These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10717#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 18 consensus length = 826 fasta sequence [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA-TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [+] EMBL CD147204 [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCACCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACANATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATT ] [+] EMBL CD147189 [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCAC ] [+] EMBL CD096446 [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAGTACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTANAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTANACACANATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTG ] [+] EMBL CD147161 [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATGTTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACCTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAA ] [+] EMBL CD147222 [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCTTCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTNTATCTCCAAAAGATTTAGATGANATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTT ] [-] EMBL CD096659 [ CGCCTTGTCAACGGCCATCATCAATATGTTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAGCTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAGAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143564 [ CACATAATCACATTCGTACAACTTCCGTTTATATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD096309 [ CATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143572 [ CATAATCACAATCGTACACTTTCCGTTTATATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143576 [ TCACAATCGTACACTTTCCGTNTATATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143525 [ ctTTCCGTTTATATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAGAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143424 [ TATATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATACCA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143535 [ tatCATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGATATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143539 [ atATTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTTGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGTAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143488 [ atTTGACTGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143422 [ TGTCCANATACATCATATTATGATGTAATTACA TTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTANAGCACGAGCAATGGTAGCTCTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTCGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143438 [ ATTGTGATGTAA TACATTTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTANAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATACTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATCGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD143471 [ AACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGC TTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] consensusID : consensus_10717#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 577 fasta sequence [TCATCACCTAATTTNCNGCCTTGTCANCGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCATTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] [-] EMBL CD096334 [TCATCACCTAATTTNCNGCCTTGTCANCGGCCATCATCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATTGACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCATTCGGTCGAACTTATGAACAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT] consensusID : consensus_10717#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 565 fasta sequence [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGTAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGG] [+] EMBL CD147256 [GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTTGTGTAAATAATTCAGTATATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGTCCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGTAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCATTATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGTTCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACCAATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTAACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGCTCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAATCGG] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_10717#0 GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCACCTGTCACTGTGCCAACGTGTACTGTT 60 consensus_10717#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10717#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10717#0 AATGATAATAAGAAATACTCAGTATCTTCACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAAT 120 consensus_10717#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10717#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10717#0 TGTTGTGTAAATAATTCAGATAACTTCAAATTTTCTACTCCTACTTCATCATCTCCTTCT 180 consensus_10717#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10717#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10717#0 TCACAACATTTATTGCATTATTCTTCATCACCTAATTTTCCGCCTTGTCAACGGCCATCA 240 consensus_10717#1 ------------------------TCATCACCTAATTTNCNGCCTTGTCANCGGCCATCA 36 consensus_10717#2 ---------------------------GAAATTAATGAAGAGAAATTTGGTCTTTCATCA 33 * **** * * * * ***** consensus_10717#0 TCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATT 300 consensus_10717#1 TCAATATTGTTATCTAATAAATCTGCACATAATCACAATCGTACAACTTCCGTTTACATT 96 consensus_10717#2 CC--TGTCACTGTGCCA-ACGTGTACTGTTAATGATAATAAGAAATACTCAG--TATCTT 88 * * * * * * * * * * **** * *** * * ** * ** ** consensus_10717#0 GACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTACATTCGGTCGAACTTATGAACAGTAT 360 consensus_10717#1 GACTGTCCAAATACATCATATTATGATGTAATTGCATTCGGTCGAACTTATGAACAGTAT 156 consensus_10717#2 CACTATCCAATTTAAATACAAATCCTTCAAATTGTT----GTGTAAATAATT--CAGTAT 142 *** ***** * * * * * **** ** ** * ** ****** consensus_10717#0 ATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGT 420 consensus_10717#1 ATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGT 216 consensus_10717#2 ATTGCTAAAGCACGAGCAATGGTAGCTTTATCTCCAAAAGATTTAGATGAAATATTTAGT 202 ************************************************************ consensus_10717#0 CCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCAT 480 consensus_10717#1 CCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGAAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCAT 276 consensus_10717#2 CCATTACGAGAATTACCATTTATTAATCGTGTAAATCAATTATCCCATACTTCACTTCAT 262 ******************************* **************************** consensus_10717#0 TATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGT 540 consensus_10717#1 TATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGT 336 consensus_10717#2 TATCACAATCAAGATGATATATTATCTACTAATGTTATCAATGTAAAAACAACTCATTGT 322 ************************************************************ consensus_10717#0 TCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACC 600 consensus_10717#1 TCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACC 396 consensus_10717#2 TCAACTATTCCATTAATATTAAACACAAATGTTAATTCAATGAAACAATTATCTGATACC 382 ************************************************************ consensus_10717#0 AATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTA 660 consensus_10717#1 AATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAG----------------------- 433 consensus_10717#2 AATTCGACAACGATGGTGAAGAATCGAAATTGCTTAGGTTCTGAATTAAAATTATCTTTA 442 ************************************* consensus_10717#0 ACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGC 720 consensus_10717#1 ----------------------AAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGC 471 consensus_10717#2 ACTAATCTTACATCTTCTGTAGAAGAAAATAATGGTAATGATAAAAGTAATGATTATTGC 502 ************************************** consensus_10717#0 TCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAAT 780 consensus_10717#1 TCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAAT 531 consensus_10717#2 TCTTCGTCTGGTGCTAGTTCTCCACGACATTTAGTTAGTTGTATCGCTGTAACACATAAT 562 ************************************************************ consensus_10717#0 CGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT 826 consensus_10717#1 CGGAATGGACTGAATAGTAATTTAGTAACAAAAAATATAACTGTTT 577 consensus_10717#2 CGG------------------------------------------- 565 *** |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||