cluster # 10663

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Schistosoma mansoni
cluster # 10663 cluster # 10663 Sequences # 19 consensus # 2

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consensus_10663#0 length = 1487 sequences # 18

consensus_10663#1 length = 501 sequences # 1

consensusID : consensus_10663#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 1487
fasta sequence

                              [TTCAGAAAACTCTTTAACTGATTTTCCAGCCAACATTCATCGTTGTCGCAAACTAAATGTTTTAAAGATTCATGGAAACCCTTTTAAAGATAATCGGTTGAAAAGGCTTTCTGTCGATGAACATTCACCAACTGCGCTTTTAGCTTATCTTCGTCGTTTGGACGAAACAGGAAGCAAAAAAGGAAAGAAAGTTAATGACAAAAATTCACCATCGAAATCTTCAACCGAACATGAAGAAATGAATAATTCCATCGCTCGACCACCGGAAGTTACGGGAATTTCGACGCCGCATATTGTCATTCAGCGCCCAAATGAAAATGAAGAATATCAAATTAATCAGACTCGCTCAGTGAAAACTGGCCCACGTCCTTACATAGTTGCCTGTACGGTTCATGGTGTA-AATTTCCTTCTGAAACAAAACTGAGAGCTTTTCTACGAGCTCAAGAAAATTGGCATCGTGATATTGGCCAAATGCGTCATCATGCAACTTTAGCTACTCATGATTTACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTTAAAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTCATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGAAGCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTCAGTTCCTCCACTTACCAATAGTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACTGATTGAAGTTTCTGGAATCAATTTACCTTTATGCAAACAA-TTTGCTGAAGTAGTCATCGCTTGGCTATTAGAAAATGCTTGCCCACAAACAAGGGAGAATAAACCCAGTGACAAGCCAAACACCGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA-TCACAGC-TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC-AGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT-AATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTACCA-TTAACCGTCGTTATCGTCATTGTTACTGGATCATGTTTCTCATTTAAAAGCAATAAACATGTTTTAATGTATGTCCGTTCGCTATTTTGTAAATTTGATTCTTTATTCTATTCATAACGTCTTTATCATGGTTAAGGAGGACATTATAACTACTGTTCTTCGTGTGGAATTAGAGAATCGAA]

[+] EMBL CD196676             [TTCAGAAAACTCTTTAACTGATTTTCCAGCCAACATTCATCGTTGTCGCAAACTAAATGTTTTAAAGATTCATGGAAACCCTTTTAAAGATAATCGGTTGAAAAGGCTTTCTGTCGATGAACATTCACCAACTGCGCTTTTAGCTTATCTTCGTCGTTTGGACGAAACAGGAAGCAAAAAAGGAAAGAAAGTTAATGACAAAAATTCACCATCGAAATCTTCAACCGAACATGAAGAAATGAATAATTCCATCGCTCGACCACCGGAAGTTACGGGAATTTCGACGCCGCATATTGTCATTCAGCGCCCAAATGAAAATGAAGAATATCAAATTAATCAGACTCGCTCAGTGAAAACTGGCCCACGTCCTTACATAGTTGCCTGTACGGTTCATGGTGTA AATTTCCTTCTGAAACAAAACTGAGAGCTTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD186980             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGGAAATGAAGAATATCAAATTAATCAGACTCGCTCAGTGAAAACTGGCCCACGTCCTTACATAGTTGCCTGTACGGTTCATGGTGTAGAATTTCCTTCTGAAACAAAACTGAGAGCTTTTCTACGAGCTCAAGAAAATTGGCATCGTGATATTGGCCAAATGCGTCATCATGCAACTTTAGCTACTCATGATTTACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTTAAAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTCATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGAAGCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
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[-] EMBL CD059591             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTCAGTTCCTCCACTTACCAATAGTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACTGATTGAAGTTTCTGGAATCAATTTACCTTTATGCAAACAA TTTGCTGAAGTAGTCATCGCTTGGCTATTAGAAAATGCTTGCCCACAAACAAGGGAGAATAAACCCAGTGACAAGCCAAACACCGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD157301             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTCAGTTCCTCCACTTACCAATAGTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACTGATTGAAGTTTCTGGAATCAATTTACCTTTATGCAAACAA TTTGCTGAAGTAGTCATCGCTTGGCTATTAGAAAATGCTTGCCCACAAACAAGGGAGAATAAACCCAGTGACAAGCCAAACACCGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCAGCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD180342             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACACCGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTCTAACTTTTATTCATTAATGCT AATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTACCA TTAACCGTC                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD180273             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACACCGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTTCAACTTTTATTCATTAATGCTAAATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTA                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD180381             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT AATAAGTTTTCTGTAGTGATACTCTTCTTTTATTACCA TTA                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD180443             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGGCGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCCATGGGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT AATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTACCA TTAACCGTCG                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD180272             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAGGAAGTTAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAGGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGAAACTTAAC AGAGTGAAATAATCATTTTTAACTTTTATTCATTAACGCT AATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTAATACCACTTAAC                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD142690             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAGGAAG TAATACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT AATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTACCA TTAA                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD196475             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGCAGAACAATTCACAGCTTTGTTGACGAAGTGGATAGATAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTATCGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATCGATACTTAAC AGAGTGAAATCATTATTTTTAACTTGTATTCATTATTGCT                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD140707             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT A                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD196986             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD196972             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAAC AGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD197156             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAGCAGAACAA TCACAGC TTGTTGACGAAGTGGATAGAAGGTTAACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTCGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGATGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAACGAATTTATATCTATATAGATACTTAACTAGAGTGAAATAATTACTTTTAACTTTTATTCATTAATGCT A                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL SM019                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATTCATTAATGCT AATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTACCA TTAACCGTCGTTATCGTCATTGTTACTGGATCATGTTTCTCATTTAAAAGCAATAAACATGTTTTAATGTATGTCCGTTCGC                                                                                                    ]
[+] EMBL SM7101               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACTCTTCTNTTATCACCA TTAACCGTCGTTATCGTCATTGTTACTGGATCATGTTTCTCATTTAAAAGCAATANACATGTCTTAATGTATGTCCGTNCGCTATTTTGTAAATTTGATTCTTTATTCTATTCATAACGTCTTTATCATGGTTAAGGAGGACATTATAACTACTGTTCTTCGTGTGGAATTAGAGAATCGAA]




