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Schistosoma mansoni
cluster # 10783 cluster # 10783       Sequences # 22       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10783#0 length = 1864 sequences # 16  
consensus_10783#1 length = 1208 sequences # 6  

consensusID : consensus_10783#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 16
consensus length = 1864
fasta sequence
                              [ACGTTGAACAACCAGTGCCAGGCAGTCCTTTTGTAGTTCATATTGGTGGTGAACCATCACTTAGAATGATGGAAAGAATTACACGACAAAGAGAACTTGCTGATGCAACATATGTAGGCAGTCAATGTGAATTAAATTTGAAAATTCCAGGAATAAATATTCGTGATTTAACAGCTAATGTAACTAGTCCATCAGGAGTAAGTCAACGATGTGATGTCTTAGCTATGGATGATGTGAACTATACCATTAAATTTGTACCACAAGAAATGGGTGTACATACTGTTTCAGTACGTCATCGAGGATCTCATATTTCTGGAAGTCCATTTCAGTTTACAGTTGGTCCTATTACAGAAGGTGGAGCGCATAAAGTACATGCTACCGGTCAAGGATTACAAAATGGTTTAACCTATTCACTAAATGATTTTAGTATTTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCAATTG-CTATTGAAGG-ACCAA-GTAAAGCCGAAATAAATTTCGAAGATAGGAAAGATGGCTCATGTGGAGTTTCTTATCGTGTAACTGAACCAGGTGAATATTTATGCTCTATTCGCTTCAATGATGATCATATACCGAATTCACCATTTCGTGTTATCATAAATGAAGCGATGGAACGAACATTCTATACACCTGAAACTAAATTATTGAATATTACAAGTATTCAAGATCGTGGTCTGTCGGTCGGGCGTCCAACAGCATTCACAGTTAATTACTCAGGAATGACAGGTAGAATGAGAGCATATGTAGTAGCTCCATCTGGAATACAGTCAGATGCATTTGTACACCAAGTGGATGTTGATCAACATGCAGTAAGATTTACACCTCATGAAAATGGAGCACATTTAGTGCATGTACTCATGGATGAACGTCCAGTACCTGGAAGTCCATTCCGTGTATTGGTTGGACAAGAAGAGACTGGTCATGTTACAGCTAGTGGGGAAGGTTTGACTCATGGACGTGTTGGTGAGCGTAATCGATTTTTCGTAAACACTGTTCAAGCTGGAAGTGGTGCTTTATCAGTTACTGTGGATGGTCCTAGTAAAGTTCAATTAAATTGTACTGAACGATCAGATGGATACGATTTCACTTATTTGCCATTATCGCCTGGTGAATATCTCATCAGTATTAAATATGGTGATTCACAACATATTATAGGTTCACCATATAAAGCAATTGTGACAGGAGATGCTGTACACGAAACAATCACAACTGATACAACACATGTTGTAGTAGAAACAGGAGGACGTATGGTTAATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTG-TTG-ATGTTATCT--AATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTGCAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATACTTTT]

