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Schistosoma mansoni
cluster # 10862 cluster # 10862       Sequences # 23       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10862#0 length = 801 sequences # 18  
consensus_10862#1 length = 580 sequences # 4  
consensus_10862#2 length = 544 sequences # 1  

consensusID : consensus_10862#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 801
fasta sequence
                              [GAGGCCTGNAATTCGGCACCAGGTTTTAAACCGCCTACTTCACTGTATGCGCAACGTAACGCAACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATTTATAATTAGAATACTTTTGTCTACCATTCTCTCTGGAGTATTACATAATCCAGTAAAAAAAGTTACTACAGTGGGTATCAAAACATGTAATGCTTCTGGTCGTAGATCATGTGAATATCCTCCACACCTCTNTTATTCTANTAATCTAATCTTGTGTTAAA]

[+] EMBL CD081538             [GAGGCCTGNAATTCGGCACCAGGTTTTAAACCGCCTACTTCACTGTATGCGCAACGTAACGCAACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTCGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATTTATAATTAGAATACT                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BF936790             [                     tGTTTTAAACCGCCTACTTCACTGTATGCGCAACGTAACGCAACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATTTA                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD133470             [                                                  GCAACGTACCGCAACTCAATCTGACGTAGCATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGAGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCTCATGGTTTCAGAGATGATCAAGATAATCAAAGGCAAATTGTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATTTATAATTAGAATACTTTTGTCTACCATTCTCTCTGGAGTATTACATA                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD171126             [                                                  GCAACGTAACGCAACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGAATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI975991             [                                                  GCAACGTAACGCAACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTCTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCCGTGGCTCTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI067145             [                                                              AACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGATTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGATTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGCTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACA                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI067196             [                                                              AACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTA                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI067419             [                                                              AACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI067243             [                                                                    ATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACANATTAATCGGCATATCGTA                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI067367             [                                                                    ATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTA                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI068154             [                                                                    ATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI066972             [                                                                    ATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD075361             [                                                                                                                     CTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTCGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATTTATAATTAGAATACTT                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD201372             [                                                                                                                                                                                                            CGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTA                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD144953             [                                                                                                                                                                                                                       ATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAGACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTA                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD134217             [                                                                                                                                                                                                                             TGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAGTTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAcg                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD198139             [                                                                                                                                                                                                                                                                 CCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD198148             [                                                                                                                                                                                                                                                                 CCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTTGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATTTATAATTAGAATACTTTTGTCTACCATTCTCTTTGGAGTATTACATAATCCAGTAAAAAAAGTTACTACAGTGGGTATCAAAACATGTAATGCTTCTGGTCGTAGATCATGTGAATATCCTCCACACCTCTNTTATTCTANTAATCTAATCTTGTGTTAAA]


>consensus_10862#0 GAGGCCTGNAATTCGGCACCAGGTTTTAAACCGCCTACTTCACTGTATGCGCAACGTAAC GCAACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTA AACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCA TTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATT GCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTC AAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTC AGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCA TGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGC ATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGA GAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGT CATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATTTATAATTAGAATACTTTTGT CTACCATTCTCTCTGGAGTATTACATAATCCAGTAAAAAAAGTTACTACAGTGGGTATCA AAACATGTAATGCTTCTGGTCGTAGATCATGTGAATATCCTCCACACCTCTNTTATTCTA NTAATCTAATCTTGTGTTAAA



consensusID : consensus_10862#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 580
fasta sequence
                              [TACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGGTAAATCACTATCTTCGGTGAATTTGAACTAATCTATTACAGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATT]

[-] EMBL CD077286             [TACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGGTAAATCACTATCTTCGGTGAATTTGAACTAATCTATTACAGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATT]
[-] EMBL CD144935             [                                                                                                                                            GAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGGTAAATCACTATCTTCGGTGAATTTGAACTAATCTATTACAGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTA                                 ]
[+] EMBL CD134308             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTC                           ]
[+] EMBL CD134305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTGATTACTAATCAT                                                                               ]


>consensus_10862#1 TACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTG ATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCT GGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGGTTTCAGAGATGAACAAGAT AAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTG TTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGGTAAATCACTATCTTCGGTGAATTTGA ACTAATCTATTACAGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCA TGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGC ATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTAACAATTGCGCCAACTATCTCGA GAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATTAATCGGCATATCGTAAACATGT CATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAATT



consensusID : consensus_10862#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 544
fasta sequence
                              [CGGCACGAGGATTACTGCCCCCAGTTTTTGAAGATAACTCGTAATCGATTCCTGAAGACTAGTAGTCAGTTTTCCAGATAATGAGGTAATAACCCATATGTGAATGCTTCCTTGATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGTTTTAACTTTTAGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTT]

