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Schistosoma mansoni
cluster # 10640 cluster # 10640       Sequences # 19       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10640#0 length = 1409 sequences # 15  
consensus_10640#1 length = 736 sequences # 4  

consensusID : consensus_10640#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 1409
fasta sequence
                              [CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGCTCATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCC-TTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATGTATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTTAAAGTGCGTACTCGGTTGAACCGTGTGTTTTTGCAAAATTATCGGCCACGTAACTCTGTCATTTACGCTTGTAAAAGTCCATGCTTGTGTCTATATCAAATGGGAGTGAACTTTTTCTTCATCGTGCTTGAGAGTATCTCTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGAAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGA-TTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTA-TTTGTTGTTTAGTTATGACTATATTGCCTATCCTGAAAC-TTCTTGACGTTATTG-TTTTCTTGTTTCTCTCTGTATTT-TCCCATAATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGAATTACTTTTATTGGAAACA-GTTTTTCGTGGTTCTTTTTCTCTCTATATTC-AAA-ATATATGCGAGCTTTTTTCTGTGACTTTTGTTTTTCCCCAACTCTTTTCTTCTTCTCTCTTACTCTTTTCTCTCTGTAGTTCTTGTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCACAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATACTAATTAATGGTCACTGGAAACGTCTCGTTTTATTTTTTAAGTACTTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]

[+] EMBL CD081092             [CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGCTCATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCC TTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATGTATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTTAAAGTGCGTACTCGGTTGAACCGTGTGTTTTTGCAAAATTATCGGCCACGTAACTCTGTCATTTACGCTTGTAAAAGTCCATGTTTGTGTCTATATCAAATGGGAGTGAACTTTTTCTTCATCGTGCTTGAGAGTATCTCTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTNTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGANAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGA TTNTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD145259             [                                                                                                                                                                                                                         CCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCCTTTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTCGTATCCCCTCATGTATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTTAAAGTGCGTACTCGGTTGAACCGTGTGTTTTTGCAAAATTATCGGCCACGTAACTCTGTCATTTACGCTTGTAAAAGTCCATGCTTGTGTCTATATCAAATGGGAGTGAACTTTTTCTTCATCGTGCTTGAGAGTATCTCTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGAAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGA TTNTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAG AAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTANNTTG TGNTTAGTTATGACTATATTGCCTATCCTGAAACTTTCTTGACG TATGGNNTTTC TGGTTCTCTCTGGATTTNCCCCAT ATC GGATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGATTAACTTTTATT NAAACACGTTTTTCG GGTTCCTTTTC CTCTAAATTC AAA ATATATGCGAGCTTTTTTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD081137             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGAACCGTGTGTTTTTGCAAAATTATCGGCCACGTAACTCTGTCATTTACGCTTGTAAAAGTCCATGCTTGTGTCTATATCAAATGGGAGTGAACTTTTTCTTCATCGTGCTTGAGAGTATCTCTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGAAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGA TTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTA TTTGTTGTTTAGTTATGACTATATTGCCTATCCTGAAAC TTCTTGACGTTATTG TTTTCTTGTTTCTCTCTGTATTT TCCCATAATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGAATTACTTTTATTGGAAACA TTTTTTCGTGGTTCTTTTTCTCTCTATATTCAAAA ATATATGCGAGCTTTTTTCTGTGACTTTTGTTTTTCCCCAACTCTTTTCTTCTTCTCTCTTACTCTTTTCTCTCTGTAGTTCTTGTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCACANAGCANAATGAAAGATGCCATANAAAAGACTTNCAC AATACTAttna                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD074960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTTTTTCTTCATCGTGCTTGAGAGTATCTCTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGAAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGA TTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTA TTTGTTGTTTAGTTATGACTATATTGCCTATCCTGAAAC TTCTTGACGTTATTG TTTTCTTGTTTCTCTCTGTATTT TCCCATAATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGAATTACTTTTATTGGAAACA TTTTTTCGTGGTTCTTTTTCTCTCTATATTCAAAA ATATATGCGAGCTTTTTTCTGTGACTTTTGTTTTTCCCCAACTCTTTTCTTCTTCTCTCTTACTCTTTTCTCTCTGTAGTTCTTGTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCCCAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATACTAATTAA                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD139442             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGAAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGATTTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTA TTTGTTGTTTAGTTATGACTATATTGCCTATCCTGAAAC TTCTCGACGTTATTG TTTTCTTGTTTCTCTCTGTATTT TCCCATAATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGAATTACTTTTATTGGAAACA GTTTTTCGTGGTTCTTTTTCTCTCTATATTC AAACATATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD139384             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGAAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGATTTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTA TTTGTTGTTTAGTCATGACTATATTGCCTATCCTGAAAC TTCTTGACGTTATTG TTTTCTTGTTTCTCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD074915             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATGAAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGA TTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTA TTTGTTGTTTAGTTATGACTATATTGCCTATCCTGAAAC TTCTTGACGTTATTG TTTTCTTGTTTCTCTCTGTATTT TCCCATAATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGAATTACTTTTATTGGAAACA GTTTTTCGTGGTTCTTTTTCTCTCTATATTCAAAA AAATATGCGAGCTTTTTTCTGTGACTTTTGTTTTTCCCCAACTCTTTTCTTTTTCTCTCTTACTCTTTTCTCTCTGTAGTTCTTGTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCCCAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATACTAATTAAT                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD141216             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TACTTCACAGTTTACCAACCTTCGA TTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTA TTTGTTGTTTAGTTATGACTATATTGCCTATCCTGAAAC TTCTTGACGTTATTG TTTTCTTGTTTCTCTCTGTATTT TCCCATAATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGAATTACTTTTATTGGAAACA GTTTTTCGTGGNTCTTTTTCTCTCTATATTC AAA ATATATGCGAGCTTTTTTCTGTGACTTTTGTTTTTCCCCca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL AI067634             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCTCTCTGTAGTTCTTGTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCACAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATACTAATTAATGGTCACTGGAAACGTCTCGTTTTATTTTTTAAGTACTTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]
[-] EMBL AI067473             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCTTGTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCACAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATACTAATTAATGGTCACTGGAAACGTCTCGTTTTATTTTTTAAGTACTTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]
[-] EMBL AI068311             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAAGTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCACAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATAGTAATTAATGGTCACTGGAAACGTCTCGTTTTATTTTATAAGTACTATCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTGTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]
[-] EMBL AI068019             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATATTTTACCACAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATACTAATTAATGGTCACTGGAAACGTCTCGTTTTATTTTTTAAGTACTTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]
[-] EMBL AI067310             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTCACTGGAAACGTCTCGTTTTATTTTTTAAGTACTTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTGTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]
[-] EMBL AI067843             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGTTTTATTTTTTAAGTACTTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]
[-] EMBL AI067303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATGTACTGGTGTTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA]