[-] EMBL CD069859             [ACGTTGAACAACCAGTGCCAGGCAGTCCTTTTGTAGTTCATATTGGTGGTGAACCATCACTTAGAATGATGGAAAGAATTACACGACAAAGAGAACTTGCTGATGCAACATATGTAGGCAGTCAATGTGAATTAAATTTGAAAATTCCAGGAATAAATATTCGTGATTTAACAGCTAATGTAACTAGTCCATCAGGAGTAAGTCAACGATGTGATGTCTTAGCTATGGATGATGTGAACTATACCATTAAATTTGTACCACAAGAAATGGGTGTACATACTGTTTCAGTACGTCATCGAGGATCTCATATTTCTGGAAGTCCATTTCAGTTTACAGTTGGTCCTATTACAGAAGGTGGAGCGCATAAAGTACATGCTACCGGTCAAGGATTACAAAATGGTTTAACCTATTCACTAAATGATTTTAGTATTTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCAATTG CTATTGAAGG ACCAA GTAAAGCCGAAATAAATTTaaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD069816             [                                                                    ATGGAAAGAATTACACGACAAAGAGAACTTGCTGATGCAACATATGTAGGCAGTCAATGTGAATTAAATTTGAAAATTCCAGGAATAAATATTCGTGATTTAACAGCTAATGTAACTAGTCCATCAGGAGTAAGTCAACGATGTGATGTCTTAGCTATGGATGATGTGAACTATACCATTAAATTTGTACCACAAGAAATGGGTGTACATACTGTTTCAGTACGTCATCGAGGATCTCATATTTCTGGAAGTCCATTTCAGTTTACAGTTGGTCCTATTACAGAAGGTGGAGCGCATAAAGTACATGCTACCGGTCAAGGATTACAAAATGGTTTAACCTATTCACTAAATGATTTTAGTATTTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCAATTG CTATTGAAGG GCCAA GTAAAGCCGAAAT AATTTAAAAGATAGGAAAGATGGCTCAcgcga                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL SMAA85200            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acGTCAAGGATTAC  AAT GTTTAACCTATTCACTAAATGATTTTAGTATTTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCAATTG CTATTGAAGGAACCAAGGTAAAGCCGAAATAAATTTCGAAGATAGGAAAGATGGCTCATGTGGAGTTTCTTATCGTGTAACTGAACCAGGTG ATATTTATGCTCTATTCGCTTCAATGATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL SMAA85202            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATGGTTTAACCTATTCACTAAATGATTTTAGTATTTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCGGTTG CTATTGAAGG ACCAA GTAAAGCCGAAATAAATTTCGAAGATAGGAAAGATGGCTCATGTGGAGTTTCTTATCGGGTAACTGAACCAGGTGAATATTTATGCTCTAat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL SMAA85204            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cAATG  TT ACCTA TCACT AATGA TTTAGTA TTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCAATTGCCTATTGAAGGCACGAA GTAAAGCCGAAATAAATTTCGAAGATAGGAAAGATGGCTCATGTGGAGTTTCTTATCGTGTAACTGAACCAGGTGAATATTTATGCTCTATTCGCTTCAATGATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD194227             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAATTG CTATTGAAGG ACCAA GTAAAGCCGAAATAAATTTCGAAGATAGGAAAGATGGCTCATGTGGAGTTTCTTATCGTGTAACTGAACCAGGTGAATATTTATGCTCTATTCGCTTCAATGATGATCATATACCGAATTCACCATTTCGTGTTATCATAAATGAAGCGATGGAACGAACATTCTATACACCTGAAACTAAATTATTGAATATTACAAGTATTCAAGATCGTGGTCTGTCGGTCGGGCGTCCAACAGCATTCACAGTTAATTACTCAGGAATGACAGGTAGAATGAGAGCATATGTAGTAGCTCCATCTGGAATACAGTCAGATGCATTTGTACACCAAGTGGATGTTGATCAACATGCAGTAAGATTTACACCTCATGAAAATGGAGCACATTTAGTGCATGTACTCATGGATGAACGTCCAGTACCTGGAAGTCCATTCCGTGTATTGGTTGGACAAGAAGAGACTGGTCATGTTACAGCTAGTGGGGAAGGTTTGACTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD180685             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAATTACTCAGGAATGACAGGTAGAATGAGAGCATATGTAGTAGCTCCATCTGGAATACAGTCAGATGCATTTGTACACCAAGTGGATGTTGATCAACATGCAGTAAGATTTACACCTCATGAAAATGGAGCACATTTAGTGCATGTACTCATGGATGAACGTCCAGTACCTGGAAGTCCATTCCGTGTATTGGTTGGACAAGAAGAGACTGGTCATGTTACAGCTAGTGGGGAAGGTTTGACTCATGGACGTGTTGGTGAGCGTAATCGATTTTTCGTAAACACTGTTCAAGCTGGAAGTGGTGCTTTATCAGTTACTGTGGATGGTCCTAGTAAAGTTCAATTAAATTGTACTGAACGATCAGATGGATACGATTTCACTTATTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD188530             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTGCTTTATCAGTTACTGTGGATGGTCCTAGTAAAGTTCAATTAAATTGTACTGAACGATCAGATGGATACGATTTCACTTATTTGCCATTATCGCCTGGTGAATATCTCATCAGTATTAAATATGGTGATTCACAACATATTATAGGTTCACCATATAAAGCAATTGTGACAGGAGATGCTGTACACGAAACAATCACAACTGATACAACACATGTTGTAGTAGAAACAGGAGGACGTATGGTTAATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATTGAGCTAATACATTTACAGTTAtt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI976895             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTAGTAAAGTTCAATTAAATTGTACTGAACGATCAGATGGATACGATTTCACTTATTTGCCATTATCGCCTGGTGAATATCTCATCAGCATTAAATATGGGGATTCACAACATATTATAGGTTCACCATATAAAGCAATTGTGACAGGAGATGCTGTACACGAAACAATCACAACTGATACAACACATGTTGTAGTAGAAACAGGAGGACGTATGGTTAATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD083329             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gAGCAATTGTGACAGGAGATGCTGTACACGAAACAATCACAACTGATACAACACATGTTGTAGTAGAAACAGGAGGACGTATGGTTAATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTG TTG ATGTTATCT  AATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCA                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD070182             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGNGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTG TTG ATGTTATCTAAAATTC ATG AATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTA                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD070111             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACACGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTG TTGAATG TATCT  AATT                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD070081             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGNGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTGNNTG ATG TATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD143292             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCCTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATACGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTG TTG ATGTTATCT  AATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTGCAAATGCCTATATAAAACTAATTGCA                       ]
[-] EMBL CD145226             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTTAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTG TTG ATGTTATGT  AATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCCTTACATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTACAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATACTTTT]
[+] EMBL CD139352             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTG TTG ATGTTATCT  AATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTTATAATTACAACAAAGTGTTTTCCc                                                                                                           ]


