cluster # 1145

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Schistosoma mansoni
cluster # 1145 cluster # 1145 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1145#0 length = 1166 sequences # 2

consensusID : consensus_1145#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1166
fasta sequence

                              [CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGAAATAGATCTAAATGAAAAGTCCAACTTTTCGTATAAAACTGTCATCAGTATTTGATTTCCACTTATTAGTAAGGTTTGAAACTCCTTGCTTTACCAACAAAATCCTTCAGTTTTAAGTAAATCTCCTTAGATTACTTATTTTTCAGAGATTTGTCATAATAAAATCCTACTGATAAATGGTAAATGATGTCAATGAGTAAAAATTAGCTTTATCTTCACAAGGAGTGATCATCATTTAGATGAACATACATTAAACGATCAAAACGGATATAAGAAAACCAGAAATTCTATATAGCACCATATGCGTTTTAGCCCATAGTGTCACATTAATTATTTGTTTTGGTATATCATTTTTACCAATATTAAACTTTACATGTAATTAAACTTTTAATTGATGTTGCTATTTCAGGTTTTTGAATCAGTTGACTTTATATTAACACCAGTATCACCTAGTCTACCTATTAGTATAGATGAATTTTCCAAATTCGACAATCGAACACGTACTACACTTGATGATGTATGTACAGTGGCTGTAAATTTGTCCGGATTACCTGCAATTTCATTTCCTGTCGGTTTATCACCTACACGTGGACTACCAATTAGTTTACAATTAATTGGACCATACTTCTCAGAATGTCAACTATTGTCACTTGTTGCTAANTTAG-ACACCAGGCTTGTTTCCAACCTTTGGTGGATCATAAATCCATTATTGATTCTATTTAAAAAGTGTTTGATTTTTAAAATTTTTCTTAGTCTCTTTTCCCTCCTTTCTTTCCGTAAATCATTTGAAATTGAATTATCGAGTGAAGTTACCCCCTTCTTTTGTGTTTATTGGTTTCTTATGACTAAAAAAATTAATTGTACAAATCTGACGTATTCTAGTTCTAATTTTATAGTGATATTACGATGACAATATACTGGATTGTTTTATAGTTTAATACTGTTTTTTTCTTAATCTATTAATCATTGGAAGAAAATTAAATAAATTAATTTTTCCTTGTTTATTGCATTTTTTGCCGGGGACAAGGTATATATTTACATATAACGTCCAATTAAATAAGCACCTATATTTTGTTGATTACAGAACAGAGGGACTTTATGTTTGTTCCTTTTTGTTTTGAAAAAAGAAACGAATTG]

