGTAATCTGTAA]




>consensus_100#0
TTACACTGCTTTAACGATACATGCTGTTTATAACCACACAATTTGAAAGTTTTATATGAT
TTTAATTTGATGTCGATCTATTAAGCTCATTATTTACTTGATTTTTACATTCACACAATG
CTATTTGACGTTAAAACAACTAAAGTGAACTGTTATGAGCGTAATAAATATTCATCATAA
TGCATTCTGATTATAATCTTAAACTATCCAGCGTTGAATGGAAATTATCAATGCGATCTT
ACACAATTGGGGCCCTGTATTTATAATCGACTTTTTTAAAACAAAGTATGAAAAAAGTGG
CTGGTAAACTTGATCGATAGTATTTGATCTGCACTAAGAAGGACCTGACACACATGACAT
TGATCACCACCCGGTGACCAATCAATTTTGAAACTCACCTGTATTTGGTTTTTGAAACAA
CTTTTATTAGTATTAATAATTTAATTCACATGAAGACTTATATTACCTGTTTTCAGTTAG
ATATCTCAACTTTCTCTAGAAGCATATTCAATCTTGAGTATTTGTTATCGACACTGTACA
TTCTTGGACGATTAATTCGAAACAGTATAGTATATATCCCCTATATTTGTATTTGATCTT
TTAAGTAAGAAGGGTGTTATCTGATTGTCCGCCTGTTACGTGATTTTGCGAGCTTATTGA
CTGTTAGAATAGTAAAGTCATGACTGTGATTGATTGTTCACTGACTTTTAAAAGATTAGT
TTAGAAAGTCAAGAATGATCATTAATCGTCGTAAACGAAATATATAGTTTAAATTATTGA
ACAGGATGTTTTTATTTCGAATGGTACTTAACCTATGAGTACGGTGTGTAACTTTATAGT
AATCTGTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case