>consensus_10640#0 CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGCTCATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATAC TTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGT TTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGT TCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATT AAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGC CTTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATG TATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTTAAAGTGCGTACTCGGTTGAAC CGTGTGTTTTTGCAAAATTATCGGCCACGTAACTCTGTCATTTACGCTTGTAAAAGTCCA TGCTTGTGTCTATATCAAATGGGAGTGAACTTTTTCTTCATCGTGCTTGAGAGTATCTCT ATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTATTGTT CACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACGCATG AAAAAAGCTACTTCACAGTTTACCAACCTTCGATTTTTTTAAACGATTATTTTTATTTTC CCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGAAAAGTTTATTGCTTTTATTTTTC AGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTATTTGTTGTTTAGTTATGACTATAT TGCCTATCCTGAAACTTCTTGACGTTATTGTTTTCTTGTTTCTCTCTGTATTTTCCCATA ATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTAGAATTACTTTTATTGGAAA CAGTTTTTCGTGGTTCTTTTTCTCTCTATATTCAAAATATATGCGAGCTTTTTTCTGTGA CTTTTGTTTTTCCCCAACTCTTTTCTTCTTCTCTCTTACTCTTTTCTCTCTGTAGTTCTT GTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCACAAAGCAAAATGAAAGATGCCATAAAAA AGACTTCAACAAATACTAATTAATGGTCACTGGAAACGTCTCGTTTTATTTTTTAAGTAC TTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTCGAGCACAAGTTACAAGAACCACT GTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGAGCGTTTTCACACATGTACTGGTG TTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATTGTGAAATCTTAATATAATAGCAT GTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA



consensusID : consensus_10640#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 736
fasta sequence
                              [TGGTACGAGACCACGTGCCTATTTAAAATTATGTTCCACTTTTCCAGTTGCTGTTTATACCATACAAAATCTCAAATTTGAAAATATTTTCCCTGCCCTATCATCTTCGGAAATGATTCATGTGATCCTTATGATTATTGAGGCTAGGCAACAAGCTTGTTTATCGTATATCCTTCGAGCGGTTTCTCAATGTCAAGTCAGAAACAATTGAATATATATATATATATATATATATAATGTATTTCTCCATTAATATTTTCGAGCAGTTGCCTACACCTCTGAACTGTGGTTATCATGTTGATTGTTCACCTGACATACATGGATTAAAAACAAAGTATTCAGCTTATTTCATTCCCCATTCTTATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCCTTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATGTATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTT]

