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Schistosoma mansoni
cluster # 10391 cluster # 10391       Sequences # 16       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10391#0 length = 544 sequences # 16  

consensusID : consensus_10391#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 544
fasta sequence
                              [CGAGGACCACTTATCCGGAGTACGGAATTATAATATTCAAGATGATAGTGATTTTCATAAACGTGTATTAAATAATCCAGCACCCGTCATCGTTGACTTTCATGCTAAATGGTGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA-ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA-TTTTTTCAGTGTATGGTTGTTATATATGAAACGAATTCTATNTATTCCAAGTGTAACTAT]

[+] EMBL CD083334             [CGAGGACCACTTATCCGGAGTACGGAATTATAATATTCAAGATGATAGTGATTTTCATAAACGTGTATTAAATAATCCAGCACCCGTCATCGTTGACTTTCATGCTAAATGGTGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATGGTTGTTATATATGAAACGAATTCTATNTATTCCAAGTGTAACTAT]
[+] EMBL CD137860             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAGTATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTCTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATGGTTGTTATATATGAAA                             ]
[+] EMBL CD137910             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGACGTTTTACATGTGCATTTTTTTCAGTGTATGGTTGTTAT                                     ]
[+] EMBL CD158932             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137851             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGACAATCTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137825             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATCTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137906             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCAATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD158958             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATACAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD159036             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGCTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137687             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137774             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137835             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137843             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATG                                             ]
[+] EMBL CD137844             [                                                                                                                TGTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAACCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGTGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATA TTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATa                                             ]
[-] EMBL CD137907             [                                                                                                                 GTGGACCTTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCTACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGTTGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAAAGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAGACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCA ATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATGG                                            ]
[-] EMBL SMAA28894            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgagGGTTAGGCGAACCAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCAACCATATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATGTGCA TTTTTTCAGTGTATGGTTGTTATATATGANACGAATTCTATTAATNCCAAGTGTAAC   ]


>consensus_10391#0 CGAGGACCACTTATCCGGAGTACGGAATTATAATATTCAAGATGATAGTGATTTTCATAA ACGTGTATTAAATAATCCAGCACCCGTCATCGTTGACTTTCATGCTAAATGGTGTGGACC TTGTAAAATTTTAGGTCCAAGGTTAGAAAATATAATGAAATCGTATATGAATTCTGTGCT ACTCGCTAAAGTTGATATCGATCAGCTAGATAGTGTTGCTGAAAAATATAAGATTAAAGT TGTTCCAACTGTGATTTCCATCAAAAATGGTAAAGAAATTGAACGTTTTGAAGGAAACAA AGAAGAGGAATTCATTAGACGTAGAATAGAAAATGTATTAGCGCATAATGGTTAGGCGAG ACAATTCAATATAATAATGCTTGAATTGATAATTTTCTTCAACTAATCACTAACTAATCA ACCAATTAATAGATTTCCTACTGTTTTCTTGTTATTAAATATTTTAGGATGTTTTACATG TGCATTTTTTCAGTGTATGGTTGTTATATATGAAACGAATTCTATNTATTCCAAGTGTAA CTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)