>consensus_10663#0
TTCAGAAAACTCTTTAACTGATTTTCCAGCCAACATTCATCGTTGTCGCAAACTAAATGT
TTTAAAGATTCATGGAAACCCTTTTAAAGATAATCGGTTGAAAAGGCTTTCTGTCGATGA
ACATTCACCAACTGCGCTTTTAGCTTATCTTCGTCGTTTGGACGAAACAGGAAGCAAAAA
AGGAAAGAAAGTTAATGACAAAAATTCACCATCGAAATCTTCAACCGAACATGAAGAAAT
GAATAATTCCATCGCTCGACCACCGGAAGTTACGGGAATTTCGACGCCGCATATTGTCAT
TCAGCGCCCAAATGAAAATGAAGAATATCAAATTAATCAGACTCGCTCAGTGAAAACTGG
CCCACGTCCTTACATAGTTGCCTGTACGGTTCATGGTGTAAATTTCCTTCTGAAACAAAA
CTGAGAGCTTTTCTACGAGCTCAAGAAAATTGGCATCGTGATATTGGCCAAATGCGTCAT
CATGCAACTTTAGCTACTCATGATTTACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTTA
AAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTCATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGAA
GCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACA
AGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCA
AATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTCA
GTTCCTCCACTTACCAATAGTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACTG
ATTGAAGTTTCTGGAATCAATTTACCTTTATGCAAACAATTTGCTGAAGTAGTCATCGCT
TGGCTATTAGAAAATGCTTGCCCACAAACAAGGGAGAATAAACCCAGTGACAAGCCAAAC
ACCGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAATCACAGCTTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTTA
ACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGTC
GATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGAT
GCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAAC
GAATTTATATCTATATAGATACTTAACAGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCAT
TAATGCTAATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTACCATTAACCGTCGTTATC
GTCATTGTTACTGGATCATGTTTCTCATTTAAAAGCAATAAACATGTTTTAATGTATGTC
CGTTCGCTATTTTGTAAATTTGATTCTTTATTCTATTCATAACGTCTTTATCATGGTTAA
GGAGGACATTATAACTACTGTTCTTCGTGTGGAATTAGAGAATCGAA

consensusID : consensus_10663#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 501
fasta sequence

                              [AAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTCAGTTCCTCCACTTACCAATAGTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACTGATTGAAGTTTCTGGAATCAATTTACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTTAAAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTCATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGAAGCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACAC]

[-] EMBL CD149631             [AAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTCAGTTCCTCCACTTACCAATAGTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACTGATTGAAGTTTCTGGAATCAATTTACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTTAAAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTCATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGAAGCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACAC]