[+] EMBL CD082246             [TGGTACGAGACCACGTGCCTATTTAAAATTATGTTCCACTTTTCCAGTTGCTGTTTATACCATACAAAATCTCAAATTTGAAAATATTTTCCCTGCCCTATCATCTTCGGAAATGATTCATGTGATCCTTATGATTATTGAGGCTAGGCAACAAGCTTGTTTATCGTATATCCTTCGAGCGGTTTCTCAATGTCAAGTCAGAAACAATTGAATATATATATATATATATATATATAATGTATTTCTCCATTAATATTTTCGAGCAGTTGCCTACACCTCTGAACTGTGGTTATCATGTTGATTGTTCACCTGACATACATGGATTAAAAACAAAGTATTCAGCTTATTTCATTCCCCATTCTTATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTNTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCCTTTTTT ACCTTNTAC                                                                                  ]
[+] EMBL CD178150             [                                                                                                                                                                                                                                                       CATTAATATTTTCAAGCAGTTGCCTACACCTCTGAACTGTGGTTATCATGTTGATTGTTCACCTGACATACATGGATTAAAAACAAAGTATTCAGCTTATTTCATTCCCCATTCTTATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCCTTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATGTATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTT]
[-] EMBL CD188189             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTGATTGTTCACCTGACATACATGGATTAAAAACAAAGTATTCAGCTTATTTCATTCCCCATTCTTATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTT TTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCCTTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATGTATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAA              ]
[-] EMBL CD132612             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTGATTGTTCACCTGACATACATGGATTAAAAACAAAGTATTCAGCTTATTTCATTCCCCATTCTTATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCCTCATTACGTGTTTCCTCGTGGTACTTATTTGTTTCTCTATTCGGACGATCTCT                                                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_10640#1 TGGTACGAGACCACGTGCCTATTTAAAATTATGTTCCACTTTTCCAGTTGCTGTTTATAC CATACAAAATCTCAAATTTGAAAATATTTTCCCTGCCCTATCATCTTCGGAAATGATTCA TGTGATCCTTATGATTATTGAGGCTAGGCAACAAGCTTGTTTATCGTATATCCTTCGAGC GGTTTCTCAATGTCAAGTCAGAAACAATTGAATATATATATATATATATATATATAATGT ATTTCTCCATTAATATTTTCGAGCAGTTGCCTACACCTCTGAACTGTGGTTATCATGTTG ATTGTTCACCTGACATACATGGATTAAAAACAAAGTATTCAGCTTATTTCATTCCCCATT CTTATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCATTTAAGTGAACTAA TTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTGTTAACGCCATCATTATTTGT TTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGT TACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGC GTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCCTTTTTTAACCTTTTACTGTGAT TATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATGTATGGCAGTTCAACTGCTTAAAA AAGGAAGGTAACAGTT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10640#0      CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGCTCATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATAC 60
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      TTTCATTCATTTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGT 120
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      TTGTTAACGCCATCATTATTTGTTTCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGT 180
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      TCTCTATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATT 240
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      AAGATGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGC 300
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      CTTTTTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTGTATTTGTATCCCCTCATG 360
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      TATGGCAGTTCAACTGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTTAAAGTGCGTACTCGGTTGA-A 419
consensus_10640#1      --------------------------------------------------TGGTACGAGA 10
                                                                         * *   ** *

consensus_10640#0      CCGTGTGTTTTTGCAAAATTATCGGCCACGTAACTCTGTCATTTACGCTTGTAAAAGTCC 479
consensus_10640#1      CCACGTGCCTATTTAAAATTATGTTCCAC----TTTTCCAGTTGCTGTTTATA-----CC 61
                       **  ***  * *  ********   ****     * *    **   * ** **     **

consensus_10640#0      ATGCTTGTGTCTATATCAAATGGGAGTGAACTTTTTCTTC---ATCGTGCTTGAGAGTAT 536
consensus_10640#1      ATACAAA-----ATCTCAAATTTGAAAATATTTTCCCTGCCCTATCATCTTCGGAAATGA 116
                       ** *        ** ******  **    * ***  ** *   *** *  * *  * *  

consensus_10640#0      CTCTATGTGTTCGTTACTGTCCATTTACTGTTCGGTACGGATTGTTATTTTGTCGATTAT 596
consensus_10640#1      TTC-ATGTGATCCTTA-TGATTATTGAG-GCTAGGCAACAA--GCTTGTTTATCGTATAT 171
                        ** ***** ** *** **   *** *  * * ** *   *  * *  *** ***  ***