>consensus_10783#0 ACGTTGAACAACCAGTGCCAGGCAGTCCTTTTGTAGTTCATATTGGTGGTGAACCATCAC TTAGAATGATGGAAAGAATTACACGACAAAGAGAACTTGCTGATGCAACATATGTAGGCA GTCAATGTGAATTAAATTTGAAAATTCCAGGAATAAATATTCGTGATTTAACAGCTAATG TAACTAGTCCATCAGGAGTAAGTCAACGATGTGATGTCTTAGCTATGGATGATGTGAACT ATACCATTAAATTTGTACCACAAGAAATGGGTGTACATACTGTTTCAGTACGTCATCGAG GATCTCATATTTCTGGAAGTCCATTTCAGTTTACAGTTGGTCCTATTACAGAAGGTGGAG CGCATAAAGTACATGCTACCGGTCAAGGATTACAAAATGGTTTAACCTATTCACTAAATG ATTTTAGTATTTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCAATTGCTATTGAAGGAC CAAGTAAAGCCGAAATAAATTTCGAAGATAGGAAAGATGGCTCATGTGGAGTTTCTTATC GTGTAACTGAACCAGGTGAATATTTATGCTCTATTCGCTTCAATGATGATCATATACCGA ATTCACCATTTCGTGTTATCATAAATGAAGCGATGGAACGAACATTCTATACACCTGAAA CTAAATTATTGAATATTACAAGTATTCAAGATCGTGGTCTGTCGGTCGGGCGTCCAACAG CATTCACAGTTAATTACTCAGGAATGACAGGTAGAATGAGAGCATATGTAGTAGCTCCAT CTGGAATACAGTCAGATGCATTTGTACACCAAGTGGATGTTGATCAACATGCAGTAAGAT TTACACCTCATGAAAATGGAGCACATTTAGTGCATGTACTCATGGATGAACGTCCAGTAC CTGGAAGTCCATTCCGTGTATTGGTTGGACAAGAAGAGACTGGTCATGTTACAGCTAGTG GGGAAGGTTTGACTCATGGACGTGTTGGTGAGCGTAATCGATTTTTCGTAAACACTGTTC AAGCTGGAAGTGGTGCTTTATCAGTTACTGTGGATGGTCCTAGTAAAGTTCAATTAAATT GTACTGAACGATCAGATGGATACGATTTCACTTATTTGCCATTATCGCCTGGTGAATATC TCATCAGTATTAAATATGGTGATTCACAACATATTATAGGTTCACCATATAAAGCAATTG TGACAGGAGATGCTGTACACGAAACAATCACAACTGATACAACACATGTTGTAGTAGAAA CAGGAGGACGTATGGTTAATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTAGACCAGATCGTG TTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTAATACATTTACAG TTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAG CCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTG TACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCA GTCCATTCACTGTTGATGTTATCTAATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTAT TACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCT TATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTAATAATTA CAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTA AAAACACATAGTTTGCAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATAC TTTT



