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Schistosoma mansoni
cluster # 10882 cluster # 10882       Sequences # 24       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10882#0 length = 499 sequences # 24  

consensusID : consensus_10882#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 24
consensus length = 499
fasta sequence
                              [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC-AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT-GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC-TGCATAGTATGTTA-GGGGTACAGTGAAGTCCA-TTATGTAAACAACTTATATATTTTGCAAAAGATCCCAAAACCGTTATTNTTAGGTGGCTTGAAAAAACACCTTTAAAACTCTTGTATTGGCAAACCGTCAAATTGATCATTCACTATTGTTATCGGGACATAACACAGACACATATGCGCCACATAAATCATTAGATT]

[+] EMBL CD070209             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTNAACAACTTATATATTTTGCAAAAGATCC                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD070233             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCGTAGTATGTTA GGNGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATA                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD070308             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCATTTATGT AACNACTTATA                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD070296             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTAGGGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACA                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD070355             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCA CATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAA                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD070270             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTta                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD070275             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGNGTACAGTGAAGTCCA TT                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD070395             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAG                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD070445             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGG                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD070456             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC GATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD070202             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGT                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD070411             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACGATTC TGCATAGTATG                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD070363             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAGATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GNTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCA TC TG                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD070421             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGNTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD070400             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGNTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACAAT                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD070458             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTCAAATCTGG ATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGTCCGTAGCCATACATTTCCT GGNTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCA                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD070318             [TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGAT                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD070207             [                                                 TAGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGNGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATATTTTGCAAAnn                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD070227             [                                                  AGTTCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATA                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD070240             [                                                     TCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAACAACTTATATATTTT                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD070247             [                                                     TCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAGAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATAT                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD070248             [                                                     TCCTGATACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTACCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGT                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD070195             [                                                                                                              TTGAAGTTTACCAGCCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTC AATCTGAGATTCATCGGAGGCATGACTTATGCTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCCT GGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTC TGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCA TTATGTAAAC ACTTATATATTTTGCAAAg                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD070416             [                                                                                                                                                                                                                                   AGCCATACA TTCCTNGGTTANCAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATA TCCACCATTCNTGCATAGTATGTTA GGGGTACAGTGAAGTCCG TTATGTAAACAACTTATATATTTTGC AAAGATCCCAAAACCGTTATTNTTAGGTGGCTTGAAAAAACACCTTTAAAACTCTTGTATTGGCAAACCGTCAAATTGATCATTCACTATTGTTATCGGGACATAACACAGACACATATGCGCCACATAAATCATTAGATT]


>consensus_10882#0 TTTCCTTTTTCTTCTTCGAATTGTTTATCATAATTAAACGAAGATTTATTAGTTCCTGAT ACTGAATATGAGTAGTGTGTTGGTAATAATGGAACAGGGTTATGAAAATATTGAAGTTTA CCAACCAGCTTCGTGGACATTTGACTTTCAATCTGGAATTCATCGGAGGCATGACTTATG CTAACAGCACCAATACGAGCCCAGTCGGCAACAAAAGAACGACCGTAGCCATACATTTCC TGGTTAACAGGTGGTCTGTTGATATGATTGCAGCGGTGTGTATGTATATTCCACCATTCT GCATAGTATGTTAGGGGTACAGTGAAGTCCATTATGTAAACAACTTATATATTTTGCAAA AGATCCCAAAACCGTTATTNTTAGGTGGCTTGAAAAAACACCTTTAAAACTCTTGTATTG GCAAACCGTCAAATTGATCATTCACTATTGTTATCGGGACATAACACAGACACATATGCG CCACATAAATCATTAGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)