consensus_10640#0      TGTTCACTATCCTCTCTCATCGTGATTTTACGCTGACAGTCAAATAATGTTCTGTTTACG 656
consensus_10640#1      CCTTCGA-GCGGTTTCTCAATGTCAAGTCAGA--AACAATTGAATATATATATATATATA 228
                         ***       * *****  ** *  * *     *** *  ****    * * * **  

consensus_10640#0      CATGAAAAAAGCTACTTCACAGTT--TACCAACCTTCGATTTTTTTAAACGATTATTTTT 714
consensus_10640#1      TATATATAATG-TATTTCTCCATTAATATTTTCGAGCAGTTGCCTACACCTCTGAACTGT 287
                        **  * ** * ** *** *  **  **    *   *  **   *  * *  * *  * *

consensus_10640#0      ATTTTCCCTTCTACTCCCCAGTTTATGGTGCATTAATTTAAGA-AAAGTTTATTGCTTTT 773
consensus_10640#1      GGTTATCATGTTGATTGTTCACCTGACATACATGGATTAAAAACAAAGTATTCAGCTTAT 347
                         **  * *  *  *        *    * ***  *** ** * ***** *   **** *

consensus_10640#0      ATT-TTTCAGAATCATGTTTAATATACTCATATACATTTACCTAT----TTGTTGTTTAG 828
consensus_10640#1      TTCATTCCCCATTCTTATTCCACTGATGCATTTGCACTCACTCAGAATACTTTCATTCAT 407
                        *  ** *  * ** * **  *   *  *** * ** * **  *      * *  ** * 

consensus_10640#0      TTA-------TGACTATATTGCCTATCCTGAAACTTCTTGACGTTATTGTTTTCTTGTTT 881
consensus_10640#1      TTAAGTGAACTAATTCTCTCCGTTTTTTGGATAATTCATTACATGACAGTTTG-TTAACG 466
                       ***       * * * * *    * *   ** * *** * ** * *  ****  **    

consensus_10640#0      CTCTCTGTATTTTCCCATAATCATAATTACACATACATGTAATTTTATTGGTCGAGTGTA 941
consensus_10640#1      CCATCATTATTTGTT-----TCTTCGTGTTATTTATTTGTTTCTCTATTCGGATGTTCTC 521
                       *  **  *****        ** *  *   *  **  ***   * **** *     * * 

consensus_10640#0      GAATTACTTTTATTGGAAACAGTTTTTCGTGGTTCTTTTTCTCTCTATATTCAA--AATA 999
consensus_10640#1      TATTTTTTCAGTTCTCAGTTACTTCACCGTTGTCCTTTTTTCTTTGAGCTTAAATTAAGA 581
                        * **  *    *   *   * **   *** ** ******   *  *  ** **  ** *

consensus_10640#0      TATGCGAGCTTTTTTCTGTGACTTTTGTTTTTCCCCAACTCTTTTCTTCTTCTCTCTTAC 1059
consensus_10640#1      TGTTGGTAGCTTTTTCAGCGTCAAGTACATGTTATATATCATTCTTGTATTTTGGCCTTT 641
                       * *  *    ****** * * *   *   * *     *   ** *  * ** *  * *  

consensus_10640#0      TCTTTTCTCT--CTGTAGTTCTTGTCATCTATCTGTTAACGTTAATATTTTACCACAAAG 1117
consensus_10640#1      TTTAACCTTTTACTGTGATTATTTTAAACAAGGCTCTG-TATTTGTATCCCCTCATGTAT 700
                       * *   ** *  ****  ** ** * * * *     *    **  ***     **   * 

consensus_10640#0      CAAAATGAAAGATGCCATAAAAAAGACTTCAACAAATACTAATTAATGGTCACTGGAAAC 1177
consensus_10640#1      GGCAGTTCAAC-TGCTTAAAAAAGGAAGGTAACAGTT----------------------- 736
                          * *  **  ***   ***** **    ****  *                       

consensus_10640#0      GTCTCGTTTTATTTTTTAAGTACTTTCGTTTAAAATATGATTTGTCGATGCATTTCTTTC 1237
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      GAGCACAAGTTACAAGAACCACTGTGTCCACAGATATTAGATTTTTGTGATTCAATTTGA 1297
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      GCGTTTTCACACATGTACTGGTGTTTTCTATGTGAAAAGCCACATAATCTATATACGATT 1357
consensus_10640#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10640#0      GTGAAATCTTAATATAATAGCATGTAATTTTAAAGCCACCAGTAGTCTTTAA 1409
consensus_10640#1      ----------------------------------------------------
                                                                           




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)