consensusID : consensus_10783#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence
                              [AATCCTCGGTACGAGGCCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTGTTGATGTTATCTAATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTACAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATACTTTTCTACCCCTAGGCTTTTTCTGAAATTTCTTTTCGCATGACTTCTTTTTTCTTTTTTATTGGACTTTCAAAATGATGAAAACACACATTACCAAAATTGGAAAGGACTCACTATAGATAGACATATAGTATTCTTCTTTGTTCCGTTAGTATTTCGCTTCTGAAAAATAAAAAAAAATTGTTTACTATTATTTATATTGTTAATAATCTTCAACTGAACAGATTTGCATGTTACACTTACATATTACACTTACAAGTGTACTTCTGAATTAGCCGATTGATGCTTCCTTCAATTGTTTGTTGTTGTTCAAAGAATTAAAGCATATTCACTAACACACTATTTATATTGTATTCTAAATCTATTCTTTTTCGTCTATAAACAATGTTATCCCGTTAAAAAGTATCCCCATTTATTATTATTATGATATATAATACGTGTCATCAAGTCTAAACAATGTTGTTTGAATGAAACAAACAAGCATCAACTACATATATTAGTTCTTTTTTTATCTCANATTCAACACCTTAATGCCTTACTACTTATTCCTTAATTCTATTAGTGCCTAATTATTATTATTATGGCTTTCTTAATTTCTTAGTANATTATTATCTAAACAAACCTAATTTGACTAANACCCACCTTCCAATTTAAGTTAGNTAACATTTTTTTTTTTGTTTGCTTTTGCTGGTTTTATCCGACCCTATGGGTTAGATGA]

[+] EMBL CD082291             [AATCCTCGGTACGAGGCCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTGTTGATGTTATCTAATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTACAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATACTTTTCTACCCCTAGGCTTTTTCTGAAATTTCTTTTCGCATGACTTCTTTTTTCTTTTTTATTGGACTTTCAAAATGATGAAAACACACATTACCAAAATTGGAAAGGACTCACTATAGATAGACATATAGTATTCTTCTTTGTTCCGTTAGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD070090             [                                                                                                                                                                   AAATGGGGTGATCAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTGTTGATGTTATCTAATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTAAAGACACATAGTTTACAAATGCCTATATAAAACTAATTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD070067             [                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTTTAGTANCATTCATGACAAGGCTTATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTACAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATACTTTTCTACCCCTAGGCTTTTTCTGAAATTTCTTTTCGCATGACTTCTTTTTTCTTTTTTATTGGACTTTCAAAATGATGAAAACACACATTACCAAAATTGGAAAGGACTCACTATAGATAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD153254             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATACTTTTCTACCCCTAGGCTTTTTCTGAAATTTCTTTTCGCATGACTTCTTTTTTCTTTTTTATTGGACTTTCAAAATGATGAAAACACACATTACCAAAATTGGAAAGGACTCACTATAGATAGACATATAGTATTCTTCTTTGTTCCGTTAGTATTTCGCTTCTGAAAAATAAAAAAAAATTGTTTACTATTATTTATATTGTTAATAATCTTCAACTGAACAGATTTGCATGTTACACTTACATATTACACTTACAAGTGTACTTCTGAATTAGCCGATTGATGCTTCCTTCAATTGTTTGTTGTTGTTCAAAGAATTAAAGCATATTCACTAACACACTATTTATATTGTATTCTAAATCTATTCTTTTTCGTCTATAAACAATGTTATCCCGTTAAAAAGTATCCCCATTTATTATTATTATGATATATAATACGTGTCATCAAGTCTAAACAATGTTGTTTGAATGAAACAAACAAGCATCAACTACATATATTAGTTCTTTTTTTA                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD072406             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTATGATATATAATACGTGTCATCAAGTCTAAACAATGTTGTTTGAATGAAACAAACAAGCATCAACTACATATATTAGTTCTTTTTTTATCTCANATTCAACACCTTAATGCCTTACTACTTATTCCTTAATTCTATTAGTGCCTAATTATTATTATTATGGCTTTCTTAATTTCTTAGTANATTATTATCTAAACAAACCTAATTTGACTAANACCCACCTTCCAATTTAAGTTAGNTAACATTTTTTTTTTTGTTTGCTTTTGCTGGTTTTATCCGACCCTATGGGTTAGATGA]
[+] EMBL BE505140             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAACAAACAAGCATCAACTACATATATTAGTTCTTTTTTTATCTCAAATTCAACACCTTAATGCCTTACTACTTATTCCTTAATTCTATTAGTGCCTAATTATTATTATTATGGNTTTCTTAATTTCTTAGTAAATTATTATNTAAACAAACCTAATTTNACTAAAACCCACCTTNCAATTTNAGTTAGTTAAtaat                                                   ]


