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Schistosoma mansoni
cluster # 1036 cluster # 1036       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1036#0 length = 1095 sequences # 2  

consensusID : consensus_1036#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1095
fasta sequence
                              [AATCGNGCCGAGGTCGACTTACTCCTTAATTAGTCTAGTTTGGTGCCGAAGATGTAGTCAAGTGTGGCGATCATTTGAGTATTCCTATCTGCTCTGGTGGGTCGTAGTCCACTTCGAGATGAATAGAAAACTCTCCTGGTTTTCGCCAACTTATCTTGAGGGTTATGATTGCGTTATCGCTAAATGTCTTCATTTACACGATATGGCTTATGAAATAAATGATCCTTAATGTGAGTTATGTTTCTAAATGCCTTTTTATCAAGGTATATGTGTTCAATTTGTTGAAACAATCAATACATATTTTGGTATCATTGCGAAGGTTTGAATTGATAATTTCAAACAGATTGTGCATTGGGTATATTGTTACAGATAAAAATAATATGTTTGTACTATCCCAATGAGTAAAAAACTTGGATTTTTTGAAGTTTCGTGACTCAGTATGAGCTAATTCTTTAGAGAATCTAAATTTTCTACTCATTAGGATATTACAAGCATACTTTTACTTACAGTACATATGTTTTTCACTATTCATCGTACTTTCTCTTCGCGCACGTAATACTGTCGTTTTCATTTGTTTAAGTTAGCCTGTGGTTATATATCTCACTACTCTATATACTCTATACCACTATATATCTTACTACTNTNTANGGGAGTTTACTTAACCGCAGAAAAAATGGGTTTGGGTGAATCTGTTGGAGAATTCCTTAAAGAATTTGTCCGTATGTGTACTCACGTTACTCAGCATGAAATCGACAGAGCAAAGAACCAATTGAAAACACATCTCCTTTTGCAGTTAGATGGTACCACGCCTATATGTGAAGAGATTGGTCGGCACATGTTGGTGTATGGTCGTCGTATACCTATAACTGAATTGCTAGCCAGAATTGACGCGCTCAATGCTGAACATATTAAGGAAATATGCATGAAGTACTTTTTTGATAAATGCCCTGCTGTCGCGTCTATCGGTCCAGTGGAAACCATGCTTGATTACAATCGTATTCGGGATAAAACTTGGTGGCTTCTTCTATAGAAAAATTATTAGTGTTTAAAATATCAAGTTGTGATGTTATTGCTTACAATCCAATTATACTTACA]

[+] EMBL CD083193             [AATCGNGCCGAGGTCGACTTACTCCTTAATTAGTCTAGTTTGGTGCCGAAGATGTAGTCAAGTGTGGCGATCATTTGAGTATTCCTATCTGCTCTGGTGGGTCGTAGTCCACTTCGAGATGAATAGAAAACTCTCCTGGTTTTCGCCAACTTATCTTGAGGGTTATGATTGCGTTATCGCTAAATGTCTTCATTTACACGATATGGCTTATGAAATAAATGATCCTTAATGTGAGTTATGTTTCTAAATGCCTTTTTATCAAGGTATATGTGTTCAATTTGTTGAAACAATCAATACATATTTTGGTATCATTGCGAAGGTTTGAATTGATAATTTCAAACAGATTGTGCATTGGGTATATTGTTACAGATAAAAATAATATGTTTGTACTATCCCAATGAGTAAAAAACTTGGATTTTTTGAAGTTTCGTGACTCAGTATGAGCTAATTCTTTAGAGAATCTAAATTTTCTACTCATTAGGATATTACAAGCATACTTTTACTTACAGTACATATGTTTTTCACTATTCATCGTACTTTCTCTTCGCGCACGTAATACTGTCGTTTTCATTTGTTTAAGTTAGCCTGTGGTTATATATCTCACTACTCTATATACTCTATACCACTATATATCTTACTACTNTNTANGGGAGTTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076768             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATATGTTTTTCACTATTCATCGTACTTTCTCTTCGCGCACGTAATACTGTCGTTTTCATTTGTTTAAGTTAGCCTGTGGTTATATATCTCACTACTCTATATACTCTATACCACTATATATCTTACTACTTTTTAGGGGAGTTTACTTAACCGCAGAAAAAATGGGTTTGGGTGAATCTGTTGGAGAATTCCTTAAAGAATTTGTCCGTATGTGTACTCACGTTACTCAGCATGAAATCGACAGAGCAAAGAACCAATTGAAAACACATCTCCTTTTGCAGTTAGATGGTACCACGCCTATATGTGAAGAGATTGGTCGGCACATGTTGGTGTATGGTCGTCGTATACCTATAACTGAATTGCTAGCCAGAATTGACGCGCTCAATGCTGAACATATTAAGGAAATATGCATGAAGTACTTTTTTGATAAATGCCCTGCTGTCGCGTCTATCGGTCCAGTGGAAACCATGCTTGATTACAATCGTATTCGGGATAAAACTTGGTGGCTTCTTCTATAGAAAAATTATTAGTGTTTAAAATATCAAGTTGTGATGTTATTGCTTACAATCCAATTATACTTACA]


>consensus_1036#0 AATCGNGCCGAGGTCGACTTACTCCTTAATTAGTCTAGTTTGGTGCCGAAGATGTAGTCA AGTGTGGCGATCATTTGAGTATTCCTATCTGCTCTGGTGGGTCGTAGTCCACTTCGAGAT GAATAGAAAACTCTCCTGGTTTTCGCCAACTTATCTTGAGGGTTATGATTGCGTTATCGC TAAATGTCTTCATTTACACGATATGGCTTATGAAATAAATGATCCTTAATGTGAGTTATG TTTCTAAATGCCTTTTTATCAAGGTATATGTGTTCAATTTGTTGAAACAATCAATACATA TTTTGGTATCATTGCGAAGGTTTGAATTGATAATTTCAAACAGATTGTGCATTGGGTATA TTGTTACAGATAAAAATAATATGTTTGTACTATCCCAATGAGTAAAAAACTTGGATTTTT TGAAGTTTCGTGACTCAGTATGAGCTAATTCTTTAGAGAATCTAAATTTTCTACTCATTA GGATATTACAAGCATACTTTTACTTACAGTACATATGTTTTTCACTATTCATCGTACTTT CTCTTCGCGCACGTAATACTGTCGTTTTCATTTGTTTAAGTTAGCCTGTGGTTATATATC TCACTACTCTATATACTCTATACCACTATATATCTTACTACTNTNTANGGGAGTTTACTT AACCGCAGAAAAAATGGGTTTGGGTGAATCTGTTGGAGAATTCCTTAAAGAATTTGTCCG TATGTGTACTCACGTTACTCAGCATGAAATCGACAGAGCAAAGAACCAATTGAAAACACA TCTCCTTTTGCAGTTAGATGGTACCACGCCTATATGTGAAGAGATTGGTCGGCACATGTT GGTGTATGGTCGTCGTATACCTATAACTGAATTGCTAGCCAGAATTGACGCGCTCAATGC TGAACATATTAAGGAAATATGCATGAAGTACTTTTTTGATAAATGCCCTGCTGTCGCGTC TATCGGTCCAGTGGAAACCATGCTTGATTACAATCGTATTCGGGATAAAACTTGGTGGCT TCTTCTATAGAAAAATTATTAGTGTTTAAAATATCAAGTTGTGATGTTATTGCTTACAAT CCAATTATACTTACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)