[+] EMBL CD082448             [CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGAAATAGATCTAAATGAAAAGTCCAACTTTTCGTATAAAACTGTCATCAGTATTTGATTTCCACTTATTAGTAAGGTTTGAAACTCCTTGCTTTACCAACAAAATCCTTCAGTTTTAAGTAAATCTCCTTAGATTACTTATTTTTCAGAGATTTGTCATAATAAAATCCTACTGATAAATGGTAAATGATGTCAATGAGTAAAAATTAGCTTTATCTTCACAAGGAGTGATCATCATTTAGATGAACATACATTAAACGATCAAAACGGATATAAGAAAACCAGAAATTCTATATAGCACCATATGCGTTTTAGCCCATAGTGTCACATTAATTATTTGTTTTGGTATATCATTTTTACCAATATTAAACTTTACATGTAATTAAACTTTTAATTGATGTTGCTATTTCAGGTTTTTGAATCAGTTGACTTTATATTAACACCAGTATCACCTAGTCTACCTATTAGTATAGATGAATTTTCCAAATTCGACAATCGAACACGTACTACACTTGATGATGTATGTACAGTGGCTGTAAATTTGTCCGGATTACCTGCAATTTCATTTCCTGTCGGTTTATCACCTACACGTGGACTACCAATTAGTTTACAATTAATTGGACCATACTTCTCAGAATGTCAACTATTGTCACTTGTTGCTAANTTAG ACACCAGGCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD076046             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGTGGCTGTAAATTTGTCCGGATTACCTGCAATTTCATTTCCTGTCGGTTTATCACCTACACGTGGACTACCAATTAGTTTACAATTAATTGGACCATACTTCTCAGAATGTCAACTATTGTCACTTGTTGCTAAATTAGAACACCAGGCTTGTTTCCAACCTTTGGTGGATCATAAATCCATTATTGATTCTATTTAAAAAGTGTTTGATTTTTAAAATTTTTCTTAGTCTCTTTTCCCTCCTTTCTTTCCGTAAATCATTTGAAATTGAATTATCGAGTGAAGTTACCCCCTTCTTTTGTGTTTATTGGTTTCTTATGACTAAAAAAATTAATTGTACAAATCTGACGTATTCTAGTTCTAATTTTATAGTGATATTACGATGACAATATACTGGATTGTTTTATAGTTTAATACTGTTTTTTTCTTAATCTATTAATCATTGGAAGAAAATTAAATAAATTAATTTTTCCTTGTTTATTGCATTTTTTGCCGGGGACAAGGTATATATTTACATATAACGTCCAATTAAATAAGCACCTATATTTTGTTGATTACAGAACAGAGGGACTTTATGTTTGTTCCTTTTTGTTTTGAAAAAAGAAACGAATTG]




>consensus_1145#0
CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGAAATAGATCTAAATGAAAAGTCCAACTTTTCG
TATAAAACTGTCATCAGTATTTGATTTCCACTTATTAGTAAGGTTTGAAACTCCTTGCTT
TACCAACAAAATCCTTCAGTTTTAAGTAAATCTCCTTAGATTACTTATTTTTCAGAGATT
TGTCATAATAAAATCCTACTGATAAATGGTAAATGATGTCAATGAGTAAAAATTAGCTTT
ATCTTCACAAGGAGTGATCATCATTTAGATGAACATACATTAAACGATCAAAACGGATAT
AAGAAAACCAGAAATTCTATATAGCACCATATGCGTTTTAGCCCATAGTGTCACATTAAT
TATTTGTTTTGGTATATCATTTTTACCAATATTAAACTTTACATGTAATTAAACTTTTAA
TTGATGTTGCTATTTCAGGTTTTTGAATCAGTTGACTTTATATTAACACCAGTATCACCT
AGTCTACCTATTAGTATAGATGAATTTTCCAAATTCGACAATCGAACACGTACTACACTT
GATGATGTATGTACAGTGGCTGTAAATTTGTCCGGATTACCTGCAATTTCATTTCCTGTC
GGTTTATCACCTACACGTGGACTACCAATTAGTTTACAATTAATTGGACCATACTTCTCA
GAATGTCAACTATTGTCACTTGTTGCTAANTTAGACACCAGGCTTGTTTCCAACCTTTGG
TGGATCATAAATCCATTATTGATTCTATTTAAAAAGTGTTTGATTTTTAAAATTTTTCTT
AGTCTCTTTTCCCTCCTTTCTTTCCGTAAATCATTTGAAATTGAATTATCGAGTGAAGTT
ACCCCCTTCTTTTGTGTTTATTGGTTTCTTATGACTAAAAAAATTAATTGTACAAATCTG
ACGTATTCTAGTTCTAATTTTATAGTGATATTACGATGACAATATACTGGATTGTTTTAT
AGTTTAATACTGTTTTTTTCTTAATCTATTAATCATTGGAAGAAAATTAAATAAATTAAT
TTTTCCTTGTTTATTGCATTTTTTGCCGGGGACAAGGTATATATTTACATATAACGTCCA
ATTAAATAAGCACCTATATTTTGTTGATTACAGAACAGAGGGACTTTATGTTTGTTCCTT
TTTGTTTTGAAAAAAGAAACGAATTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case