>consensus_10783#1 AATCCTCGGTACGAGGCCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGG ACCAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAAT TAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACA TGTACCAGGCAGTCCATTCACTGTTGATGTTATCTAATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAA ATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGAT AATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATGAA TGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTAAAACAA CAACAACATTAAAAACACATAGTTTACAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATTGCTTTA ATCCTTCATACTTTTCTACCCCTAGGCTTTTTCTGAAATTTCTTTTCGCATGACTTCTTT TTTCTTTTTTATTGGACTTTCAAAATGATGAAAACACACATTACCAAAATTGGAAAGGAC TCACTATAGATAGACATATAGTATTCTTCTTTGTTCCGTTAGTATTTCGCTTCTGAAAAA TAAAAAAAAATTGTTTACTATTATTTATATTGTTAATAATCTTCAACTGAACAGATTTGC ATGTTACACTTACATATTACACTTACAAGTGTACTTCTGAATTAGCCGATTGATGCTTCC TTCAATTGTTTGTTGTTGTTCAAAGAATTAAAGCATATTCACTAACACACTATTTATATT GTATTCTAAATCTATTCTTTTTCGTCTATAAACAATGTTATCCCGTTAAAAAGTATCCCC ATTTATTATTATTATGATATATAATACGTGTCATCAAGTCTAAACAATGTTGTTTGAATG AAACAAACAAGCATCAACTACATATATTAGTTCTTTTTTTATCTCANATTCAACACCTTA ATGCCTTACTACTTATTCCTTAATTCTATTAGTGCCTAATTATTATTATTATGGCTTTCT TAATTTCTTAGTANATTATTATCTAAACAAACCTAATTTGACTAANACCCACCTTCCAAT TTAAGTTAGNTAACATTTTTTTTTTTGTTTGCTTTTGCTGGTTTTATCCGACCCTATGGG TTAGATGA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10783#0      ACGTTGAACAACCAGTGCCAGGCAGTCCTTTTGTAGTTCATATTGGTGGTGAACCATCAC 60
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      TTAGAATGATGGAAAGAATTACACGACAAAGAGAACTTGCTGATGCAACATATGTAGGCA 120
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      GTCAATGTGAATTAAATTTGAAAATTCCAGGAATAAATATTCGTGATTTAACAGCTAATG 180
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      TAACTAGTCCATCAGGAGTAAGTCAACGATGTGATGTCTTAGCTATGGATGATGTGAACT 240
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      ATACCATTAAATTTGTACCACAAGAAATGGGTGTACATACTGTTTCAGTACGTCATCGAG 300
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      GATCTCATATTTCTGGAAGTCCATTTCAGTTTACAGTTGGTCCTATTACAGAAGGTGGAG 360
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      CGCATAAAGTACATGCTACCGGTCAAGGATTACAAAATGGTTTAACCTATTCACTAAATG 420
consensus_10783#1      --------------------------------------------------------AAT- 3
                                                                               *** 

