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Schistosoma mansoni
cluster # 10698 cluster # 10698       Sequences # 20       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10698#0 length = 945 sequences # 19  
consensus_10698#1 length = 435 sequences # 1  

consensusID : consensus_10698#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 19
consensus length = 945
fasta sequence
                              [ACATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACAACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA-CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACGAACAGTCAAGGACAAGATCAATCAAGCAGTTGTCATGTGACAATTATACCAGAAGAGGGAGTTGTCACTGAAACTCAATTGCCAGAAGAATCTATGATTGCAAATCTAGCTATGATGGAAGATCATTTAGTAAGAAATGGACTAGATCGAGCTAATCGTTATCATGACGATATACGTCCAACAAATCCACCAAATTTTCTTAAACCACTTGCACCACAAGTTGGTCTTCGTGAATCAGCTCCAGCACATTTCGAAACGTGTGTAGAACCCACAAATGATCCTTCATTAACAGTTGAATGGTATAAAGATGGCAAACCTGTTAGCATGGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGATATTCATTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACG]

[+] EMBL CD096290             [ACATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACAACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD096185             [ CATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACAACAACACTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD146760             [ CATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACAACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD146862             [ CATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACAACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTAATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGGTGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD147003             [ CATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACGACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTCAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD147004             [ CATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACGACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTCAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD096172             [ CATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACAACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD189760             [                                                                                      CAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD179954             [                                                                                                             CAAACT ATCAA TANACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD061264             [                                                                                                              AAACTAATCAATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATATCCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD163309             [                                                                                                                                                                     ATTTGATCAACAAGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACGAACAGTCAAGGACAAGATCAATCAAGCAGTTGTCATGTGACAATTATACCAGAAGAGGGAGTTGTCACTGAAACTCAATTGCCAGAAGAATCTATGATTGCAAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD179942             [                                                                                                                                                                                 AGTACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD179919             [                                                                                                                                                                                                        GTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAATGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD112065             [                                                                                                                                                                                                                                                            TAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAATCTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGGCATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACGAACAGTCAAGGACAAGATCAATCAAGCAGTTGTCATGTGACAATTATACCAGAAGAGGGAGTTGTCACTGAAACTCAATTGCCAGAAGAATCTATGATTGCAAATCTAGCTATGATGGAAGATCATTTAGTAAGAAATGGACTAGATCGAGCTAATCGTTATCATGACGATA                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD189443             [                                                                                                                                                                                                                                                                                CGTCTGGTCCACCACAG TTGTTGTTCATCCTGTAGGCCAA CTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACGTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGTGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGCAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTACTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACGAACAGTCAAGGACAAGATCAATCAAGCAGTTGTCATGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD179928             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCAGCTTCTCGTTTCACAACGACAATTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACATGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD167192             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCTATCAAGCAGGTGTCATGTGACAATTATACCAGAAGAGGGAGTTGTCACTGACACTCAATTGCCACAAGAATCTATGATTGCAAATCTAGCTATGATGGAAGATCATTTAGTAAGAAATGGACTAGATCGAGCTAATCGATATCATGACGATATACGTTCAACAAATCCACCAAATTTTCTTAAACCACTTGCACCACAAGTTGATCTTCGTGAATCACCTACCGCACATTTCGAAACGTGTGTAGAACCCACACATGATTCTTCATTAACAGATGAATGGTTTA                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD154807             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCATGTGACAATTATACCAGAACAGGGAGTTGTCACTGAAACTCAATTGCCAGAAGAATCTATGATTGCAAATCTAGCTATGATGGAAGATCATTTAGTAAGAAATGGACTAGATCGAGCTAATCGTTATCATGACGATATACGTCCAACAAATCCACCAAATTTTCTTAAACCACATGCACCACAAGTTGGTCTTCGTGAATCAGCTCCAGCACATTTCGAAACGTGTGTAGAACCCACAAATGATCCTTCATTAACAGTTGAATGGTATAAAGATGGCAAACCTGTTAGCATGGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGATATTCATTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATAC              ]
[-] EMBL CD096774             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACGTCCAACAAATCCACCAAATTTTCTTAAACCACTTGCACCACAAGTTGGTCTTCGTGAATCAGCTCCAGCACATTTCGAAACGTGTGTAGAACCCACAAATGATCCTTCATTAACAGTTGAATGGTATAAAGATGGCAAACCTGTTAGCATGGGCTGTCGTTTCAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTGTGTTAGATATTCATTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACG]