>consensus_10663#1
AAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTT
ATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGG
TTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTCAGTTCCTCCACTTACCAATAGTC
ATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACTGATTGAAGTTTCTGGAATCAATT
TACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTTAAAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTC
ATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGAAGCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAG
AAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATT
TGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTCAAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTC
CTATTGTTGTGGATAGTACAC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10663#0      TTCAGAAAACTCTTTAACTGATTTTCCAGCCAACATTCATCGTTGTCGCAAACTAAATGT 60
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      TTTAAAGATTCATGGAAACCCTTTTAAAGATAATCGGTTGAAAAGGCTTTCTGTCGATGA 120
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      ACATTCACCAACTGCGCTTTTAGCTTATCTTCGTCGTTTGGACGAAACAGGAAGCAAAAA 180
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      AGGAAAGAAAGTTAATGACAAAAATTCACCATCGAAATCTTCAACCGAACATGAAGAAAT 240
consensus_10663#1      -------------------------------------------------------AAGAA 5
                                                                               * * 

consensus_10663#0      GAATAATTCCATCGCTCGACCACCGGAAGTTACGGGAATTTCGACGCCGCATATTGTCAT 300
consensus_10663#1      GCACAGTTGGATAGA--AAATCTCGTAAACAAACAAGATTTAGTCAA-GTTTATCGTTAT 62
                       * * * **  ** *    *    ** **   *     **** * *   *  *** ** **

consensus_10663#0      TCAGCGCCCAAATGAAAATGAAGAATATCAAATTAATCAGACTCGCTCAGTGAAA-ACTG 359
consensus_10663#1      TTGA--ATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTT-TCAAATGTATTCAGTGATGTAATG 119
                       *         * ** * **  * * *   *   *  *** *     *******   * **

consensus_10663#0      GCCCACGTCCTTACATAGTTGCCTGTACGGTTCATGGTGTAAATTTCCTTCTGAAACAAA 419
consensus_10663#1      GTTCCTATTGTTGTGGA-TAG--TACACCAGTGGTCATCTCAGTTCCTCCACTTACCAAT 176
                       *  *   *  **    * * *  *  **   *  *  * * * ** *       * *** 

consensus_10663#0      ACTGAGAGCTTTTCTACGAGCTCAAGAAAATTGGCATCGTGATATTGGCCAAATGCGTCA 479
consensus_10663#1      A------GTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACA-CATAATAT--ACTGATTG----- 222
                       *      *   *   **  * * **    *    ** * * ****   *  * **     

consensus_10663#0      TCATGCAACTTTAGCTACTCATGATTTACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTT 539
consensus_10663#1      ------AAGTTTCTGGAATCA--ATTTACAACTAATCCGTTTTCCACTTGCTTACACTTT 274
                             ** ***    * ***  *************************************

consensus_10663#0      AAAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTCATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGA 599
consensus_10663#1      AAAAGAAGCAAAGTCATTTCTAATTCATCCGTTGAATAGATCTATTAATGGTACTGGTGA 334
                       ************************************************************

consensus_10663#0      AGCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAAC 659
consensus_10663#1      AGCATTTTTGAGACAATTAGTTCAAGAAGCACAGTTGGATAGAAAATCTCGTAAACAAAC 394
                       ************************************************************

consensus_10663#0      AAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTC 719
consensus_10663#1      AAGATTTAGTCAAGTTTATCGTTATTTGAATGTATTGGATATCGAAAGTGCAATGGTTTC 454
                       ************************************************************

consensus_10663#0      AAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACACCAGTGGTCATCTC 779
consensus_10663#1      AAATGTATTCAGTGATGTAATGGTTCCTATTGTTGTGGATAGTACAC------------- 501
                       ***********************************************             

consensus_10663#0      AGTTCCTCCACTTACCAATAGTCATCACACACGGTTAACTGTAAACACACATAATATACT 839
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      GATTGAAGTTTCTGGAATCAATTTACCTTTATGCAAACAATTTGCTGAAGTAGTCATCGC 899
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      TTGGCTATTAGAAAATGCTTGCCCACAAACAAGGGAGAATAAACCCAGTGACAAGCCAAA 959
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      CACCGAGGAAGTTAATACAGCAGAACAATCACAGCTTGTTGACGAAGTGGATAGAAAGTT 1019
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      AACACTGAAGTCGGTTGTCATTCCACCTAACGCTCTTGTGGTACGTCCAATTCGTGTTGT 1079
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      CGATGTTGATTTCGATTACAATCTATGTGTCATGTTTCCATCACGGTCGGATTTAACTGA 1139
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      TGCAAAGTTTAATACCATTCGTTAGATATATTATTCTTATTACTCATATGTTATCAGAAA 1199
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      CGAATTTATATCTATATAGATACTTAACAGAGTGAAATAATTATTTTTAACTTTTATTCA 1259
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      TTAATGCTAATAAGTTTTCTGTTGTGATACTCTTCTTTTATTACCATTAACCGTCGTTAT 1319
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      CGTCATTGTTACTGGATCATGTTTCTCATTTAAAAGCAATAAACATGTTTTAATGTATGT 1379
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      CCGTTCGCTATTTTGTAAATTTGATTCTTTATTCTATTCATAACGTCTTTATCATGGTTA 1439
consensus_10663#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10663#0      AGGAGGACATTATAACTACTGTTCTTCGTGTGGAATTAGAGAATCGAA 1487
consensus_10663#1      ------------------------------------------------