consensus_10783#0      ATTTTAGTATTTATACTCGTGAAGCCGGTGCAGGTGGTTTATCAATTGCTATTGAAGGAC 480
consensus_10783#1      -CCTCGGTACGAGGCCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTGGAC 62
                          *  ***      *     **** ***   * **   * *   ***   *    ****

consensus_10783#0      CAAGTAAAGCC------GAAATAAATTTCGAAGATAGGAAAGATGGCTCATGTGGAGTTT 534
consensus_10783#1      CAGTTGTAGCCTGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTCAATATTCAATTA 122
                       **  *  ****      *** * *** *  ** *** *    ****   ** *  * ** 

consensus_10783#0      CTTATCGTGTAACTGAACCAGGTGAATATTTATGCTCTATTCGCTTCAATGATGATCATA 594
consensus_10783#1      GTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAAATGGGGTGATCAACATG 182
                        ****  ****  *** *  ***    *****      ***   *    **** * *** 

consensus_10783#0      TACCGAATTCACCATTTCGTGTTATCATAAATGAAGCGATGGAACGAACATTCTATACAC 654
consensus_10783#1      TACCAGGCAGTCCATTCACTGTTGATGTTATCTAATTCAATGAAATCTTTTTTTTTAAAT 242
                       ****       *****   ****    * *   **   *  ***      ** * ** * 

consensus_10783#0      CTGAAACTAAATTATTGAATATTACAAGTATTCAAG-ATCGTGGTCTGTCGGTCGGGCGT 713
consensus_10783#1      C---AACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATTTTAGTACCATTCATGACAAGGCTTATGA 299
                       *   ****  ****     * *   *   ***  ** * * *         * *    * 

consensus_10783#0      CCAACAGCATTCACAGTTAAT-TACTCAGGAATGACAGGTAGAATGAGAGCATATGTAGT 772
consensus_10783#1      T-AATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTACATG 358
                         **   **  *  * * * * ****    ****** * **  *      * * *  *  

consensus_10783#0      AGCTCCATCTGGAATACAGTCAGATGCATTTGTACACCAAGTGGATGTTGATCAACATGC 832
consensus_10783#1      AATGTAAT---AATTACAACAAAGTG---TTATCCAC-AAATATATAGAGGGTGAATTGT 411
                       *     **    * ****   *  **   ** * *** ** *  **   *    *  ** 

consensus_10783#0      AGTAAGATTTACACCTCATGAAAATGGAGCACATTTAGTGCATGTACTCATGGATGAACG 892
consensus_10783#1      -------TTAAAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTACAAATGCCTATATAAA-- 462
                              ** * **  **  ** **  *  ***  ****  *   *  * *  ** **  

consensus_10783#0      TCCAGTACCTGGAAGTCCATTCCGTGTATTGGTTGGACAAGAAGAGACTGGTCATGTTAC 952
consensus_10783#1      ACTAATTGCATTGCTTTAATCCTTCATACTTTTCTACCCC---TAGGCTTTTTCTGAAAT 519
                        * * *  *      *  ** *    ** *  *    *      ** **  *  **  * 

consensus_10783#0      AGCTAGTGGGGAAGGTTTGACTCATGGACGTGTTGGTGAGCGTAATCGATTTTTCGTAAA 1012
consensus_10783#1      TTCTTTTCGCATGACTTCTTTTTTCTTTTTTATTGGACTTTCAAAATGATGAAA-ACACA 578
                         **  * *      **    *        * ****       **  ***       * *

consensus_10783#0      CACTGTTCAAGCTGGAAGTGGTGCTTTATCAGTTACTGTGGATGGTCCTAGTAAAGTTCA 1072
consensus_10783#1      CATTACCAAAATTGGAAAGGACTCACTATAGATAGACATATAGTATTCTTCTTTGTTCCG 638
                       ** *    **  *****  *   *  ***   *     *  *   * **  *    * * 

consensus_10783#0      ATTAAATTGTACT---GAACGATCAGATGGATACGATTTCACTTATTTGCCATTATCGCC 1129
consensus_10783#1      TTAGTATTTCGCTTCTGAAAAATAAAAAAAAATTGTTTACTATTATTTAT-ATTGTTAA- 696
                        *   ***   **   ***  ** * *   *   * ** *  ******   *** *    