>consensus_10698#0 ACATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACA ACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCA ATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGT ACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCAGTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAAT GCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTCA TCCTGTAGGCCAACTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTACG TCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAGC AGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACAT GAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACGAACAGTCAAGGACAAGATCA ATCAAGCAGTTGTCATGTGACAATTATACCAGAAGAGGGAGTTGTCACTGAAACTCAATT GCCAGAAGAATCTATGATTGCAAATCTAGCTATGATGGAAGATCATTTAGTAAGAAATGG ACTAGATCGAGCTAATCGTTATCATGACGATATACGTCCAACAAATCCACCAAATTTTCT TAAACCACTTGCACCACAAGTTGGTCTTCGTGAATCAGCTCCAGCACATTTCGAAACGTG TGTAGAACCCACAAATGATCCTTCATTAACAGTTGAATGGTATAAAGATGGCAAACCTGT TAGCATGGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGATATTCA TTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACG



consensusID : consensus_10698#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 435
fasta sequence
                              [TTTCTTTCCTATGTTTTGCCTTTGTTTAATGTCTAGTCATTAGAAAAGCATATTTGGCATAAATAACTATGCTAAAATGTAGGGAGGTCATAATTTCCTGTTTTCAGACCTGAAAATTGATCAAAACCGTTTGTTCATCACTCTCGTTCACTTTATGAACATAGTGTTCTTTCAGAATTGATTAACACAAGCAACTATTTATTTTCATCAAACATTAAACACTTAATTCATTTTATGAAACATCTTTTATATAGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGATATTCATTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACGTAATGCAGCAGGACAAGTACAAAGCAATGTGGTTGAATTACAGTAAGTAAATAATGTTTAAGTTTTCATTTATATGAACATGTA]

[+] EMBL BF936513             [TTTCTTTCCTATGTTTTGCCTTTGTTTAATGTCTAGTCATTAGAAAAGCATATTTGGCATAAATAACTATGCTAAAATGTAGGGAGGTCATAATTTCCTGTTTTCAGACCTGAAAATTGATCAAAACCGTTTGTTCATCACTCTCGTTCACTTTATGAACATAGTGTTCTTTCAGAATTGATTAACACAAGCAACTATTTATTTTCATCAAACATTAAACACTTAATTCATTTTATGAAACATCTTTTATATAGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGATATTCATTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACGTAATGCAGCAGGACAAGTACAAAGCAATGTGGTTGAATTACAGTAAGTAAATAATGTTTAAGTTTTCATTTATATGAACATGTA]


>consensus_10698#1 TTTCTTTCCTATGTTTTGCCTTTGTTTAATGTCTAGTCATTAGAAAAGCATATTTGGCAT AAATAACTATGCTAAAATGTAGGGAGGTCATAATTTCCTGTTTTCAGACCTGAAAATTGA TCAAAACCGTTTGTTCATCACTCTCGTTCACTTTATGAACATAGTGTTCTTTCAGAATTG ATTAACACAAGCAACTATTTATTTTCATCAAACATTAAACACTTAATTCATTTTATGAAA CATCTTTTATATAGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGA TATTCATTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACGTAATGCAGC AGGACAAGTACAAAGCAATGTGGTTGAATTACAGTAAGTAAATAATGTTTAAGTTTTCAT TTATATGAACATGTA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10698#0      ACATTCCACTTGGAGTGCACAGACTAATAATAATCAAGTGATTGATAACAGAGGAAAACA 60
consensus_10698#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10698#0      ACAACATTACCAACAACAGCAACAACCAGTTCAAACTTATCAACAAGTTCAAACTAATCA 120
consensus_10698#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10698#0      ATTAAACACACAGAATACTTTACCACCTATTGTATCTAGTCAAGGATTTGATCAACAAGT 180
consensus_10698#1      --------------TTTCTTTCCTATGTTTTGCCTTTGTTTAATG-TCTAGTCATTAGAA 45
                                      * **** * *  * ***  * *  * ** * * *  ***  *   

