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Schistosoma mansoni
cluster # 10271 cluster # 10271       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10271#0 length = 880 sequences # 14  

consensusID : consensus_10271#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 880
fasta sequence
                              [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATGAAAATACTTTATTTGGTTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTTCTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGTTACATCACAACCATTATTGTTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGGAAGTCTTATAAGAAAGGAATGAGGGCGAAGAAATAAACTTTTCAATTTAGTCCTCGAAACTGAATCCGTG]

[+] EMBL AI976846             [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATGAAAATACTTTATTTGGTTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTTTTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGTTACATCACAACCATTATTGTTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD074919             [                                                                           AATACTTTATTTGGTTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTTCTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGTTACATCACAACCATTATTGTTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAAC ACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTT                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD072964             [                                                                           AATACTTTATTGGGGTTATAAGTAAACACAGTTCTAAACTTTCTTCTAGAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGGTACATCACAACCATTATTGCTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATTAGTTAATCATAGTTTGGATTGAACTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTGGTCCATAATAACTTTCAACTGGAACAACATTTGGTTCAATTTTTCTATTACAATCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD075988             [                                                                           AATACTTTATTTGGGTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTTCTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGGTACATCACAACCATTATTGGTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGGTCAATAATGATTACCATCCATATGACGTTTGGGTGCCCATAAATTCCAAAATTGGCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGGTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD076000             [                                                                           AATACTTTATTTGGTTTATAAATAAACACAGATTTAAACTTTCTTCTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGGTACATCACAACCATTATTGGTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGGTCAATAATGATTACCATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGGAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AW017295             [                                                                                         TTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTTCTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGTTACATCACAACCATTATTGTTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCANGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATTATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGGTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATANAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCAT                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI976843             [                                                                                         TTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTTCTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGTTACATCACAACCATTATTGTTTATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTTTGGATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCATGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATTATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAA TTTTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD082386             [                                                                                                                                                                                                                                 AAGTANATAATATTNTGGATTGATTANTCCATTAAATGTTCAATAATGATANCGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGGAAGTCTTATAAGAAAGGAGTGAGGGCGAAGAAATAAACTTTTCAATTTAGTC                  ]
[-] EMBL CD082399             [                                                                                                                                                                                                                                                  GATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGCCCATCAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCGTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGGAAGTCTTATAAGAAAAGAATGAGGGCGAAGAAATAAACTTTTCAATTTA                     ]
[-] EMBL SM960                [                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCAT ATG NTNCGA CCAAATGNCGTTTGTGTGCCCA AGATGCC AAATTGTCGTCCATAATAACCTCCAGCTGG ACCACATCTGGTTCAGTTTTTCTATTACCATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACCACACCATCCTGGTAGNCAATCATAATCAGCTACACATANATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCNTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCCAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTA TTCTCCT AAAACCACAGATCACAGTACTAGATACT AAATCTTAATTT                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD078492             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAGTTTGCATTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCGTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGATGCATTCATACTCTTCTCAGCAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTAACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCCAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCTCAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAAGTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCG                                                                       ]
[-] EMBL CD201239             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCACAACACCATCCTGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTGTCATGAAAA                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD189871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCTAGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAAATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAAATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAAT                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD077951             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CACAGTCTTGTTACTGCTTGTACGCCCAAATTTNTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTAACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAAACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAACTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGTAAGTCTTATAAGAAAGGAATGAGGGCGAAGAAATAAACTTTTCAATTTATACCTCGAAACTGAATCCGTG]


>consensus_10271#0 TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTGGAAATGAAAATACTTTATTTGGTTTATAAGTAAACACAGTTTTAAACTTTCTT CTAAAATTCAAATGAAATGAAATTTATTCACAACCGGTTACATCACAACCATTATTGTTT ATCACAACCAAATTAAAGTTTTTAAATATTCTTTGATGAATAAATAAGTAAATAATATTT TGGATTGATTTATCCATTAAATGTTCAATAATGATTACGATCCATATGACGTTTGTGTGC CCATAAATTCCAAAATTGTCGTCCATAATAACTTCCAGCTGGAACAACATCTGGTTCAGT TTTTCTATTACAATCTTGTGTACAGCGACGTGCATATAGTTTGCCTTCACAACACCATCC TGGTAGACAATCATAATCAGCTACACATAAATTTCGGTAAGATCCAGCAATTTTATTTCT AGCATTCCTAAGTTGACATTGCAAATCAGGGCTGCATTCATACTCTTCACAACAATTGAA ATCATCCATGCATTCCTCTCCTTCCATACCACACAGTCTTGTTACTGCTTTTACGCCCAA ATTTTTATCATAATCCTTTGTTCTTGTTCTTGCCTCGATGATAATGATGAGACAGATGTA ACATAAAAATGTGCAAGTGCAATATTTTAGCATATGAACTAAATACTATTTCTCCTAAAA ACAACAGATCACAGTACTAGATACTAAAATCTTATTTTTGTTTAGTTAAACTAAGTTAAA CTAAGTTTATAGTTAACAAAGTTAGTGCGGAAGTCTTATAAGAAAGGAATGAGGGCGAAG AAATAAACTTTTCAATTTAGTCCTCGAAACTGAATCCGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)