consensus_10783#0      TGGTGAATATCTCATCAGTATTAAATATGGTGATTCACAACATATTATAGGTTCAC-CAT 1188
consensus_10783#1      TAATCTTCAACTGAACAGATTTGCATGTTACACTT----ACATATTACACTTACAAGTGT 752
                       *  *    * ** * ***  **  ** *     **    ******** *  * **    *

consensus_10783#0      ATAAAGCAATTGTGACAGGAGATGCTGTACACGAAACAATCACAACTGATACAACACATG 1248
consensus_10783#1      ACTTCTGAATTA-GCCGATTGATGCT-TCCTTCAATTGTTTGTTGTTGTTCAAAGA---A 807
                       *      ****  * *    ****** * *   **    *      ** *  ** *    

consensus_10783#0      TTGTAGTAGAAACAGGAGGACGTATGGTTAATGGACCACATTCTAATTTTGGTCCATCTA 1308
consensus_10783#1      TTAAAGCATATTCACTA--ACACACTATTTAT--ATTGTATTCTAAATCTATTCTTTTTC 863
                       **  ** * *  **  *  **  *   ** **  *    ******* * *  **  * * 

consensus_10783#0      GACCAGATCGTGTTACATGCTCTGGACCGGGACTTAAACAAGCATATCTTAATGAAGCTA 1368
consensus_10783#1      GTCTA--------TAAACAATGTTATCCCG---TTAAAAA---GTATCCCCATTTA-TTA 908
                       * * *        ** *   * *   ** *   ***** *    ****   **  *  **

consensus_10783#0      ATACATTTACAGTTAATGCATCACAAGCAGGTCATGATGTACTGTATGTTGGAGTATCTG 1428
consensus_10783#1      TTATTATGATATATAATACGTGTCATCAAGTCTAAACAATGTTGT---TTGAATGAAACA 965
                        **   * * *  **** * *  **   **   *     *  ***   *** *  *    

consensus_10783#0      GACCAGTTGTAGCC-TGTGAAGAAGTCAATATTAAACATATGGGTTATGGTC--AATATT 1485
consensus_10783#1      AACAAGCATCAACTACATATATTAGTTCTTTTTTTATCTCANATTCAACACCTTAATGCC 1025
                        ** **    * *    *  *  ***   * **  *  *     * *    *  ***   

consensus_10783#0      CAATTAGTTATACTGTACGTGATCGTGGTCGTCATTTAATTATGATTAA-ATGGGGTGAT 1544
consensus_10783#1      TTACTACTTATTCCTTA----ATTCTATTAGT-GCCTAATTATTATTATTATGGCTTTCT 1080
                         * ** **** *  **    **  *  * **    ******* ****  ****  *  *

consensus_10783#0      CAACATGTACCAGGCAGTCCATTCACTGTTGATGTTATCTAATTCAATGAAATCTTTTTT 1604
consensus_10783#1      TAATTTCT------TAGTANATTATTATCTAAACAAACCTAATTTGACTAANACCCACCT 1134
                        **  * *       ***  ***      * *    * ******  *  **  *     *

consensus_10783#0      TTTAAATCAACTGTATTACAATTTGTCCAACCAATT-TTAGTACCATTCATGACAAGGCT 1663
consensus_10783#1      TCCAATTTAAGTTAGNTAACATTTTTTTTTTTGTTTGCTTTTGCTGGTTTTATCCGACCC 1194
                       *  ** * ** *    **  **** *        **  *  * *   *  *  *    * 

consensus_10783#0      TATGATAATTACACGCTTATTAACTATACTTTTAAATGACTGATAATAGATATTCCTTTA 1723
consensus_10783#1      TATGG--GTTAGATGA-------------------------------------------- 1208
                       ****    *** * *                                             

consensus_10783#0      CATGAATGTAATAATTACAACAAAGTGTTATCCACAAATATATAGAGGGTGAATTGTTTA 1783
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      AAACAACAACAACATTAAAAACACATAGTTTGCAAATGCCTATATAAAACTAATTGCATT 1843
consensus_10783#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10783#0      GCTTTAATCCTTCATACTTTT 1864
consensus_10783#1      ---------------------
                                            




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)