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Schistosoma mansoni
cluster # 10200 cluster # 10200       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10200#0 length = 982 sequences # 14  

consensusID : consensus_10200#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 982
fasta sequence
                              [TTTGAGTATTGTAGAATTATATTTAATTAAAGATTAAATCTATGATTAGAATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAGATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT-TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTATCAAACGGATAATTTGCAACCAAATCACCACCATGCATATTAGCACCCAGCACAAAATTGATTTTGTCTAACCATTCCATTA]

[+] EMBL CD073896             [TTTGAGTATTGTAGAATTATATTTAATTAAAGATTAAATCTATGATTAGAATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAAATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGCGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD073887             [            AGAATTATATTTAATAAAAGATTAAATCTATGATTAGAATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAGATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD076615             [                                                  ATTTGATATATTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTGTCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAGCATAATTTATCATGTAGATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACAT AACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGC AAATATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD169317             [                                                                                                                                                                                                                                     GGGGGATTGTAATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD088303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTTACTTGCTGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATAGCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCT TTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD078486             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTATANAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTA TTGCCTNTTTGTAAGAAGTCGATAATAATCACCAAATTGATCTGTATNTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGATGGATCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTATCAAACGGATAATTTGCAACCAAATCACCACCATGCATATT                                         ]
[+] EMBL CD149180             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD149198             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD195208             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTAT                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD195225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTATATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGGATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTATCAAACGGATAATTTGCAAC                                                              ]
[-] EMBL CD195326             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTACTTTCCGCATATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTAT                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD142166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGACATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCCAATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTt                                                                                  ]
[+] EMBL SMRAP040             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TACTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTSAGAAGCGTTGGGAAACTTTTSACAACCCAATTCCAAAGTTATTTSGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTRATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTRATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAG  SWWGCACTTTTKAATCCCTTTKBKCATTCGKGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGT                                                                                            ]
[-] EMBL CD111795             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCATTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCATAGCACTTTNTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGCTCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTATCAAACGGATAATTTGCAACCAAATCACCACCATGCATATTAGCACCCAGCACAAAATTGATTTTGTCTAACCATTCCATTA]


>consensus_10200#0 TTTGAGTATTGTAGAATTATATTTAATTAAAGATTAAATCTATGATTAGAATTTGATATA TTCTATGTATTTGCGAATATTGATATGTCAGTCATATATAAGTAACCTTAAGCTAAACTG TCCTCATCGATCCATGTGGTTTGTGGTATCATATTCATCATTTCACTATACTGTTTTAAG CATAATTTATCATGTAGATAACCGCTGATGTGAAATGGCTTGGAAACGGGGGGGATTGTA ATACTGTTCAATACATCATATCTTTTGAAATTTGTTGGTAAAAGTAGAAAATTTACTTGC TGTGCTTCAAGAAATGGTCCATTTATAGACGGTGTGTAATGTACATCAACACAAGCGATA GCTGGTATAAAACCATCAGCTGAGGCGGTAACTATGTATTTGCCTTTTGTAAGAAGTCGA TAATAATCACCAAATTGATCTGTATTTATATTGTGAAGTATAGGAGTGAGAGTAGTTGGA TCAGTTATATTAGCTACTTTGATGATTGCGTTTTCTACTGGAATGTAAGTATTTTCCGCA TATCCATATACAGTGCCTTTAATACCTCTATGGACTTGCAAAATATAGTTGAGCAGAGAC ATTTTATTTTCATTCCAATATCTTGGTAATTCAGAAGCGTTGGGAAACTTTTCACAACCC AATTCCAAAGTTATTTCGAAACTATTCGTGTGCAGATAATTGTAATCTTGCATTCCTCCA TTCAACGAATACCATCTTGCACCATTTGTAATGCCATCATTGAAGTGGTTATCGGAGTCA TAGCACTTTTTAATCCCTTTTTTCATTCGTGGATGTTTATCAGCATAGGATTCTGCTAGC TCAACAAAAGTAGGGTTGTCTGGTGTAATAGATTCGGCAGAATTCCCAGTTATTGACTTA TCAAACGGATAATTTGCAACCAAATCACCACCATGCATATTAGCACCCAGCACAAAATTG ATTTTGTCTAACCATTCCATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)