These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10354#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 918 fasta sequence [CCTCCAGGCCAGAATTTGGCACGAGGCCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGGTTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAG-TCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA-CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA-ATGTTTTCTATCTTATAACATACTCTTATATATTTGACATGGTTTCGTGAAAAACTGAAAGTGCTATATTGTGTTATCTAATCTATAAATTTCAGTAATGG-ATTTTTATTAAGGCACACAGAAAATATATATGAACCTTGTTTAGT] [+] EMBL CD080537 [CCTCCAGGCCAGAATTTGGCACGAGGCCGATTTCCCGCTACGGCGACTATTTATGATGTACGGAATTGGTTTCAAGAATTGGTGTCCTGTGATTTCCAAATGGAGGATAGCTCTCAAGTTTTAAGTGAAGCTGATCGTAATAATTTTAAAAATTTATTCTTGCAAGGATTCCGGTTTTTGCAGTTATATCCTAAAAGGATCTTCGGACCAGAAGACGAATCTCAG TCATTAAGAGAACTTGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTANCTTTGAG TGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGNTACTACAAAAAGCATAGAATAAAT ATATTTGTCTAGATAAACG AATATGATAGACAGTTTTTAACTAACTCATTCACAANNTG TTTCTATCTTATAACATACTCTNATATATTTGACATGGTTNCGTGAAAAACTGAAAGNGCTATNATGNGGTATCTAATCTATAAANTTCAGNNATGGNATTTTTATTAAGGC CCCCG AAATTTTTATGAACCTTGTTTAGT] [+] EMBL CD060159 [ ATCTCAGCTCATTAAGAGAACTGGGTTATTATCCATCAGCTGCATTGTTTCTTGTATTAAACAAATCTAATCAAGCTATCACGCGTTCAAACGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATGTTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCACATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCATCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTG ATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGA ] [-] EMBL CD073119 [ CGATGGAATCGTGTCCCAGTTTTACAATATTATCAGTTCAGGCTTCAGCACTACTTATGGTTTGATTGGTTGGGCAGTAGGTGGATTATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA ATGTTTTCTATCTTATAACATACTCTTATATATTTGACATGGTTTCGTGAAAAACTGAAAGTGCTATATTGTGTTATCTAATCTATAAATTTCAGTAATGG ATTTTTATTAAGGCACACAGAAAATATATATG ] [-] EMBL CD196362 [ ATATTCATTGGGACAGAGTCTTGTATCCACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCATATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTGATACATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA ATGTTTTCTATCT ] [+] EMBL CD195018 [ ACTCTGACAGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTTCCTGGAAATACAGCACATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTCTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTG ATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTA ] [+] EMBL AI764802 [ AGGTTCTCGCACTCAGCAATCTAATAGTAATCTT ATGGAAATACAGCACATCCAAATGGTTCGAAAAAAAATCGTTCTGTAAGACGTCAAGGTAATGTCGCTCGTTTTTCGCACATGCCTGATAGTTCGGATGATGAACAAGCCCGATGGGATGGAAATTCCACAGAACAACTGGGATAC TACT TTTTAGGC GGTATTAAA ] [+] EMBL BF936920 [ ATGATGAACAAGCCCGATGGAATGGAAATTCCACAGAACAACTGTG ATACTACTTTTAAGCTGCTATTAAATGTCTTGTCTTTCCTTA CTTTGAGTTGTATATTCACTTAACTCTCCCCTATTGTAACTACAAAAAGCATAGAATAAATAATATTGTTCTAGATAAACGAAATATGATAGACAGTTTTAAACTAACTCATTCACAA ATGTTTTCTATCTTATAACATACTCTTATATATTTGACATGGTTTCGTGAAAAACTGAAAGTGCTATATTGTGTTATCTAATCTATAAATTTCAGTAATGG ATTTTTATTAAGGCACACAGAAAATATATATG ATCTTGTTTAGT] consensusID : consensus_10354#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||