[+] EMBL CD084181             [CGGCACGAGGATTACTGCCCCCAGTTTTTGAAGATAACTCGTAATCGATTCCTGAAGACTAGTAGTCAGTTTTCCAGATAATGAGGTAATAACCCATATGTGAATGCTTCCTTGATGGTACACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCTAGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCTGGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGTTTTAACTTTTAGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCATTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTT]


>consensus_10862#2 CGGCACGAGGATTACTGCCCCCAGTTTTTGAAGATAACTCGTAATCGATTCCTGAAGACT AGTAGTCAGTTTTCCAGATAATGAGGTAATAACCCATATGTGAATGCTTCCTTGATGGTA CACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCT AGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCT GGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGTTTTAACTTTT AGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCA TTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGTCTGC TACTCTTTTTGCCACCGGAACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAAC TGGAGATGATCGGTTTTCTAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTG GCTT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10862#0      --------------------------GAGGCCTGNAATTCGGCACCAGGTTTTAAAC-CG 33
consensus_10862#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10862#2      CGGCACGAGGATTACTGCCCCCAGTTTTTGAAGATAACTCGTAATCGATTCCTGAAGACT 60
                                                                                   

consensus_10862#0      CCTACTTCACTGTATGCGCAACGTAACGCAACTCAATCCGACGTAACATACTGCATGGTA 93
consensus_10862#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10862#2      AGTAGTCAGTTTTCCAGATAATGAGGTAATAACCCATATGTGAATGCTTCCTTGATGGTA 120
                                                                                   

consensus_10862#0      CACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCT 153
consensus_10862#1      ---------TACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCT 51
consensus_10862#2      CACCTACCTTACGTTAATGGAATACTAAACCTCATGGGTCGTGGTACAACTGGTCAATCT 180
                                ***************************************************

consensus_10862#0      AGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCT 213
consensus_10862#1      AGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCT 111
consensus_10862#2      AGTCCTGTGATTGAAGTTAAGCCGTCATTTTGTTGGGATTCAATGTTGGTACGACTAGCT 240
                       ************************************************************

consensus_10862#0      GGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATG----------- 262
consensus_10862#1      GGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATG----------- 160
consensus_10862#2      GGATTGTCTGGGGCATTGGCTGTTATTGCGAGCGCTTATGGTGCCCATGTTTTAACTTTT 300
                       *************************************************           

consensus_10862#0      --GTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCA 320
consensus_10862#1      --GTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCA 218
consensus_10862#2      AGGTTTCAGAGATGAACAAGATAAACAAAGACAAATTTTCAAAACTGGGGCTTATTATCA 360
                         **********************************************************

consensus_10862#0      TTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTG----- 375
consensus_10862#1      TTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTGGTAAA 278
consensus_10862#2      TTTGGTTCATTCGGTGGCTTTGTTAACCACGCCTTTATTCAGACGTCCTGTTTTG----- 415
                       *******************************************************     

consensus_10862#0      -------------------------------------TCTGCTACTCTTTTTGCCACCGG 398
consensus_10862#1      TCACTATCTTCGGTGAATTTGAACTAATCTATTACAGTCTGCTACTCTTTTTGCCACCGG 338
consensus_10862#2      -------------------------------------TCTGCTACTCTTTTTGCCACCGG 438
                                                            ***********************

consensus_10862#0      AACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTC 458
consensus_10862#1      AACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTC 398
consensus_10862#2      AACTCTACTGTTCTCTGGTTCATGCTATTATGTGGCTCTAACTGGAGATGATCGGTTTTC 498
                       ************************************************************

consensus_10862#0      TAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTA 518
consensus_10862#1      TAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTTTCTTTGGTTTTCTA 458
consensus_10862#2      TAGAATAGCACCTATTGGTGGCATGACGCTCGTATTCGCCTGGCTT-------------- 544
                       **********************************************              

consensus_10862#0      ACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATT 578
consensus_10862#1      ACAATTGCGCCAACTATCTCGAGAGCTGTTTATTACTAATCATTCATTTTTCTACAAATT 518
consensus_10862#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10862#0      AATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAA 638
consensus_10862#1      AATCGGCATATCGTAAACATGTCATTTTATTTTTCTTCTCAGATACTAGTAAACAAATAA 578
consensus_10862#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10862#0      TTTATAATTAGAATACTTTTGTCTACCATTCTCTCTGGAGTATTACATAATCCAGTAAAA 698
consensus_10862#1      TT---------------------------------------------------------- 580
consensus_10862#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10862#0      AAAGTTACTACAGTGGGTATCAAAACATGTAATGCTTCTGGTCGTAGATCATGTGAATAT 758
consensus_10862#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10862#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10862#0      CCTCCACACCTCTNTTATTCTANTAATCTAATCTTGTGTTAAA 801
consensus_10862#1      -------------------------------------------
consensus_10862#2      -------------------------------------------
                                                                  




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)