These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11365#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 55 consensus length = 979 fasta sequence [ATTGTCCGTACGCGGAGCTAACACGACAGCTCCATGAAATACCACGAACTCTATAAACTTTTCCAACATCAATCTTGTCAATAGGAACAAATCCACTCAAGGTCGTGGAGGCAGAT-TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG-TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC-TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG-ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC-AAAAATCGATATTC-AG-AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT-ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG-TTCGTGGTATTTC-ATGGAGCTGT-CGTGTTAGCTC-CTCGTACGGA-CAATCC-TTAGTGTCTGGTGC-AAAATCGGTTCTC-AATCAA-TTTCT-AAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGCAAGGGTCAATAAGCAG-GCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTTTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGAT] [+] EMBL CD124297 [ATTGTCCGTACGCGGAGCTAACACGACAGCTCCATGAAATACCACGAACTCTATAAACTTTTCCAACATCAATCTTGTCAATAGGAACAAATCCACTCAAGGTCGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGT ] [+] EMBL CD193443 [ GTCGTGACTGCAAATCCTGGTGTCGTGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC ] [+] EMBL CD113332 [ TCGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGAGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAA ] [+] EMBL CD113287 [ TCGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGT ] [+] EMBL CD118939 [ TCGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGCCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAA ] [+] EMBL CD111372 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACCCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTAAAAACGTATTCGTCACAAAAGCGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTAGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATG ] [+] EMBL CD124263 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGT ] [+] EMBL CD155745 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCG ] [+] EMBL CD094971 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTT ] [+] EMBL CD094759 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTACTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTT ] [+] EMBL CD094800 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTT ] [-] EMBL CD162905 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACACCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGT ] [+] EMBL CD114874 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGC ATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTT ] [+] EMBL CD115051 [ CGTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTGTTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTGACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTT ] [-] EMBL CD155692 [ GTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTA ] [-] EMBL CD068344 [ GTGGAGGCAGAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTT CCC GGGACT ] [-] EMBL CD155693 [ GTGGAGGCATAT TTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTGTAATCAGGTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTGGTCGCAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATAGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGAGACAGGTAGTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATGGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGGTCATGGTTGCACCGT ] [+] EMBL CD123911 [ TCTACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCACTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGT ] [-] EMBL CD119267 [ GTAAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAANACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTCGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT TTT ] [-] EMBL CD198998 [ TAAAAAACTTGTTTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD157284 [ AAAAAACTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATT ] [+] EMBL CD199086 [ CTTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGT ] [-] EMBL CD198956 [ TTG TTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD199049 [ TTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD198942 [ TTG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD199080 [ TG TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD199045 [ TG TTTTAAAACGTGTTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCAAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD198988 [ gt TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCGGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGGGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD198984 [ tgt TTTTAAAACGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTA TGAAGCTTTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATT ] [-] EMBL CD113397 [ AGC TTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTATCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCCAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCGTGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCAGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTTTCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGCAAAAGTTTATAGAG TTCATGGTATTTC ACGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTAGTACGGA CAATC ] [+] EMBL CD078134 [ aggCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACTTTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC ] [+] EMBL CD120136 [ TCGGTTATTATTCGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAGGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATGAATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAACAAAAAATCGATATTCAAGAAAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCTAATTGACAAGA ] [+] EMBL CD158120 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTCAAATC A TTTCN TAGTGATGTA ] [+] EMBL CD158072 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGNGGTGAAGTGTTGT ] [+] EMBL CD136028 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAGTCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTA ] [+] EMBL CD193515 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC T ] [+] EMBL CD169966 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTT CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC A ] [+] EMBL CD157989 [ TATTATTGGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAGC AAAAA ] [+] EMBL CD157926 [ TATTATTTGGAATTCCTGCACATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTT CT ] [+] EMBL CD193423 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTA ] [+] EMBL CD169873 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGCAAAAATCGG TCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTA ] [+] EMBL CD158122 [ TATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTA ] [-] EMBL CD120112 [ ATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGCGGTTACCTATCTACCGCGGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AGAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ] [-] EMBL CD193517 [ ATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACC ] [-] EMBL CD136024 [ ATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ] [-] EMBL CD158234 [ ATTATTT GAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGAAAAGATTGTTGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ] [-] EMBL CD113376 [ TGGCTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGCTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGC CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTTTC AATCAA TTTNTGAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGCAAGGGTCAATAAGCAGCGCAAAAGCCCTGGATTTG ] [-] EMBL CD177971 [ ACACTAGTCGGGGTTTCGAATGTTCCTTATG ATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAG GCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTTTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGAT] [-] EMBL CD144451 [ CATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTTCCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTAT ] [-] EMBL CD136025 [ TGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTATTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ] [-] EMBL CD113385 [ TTGGTTTAAGTGGTGGCGCCTCAAC AAAAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGCAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAAT ] [-] EMBL CD136091 [ AAATCGATATTC AG AAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGCTTCGTGGTATCTCTATGGAGCTGTNCGTGTTAGCTCTCTCGTACGGACCAGTCCGTTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ] [+] EMBL CD193475 [ ACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTA ] [-] EMBL CD193433 [ CGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAA TTTCT AAGTGATGTAT ] [-] EMBL CD136127 [ GGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT ATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTAATAGAG TTCGTGGTATTTC ATGGAGCTGT CGTGTTAGCTC CTCGTACGGA CAATCC TTAGTGTCTGGTGC AAAATCGGTTCTC AATCAACTTTCT AAGTGATGTATAat ] consensusID : consensus_11365#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 620 fasta sequence [GGCCTCGAGGCTACGAATTCGGCACGAGGCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAACAAAAATCGATATTCAGAAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCTATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCATTGATTCGGGAACCCAATCGTTGGCTTTCGTCCTGATGGCTTGTGAAAGTGGACGTAATGCTAGCC] [+] EMBL CD084159 [GGCCTCGAGGCTACGAATTCGGCACGAGGCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTATCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAACAAAAATCGATATTCAGAAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCTATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCA ] [-] EMBL CD195934 [ tgGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCATTGATTCGGGAACCCAATCGTTGGCTTTCGTCCTGATGGCTTGTGAAAGTGGACGTAATGCTAGCC] consensusID : consensus_11365#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 368 fasta sequence [TCCTTTGCACAGGACTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTTTTTGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGGTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCC] [+] EMBL CD113961 [TCCTTTGCACAGGACTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGGTCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCTCAGTCTAATCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTTTTTGTATTCGTCACAAAAACGATAGTCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGGGACAGCAATCAAAATTAACGATACAGGTACTATTGTGTCTGTTTCCCCGGGGACTCTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGGTATTATTTGGAATTCCTGCTCATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCC] consensusID : consensus_11365#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 323 fasta sequence [AATGTCTTGTGAAACAGGATACATTGTAAAACTAGTTTGAAACATCCATGTCTGAATGTAAATTTAGCAAGCTCACTGTCTACTGGTTTGAATTAGATCAATCTCCCACGATGAATTAAATTTTTCAAATGCTTCTTAATTCACTCACTCAGAACGAATAATTTTTCAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTT] [-] EMBL