Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10056 cluster # 10056       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10056#0 length = 771 sequences # 13  

consensusID : consensus_10056#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 771
fasta sequence
                              [AGAGTATTTATCGGGTCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTATTTGAG-TTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGG--AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]

[+] EMBL CD094945             [AGAGTATTTATCGGGTCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTATTTGAGCTTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGGAAAAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTAACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATTTAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCA                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD094509             [AGAGTATTTATCGGGTCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTATTTGAG TTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGG  AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGANTAAGATGAGCTC                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD094600             [AGAGTATTTATCGGGTCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTATTTGAG TTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCTAAGTTTGCCTTCAAACGCGG CATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGG  AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTC ACGATAGTGTAACTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGNGGACGATATAGTGATA                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD094598             [AGAGTATTTATCGGGTCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTATTTGAG TTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTGAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGG  AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGng                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD164677             [    TATTTATCGGGCCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTATTTGAG TTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGGA AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD132374             [                                              CTAACCGTCACTTATTTGAG TTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGGA AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATGTATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD082812             [                                                                           ACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCCATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTAATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGG  AAAAAACAAAAAGAAGCAAGAACTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACT                                                                ]
[-] EMBL CD094739             [                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGCAGATACATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAGCAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]
[-] EMBL CD095154             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTACACCATATATCTCCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGTTGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]
[-] EMBL CD095218             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCTGGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]
[-] EMBL CD094682             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACCTTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACNCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCCATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT]
[+] EMBL CD130951             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACGTAATGTTAACCCAGGAGATCCCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGTTTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATT    ]
[+] EMBL BG932509             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCTGATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGATGAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGACGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGGAAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCT                   ]


>consensus_10056#0 AGAGTATTTATCGGGTCATTTTGGGACCGACCACTGCGATATGACGCTAACCGTCACTTA TTTGAGTTGGAGTCACAGGACTTGTTTAAAGACCTCCGAAGTTTGCCTTCAAACGCGGCC ATGCGCAAACTAAATGATATGATACGACGCGCAAGGCTAGCTAAAGTACATGCCTACCTA ATTGGTCATCTTAAGAAAGAGATGCCTTCAATCGTTGGAAAAAACAAAAAGAAGCAAGAA CTTATTAACAATTTACAGCAGATATATGATACTATCTCACGTTTACACCATATATCTCCT GGCGACTTCCCTAAACTCTCTCATATGCAGAGTATTTTGAGTGAACAGGATTTTACCACC TTCCCCTCTCTTAAAGAAAGGCTTATTGAACAAGTTGACGTAATGTTAACCCAGGAGATC CCTAAATTAATGCAGATGATACCAATTGAACAATCAGCGGCTGTTCAACAGGGTACAAGT TTCATTAAGGGAGGAGCTTTCAACGATAGTGTAATTGATAGCCCATTTACGGCCGATGCT GATATGGCTATTAATCGTGGACGATATAGTGATAAGTCGACTTTAGAGGACGATAAAGAT GAGCTCATAAAAGAATTTGAAAGTCTTCAACCAATTGATGGTCTTCTTTATGGAAGCGGA CGATTAAAAGCGAAATTGATGGAATCTCATTTACCTAATATCACACTAAGTCGTATATGG AAACTTTCAGACATTGATAAAGATGGTTGTCTTGATATCGATGAATTCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)