Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10343 cluster # 10343       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10343#0 length = 1643 sequences # 15  

consensusID : consensus_10343#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 1643
fasta sequence
                              [TTCTTTCATCTGTTTCATCACCGTTTATTTGTCGATTATTCAATACATATCGTGATAATAAATATGTATACATGTTATTAGAAGCATGTTTAGGCGGTGAATTATGGACTATCCTTCGTGATAGTCATCATCTTGAAGAACGTACAACAAGATTTTGTTTGGCATGTTGTATTGAGGCATTGGATTATTTACATCGTCATGGAATTCGTTATCGTGATTTAAACCCAGAG-ATATGCTGGTGACATCCAAAGG-TACATTAAATTATGCGAGTTCGGATTTGCTAAATACATTGGAATTGGTCAAAAAACATGGACATTCTGTGGTACACCAGAATATGTTGCACCAGAAGTAATTCTTAATCAAGGACATGATTTCGCTGCAGATTATTGGTCATTAGGTATTTTAACTTTTGAATTACTTACAGGCGCTCCACCGTTTCAAGCATCAGAACCAATTAAAATTTATATGAAAACATTGAAAGGTATCGATGCTTTGGGTTTGGCACAAAACAAATATATCAGTTTAAAAGCTTTACAATTTATTCGACGATTATGCCGATTTAATTCATCTGAAAGATTAGGTGTTGGTAAATATGGAATACAAGAAATACGTAGTCACAAATATTTTCAAGGATTTGATTGGGCTGGTATAGTTAAACAAACATTGACTACTCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGATCGTTTCACAATGGATGAACAAGAAGCTCCAGATGAATTATCAGGATGGGATGCAAATTTTTAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTTAACAGACATACACGCTAACATTCATCTTGTCTAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAGCTAG-AAGGGA-CCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTC---CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTG-TCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTCAACATATAATAC-TGATCATTTAAGCTTGATTCGACCCATTTCCCCCTCTTTCTCTCCCCCTCTCTCTTCCTCCCTCTCATTCCCTCTCATTATCCATGTGTAATTATTTTCGGACATAAATTTTCAAGTAATCGAATCCGTTATCAATACAGACTGTAAATTCTTGAGTATCATCTTCTATTTTAATATGTATTCATATGTAGGTCTGTAAGAACTATGCCTTA-TTTGCGTGCGTATGTGGGCGCGTGCATTGTGTGTCTGTTTTCTTTTTTTTTTTTAGTTGTTTATATGTCTACCACCAATTTTTGTTGTTGCTATTGCTGATTATCTAACAGTTTCATGGAAATGAGAAGAGAGTTCGTTGGTCCTTTTCTTTTGTTTTATTTATTTATATTACTAATTATACTACTCATTGTTCATTCATATTGAACATAGAATAACAACATCAAAATTTAAAAAAATGTGGTAACAGAATTCATTAAGAGAAATATTAAACGAATTGATCGGTTGATTG]

[+] EMBL CD196009             [TTCTTTCATCTGTTTCATCACCGTTTATTTGTCGATTATTCAATACATATCGTGATAATAAATATGTATACATGTTATTAGAAGCATGTTTAGGCGGTGAATTATGGACTATCCTTCGTGATAGTCATCATCTTGAAGAACGTACAACAAGATTTTGTTTGGCATGTTGTATTGAGGCATTGGATTATTTACATCGTCATGGAATTCGTTATCGTGATTTAAACCCAGAG ATATGCTGGTGACATCCAAAGG TACATTAAATTATGCGAGTTCGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD130804             [                                                                                                                                                                           TTGAGGCATTGGATTATTTACATCGTCATGGAATTGTTTATCGTGATTTAAAACCAGAGAATATGCTGGTGACATCCAAAGGTTACATTAAATTATGCGATTTCGGATTTGCTAAATACATTGGAATTGGTCAAAAAACATGGACATTCTGTGGTACACCAGAATATGTTGCACCAGAAGTAATTCTTAATCAAGGACATGATTTCGCTGCAGATTATTGGTCATTAGGTATTTTAACTTTTGAATTACTTACAGGCGCTCCACCGTTTCAAGCATCAGAACCAATTAAAATTTATATGAAAACATTGAAAGGTATCGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD114327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGTTGCACCAGAAGTAATTCTTAATCAAGGACATGATTTCGCTGCAGATTATTGGTCATTAGGTATTTTAACTTTTGAATTACTTACAGGCGCTCCACCGTTTCAAGCATCAGAACCAATTAAAATTTATATGAAAACATTGAAAGGTATCGATGCTTTGGGTTTGGCACAAAACAAATATATCAGTTTAAAAGCTTTACAATTTATTCGACGATTATGCCGATTTAATTCATCTGAAAGATTAGGTGTTGGTAAATATGGAATACAAGAAATACGTAGTCACAAATATTTCCAAGGATTTGATTGGGCTGGTATAGTTAAACAAACATTGACTACTCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGATCGTTTCACAATGGATGAACAAGAAGCTCCAGATGAATTATCAGGATGGGATGCAAATTTTTAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTTAACAGACATACACGCTAACATTCATCTTGTCTAAA NTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD094074             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTTCGCTGCAGATTATTGGTCATTAGGTATTTTAACTTTTGAATTACTTACAGGCGCTCCACCGTTTCAAGCATCAGAACCAATTAAAATTTATATGAAAACATTGAAAGGTATCGATGCTTTGGGTTTGGCACAAAACAAATATATCAGTTTAAAAGCTTTACAATTTATTCGACGATTATGCCGATTTAATTCATCTGAAAGATTAGGTGTTGGTAAATATGGAATACAAGAAATACGTAGTCACAAATATTTTCAAGGATTTGATTGGGCTGGTATAGTTAAACAAACATTGACTACCCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGATCGTTTCACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL SMAF9659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAACATGGAATACAAGAAATACGTAGTCACAAATATTTTCAAGGATTTGATTGGGCTGGTATAGTTAAACAAACATTGACTACTCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGATCGTTTCACAATGGATGAACAAGAAGCTCCAGATGAATTATCAGGATGGGATGCAAATTTTTAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTTAACAGACATACACGCTAACATTCATCTTGTCTAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAGCTAGAAAGGGA CCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTG TCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTTAACATATAATAC TGATCATTTAAGCTTGATTCGt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD178158             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATACGTAGTCACAAATATTTTCAAGGATTTGATTGGGCTGGTATAGTTAAACAAACATTGACTACTCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGATCGTTTCACAATGGATGAACAAGAAGCTCCAGATGAATTATCAGGATGGGATGCAAATTTTTAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTTAACAGACATACACGGTAACATTCATTTTGTTTAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAGGTAG AAGGGA CCCATGTATTACATGTATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAAACCACGTTATGTGGTGTTtt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD114220             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAGTCACAAA ATTTTCAAGGATTTGATTGGGCTGGTATAGTTAAACAAACATTGACTACTCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGATCGTTTCACAATGGATGAACAAGAAGCTCCAGATGAATTATCAGGATGGGATGCAAACTTTTAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTCAACAGACATACACGCTAACATTCATCTTGTCTAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAGCTAG AAGGGA CCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAAGTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTC   CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTG TCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTCAACATATAATAC TGATCATTTAAGCTTGATTCGACCCATTTCCCCCTCTTTCTCTCCCCCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD081256             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggTGGGCTGGTATAGTTAAACAAACATTGACTACTCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGATCGTTTCACAATGGATGAACAAGAAGCTCCAGATGAATTATCAGGATGGGATGCAAATTTTTAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTTAACAGACATACACGCTAACATTCATCTTGTCTAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAGCTAG AAGGGA CCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTC   CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTG TCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTCAACATATAATAC TGATCATTTAAGCTTGATTCGACCCATTTCCCCCTCTTTCTCTCCCCCTCTCTCTTCCTCCCTCTCATTCCCTCTCATTATCCATGTGTAATTATTTTCGGACATAAATTTTCAAGTAATCGAATCCGTTATCAATACAGACTGTAAATTCTTGAGTATCATCTTCTATTTTAATATGTATTCATATGTAGGTCTGTAAG ACTATGCCTTA TTNGC                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD093327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTTAACAGACATACACGCTAACATTCATCTTGTCTAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAGCTAG AAGGGA CCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTC      CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTG TCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTCAACATATAATAC TGATCATTTAAGCTTGATTCGACCCATTTCCCCCTCTTTCTCTCCCCCTCTCTCTTCCTCCCTCTCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD147043             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGCTAACATTCATCTTGTATAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGGTGAAAGCTAG AAGGGA CCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGGCTTCTTATCTCTCTTA   CTTCTTCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTGTGTG TCGTATGTTGAATCTTTTTACTCTATGGCCAACATATAATACTTGATCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL SMRAP038             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aAAATTTTTTRCCCCTTTGTTTTWWAATTTGTTGAAAGCTAG GAGGGA CCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTGTTCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTTAACATATAATAC TGATCATTTAAGCTTGATTCGACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD114089             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taagaagaTGAAAGCTAG AAGGGACCCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI975410             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTC   CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTG TCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTCAACATATAATAC TGATCATTTAAGCTTGATTCGACCCATTTCCCCCTCTTTCTCTCCCCCTCTCTCTTCCTCCCTCTCATTCCCTCTCATTATCCATGTGTAATTATTTTCGGACATAAATTTTCAAGTAATCGAATCCGTTATCAATACAGACTGTAAATTCTTGAGTATCATCTTCTATTTTAATATGTATTCATATGTAGGTCTGTAAGAACTATGCCTTAGTTTGCGTGCGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD090006             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGAAGTACTGGAATACAACTGTGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTC      CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTATTCAATGTATATGTTTGTG TCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTCAACATATAATAC TGATCATTTAAGCTTGATTCGACCCATTTCCCCCTCTTTCTCTCCCCCTCTCTCTTCCTCCCTCTCATTCCCTCTCATTATCCATGTGTAATTATTTTCGGACATAAATTTTCAAGTAATCGAATCCGTTATCAACACAGACTGTAAATTCTTGAGTATCATCTTCTATTTTAATATGTATTCATATGTAGGTCTGTAAGAACTATGCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD178720             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCTCTCATTATCCATGTGTAATTATTTTCGGACATAAATTTTCAAGTAATCGAATCCGTTATCAATACAGACTGTAAATTCTTGAGTATCATCTTCTATTTTAATAAGTATTCATATGTAGGTCTGTAAGAACTATGCCTTAGTTTGCGTGCGTATGTGGGCGCGTGCATTGTGTGTCTGTTTTCTTTTTTTTTTTTAGTTGTTTATATGTCTACCACCAATTTTTGTTGTTGCTATTGCTGATTATCTAACAGTTTCATGGAAATGAGAAGAGAGTTCGTTGGTCCTTTTCTTTTGTTTTATTTATTTATATTACTAATTATACTACTCATTGTTCATTCATATTGAACATAGAATAACAACATCAAAATTTAAAAAAATGTGGTAACAGAATTCATTAAGAGAAATATTAAACGAATTGATCGGTTGATTG]


>consensus_10343#0 TTCTTTCATCTGTTTCATCACCGTTTATTTGTCGATTATTCAATACATATCGTGATAATA AATATGTATACATGTTATTAGAAGCATGTTTAGGCGGTGAATTATGGACTATCCTTCGTG ATAGTCATCATCTTGAAGAACGTACAACAAGATTTTGTTTGGCATGTTGTATTGAGGCAT TGGATTATTTACATCGTCATGGAATTCGTTATCGTGATTTAAACCCAGAGATATGCTGGT GACATCCAAAGGTACATTAAATTATGCGAGTTCGGATTTGCTAAATACATTGGAATTGGT CAAAAAACATGGACATTCTGTGGTACACCAGAATATGTTGCACCAGAAGTAATTCTTAAT CAAGGACATGATTTCGCTGCAGATTATTGGTCATTAGGTATTTTAACTTTTGAATTACTT ACAGGCGCTCCACCGTTTCAAGCATCAGAACCAATTAAAATTTATATGAAAACATTGAAA GGTATCGATGCTTTGGGTTTGGCACAAAACAAATATATCAGTTTAAAAGCTTTACAATTT ATTCGACGATTATGCCGATTTAATTCATCTGAAAGATTAGGTGTTGGTAAATATGGAATA CAAGAAATACGTAGTCACAAATATTTTCAAGGATTTGATTGGGCTGGTATAGTTAAACAA ACATTGACTACTCCATTCAGAGTTAAATTGAATGGACCATTGGATCATTCAAATTTTGAT CGTTTCACAATGGATGAACAAGAAGCTCCAGATGAATTATCAGGATGGGATGCAAATTTT TAAAATTTATTCATAAAAATACTTACATACCTGTGCAGGTACACCTTAACAGACATACAC GCTAACATTCATCTTGTCTAAATTTTTTTTTCCTTTGTTTTTTAATTTGTTGAAAGCTAG AAGGGACCAATGAATTACATGAATGAATTGATGAATGATTGAAGTACTGGAATACAACTG TGCAATCCATGTTATATTGTCTTCTTATCTCTCTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT CTTCTCTATCTTATCAATACTGTTATTTTGATAAAATGATACTGTAGATTATAGCCTGTA TTCAATGTATATGTTTGTGTCGTATGTTGAATTTTTTTACTCTATGGTCAACATATAATA CTGATCATTTAAGCTTGATTCGACCCATTTCCCCCTCTTTCTCTCCCCCTCTCTCTTCCT CCCTCTCATTCCCTCTCATTATCCATGTGTAATTATTTTCGGACATAAATTTTCAAGTAA TCGAATCCGTTATCAATACAGACTGTAAATTCTTGAGTATCATCTTCTATTTTAATATGT ATTCATATGTAGGTCTGTAAGAACTATGCCTTATTTGCGTGCGTATGTGGGCGCGTGCAT TGTGTGTCTGTTTTCTTTTTTTTTTTTAGTTGTTTATATGTCTACCACCAATTTTTGTTG TTGCTATTGCTGATTATCTAACAGTTTCATGGAAATGAGAAGAGAGTTCGTTGGTCCTTT TCTTTTGTTTTATTTATTTATATTACTAATTATACTACTCATTGTTCATTCATATTGAAC ATAGAATAACAACATCAAAATTTAAAAAAATGTGGTAACAGAATTCATTAAGAGAAATAT TAAACGAATTGATCGGTTGATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)