consensus_10698#0      ACCTAGACGTTTTCCTTCTGGTGATCA-GTCAAAACAAATTAAGGTCAAATCACTGCCAA 239
consensus_10698#1      AAGCATA---TTTGGCATAAATAACTATGCTAAAATGTAGGGAGGTC--ATAATTTCCTG 100
                       *   * *   ***        * *  * *  ****   *   *****  ** * * **  

consensus_10698#0      TGCGTAATTCAGTTAGCATAGATGGTATTGACTCGTCTGGTCCACCACAGTTTGTTGTTC 299
consensus_10698#1      TT-----TTCAGACCTGAAAATTGAT-CAAAACCGTTTG-TTCATCAC----TCTCGTTC 149
                       *      *****     * *  ** *    *  *** ** * ** ***    * * ****

consensus_10698#0      ATCCTGTAGGCCAACTAACCATAGCAGAAGGTGAACCAGCTAATATAACTGCACGTGTAC 359
consensus_10698#1      ACTTTATGAACATAGTGTTC-TTTCAGAA--TTGATTAACACAAGCAACTATTTATTTTC 206
                       *   * *   *  * *   * *  *****  *  *  * *  *   ****     * * *

consensus_10698#0      GTCCGGCTGGTGATAGTACATTAGTTGTTGAGTGGTATAAAAATGGCAAGCCATTACCAG 419
consensus_10698#1      ATCAAACATTAAACACTTAATTCATTTT--------ATGAAAC-----ATCTTTTAT--A 251
                        **   *     * * *  ***  ** *        ** ***      * *  ***    

consensus_10698#0      CAGCTTCTCGTTTCACAACGACATTTGATCGAGGCTACGCAGTACTCGATTTTCTATACA 479
consensus_10698#1      TAGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGATATTCATTATT 311
                        **  * ****** *   *    ** ** ** ** *  **  *  * *** ***  **  

consensus_10698#0      TGAATGAAGATGATAACGGGGACTATTCCTGTGTAGCAACGAACAGTCAAGGACAAGATC 539
consensus_10698#1      GTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACGTAATGCAGCAGGACAAGTAC 371
                          **  *** ** ** ** *  ** * **********   **      ********  *

consensus_10698#0      AATCAAGCAGTTGTCATGTGACAATTATACCAGAAGAGGGAGTTGTCACTGAAACTCAAT 599
consensus_10698#1      AA---AGCAAT----GTGGTTGAATTACAGTA----AGTAAATAATGTTTAAGTTTTCAT 420
                       **   **** *     **    ***** *  *    **  * *  *   * *   *  **

consensus_10698#0      TGCCAGAAGAATCTATGATTGCAAATCTAGCTATGATGGAAGATCATTTAGTAAGAAATG 659
consensus_10698#1      TTATATGAACATGTA--------------------------------------------- 435
                       *   *  *  ** **                                             

consensus_10698#0      GACTAGATCGAGCTAATCGTTATCATGACGATATACGTCCAACAAATCCACCAAATTTTC 719
consensus_10698#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10698#0      TTAAACCACTTGCACCACAAGTTGGTCTTCGTGAATCAGCTCCAGCACATTTCGAAACGT 779
consensus_10698#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10698#0      GTGTAGAACCCACAAATGATCCTTCATTAACAGTTGAATGGTATAAAGATGGCAAACCTG 839
consensus_10698#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10698#0      TTAGCATGGGCTGTCGTTTTAATGCTGTTTTGGACCGGGGATTTGCTATGTTAGATATTC 899
consensus_10698#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10698#0      ATTATTGTTATCCAGAAGACAATGGAGCATACTTCTGTGTAGCACG 945
consensus_10698#1      ----------------------------------------------
                                                                     




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)