CD181075 [AATGTCTTGTGAAACAGGATACATTGTAAAACTAGTTTGAAACATCCATGTCTGAATGTAAATTTAGCAAGCTCACTGTCTACTGGTTTGAATTAGATCAATCTCCCACGATGAATTAAATTTTTCAAATGCTTCTTAATTCACTCACTCAGAACGAATAATTTTTCAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTT] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_11365#1 ----------------------------------------------------GGCCTCGA 8 consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 ATTGTCCGTACGCGGAGCTAACACGACAGCTCCATGAAATACCACGAACTCTATAAACTT 60 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 GGCTACGAATTCGGCACGAGGCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTAC 68 consensus_11365#3 -----------------------------------------------------AATGT-- 5 consensus_11365#0 TTCCAACATCAATCTTGTCAATAGGAACAAATCCACTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGG 120 consensus_11365#2 ------------TCCTTTGCACAGGA---------CTCAAGGTCGTGGAGGCAGATTTGG 39 * consensus_11365#1 ATTCGTGGTTACCTATCTACC----GCAGCTC-TATTGGTTTAAGTGCTGGCGC----CT 119 consensus_11365#3 -CTTGTGAAACAGGATACATT----GTAAAAC-TAGT--TTGAAACATCCATGT----CT 53 consensus_11365#0 TCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCT 180 consensus_11365#2 TCTCATGGTTTCCACCATACTCCTGGAAGGGCATGGTAATTTTAGGGTGAAGATAGCGCT 99 * ** * * * * * * ** * ** consensus_11365#1 CAACAAAAATCGATATTCAGAAACGTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGT 179 consensus_11365#3 GAATGTAAAT-----TTAGCAAGCTCACTGTCTA--CTGGT--TTGAATTAGATCAATCT 104 consensus_11365#0 CAGTCTAA-TCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTAAAACGTATT--CGTCACAAAAACGATAG 237 consensus_11365#2 CAGTCTAA-TCAGCTGTAAAAAACTTGTTTTTTT-TGTATT--CGTCACAAAAACGATAG 155 * ** * * ** * * * * * * * consensus_11365#1 TTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAGTTGTTCCT--A------TTGACAAGATTGATGTTGG 231 consensus_11365#3 CCCACGATGAATTAAATTTTTCAAATGCTTCTTAA------TTCACTC-ACTCAGAACGA 157 consensus_11365#0 TCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGG 297 consensus_11365#2 TCCAGGAGTCGATAATGCTGAGGTCTGCTTATTGAAGCTTGCCGACAAAATATCGAATGG 215 ** * * * ** * * consensus_11365#1 AAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACA 291 consensus_11365#3 ATAATTTTTCAGAGTTCGTGGTATTTCATGGAGCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACA 217 consensus_11365#0 GACAGCAATCAAAATTAACGATACA----GGTACTATTGTGTCTGTTTCCC-CGGGGACT 352 consensus_11365#2 GACAGCAATCAAAATTAACGATACA----GGTACTATTGTGTCTGTTTCCC-CGGGGACT 270 * * * ** * ** ** ** * **** * * * * **** consensus_11365#1 ATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTT-CTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTA 350 consensus_11365#3 ATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTT-CTCAATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTA 276 consensus_11365#0 CTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGTTATTATTTG 412 consensus_11365#2 CTGATTGGAGGCAGTTTCAGCCTCGAATGTTCAAATGATCGAGGTATCGGGTATTATTTG 330 * ** * * * * * ** *** * **** ** * *** *** consensus_11365#1 CAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGT 410 consensus_11365#3 CAATCGATCATCGAAAGGGTCAATATGCAGGCAAAAGCCCTGGATTT------------- 323 consensus_11365#0 GAATTCCTGCTC--ATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCCTATTGAAGCAACACTAGTCG 470 consensus_11365#2 GAATTCCTGCTC--ATGGTTGCACCGTTTTGTAAAACTCC-------------------- 368 *** * ** * ** * * * **** ** consensus_11365#1 GGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTGCAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGA 470 consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 GGGTTTCGAATGTTCCTTATGATCCGTCTGTAGACATGATCGTACATTCGTGGTTACCTA 530 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 GTGATAATGTTCTTATGGATGCGGAAACCATAGGAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAG 530 consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 TCTACCGCAGCTCTATTGGTTTAAGTGCTGGCGCCTCAACAAAAATCGATATTCAGAAAC 590 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 ATCAGATTTACAGAGGGGGCTTCATTGATTCGGGAACCCAATCGTTGGCTTTCGTCCTGA 590 consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 GTGGTGTATATCCTGGTGGCGGGGGTGAAGTGTTGTTTTCTTCCAGGCCTTGTAGTGGAG 650 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 TGGCTTGTGAAAGTGGACGTAATGCTAGCC------------------------------ 620 consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 TTGTTCCTATTGACAAGATTGATGTTGGAAAAGTTTATAGAGTTCGTGGTATTTCATGGA 710 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 GCTGTCGTGTTAGCTCCTCGTACGGACAATCCTTAGTGTCTGGTGCAAAATCGGTTCTCA 770 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 ATCAATTTCTAAGTGATGTATACTTTACAATCGATCATCGCAAGGGTCAATAAGCAGGCA 830 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 AAAGCCCTGGATTTGGTCTGACTCTGTGGGCGGAACGTAAAGACGGTGGTGTTTATTCTG 890 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#3 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#0 CAGAAGCAATGTCGGAACCTGAAGGGAGTGATAATGTTTTTATGGATGCGGAAACCATAG 950 consensus_11365#2 ------------------------------------------------------------ consensus_11365#1 ----------------------------- consensus_11365#3 ----------------------------- consensus_11365#0 GAAAATTAGCAGCACACCGACTATTAGAT 979 consensus_11365#2 ----------------------------- |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||